TCONS_00004565 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00004565
Unique NameTCONS_00004565
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1726

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00004565 ID=TCONS_00004565|Name=TCONS_00004565|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1726bp
CACTAATCAGTACAACTTGTCGACAACGCACTATTCAATACACCACACTG
GCTTTTTCTTCTCGATTTCAAaCGCAGAACCCATCGTGGTCGTTCGACAT
TTCACCTCACGCTTCGAAACCGCCTCACCTTTCACACTCGTCCGCGCTTC
CAATGACACACGCAGACCCTttgaacaacaacaacaacaacaacaacaac
aacaacaacaacaacaacatcaatAATAACCATCACCATCATCAACTCGA
TTCAGTGCCAGGTGAAACAGATTTGAACAGTGCTGTATCATCAGAAACGA
TGCCAGATTCCGAAGATTCCATTTTCAAAGATGACGAAGATGAGaaagac
aaaagaaaacaaaagaaacgagggatttttcccaaaatggcCACCAATAT
CATGAAAGCTTGGTTATTTCAACATTTAAATcaTCCATACCCCTCAGAAG
AACAAAAACGTCAACTGGCAAATGAAACTGGTCTTACCATACTTCAAGTT
AATAATTGGTTTATCAATGCAAGGCGGCGTATCGTCCAACCCATGATCGA
TGCATCAAACCGGGCAGGTAAATCACCGGTTGTCACAGTATATAAATCAC
GTAAACGTAAAAATTCGGGATCGGACAGTATTTCACCAGGACCTTTTCCC
TATCCACCAATGGGTGGCCATTATTCGGCGCCATATTTAAACGAACATTA
CTCTGGGATGTATTCACAATACCATAATGACATCACAGGAGCTTCAACGA
CTACACCGCATGCGCACTACAGTCCAAGGTCGTACGGGTGTGGCGCATCT
GATCAACATTCGATGGGTGTCTCTCTACCTCCACAAACCAGCTGTGCTCC
TATGAGACAGCATTCTTCATCTTCTTATGGAACTTATAGGACCTCCCCGG
TCCCTCCTACTCCACAGTCTCCCTTCTTAGGGCACACACATCCTTCAATG
ATGCCACCGTCTACGAATACGCCCAACCTTCATGGTTACCACCAGACACA
CCCAGCATCTTATCCGCCCCCTCCGCCTCACCAATACACGCCCCACGAAG
AACTCACGCCCCATACCGTTCATAGTGTTATGAATATGCATAATATATAA
CACTTGCCTCCCTTCTTTCTCCCTTATTACGATATAAATAGTTTTcacca
ttaattttttctgtgtGTTGTTTTTTATactattttttaagaaattttat
gTTGCTGTTATATTAAATAAATCATAGTTCATTCTCCTTAGGGCCATGTA
ATGGTCTggagaattttttaaaagaaattttaaccattttgttagataaa
aaaaagttaaaagcggTCGTTAATATATGTTTTctataatatttttaacc
taacTTCGGAGAATCGGTGATGAATATCCTTAAATAACATATTTTCACAT
TTTAGGAAGCTATTTCTAATGGATTCCTTTTGAAAATGCAATCGTTTGat
gtattttgagttttttaaattctaatttttcttaaaattccaGTTGCTTT
TCTGTCTTAActttaaattaattaaaaagtgcttaatatttattttatat
tatttcgcttgattttttaaagaaaatacttttttctgcttttagaaatt
tttgacCGTTTAATAATGGGCTGTAAATAATGATGTAGCTTTGtcctttt
tgtaattttaccaTATTTTAATTAAAAGCAAGAACTTTAGTTCTTACCTT
ATTATatgagaaaatttgaaatagaa
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000045:648923..662491-

Legend: exon
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>TCONS_00004565 ID=TCONS_00004565|Name=TCONS_00004565|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13569bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000045:648923..662491- (Clytia hemisphaerica)
CACTAATCAGTACAACTTGTCGACAACGCACTATTCAATACACCACACTG
GCTTTTTCTTCTCGATTTCAAGTAAGATTTATTATGTCTTCAATCTTCTT
TCACTCAAAATTGTCAGGTATCTTTTCAAATTCTGAAGACTAAAATTTCA
CTAAAGTGATTAACATCATAATCAGGGTGTTTGATCGTGTTACTCCTCCT
AGTATTTTGTTGTTGATCCCTCTGGGAAATTTTTGGTGTATTATCTGAAA
GATTTATCTTGTGTGGACTGCCTGTCACCGTTTTAACGTAAAATGAAATT
GTTTTGTCATAAGCCTTGATGATGAAAAGCGATAAGGGACTTGAATGTCG
TACAAGGAAAAAAATGTTACTCTAAAGTATTGTATTATTTTTGTTTAACA
TCATTGGGCTATTGGTCAGTAAAATGAGGTGGAAAATCCAGGGTGGTCAG
TAAAACGAGGTCGAAAATCCAAGGCGGTACAAAAAAAGAGAAAAACAATC
GAAGGACCCCCTTTGACCCCCCCCCTGACAAATTGAAATAAAATCCAGGG
TAAACATAGGGGGTACAAATCTTTCGGGAATTATTTAAATCGTTTCAAAA
TTTCAATTCGTGAATGTGTAGAACTATCATTTTAAGGTTGCCAAGGTCAA
AAAAATTTCTTTAAACGTTTTTTTTCACGAGAGAAAAAAATCTGGGCAGA
TTCTTCAGATCGATGCCAACCTCATTATATTTGTTTTGCATTCTTGGATT
TACCGCAATTTCAGAATCTTCTTCTTCCCAGTAATGAAAGAAAAAAATTT
TCACAGCAGGCATTTTTCAGTAAATGGATTTATGACATAATTTCACAAAC
CTTTCACTCAAAGAAATTTACAGCCAAAGGTAAAAAGGAAAAAAGATGAC
TTTCTCTCCACCTTAATGATTTTAACATGGCTTCAAATTAGATTAGCGTT
AAATTGATGACAGGGACGATTTTTTTCTCGTTATTCTCTAACTTCTCCTT
ATATTCTTATAAAACTTTTCATGGTATGGAACATTTTTTAATTTCATTAA
TTGTTTAATTTAATCAATGTATTAATATTTATTACATCCCTTTTTTTACA
CTACCCACGCATCTGACCTTAAATTTTTCATCCAGTTTTGAATCTTAAAC
TTTAGGAATTTTCAAATTCTGAATTATTTCATTTCAACTTCTGGCAATTG
AATTTATGAAAGTTGATTTGCGTTAGGTCTTCACCAATGTGAGTAGATGC
GTTTCTTTAAGGATGGATTAAAATTTAATTTTGCAACTACAGTCGATTCT
CTCTTATTCGAATTTTTCTGTAATTCGAACTATGATATTGGTTCCTCAGC
TGGAAAGTAGTTTAAATTACTCTTTGTGATTAAAACCTTCCTCTAAATCT
TTGAAGAATGACAACCGATGACAAGAAACTGATTTATAGGAATTTTGTTC
AGAAATTGATTCCAAGGCACATTTGAGATGTGGTAAGATATAATCCTCAA
GCTGGATTTGGGTAGCCAAAAAAAATGAAAATGTCAGAGTTAATTAAGCG
GTGGGTAGAAAAATGATTAAATTTCGAGACATCCCCACCATATAGTAGTT
TCTATAAATACGAAATAAAAAAAACTAAATTTAATGATATTCGTCTGGTT
GTTGTCATTATAAATTATTCTGAATGACCAATATAAAGATCATTTTCCAT
TTCCGGTGCTGGCCGAAAAAAAATCGCCTCTTTGGTTTTTGGCTGACATT
TGCTTTCTGATGCATACTCCAAATATCTTAATTGTTCTTTGTGTGTTCGT
GCGTCCGGATCAGAAGTCATTGAAGTTCGTCGCGATATTGAATTTTTTGG
AATAGAGTTTCACAAGGAAGATGAAGATATTATTTGGCTATCCAGTCTTA
GAGGTAAATCTTTTGATCCCTTTTATCTGGTCCTGGTTTTTATGTCCTTT
TGTCATGATCTGACATAACCAATCACACTAGCTGTATCCAATTGCGGTAT
GTATTTACAACGATTTCTAGATTTTGAATACAGCAAGAGAGGTTTTGGCT
ACTATTATCGGGCGAATATGGTTCATTATTCAATATCTCGTTATCTATTT
CTGAATAGATTAATACACCCACTTCTCACTGATCCGGTGGACCCCCTCCA
AATGGAAAAATTTACCAAAATATGGTCCCTTTTGAAAATTATATTTCAAT
TCTTGGCTGAAAGTAATCAAATAAACTAATCATATCGGATCTGTGAGAAA
AGGGTGTATTTTTTTGTATCTTACATTTCTTAGAGCACTCTATCACACCT
TTTCCTGTTAACCACGTGATCAATGTGGTGATTTCTTTAAGTTTGAAATT
TTCTGTCTTTCCTGGAGTTGTAGTAAAAGTAGTTCGTTTTGGGTAGTAAT
TGTATAAGATATAGGAACTGGAATAGTTTTAAAATTACACGCACCACAAA
ATTCAAACTTTGAGGTTTGAAAGTAAAAAAAATCTACTGATTCTAAACAT
TCTGGTCTAGCAAGATTTCTAGGCCGAATGAAATACAATTTCGTAATTTT
AAAAGAAATAAAATTGTTATTTTCGCCTACGCTTTTTTATCAGGTACTTA
ACCGATGCAACGCCGCCCACGTAATTACTCAGCAAATTATTTTACTTTCC
CCTTCTTCAATGCCAAGCAACCTTTCGAAAGTTAAAATGTAATACGTATT
TAATTTACAGTAAAGTACCTCTCCTGGTCTTTCCAATGGAATTGACGTTT
TCTTAATTTTTAATTATTTCTTATTCTGGGGGAAAAGCTTTCTATAAATC
AGTATTTCGACAATTGATTTAGAGATGTGCATAGATTTTCAGACGCGGTA
TTAAACTGAATTTAAAAATTCCAATGACCTTTTTCAAAAAATAATTTCGA
AATATTATGAAATATTTAACTTGAATTATTTTTTGTGCCAAAATCAATAA
AACTTTCTTCAGCCAATAGATCTAAAATAAACAGAATTTGATCCTTTTTA
GCGGTAATTTATCCGTTGAAGTGTTTTGTCTGTAAAATATAAAAGCTCAA
AAATTTAGGTCCGAAATTTTATATTTAAATTGGGTTAGCCAATTTGTTCA
AAAATTGCGTATACTCCATTTCAATAAGAACCCTTTGTATCTGAAAAAAG
TGTAATAAAATGCCATCATTTGATTGGATAATCATTTTGTAAACAATGCA
TATGATTGGTTGTCTGTTATCATTTAAAATCCATCTCATTTTCCCGCCAT
TTCATCATTTGATACTTAGATAGTCACACATGTGGTCGAGGCCTACTCAT
AATTTAATCATTTTTGACATTTTATAAACAAAGCGTTTAAGTTAATTGTA
GATGAAATTTTTAAAAAGATCCTGCAGATAAAATTTTGATCACTGGCCTG
CCACTGTATATTGATTTGTCATTGTTATTTGGTTACTTTTTGGAATCTCG
ATTGGTGATTGGTCAACCACAAGACAATAAATAGCAAGTTAACAAAATCG
TTTTGTGGAAATTTGGGTCACGTTAAATTCACTTCTCATTGTATATGTCA
GATGTCATTTCGCAATTGATTTGAAAGAGTCACCAATGTATTACCACGGC
AAAGAAAGCAAATATTGGGTAAATTGAAGATGTATTATTGATTTACACGT
TTTATTTTTTTATAAGAACAAACTATATAAGAACATAAGGCTTCGAGGCC
CAAAAATTTAAGAACATTCTAAGAACATTCTAAGGCTTTGGAGACTTAAA
AACATGCATTTTCTCAAGAAATTAGATCAAAATGCTCAAAAAATGCTGAA
AATAAGAACATTTTAAGAACATTTTTAGGCTTCAAATCCAAAAAACTAAG
AACATCCGAAGGCTTCGAAAATTTTTGACGTTCTTATAAAAAAAAAAACG
TGTAGCACCTTTTTTTACCCTCAAAACAAAGTAATGAAAGTGTAGAAAAA
AATGAGACATTCTAAGTAATTAAAGGTAAACATGGGGAATAAATTTGAGA
AGTTGTCAATGTAAACGCGGGGTAGAGATTGACTTTTTGTCAGTTTTCTT
TTTTTTCTGCCACTTTGTCAAGTTGTCAACTTTCTTTTTTTTATTGTATT
TGAAGGTCATCTTGTCTTGATTGATGTCTTCCAAATGTCCCTTTCTTTGA
ATACGTTTTTCACTATGTACATTTTGCTATTTTCTTCTACGTCAACTAGT
TGCAGTGGCAGAGTGTTGTTACTTTCTGTGTTCACATTGTTTTCATACCT
AAACCTAAAGTCATTTTGTGAGTCATGAACTGTATCGCAAATTAATTGTT
TTTGGAGTTTTTTTTGGAAGAATAGTGTTTTATTTTCTAATTCGAAACAT
GGTCGCAATGCTTGGATATAATTTTAAGGTATTTATCATTTTTGCAATTT
GAAATTTCGCTTCATGCTGGAAATTCCTTAATCTTTCAAAATCAATATTG
TTTTTTTTTTCAATAATACGCATCAGAACATCACCTAACATTTTATAATT
CTGATATATTTCTTCCCTGCTAATCTAATGAAAATCCTCAGCGCTGCTAC
ATCTTAGGTTCTGCAGTTTTCAAAATCTTTTTTATCAAATTTCGTCATCG
GTTGATTTAGTTGCAACATTTTGCCTTGTTTTTTAATGGGGTGAAGAAAT
TACGAATGGTGGTTCTTAGGACTTTGGCATTGTTGATAAAAAAATGTGTT
TTGTTTATTTGTTTCTTTTCTCGAGTAGAACCGTAGGAAATTGTTAAGAA
GAGGTTGAGTTTATTTTTCTAACGCATCGAGTTCATCTCTACTTCACGAA
CTGCAGCAGTGTGGAATCATTTAATTTGCCTTTCGTTACTTCGAGAGTGT
GTAGCTGCAGTTAATAATTGACAATTTTACGATAGTAGTTTGTTGTAATC
AAAAAAAACATTTTTGGAGTCTGAGGCTTAATTTGTAAGTTGTTCTCTGT
TATACTAAACTATGATATTTAAATGTGTACTTCTTCTGATTGGATTCAAT
TGACGTCATAACTCGGGTTTTTCATAACTCGGGTTTTCATAACTTGGGTT
TTTTAACTCGGGTTTTCCAAGCCTCTTTCAGTTCGGATTCAATTGATGTT
GTGGTGCAATAATACAGATCTTGACAAATCCCAGCTACATTAAAGTAAAA
GACCAGCACTGGCATTCCAGTCTACAATGTGCCGGATACCGATTCCATTG
GAACCCTCAATACTTTCATATCTTAATCTCAACCTTCTCAATCATCTTTC
AATCTGTTCATCAATGGGTTTGTTACTCTGCTTGGCTGGTTGGATTTGGC
TTTAGGTTTGTTGAAGTTGCTTGTCGAATAAATGATTCTGAGGGACCGAA
AGATATCTGCAACATCTTCACATGAAAATTTGTTTGCCTGTTTACTTACT
AAAAAAAAGCTTGAATAGAAAGAGCCCTTAAGAATTCCTTAATTCATCAT
CAACTTCTAATGTTTTNTGTTTTCCTGTTTACTTACTAAAAAAAAGCTTG
AATAGAAAGAGCCCTTAAGAATTCCTTAATTCATCATCAACTTCTAATGT
TTTTTCCAAAACACTAATGACGTCATGCTAAAGGGGCCTTTTCTCTATTA
TGAAAAACGTTAACCAAGTATGGTCAATAATTTTTCCTTGACTGGATAGG
TAGTAAAATTGACTAAATCTAAACTGCAACAGTTTAAAAATTTCAATTTG
ACTCTTCGCTGATTCAATCGAAGTGGAACGGGGATCTAATGTTTTTGAAT
TAAAAAAAGATTCGAATATTAGAATAAAGCATTTTAAGAGGGTTCCCTTT
GGCGCGGAATGAGGATTAGTTTGAATTATAGAAATATTCAAATACTAGAA
GTTCAAATTAGCAAGATTGTACTGCATTCGTTGGTATGCTGCGTCTAGTT
AATTCTAGGCCAATAAATGACTGTTTCCTCAAGAAATGCAATACAAATCA
TTTTTCCAGCAATCTAGCAAGGAACCTTGGCTTTTTTAAGGGTAAGAATG
AGGGATAAGCTGACGAAAATAAGAATACAGTTAGAGTGCGAAAAGAAGGC
CGTTATCCTTCTTTGTTGACAAAACAGGAAACCATCTCTTTGTTCTTAAC
ACCTTTCGTGTTACCTATATTTTTTTCTCCTTTTTTTTGCGTTTATTTTG
TTTGATACTTTGATCAGGTGCTTTTTCGTGCCTTGACACGAGCTTTTCTG
AGAATGATGATAGAACTTTCATATTTGATATTTGCTAAATGTTAGTCACC
TGTGGAGTTTTCAATTACGTAAGGGTTTGAGTTTTATTTTCCTTTTCTGA
TATAAAAATAATTTATAAAAACAATGAGGCTCAAAAACGACCAAAAGTAA
GAACAATTTTAGGGTCAAAGTAGTAAATATTAGGAAATTTTAGGTATAGA
GTACCTCACTTTTGTTTTAAAAACAAGAACAGGATAAGAACAATTTGAGG
CTCAAGGTACAAGAAAAAAATAATCTTCTGATTCCGCTCTGATAAAAAAT
TGGTTTATAACAAAAATTACCCAAATTATTTAAAGTGGTAAAGTTTTCGC
CTCATTTAAGTCACTTAAAGCTAAGGCTAAACAACACCTAAATTCTTCAT
TTTTTTATGAATCAAATTAATTGATTTTTTATTGATTGGAAAAGACCTCG
CGTGGAAAATAGCCCGTTTTCTTCCACAAATATGAAAGAAGCTTAGTCAG
CGGTATTGGTCTTGGTGTCCCAGCTCTCGGAAATAGCCTCTCATGGAATT
GTTGACTCTTCAACCGCAGCACTTCCTTCACAAAGGCTTGCAAATACATG
CATACAACAAAGCAAGTAAAAATTTGCGGCTCAAGCACTTTGTCTTATAT
TATATCACAGTGGTGTGCGAAGTCTAACAGGTTGGACCATTATTTCATGA
TATTCACCTTTATCTGGTATCGTTATTTTTCACCTATTTTCCTCAACTTT
GAATGTCTTTCAGGCCTCCTCTTATATACCGTGAAGCTTCATTCAAAAAA
GTTGGAGTTAGACTTAAATTCGCTTATTTTTTGAGTTGTTATAAAAGCAT
TTTAAGACTCTCTCGTGAAAGAATTCAATTTGCTTGACCCTTGACCTAAG
CTACTAAGCAACTATGGGATATCGTGCCAAGAGGAATTTTATGACTCCTT
TCTCAAAGACCACCCTATGCTTATAGATACAATAAGTAGGAGAGAAATTT
GTTCAATTTTAGAGGAAGGATCTGAAAAATTCGAATGAACCTTCAAGTCA
TTAAGTGATTTTATTGTTATTTTTGTCTAAATATAGTTATTACCTGTTTC
TAATCCGGATTCGAAATGAACCTCATCAAAATGCAAATATCCCCAGTTAC
TCGAGGAAGTTTGCAACTTTTTATTGTTATTGATTTTGACTTTAAAAAAC
CGCAAAATTTGTTTAGGAAACGGGAGAAACGGGAAAGATATCTGTTCACA
TGCGAGAGTCATAGAAAGAAATGCCGTAAAATAAGGGACTTTTTTCTTCC
CTTTTCTGTTTCTCCCTTCAGCACCCCTATCTTCTCTAAAGGCCGGTAAT
TTTCTAAAACATTATGCGGTTTAAGGCATTGTTTCCACTTCAAAATAAAA
GCAATTTTTTTGTTTTCTTATTAAACATACTTGTATTATAGTTATAAAAC
TTTTAGGGTATCGCAGTCTTTCAAGAAACTTTTAACATTTACATTTTTTG
TTTTATCCTTTGGGCATCAGGATATTGGTTAAATGGTTTCATTGGGTTTT
TAGGGAAGTAATTTGATTAATATAGCGTTTGGTGATCTTGAATATTTATA
AGGAGGAGCAAAAGAGATTTTTGTTTCATTCAATTGAAAGGGTTTGTTCG
TGTTTTCCCACTCACAATAAAAGGTAAAAAATTTCTTGACAGGTCCCATC
AAACATAAGATCCCTTGGTATTATTTCAAATGACAGAATTATGACAAAGT
GGTTTTTGAACTTGATGGTTTAGACTGAAAGTGCCTAGAAGCTGTTTTAA
CCATTGATTGGACTTATTTTTCTTAGAATTTAATGTTTCAGATTTAATTT
CATAATCTTTTGGAATTTTTCCTGGTTCCATTTTTTCTTGGCAAGGTTGA
ATTTTTTGAGAACTCTTCCTGAAGTATATAACAATATAATTAGGTACAAT
AGGCACAGAAGAAGGTTGAAATGAACTTGTCTCAATGTAATTTAGGTATA
AACCATCCCTGTATTTCGCTTAGTTCGCCAGCTCTCATTAAGAAGACCGG
TTGAAGTACAGTACCACTAGTTGCAATTAAATCAACCGAAGTCGTTAGAA
ATCAAAAGTTCAATCACAACGACCCTACCATTGGTGGATATACTTAAAGA
GCGTGTAAATATTGAATTACTTTTATTTTATTCAGACGCAGAACCCATCG
TGGTCGTTCGACATTTCACCTCACGCTTCGAAACCGCCTCACCTTTCACA
CTCGTCCGCGCTTCCAATGACACACGCAGACCCTTTGAACAACAACAACA
ACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACATCAATAATAACCATCAC
CATCATCAACTCGATTCAGTGCCAGGTGAAACAGGTAAATAGTTTTCTCT
TTATTCACTTACATGAACTGAACCTTGAGGAGTGGAGACCATCAAATGTG
GTGGATCTCTGAAGTTTCAAAATTTATGACGAAGGGTGTTTCTTTTATCC
ATACTCCTTATAAGGAAATAACACTCTCCCTCATAAAATCTGAAGCCTCC
TTCGATCAGCAACTGTGATCTATAATGTTTCCCGCCCGTCCACCTACGCC
ACAAAACGCCATAAGAACCGTTTCTAACCGTTTCTGTATATCGTCAATGG
AATGTTTTTTGAACATTGAAGCTAGTCGGCTCAAATCCACACTTTTTCGA
TATTCATTCAATCGATAATCAATCAATGGACATCAGACGATTGTATGTAA
ATCACCTTAGGTAGGAATCTCGTTGGCACCTGCTTCAGTCTGATGGGGAA
ATTTAACATTAAAATAAAAGATGAGCTTGGAGATTGATTCTCTGGTGGCG
AAAGTGAGTAAACCATCGCACGCAGGTTCATCTGTAGTTGTGCTCAGAAC
TAATTCAATTTGATCGTTGAGAATGAATAGTCTCCATTCACTAAACGAAT
GGCAACAGTCACGCGATGGGTGCGCTAAAAATTATCAGCATGATCAGAGC
TTCGAAATCAGAATGTATATTCATCAATTCAATTTGTTCTTTGTTAACAA
TCTAATAATCTATACTTATGATGGCCAAAGACTACACGTTTTTTATAAAA
ACAAACTAAAGAACACGAGGCTTTGACAGCAAAAATATTAAGAACAACTT
GAAAATATGTTGAGGTTTTGCCAGGAGTTTTGCGGAACCTTGAACACCCG
ATTTCTTAGGAAAATAGCCAATGTGGTAAAAATATGAATATGTTAAGAAA
ATCTTTTGGCTTAAAACGCAAAAATCAAAATCCGTAGGCTTTAAAAATTT
TGGATGTTCTTAAAAAAATGTGTATTTGAAGAACGGACCTATCCCAATCT
AAGACCACACCCATGTTCAAAAAATGTTTTCCTCCAGGAGTATTTATCGA
AGATTTGTTTAGATGTGATAGCTGATAATAATTCATCATTCATTTATTTC
GAAAGTTTTGACACTAATATCAAGTGATCACCTTGAGCTGCTTGATTGAT
TACAATCTATCCCTCTTTCTTTATTTTCTAATCCATGAACAGGAGGATTT
GGAATCCTATCAAATTAATATTTTTTTTTACTTTTCCCGACATTAAGTAG
TTTTGATCCGGCGACAACCTATTTTTTCTTCTCCAGCCAAAGTTCATAAT
ATCTGGAATGGGTTAATTTTTTACAATAAAAGTGGACGCTGAAATTTGAC
CCAGTGAATTGATAAATATACAACAGTAATATGCGTTTTTTTTTTTATAA
GTACGTCAAAAATTTTCGAAGCCTTCGGATGTTCTTAGTTTTTTAGATTT
GAAGCCTAAAAATGTTCTTATAATGTTCTTATTTTCAGCATTTTTTGAGC
ATTTTGATGTAATTTCTTAAGAAAATGCATGTTTTTAAGTCTCCAAAGCC
TTAGAATGTTCTTAGGTTGTTCTTAAATTTTTGGGCCTCGAAGCCTTATG
TTCTTATATAGTTTGTTCTTATAAAAAAAAAACGTGTATGCTTCTAGCTA
TACCAGCCTTGTTAATCTAATATGATTACACCATTACACAATTTTAAGAT
ATTAGATTACAATGGACAATCAATACCCATTTTCGATGAATTTGTAGGAC
AATAGAATTGTTCTCAAAGAGTGCTTAATTAAGCTCTTCATTTGATAGCG
TGAAATTGTAACCTACTACAAGTCCCCGTAATTGAATTTATAAGCCACAC
TTTCCTGTCACAGTTTCAAACAGATTCCATTTTAAATGATTGAAATGTCT
ACTAAAGACGGCGTGTGAATGAATGGAAGGTTGGTTTTCTGTGGAAGTTT
TTTAGAGGAAGAATTTTCTTTTGAAATTTTGCTTGTGATGAAAGGCATTC
AAGCGTGTGAAGTATTTCTTTCAAAAGTGTCAAAAAGTTTATTCGTTTCT
TGTCTTCAGGCTGTAAATGTTATCAGTTTTTCAATCAAAATTTCTGTTTG
GTTCAAATATGGTTCAATCAACATATTTTTGGTTCAAGCAGTAATTTTTA
GAAACTATTTTTGTAACAAGGTTTATGTTATAGTTAGTGTAATAATTCGT
AAACAAATGTTCTTCGCTATACAGCTGGTGCGAAAATTTTCGAACATCCT
GTCGTAAACTTGTCATATCGAAATTGCTCGTAGCTATTCAAACAGTGTGA
AAAGTGTCGAAATTTCATGTCGAAAATAAACTTGTCTAGGGATTATCTGT
CATTTGCTAATTATTTTTTTGGTAAATTTTTTTAACATCTGTTTACGGTA
AGTGGCATTTCTTGTCGTGAAAAACTGACAAATAAATTTTTTAGATGATA
CCAAAATAAAATTATTTTGTGAATTTCATTGATGGTTAGCTATATGGGCT
CTTGGTTTTCTTGTAAATTTTGTAGAAGAGTTTTTGGGTAGAAATCGCAA
GTTTAACCATCATGGGAGAGAAAGATGTTTATTGTATTGATAAAACTATG
GCTGTACTGTATAACATTATAATGTCATTGATAGATTGCAGGTTTGTTAG
CTTTGAAAATCGGAATGTGTCTTTTGTAGATGTTCTAAAAGAAGTTGGCG
TGAAAAATTACGGAGAATATACGTGAATGTATTTTTGGTCTAAAATGTGA
AGTTACAGTGATGGTAAATAGCCAAGCCTGGCTATTTCAAACGAAGATGT
GTTGATGAGACCTCGACCAGTAATCACGTGGTCAAATTTCGCCGTTAGAT
TTCTGTTGACCCTAAAATTGCACACTTTTTATGAAAAAAATTCTATATGG
AGATTGAGAAAAGTCACGATAAGAAAATTTATAAAATGTAACCCAAAGGA
ATTATTATCTTCGGTAATTAAAAAACGAATTTATTCTTCTTTCACCAGAT
TTGAACAGTGCTGTATCATCAGAAACGATGCCAGATTCCGAAGATTCCAT
TTTCAAAGATGACGAAGATGAGAAAGACAAAAGAAAACAAAAGAAACGAG
GGATTTTTCCCAAAATGGCCACCAATATCATGAAAGCTTGGTTATTTCAA
CATTTAAATGTAAGCAGTATATTCAATATCTCATTTAGGCTTTGCGAAAT
TGAATACGATTGTAATTTTCAAAACCACTCTTGTTTGAGTTGATTCTACT
CACATGTTACCTACTTAGGCTCATTAGTTTGGACTCCCACAGTAATAATG
TAATAACTAAATTGATGCCTAAGCAGATTATTCACGTTAAAGTGTTACCC
CATCTATCAATGCATTCATGAACCTATCTGCCGCATCTGTAACTGAAACT
TTTATGAATATTTAACACTTCTTTTTTTTCTAGCATCCATACCCCTCAGA
AGAACAAAAACGTCAACTGGCAAATGAAACTGGTCTTACCATACTTCAAG
TTAATAATTGGTATGTTTTCCAACAATCTTTTAACAACCTGGCTATTCGT
AAACGATAGACAGTATTCCGGTTCTAGAAGGCTGCCCTGTCCGTAGACGT
CAAATTTCATTTTTTTACCTTGCGCTGTAATTTTACATAAAACTATTTGT
TTTTTTTTTAGATTGACGATGTGCTCAAGCGCTAAACATTGAATTTCAAA
AATTTTCATCATCTGTTGAAACTATAGTCCCCGATCAATACTTTTCTTTT
CCCTTTTCAGAAAAGCTTATCATCGTCAATATTTTTTCATATTTCATGTA
GGTTTATCAATGCAAGGCGGCGTATCGTCCAACCCATGATCGATGCATCA
AACCGGGCAGGTAAATCACCGGTTGTCACAGTATATAAATCACGTAAACG
TAAAAATTCGGGATCGGACAGTATTTCACCAGGACCTTTTCCCTATCCAC
CAATGGGTGGCCATTATTCGGCGCCATATTTAAACGAACATTACTCTGGG
ATGTATTCACAATACCATAATGACATCACAGGAGCTTCAACGACTACACC
GCATGCGCACTACAGTCCAAGGTCGTACGGGTGTGGCGCATCTGATCAAC
ATTCGATGGGTGTCTCTCTACCTCCACAAACCAGCTGTGCTCCTATGAGA
CAGCATTCTTCATCTTCTTATGGAACTTATAGGACCTCCCCGGTCCCTCC
TACTCCACAGTCTCCCTTCTTAGGGCACACACATCCTTCAATGATGCCAC
CGTCTACGAATACGCCCAACCTTCATGGTTACCACCAGACACACCCAGCA
TCTTATCCGCCCCCTCCGCCTCACCAATACACGCCCCACGAAGAACTCAC
GCCCCATACCGTTCATAGTGTTATGAATATGCATAATATATAACACTTGC
CTCCCTTCTTTCTCCCTTATTACGATATAAATAGTTTTCACCATTAATTT
TTTCTGTGTGTTGTTTTTTATACTATTTTTTAAGAAATTTTATGTTGCTG
TTATATTAAATAAATCATAGTTCATTCTCCTTAGGGCCATGTAATGGTCT
GGAGAATTTTTTAAAAGAAATTTTAACCATTTTGTTAGATAAAAAAAAGT
TAAAAGCGGTCGTTAATATATGTTTTCTATAATATTTTTAACCTAACTTC
GGAGAATCGGTGATGAATATCCTTAAATAACATATTTTCACATTTTAGGA
AGCTATTTCTAATGGATTCCTTTTGAAAATGCAATCGTTTGATGTATTTT
GAGTTTTTTAAATTCTAATTTTTCTTAAAATTCCAGTTGCTTTTCTGTCT
TAACTTTAAATTAATTAAAAAGTGCTTAATATTTATTTTATATTATTTCG
CTTGATTTTTTAAAGAAAATACTTTTTTCTGCTTTTAGAAATTTTTGACC
GTTTAATAATGGGCTGTAAATAATGATGTAGCTTTGTCCTTTTTGTAATT
TTACCATATTTTAATTAAAAGCAAGAACTTTAGTTCTTACCTTATTATAT
GAGAAAATTTGAAATAGAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_002564XLOC_002564Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00004565-exon-sc0000045-1575043694:662421..662491TCONS_00004565-exon-sc0000045-1575043694:662421..662491Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004565-exon-sc0000045-1575043694:653908..654106TCONS_00004565-exon-sc0000045-1575043694:653908..654106Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004565-exon-sc0000045-1575043694:650783..650943TCONS_00004565-exon-sc0000045-1575043694:650783..650943Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004565-exon-sc0000045-1575043694:650432..650508TCONS_00004565-exon-sc0000045-1575043694:650432..650508Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004565-exon-sc0000045-1575043694:648923..650140TCONS_00004565-exon-sc0000045-1575043694:648923..650140Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004565-exon-sc0000045-1510915933:662421..662491TCONS_00004565-exon-sc0000045-1510915933:662421..662491Clytia hemisphaericaexon
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000045supercontigsc0000045:648923..662491 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0	1.27274e-05	1.11972	0.87443	4.11347e-05	0.00291132	0	1.76769	3.41478e-05	0	0.441553	0	6.64999	5.54174	0	0	3.00408	3.75639	1.66638	4.43942	6.10369	0.000683259	83.3703	43.5005	0	1.79389
Blast
[Close]
BLAST of TCONS_00004565 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: ME3L1 (Putative homeobox protein Meis3-like 1 OS=Homo sapiens GN=MEIS3P1 PE=5 SV=2)

HSP 1 Score: 135.191 bits (339), Expect = 1.609e-35
Identity = 59/73 (80.82%), Postives = 66/73 (90.41%), Query Frame = 3 
Query:  369 RGIFPKMATNIMKAWLFQHLNHPYPSEEQKRQLANETGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDASNRAGKSPVVT 587
            RGIFPK+ATNIM+AWLFQHL+HPYPSEEQK+QLA +TGLTILQVNNWFINARRRIVQPMID SNR G+    +
Sbjct:  165 RGIFPKVATNIMRAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRTGQGAAFS 237
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00004565 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
ME3L11.609e-3580.82Putative homeobox protein Meis3-like 1 OS=Homo sap... [more]
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