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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00004776 ID=TCONS_00004776|Name=TCONS_00004776|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2244bp TCAGCACGGAATAAAGATGGATAGATTTTCAAAAGATCATCAATTCACAA AAGGATGTCACTGGGTTCCAATGAAGCTAAGGAGGCAGTTGCAACACTTC GTGATCGTTTGAAACATGGGCAAAACATGACCAAGATATTGGAATCACAA CTGGATACAGCGCAACAGAATATAAGTTTATTGCAAGGGCAAGTGCGTTT AGCCAACGAAACCATTTTGAACTTGAAGAAATATTTCACCGAAACGGAGA ACACTTTGAATGATTTGTTTACATCGAATCATTCCTCAAGAAGTTTTCAA TACAATGATGGTGCTACAAAGGAGCAATCAGATATggataaaaatcaaca aatgtCGAAAGTTGCTCGAGGTTCTACTAGATCACCAAGAACACCAGAGT CGATGGATACTAAGACACACCATGACGACAAACGCAGGGAGCGTGAGCAC AACAACAAATCACCATACGCACAACAATTACGTCAAGTTCTGGATGCTCT ACAAGACGAAGAGCCGAAGAAATCTTCACACACTCATCATCGTTTACACG AGAAAACAGAACCTTCAGAACACAGTCCATCACCTCCGCCTGCAGACCGT CGTTTGATGCAGGCTACAAAACATTATCACCATGAGAATGAAGGTGGTGC CTTTCAAAGACGACAACCTCATCCAGAAGAGGACTATCCAAAGATGAAAC ACCATAAAATGAACGGTCATCCTTCAAGAGAATCAACCAATGGGAACCAT CATGACCCAATCTCCCCTAAACCATCCTATTATCAACAACACCATTCTAA TGAGTTGTCACACGGTCATCATCAGCCACATCCTCATAGCAACCATTGCA TGGGACCATGTTGTCCCAGCGAAACGCCACCATCAAGCTACAAAATGATG GAGAAATCATATCATTATGGTTCAGATGAAAAACCGACACACTATGTGGA GAAATCACCAAATGGAGGTGTTCACTATattgctgtacattcaccagaga GCACTACCAGCTCTGGCAAACATGGCGAAAGACATCATAGTCATCATTAT GTTCCTTATGCTTACCACATCCCTGGTGAGAATCCACATAAAATGATACA CGAAATGCCACCGCAACCACTTTCACCGACAACCAACAGTGGTGGTGGGC GCCGAAAGAGGGCGTACGCCCCATTGTTACCAAATGAAGAACCACCACAT TTGAAATACACCAAAGTGAAGCGAATCGATGGTAGCAAGTTGACAGCACA AAAAGTCCTCCAAGATTTCACAAAGAGGCGATTCATTGCTTATAATCCAC GATACGATTTGGACTTATTAATTGTTCCTCCGCCCATCCCTGCATCAGAC CTCCTCAAGGGCGGTCATCAATTCAAAGGAACTGAACAAAAAATGACCAA CATTCGATCTCCAGTAGCCTCACcacaagaaaacaaaattcaaagcGAAC GTCGATCAACAATTTACGGAAAACCATCCAATGAGAGTCACTCCGATAAA GAGGACGAGGAAGTTTTTACGGAACCGAGAAGTCCTCTTGATGACGCAAA CAATAATAATCACCATGACGataacaacaacaataacaaaactGTAAATA ATAATTCATGGCCGCACAAGCCACAAATATATTCAGGGAAAGGTGTCTCT GTGTTACCAAGCATCAAAGAGGAGCCGAGGAGCAATAAATTGGAAGATCA GATTAATAAGTTGAGACATGATCAAGAAGCGAATACGATTCCAGCCGTCT ACCGACAACAAGACAGTCCTTACAGTGATACCAACAATAATAACGAAAAC AGTCCCATGGTGGTCAGAGAGAATGCAGCTTCGCCGATTCCTATTGTTAG ACGTACCGAACAGTATTGCAGTTAGAAATGCGtttccattttttccattt ctaaaaactaaaaattttgaatttgtagTGAGTTTAGCGCGTCTTTATGT TAAATTTTGTAATCCTTAGGCTCGAAGTGGAGGTGTATTTACTTTACAGA GCAGAAGATAGATTAATCTTTGTATCAATGGTGATTTTTTTGTCACGTTG TCTTGTTGCATTTGGAGATTGGATTATAAAGCCAGTTGCTTTTGTTATTG TATATCCTCATTAAAAAAcgtaaatttttgaaactttgttgatatttttc ctCTTCTTTTTGTATAGTTTACTAGATAGatataattttgaaagtttttg gatGATTAGACaactttgaaaatattgataaataaataattcat Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000048:126098..135568- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00004776 ID=TCONS_00004776|Name=TCONS_00004776|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9471bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000048:126098..135568- (Clytia hemisphaerica) TCAGCACGGAATAAAGATGGATAGATTTTCAAAAGATCATCAATTCACAA
AAGGGTAAGGATTGAATTTTAACTTGGGGATGACTTTTTCTCTTTTTCAT
ATATTTATAATTATATAATATTGGTTTCTTTTGATGTTTCATTTTTTTAT
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CTAACTTGTTTTTTATCAAATATTTCAATACGCTTTTTGCTTATCTTGAT
CCTGAGACGCTTCACTACGTTCACAAAACTTACATAAATTTTCAAATCAA
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TTTTGAATTTTTAACTTTATGGTTGAAATTTATTTTGACTATACAATTAA
AGCTTCGGTTAATTAGTTAGTCATTAGGATTTTATGATATTTTTTGAGTG
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CAGTTTTCATTTTCAAGAATTTCAGCTTTGATAGGAGGTTGGTACAGTAT
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GCTGAAAGCCGAGTTGACATACTGTAATGCTTTTTTTGTTGATATAGCTA
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GGTTTAACATACCTACTTCTCACAGTCACATTGGAAACCCTTCCCATTGG
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CCGCGCTGAAAATAATCCGATAAGCAAATCCTCACTGCAACGTATATTGT
GCTAATTTTTCAATTCCCACTGAATTTTTGGCTCGAAAAATATGGAATTA
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TGGAGACTTAAAAGCATGCATTTTCTTAAAAAATTACATCAAAATGCTCA
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TCATTTCCTACGAAATTGCATGCTCGAGAGTTCGCAAAGCATTGTATTCT
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GCACCACTCGAAAATTGACTTAGTTTTCAAAAATTGCAGTCCAAAACCTT
TCGATTTTTTGACCTGAAAACAATAGATTTTCTATCCCGATTTGGATTTT
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GCGTGAATGGGCGGATTTTGTTGTGTGAATGGGCGGCTTTTGTTGCGTGG
ATTTTTAGTTCGTTTTCTCTTCTCCATATACCTCAAAACACTCGTTGTAG
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ATCGATATTTATCTAAAATACCAGCTGATCTTACAAAGGTTGTAAAGGCT
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GTGCCATTATAAGAATTGACAAACGAACAAAATAACTAAATTGAAGCTAT
TTTTTGTCCTTTCATAGGAAGATGTCACTGGGTTCCAATGAAGCTAAGGA
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ATCATAGTCATCATTATGTTCCTTATGCTTACCACATCCCTGGTGAGAAT
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TTTCTTTCTTTCTCTTTTTAAACTGTTAACGATCGAAGAAACAACAAAAT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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TCONS_00004776-exon-sc0000048-1510915933:127388..128597 | TCONS_00004776-exon-sc0000048-1510915933:127388..128597 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00004776-exon-sc0000048-1510915933:126098..127077 | TCONS_00004776-exon-sc0000048-1510915933:126098..127077 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000048 | supercontig | sc0000048:126098..135568 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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