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transcript sequence >TCONS_00004779 ID=TCONS_00004779|Name=TCONS_00004779|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2318bp GAAAGATTCGTCACTTATTGGTAACTTTGGTAATGACAGAGGAAGGTAGA TGACTAATCACGGAAAATTTGGAAAACACTTCAAAAATGagttcaaaaca agaaaaatggaAATATAAGATGATGAAGATGTCACTGGGTTCCAATGAAG CTAAGGAGGCAGTTGCAACACTTCGTGATCGTTTGAAACATGGGCAAAAC ATGACCAAGATATTGGAATCACAACTGGATACAGCGCAACAGAATATAAG TTTATTGCAAGGGCAAGTGCGTTTAGCCAACGAAACCATTTTGAACTTGA AGAAATATTTCACCGAAACGGAGAACACTTTGAATGATTTGTTTACATCG AATCATTCCTCAAGAAGTTTTCAATACAATGATGGTGCTACAAAGGAGCA ATCAGATATggataaaaatcaacaaatgtCGAAAGTTGCTCGAGGTTCTA CTAGATCACCAAGAACACCAGAGTCGATGGATACTAAGACACACCATGAC GACAAACGCAGGGAGCGTGAGCACAACAACAAATCACCATACGCACAACA ATTACGTCAAGTTCTGGATGCTCTACAAGACGAAGAGCCGAAGAAATCTT CACACACTCATCATCGTTTACACGAGAAAACAGAACCTTCAGAACACAGT CCATCACCTCCGCCTGCAGACCGTCGTTTGATGCAGGCTACAAAACATTA TCACCATGAGAATGAAGGTGGTGCCTTTCAAAGACGACAACCTCATCCAG AAGAGGACTATCCAAAGATGAAACACCATAAAATGAACGGTCATCCTTCA AGAGAATCAACCAATGGGAACCATCATGACCCAATCTCCCCTAAACCATC CTATTATCAACAACACCATTCTAATGAGTTGTCACACGGTCATCATCAGC CACATCCTCATAGCAACCATTGCATGGGACCATGTTGTCCCAGCGAAACG CCACCATCAAGCTACAAAATGATGGAGAAATCATATCATTATGGTTCAGA TGAAAAACCGACACACTATGTGGAGAAATCACCAAATGGAGGTGTTCACT ATattgctgtacattcaccagagaGCACTACCAGCTCTGGCAAACATGGC GAAAGACATCATAGTCATCATTATGTTCCTTATGCTTACCACATCCCTGG TGAGAATCCACATAAAATGATACACGAAATGCCACCGCAACCACTTTCAC CGACAACCAACAGTGGTGGTGGGCGCCGAAAGAGGGCGTACGCCCCATTG TTACCAAATGAAGAACCACCACATTTGAAATACACCAAAGTGAAGCGAAT CGATGGTAGCAAGTTGACAGCACAAAAAGTCCTCCAAGATTTCACAAAGA GGCGATTCATTGCTTATAATCCACGATACGATTTGGACTTATTAATTGTT CCTCCGCCCATCCCTGCATCAGACCTCCTCAAGGGCGGTCATCAATTCAA AGGAACTGAACAAAAAATGACCAACATTCGATCTCCAGTAGCCTCACcac aagaaaacaaaattcaaagcGAACGTCGATCAACAATTTACGGAAAACCA TCCAATGAGAGTCACTCCGATAAAGAGGACGAGGAAGTTTTTACGGAACC GAGAAGTCCTCTTGATGACGCAAACAATAATAATCACCATGACGataaca acaacaataacaaaactGTAAATAATAATTCATGGCCGCACAAGCCACAA ATATATTCAGGGAAAGGTGTCTCTGTGTTACCAAGCATCAAAGAGGAGCC GAGGAGCAATAAATTGGAAGATCAGATTAATAAGTTGAGACATGATCAAG AAGCGAATACGATTCCAGCCGTCTACCGACAACAAGACAGTCCTTACAGT GATACCAACAATAATAACGAAAACAGTCCCATGGTGGTCAGAGAGAATGC AGCTTCGCCGATTCCTATTGTTAGACGTACCGAACAGTATTGCAGTTAGA AATGCGtttccattttttccatttctaaaaactaaaaattttgaatttgt agTGAGTTTAGCGCGTCTTTATGTTAAATTTTGTAATCCTTAGGCTCGAA GTGGAGGTGTATTTACTTTACAGAGCAGAAGATAGATTAATCTTTGTATC AATGGTGATTTTTTTGTCACGTTGTCTTGTTGCATTTGGAGATTGGATTA TAAAGCCAGTTGCTTTTGTTATTGTATATCCTCATTAAAAAAcgtaaatt tttgaaactttgttgatatttttcctCTTCTTTTTGTATAGTTTACTAGA TAGatataattttgaaagtttttggatGATTAGACaactttgaaaatatt gataaataaataattcat Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000048:126098..137272- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00004779 ID=TCONS_00004779|Name=TCONS_00004779|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11175bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000048:126098..137272- (Clytia hemisphaerica) GAAAGATTCGTCACTTATTGGTAACTTTGGTAATGACAGAGGAAGGTAGA
TGACTAATCACGGAAAATTTGGAAAACACTTCAAAAATGAGTTCAAAACA
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TCATTCAAAGATTGCAAATTCCAAATTCCAAATCATTCCTTGAAGTTTCC
TCCCCTAACTTGTTTTTTATCAAATATTTCAATACGCTTTTTGCTTATCT
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GCTTTGGAGACTTAAAAGCATGCATTTTCTTAAAAAATTACATCAAAATG
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TTCTCCTAGAATACACCCTGTGTCACAGACCTGGTGGGACCCCCTACCCA
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CCTTTCGATTTTTTGACCTGAAAACAATAGATTTTCTATCCCGATTTGGA
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GCAGGGCAAGGTTAAACACTCTTGGGTTTTAAAACTATTGCCTTGAAGCC
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GTTTACCACTGGCCAATCAGAGAGGCTTTTGCTTTAAATTTCAGCTGTCA
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TATGAAGTAGATTTTCTTTAAATAGAAACTGAGTTACATCACCTTCAATA
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TAAATGTCTCGTTTTTCTGTACCAATTGCCAAATGAGAGGTCAAGTTTCA
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AATTGCGTGAATGGGCGGATTTTGTTGTGTGAATGGGCGGCTTTTGTTGC
GTGGATTTTTAGTTCGTTTTCTCTTCTCCATATACCTCAAAACACTCGTT
GTAGCTTTGAAACAGGCCGTACATGAACCAGTGAGTATGTCTACGTCGCT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00004779-exon-sc0000048-1575043694:137149..137272 | TCONS_00004779-exon-sc0000048-1575043694:137149..137272 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00004779-exon-sc0000048-1510915933:127388..128601 | TCONS_00004779-exon-sc0000048-1510915933:127388..128601 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00004779-exon-sc0000048-1510915933:126098..127077 | TCONS_00004779-exon-sc0000048-1510915933:126098..127077 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00004779-exon-sc0000048-1491911889:137149..137272 | TCONS_00004779-exon-sc0000048-1491911889:137149..137272 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00004779-exon-sc0000048-1491911889:127388..128601 | TCONS_00004779-exon-sc0000048-1491911889:127388..128601 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00004779-exon-sc0000048-1491911889:126098..127077 | TCONS_00004779-exon-sc0000048-1491911889:126098..127077 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000048 | supercontig | sc0000048:126098..137272 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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