TCONS_00004413 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00004413
Unique Name	TCONS_00004413
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2124

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000044:453823..467156-

transcript sequence

>TCONS_00004413 ID=TCONS_00004413|Name=TCONS_00004413|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2124bp
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TAAAgGTGGTAGAGAAAGAACCGGATGAAAGACCGATGCATCTGATCAAT
GTACGAAAAcgaccccttctcacagacccgAATGGAACCTCGTGGATAGT
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AATATAATAATGAAAAATGATATCAAAAATAATGGAACGAAACAGCAAAC
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TACTATAGTGGAAGAATAGTATATAAAGtgacattcaatttcttatccAA
TACATTTAGGCGTGATCGTTTAAAACAGTTCTTTAACGCCTTACCAATGA
ATGCTGTTGTTTTAATAACCGTCAATAAGAAATGCGAAGCAAAGATCGAC
CAATGGTATGATTTCTTATTACAACATTCGAATCTGGTTTTATTGAATAT
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GGGGCATTATTTCGACATCGCATGCACCGATTTATCGTTATAAAAGTGAC
GCACACCAAGGCGCGATACAAGAAGACTATCAACTAGTTTTAGATAACGA
TAGTGGTAATTTCAAGACACACAAACAAGAAGGGGGTACGACTGATGACC
AAAAGATTTTCGTTATTGTTCTCGTAGTTTCAATCACaggtgtttttatt
attttcattgctGTCATCTCATTGGTCTATTGTTGTAAAAGGAAAATGGC
AGCCAAGAAGCGAGAAGAAGATGAAAGATTATCAAACCGAAAACGATTGA
ATTGGAAAATCGATAATTGGTTTCGACAACGCGAGATTGAAGGGATAAAT
CGTAAAATTGCGAAAGTGAACTCGTTAAGTGGAGATACAACTTTAACTCG
TAGTCTCAAAGAATCGGTGCGGGATCGGAATCCATATCACCAAGGCGACT
TTGTACGAACCTCCATTTCAACACCATCCGTCGTTGATTTTCGGAATCAC
GATTTTGCatacgaaaatatttttgatcccgATGAGATATCGCTATCAAC
TCGTTTTACGACGTTATCACGAGTTTATCCAGATAATATAAGTAATATTG
CTACCATAGCAACACCATATGATGCACAGGACCGATGGTTGTCGCCTTTC
GATGTAAACAGATATTCGGCGAGACGAGAATCGTCGGATCAATTTTCAAC
GCTGACGAGTAGCGACTTTTCGAGCGTCTCGCAACACAATACAATCGATC
GTTTTTACGTCCGAGAGCACCAAACCTTACCACGTGGGCTTCAATGGTTG
TCGCCAGGCACTCGCCGACAAATATTTTTCTCGGCAGCCGACACAGAAAC
GAAAAACGAAAATGGAAGATTGTCGGTAAACGAGGATAATCGTTTTTCTG
ATTATTATCGTCATGATGTCGATGGTCATTTACATAAAACGCCAATGAAC
GGGAAAGATTTCACGCCGCCGGCTTACGTAGCTCGAAATTCCCGGAAGAC
GTCGTCGAATTCCGACGACGGTGAATTGTCGGACTCTGGTAATTATTCGG
ACCCAAGAGAATTGGATTCTAGCACGCTTTCGTTGTTCAAAGATGAATTG
CTGAAACGAAACTCGAACGCCTCTTTTTATGAGATCGCaacaaaagttta
aaatcgaaaaaaataaaaatgagtttGGGCATTGGAGAAATGCTGGAAGG
CGAGAAGAAGCcactattgaaaaattgaaaaattgaaataaagacGCTTG
CCTAATTACAATAGAGCAAATAACCCTCAACTTGATCAAACTTGATGAAG
ACTGAAAACTCCTTTACAAAGGATCGGGACGGAGGCACATTCATTCACCA
AGTGAGTTACATCACCCAGTGGAAATCGAACCCCAACCTCCTTGACGGCA
GTCAAAAGATTTATAAAGACTACACTACTGTGTTCAAAATTCATGCTCTT
GTGAGCGTACATAACCTTTTAGTT

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000044:453823..467156-

Legend: exon

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>TCONS_00004413 ID=TCONS_00004413|Name=TCONS_00004413|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13334bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044:453823..467156- (Clytia hemisphaerica)
TGAGTTACTGAACCATAAAATGAAAAGACATTAACCAAGATGGACAAAAG
TAAAGGTAAGAAAAAGAAGAAAACTTATCTATTTCAGTAAACCTATTCGC
TTTTATTGTACATGCATTTCCTACCTTGTGAAAACCGAAAACAAATCTAA
AGGGGAATTCGTCTAAGTTAAATCTTTAATCAATTGTTGAGTTGAGTTGT
GTATTTTCTTATTTCTATTTCAATTCTTATTCTTTTTAGGTGGTAGAGAA
AGAACCGGATGAAAGACCGATGCATCTGATCAATGTACGAAAACGACCCC
TTCTCACAGACCCGGTAGGATATTTTCATCCAGTGGGGTTAAAAATAACG
GACTGAAACTCTGGAAAGGGGTGTATGAAAGGGAGCGCACCGATTAATAC
TTCCAAACCGACACCTACACACAGTTGGTTAATATCCTAGGAATTGCTTT
AAAATTTCGCATCTTTCTATGTTATGATGTAATCAATATGCGGAATTACA
TTTATTCTTCCGGGGGAGTCGCCTTTAATTTCGCGAAAAAGCCACATCAT
CATTAGCTGAAATTTATGCTGATCTGTTTTAAATATTTTTCAATATACGA
TTTGATGTTGATTGATAATAAATACTTTCACTTTCCTTTACTTTTAATTT
CTCTTGTTAGGGACCAATCAACTTGAGTTGATGACAATAAAAGCAACAAT
TACAAATAAACTAGAAAGGTATTTTTCTGAAATCCCATATTGAAAATTAA
TTCTTCCATCTTTAAGATTTTTGTTAATGTTTCTTCACATGCTAAGTAAT
TAATTCAGTTCTATCCAGTTTATAGTCATTTTTTCTTATATACAGCAGAT
AGTACAGATTCCTTTGGCGAAACTATTTTATGCAGCAACGACTTTTAGTA
TATAGATTTCATATGCCATAGACGGAAATTTCTCGTGCAATATGGAAATA
TTTTACTCGTCCTATATTCTTTATCCGTATATTAAACGGAAAAATTTCGG
AAGTCATAAAATATTTCTCATATTGCAATCGAAGTTGTCTGATATGTTGT
TCTAGACAAATTTCTCCTCAAGACTCTCGGATGACTTTGAATTGACGTCA
ATAATTTTTTGACGACATTGAAGATTACCTGTTTAGTCCATTGACGATTG
CGTTGAGTATGAAACTAACTTAACTCGTTTTCTTAACTCAAAACTAATAT
TTCATCGTGAAACGTCTCTCTACAATAATAATTTTGGGTGTGTTCATTTC
TACAGAATGGAACCTCGTGGATAGTACTACGCAATAAACCGAGAGGTTAC
AAAGAAAATATTGATATTGACTGTCAATATAATAATGAAAAATGATATCA
AAAATAATGGAACGAAACAGCAAACAAACAAATTAAAGGTATTTCCGTTC
ATTTGAATCATTTTTCTTCCTGTATTAAACCATTATGAGGTGTAATGACT
TTCTCACATATTAGCCCCGCTATGGGCTAAAGGTATTTCCGGTACCCTTA
ATTACATAAGCATAATCTTTCCTCGCTCACAGACTTGTATATCCCTGTTA
TCGGCCTTTATCATCACGTCACGCAATCACGCCTCAAATGTTTGCCAAAG
TCAGTCGTTCATGGTGTTTCAATAAAAATGGCTCGCTAAAAAAAATGATT
GCTTTGGGAAATAGATATTATTATCTAGAGATATCGAAATCGAGATTGTC
CTTGGGTTATGGCGCTCTAAATTAGCGATGTCGAGAGGCTATTTTATGTC
AAACATGGCCCCAATAAAATTGACATAGGCTCACGTTTGAAAGATCTTCA
AATTTAGAACGACATAGTGTCAAGAGTTAATTTGATCCAGTCCCGGAATG
ATAATTTTTTTTCTGGAAGAGCCTTATCTAGCTACTAACTTACGTATTGC
CTATTTCCACCTATTCAACTATTACACTGAAACTCGGGAATCATTGAGAC
AATCCCGATCAGGTCATCGGGCTAACCGCTGAGAGTAACTATATTTTATA
AATTGAAAAAGGCTAAAACAAAACCAAATTTCTAGTTTAAGTAACTGTTG
TAAGGTTGGACAGATATTTTGATAAAATCGCGAGGACAGGCTGTCATCAG
CATCAATTTGGCAAATTTTCAAACATCAAAAATATGCAAGTTATTTTAAA
GCAATCCATCATCATTCCAAGAAAATGATTAACCATACTTCTTCAATTAA
GTGATTGAATCAAAATAGTTTAGAGAACATTAAAAAACACACCACATTTT
TACTATACTAATGCAGTTGCAATTTGTCATGTATTTATTTCGGTGTTGAC
GAGATGAGCTGTGGTGTGGGAGTGATTGTGAAAGTTTTATGTAAGATCTG
TGGTAACAAACTTAAGCTGAAAGTTCACCTTTCTAAAGTGACATTCTGAC
TATTATGCGTTGTGAACGAGATGAAATGATCACAGGTGTCAGGTGTTGTG
CAATGTTTACCTCATAACCTTCTATGATAGTATACCGTCGTTATTTCCGG
TAAGATCCCACTTCCCGGACTGAACTTCCTCTGTCACTTTCCAGTGGAAA
AAAAAAACCAAAACTCTGGCTAGTTGAAAAATGAACTTGGGAAAGTTAGC
CAGTCTTCTAATTCAACACAAGGTTTATCATGTACATTTTAAAAACCCTT
TAAAAAGTTTTTCAGCCGATTATCCTGGGGAAAACAGTAGAAATATTTTG
GGAAAGTTGTGGAACTTTTTGTCCGGGAGGTAGGTTCTTTGTCCTGAAAG
TGGAATCTTAACCGGAACGACGGTACAAACTTTATCGATCAATATTTGTA
TCTAACGTTGTCTTTTAAATGGGAAAAAAGGACAAAAAGACGCAAAAATC
AATAAAAAAAGTTTCGGGTAAATGAAATTTACGATTTGAACATCTTTTTG
TTAAATGCAACACACGAAGAACACATTTAGCCCTCTCATTTAAAAAAAGA
AATTGGGGTCTTTTCTTATTTCTGATAAAACATCAAGGTGTCTCGCGATA
TTTTGAAACGATGACTGAATTATATGAAATCCTTTACATTGCGCTTATAG
AGTTTCGTTTTCGCTAAAACAAAACTGACATATTCTTGAATGTTTCAACA
TTTGTAAATTAAAAACATAAGAATGAGCCACTTGATCTTTTGTGATTGTT
CCTATAATAAAATACTAATGGATACTTCAAATATCAAATTTTCTAAAGAA
ATGTGATTTGGGTATTGCTTTGTTTTTGCCAGGTAGTCGATGTGTTAGGG
GATTCCGTTTCTTGGTTACTATAAATGTGTCTTTGTGGCGAATCTTGACT
TTTTCTTGTCTTGTCTTTGAGTTCTTATAAAATAGTGTTCTTATAAAAAA
TCATTCCACTAAAAATCGAAAACTAACATGTCATCTTATTTTCAAAAGAC
AAATGACGTAAAAAACAACACATGAATTCGTTTTTGTAAGGGTGAGTCTA
AACTTTTTCTTCTCTTTCAGTTCCTATAGAGTAGTATTCTTATTAAAAAC
ACATTTAAGACATTCTTTTTATACCGAGAGGAGGTGCGCCACTTATGCTG
ACAAAGCAGAATAAAGAAAAGAATTTTTCAAAGTTTGTGCTCGCGCGGAG
AAAGGGTTCCAAATTTCATCACCCAACCGTCACCGGTTGCCGGGGAACGG
GCCGTGCAAGGTACGGCGCGGGACATTCCCGCACGGACAATTGCCGGTCC
GTACGGTGTTTTCGGCGCGAGAGGGATATAAAGTTGGCCTTTCTTTAGTT
TAGAAACATGCTTAGTAAGTAAATGTTTGGAGATACGTTAAATGTTGTCC
TTGAACAAAAAAATTGAAAAATAATATGTCATTTCATTTTCAAAAGACGG
ATCACGTAAAAAAAACAACACAAAAACAAAAATTGTTGAACACAAAGAGT
AGCTAGGCAGTAAGGTAGTAAAGCGACTTTGTCTGTTGTCTATCTATCAT
TGTTCGAAACTACCTCAATGATTTCCTGTGACTAATTACCTTACTAATTG
CCTCTTTAACGATTCCCGCTTTCTACTCGACTATCCACTTCTTTTTATTA
TTATTTTTCACTTAATACACATAAGAACAATAACAACAACTATAAAATAG
ACTACATCTCCATCATATACAATTTAACTATTTGCTATTTGAAAGATTTA
CCACTGGCTATCACCAATACTTGATCTTTCCAATTTCGATGCACCTTCAA
TAAATTTGTTACTTTTATTTTTATGGATATTTAGTGACTTTCACTTTAAA
GTAAAGTGGTTGTTACATATTTATTAAATGGACTGTTAAAGACAATTTGC
TGACTCGACAAAATGTGTTGCAGTAATGGAATAACTACAGCGAAGAATTG
TTGGTTGTTTTTCATTGTTTTCTTCGTGGCGTTTTGTCTTGGAAATCATG
GAAGATGCAACGCCCTTATCAAAGGTATGAAATGGTTTTATTTTAGAAGC
TGCTAGAATTGTTTATGTGGAGGCGCTGTTACTGTATTTTCAGTTAAGAT
CCTATTATCAAATCCAAACCTCGAAATCAATAGCTTCTATCTGCACGTTC
TTTGGATGTATAAATATCTGCATCGTTGAGGGGGCCATTGTATTATTTTT
CGTCCCGTATATGATTACCGAAGAAAGAGTCAATGAAATGAATTCATTTT
TCACAACCTTACTAAACTTTATAGGTCACGATTTTGAAGCAGTCCCTTAC
TCGTAATAAGTTAACTTAAACTTAATAGGTTATAATGTGACAATTCTTAG
ACTTTTCATGGAGCCTGGTAGCGAGAGGTGGAGACTTTCCGTGTTGTTTA
CTGATTTTATTTCATTTTATTGGATTGATGAAAAAAAGCTGAAAATTTCA
ATTCCACTGTGTAAAACAATAAGGAACTTATTTGCTGTACGCAGGTTTTA
TTGATTCCCACTGGTATCTCAGCCAGTGGTTAATTAATGACCGCTAATAA
ATCAACACCGTCACTTTGGAATCTTATTAGGTCGATGTCTTGTTTACAAG
ATAAGTCTTGTATTCATTAAGATGACAAGTCTCCTTAAATATTCTTTATT
TGAAAGTATTACTGGGTTAACGATAGTTTACAAATTTAATTTCAAATGTT
AATACTTTTAGATACACATGGGTAGTGTATTTTAGAAGCCTTTTTTTGCA
AGGTTATTAGGAATGAAAATCTTAAAATAAAACCTAATTAAAATTGATTC
TGAAGTTTTGGATATACTTTTAGCTTTCTTCTCAATCTAATAAAATCTTA
CTANAAATTGATTCTGAAGTTTTGGATATACTTTTAGCTTTCCTCTCAAT
CTAATAAAATCTTACTAAAAAAAGTTTGTATCAAAAGTATTAATTTAAAT
GAGTTTATAATTTGATGAGTTTTTACAATCTTTTAAAATCCTTTAAAAAG
TAACCGTTGGCAATGATTTGTAGGTCTACTATAAAATATGTTTTTTTCTA
TAATGAGTATATAATCTTTATAAGGAAGTTGGGAACGGTAATTCGGTTAC
ATGCAGACTCCATTGAAAAGCAATTTTCAATAATGTTCTTTAGTGATTGA
ACGTGCGCTGATTTTCTTTAGAAAAACCGGGAAATGTATTACTTAATTCG
GATTAAATTAGATTAATTCTACAATCAAGTTCCGTCATTTTTTAAAGTGA
CCTTATTATTGTTTTTCATTTTGTTCTAAATTCAGCGAAATTCGCATTAA
TTTGATAAAGCCAAATGAACGAAAATTTACTTGAAATACCATAAGAATGT
TCACAACGTTCATATAACGTTAGATGAATGTTGAAGCAACACTGTGTACC
CGGTGGGTTGCCTTGCAAATTTTATTTCCGTCAGCGGACGTAGACCTGAA
TTACTGGCCGAAGACTAGCGGGCACCTCACTATAAACTGGGGTTTTTTTA
TCTTGTTTCTCAATGAGTTCCATACTTTATGACGACTTTTGGAGTGACGT
CAAAAAATCGAATGCTTGGAGCCCTAAAACCTGGGCTCAAAACATTCGAA
AAAGTAACAAAGTGGAATTTTTGATGTCGAAAATTCTCCTTTTTTCGAAT
AATAAAACAAAAGTAATGGAAAGTAGTCGTCAATATTACATGAAAAAGTT
ACAAATGTTAATCAATATAATTTTCAAATTTATGTATAAGGGATGTTTTA
TGCTACCCACGCGCTAAATGGACATAGCACGTATTTTTCGTTCTGTTTGT
CAATTACATTTGATATTATATAATTATTATTGGGGAGAATGGAGTATAAA
GTTTCCTTCCTCTGAAGTAAAAGTTTTCAACATTATTGTAACATTGTCAG
GAAATTTGAAAAGCCCTTTTTTTGGGTCGATTATGTCTTATTAAAACTTT
GTTTTATGGGTTTTAAACTATGTCTTCTAGTGCAAATAGCATTGATTTTA
AATTGACGAAGGACCAAAATCGACTATTTTTGTATGATTTTCTAAAGCAT
ATAATTCAAATTATCTATATGTTCTTTTTTCCATGAAACAACCACGTGGT
CATATACCTTGGTCGTCTTTTTGCGGAAAGCACTTAAGAGTTTTCAATTT
GTAAAAAATCATTTGGTAGGCCTACGGTATATCCGTATAAATCTTAACTT
GCTTGACCGAAAACTCTAGCCTCGTTTTTGCTTGTTAGTAACCCTTAATT
AGCTAGGAGCCAGCGAATTTCAAAAGTATTGCTTTTTTAACATACTGGTA
TTAAATATTGCAATTGGCATTTTTTCGCTAATTGCCATCATTTTCCGACA
ATTAGACTTATTAATTCAGAACTTCATTTCGCTTGCAGTTAACGAATGAA
AAACTTTCTTCGTTTTAAATTGATTAGAGGTTAGATGTCATTTTGGCCAC
CCCATACCCTCCCAGTAATCTTCAAAAAAGGCGTTTTATTTTCGCTGCAA
TAATGCTTGTCTCAAGAGAATACAGTAACTTAGTAATGATAAAATAGCTT
CATTAATGACGTGTATATGTACGACTCCAAGCTCAATTTCTCTTTTCTGA
AAATGAAAATATCTCAAGATTTCATAATTTTTCTTATGCTAGGCCTTCTA
GAAGTTCAATTCATTCCAGAAAAAAAAATTGGAGGTTTTCATCTGTGTTT
TTCAGGACTTTATCACTACTTTTTACTTTAAGAAGTCCAGCCAGCGCCTT
ATATAACAAGAACGCTTTAAAAAAGGCTTGAAAAATGATCTGGCAAAGTT
AAATACAAAGTGCTCAAGACGATGTTTGCTTATGAAGTAATACGCAATCT
AGCACGTTCAAATACTATTTCCTTCAATTAGTGGGCGCTCTTAAAACCGC
AGTATGTACAGTTCAAAAAGGGCTGGCCGTCTAAGTCTTTGATTGTCATT
CTCTTTGACCTCATTTTTACTTTTTCTTTGGAAGCAGAGCAGTGACTTTG
CATTGATAACGGAACTTCAGAAATTTGGCAAAAGAACTAACGAGACCGTC
ATACAAAAAAAGTGTTAAAAAGATGACGGTTATGCGAAAACCGTATGCCG
GATCTTTAAATGACTTATTAATGACGGCAACAAGTGAAAAAGACGATAAC
GACGACGTCATTTTTCATTCGTCATTAAGTGTGCACTGATATATTGTGTC
GGTATTTATATAATGTTTTTTTGTTATTGTTTTTCTTAAAATTCTTTCTT
TTTATAAGAAATAGAAGAATATGTTCTTCGCCTACTCAGGGACTCTATCT
ATCTACGTAATACATTTTCCATTCGTCTCATTAAGCTAAGGATTTTTGAC
CTTGCATATGAAATATGTAAGGTCGACTATTTAGTTGAAAAAGGGACAAT
CTCAAAGTTTAAGGTTAGCAAATATGTTAGTTTTTCAGACATTATTTTTG
ACATTTGGCCTTTTGATGTTAGTAGGTTGATATTTTATTGTTTTCATTTC
CCGACATGCATACCTCGGGAAGACTTATATTGCATAATAAAGCTATCATT
CTTCATTCCNATTTCCCGACATGCATACTTCGGGAAGACTTATATTGCAT
AAGAAAGCTATCATTCTTCATTCTATTATTTTGAGAAATCTTAGAAAATA
ATTTTTATATAGACTTAAGGAAGGATCGTGTAGGAATGATATATTTTCCA
ATGTGCATCCTGGATTCCATTGAATACAAGTTTCTATTTTTGATATCGGA
TCGTTAACTTGTGTCCACCTAAACCTGATAATTACTGACACTCAAACAAT
AGCTAGGGCTGAATAAGAAAAAAATTAATCTCCGTCCAGATTCTGATTAC
TCTGCGTTGGCACGTATGCATCCTAAAGGCAATGGCTCCGTAAGAGCCAT
TTAAAATTTTTTAAAGTTTCTGCCCCCAAAGTAAGAACGTTTTTTTATCC
GATAATTTTGTAAGAATCCATTGAATGACTGGATTTTAAAAACAAACATA
AAAATCGTCAATTTATTTTTTGATGTCATGCACAATATCCGCAATTATTT
AAGATATGCACCATTTTTGTCTCACAAGGGCCAAAAGTGACCAAAATTTG
AACTTGTCATACATCTGAGATGAGAAACGGATGTAAAATCGTACTTTTCT
TAGATTTCATTTTAGTCTTTCAGCATTCTTTTTAAGGAGATCAAATTAAC
ATGAATTCGAATCACCATTATGGAGTAAAATTAATTGGCGTTGCTAGATT
TGCGGTCTACTAAGCTGAAAGCTTTTCGCCACCGTTTGCCAAACACGTGT
TTTCTTTCAGTAAAAATTTGATTTATTATTTTGAAATTACGCACCACGAA
ATTATTTTCTGCCAATGACGTTATTGGGGTGAAAACGTTTTAATTGAAAA
TTCTTACGTGGGATATTATTTCGAAATTTAGCTTTCATCGCAAAAAATAT
GGAAAGGGACGTTTTTAAAGCATACAATCTTCACATTTACTTTTAATTTA
AATCCATGCCTTTGGTTTATAAGTAAGAAAATAAACCAGTCAAGGGCTTA
GCGAATGTTCTCTTTTCGATTTCTGTCAGCCTACATGTAGGAGAGGGTTT
TACAGCCAACTTTCTACCCACTTTTAATTCACAATGAGAATAGACAGGGC
CAGAGCTTTAGATGGCGGCCCTTTTGCTTGGTTAATGAGAATTAATCAGC
CAACTTTTTTGAGTTTCTCGCTTAAAAGGTTCCATCAACAACCTTGCTCA
TGACAACCTGGATACTCTACGCTTATGCTACGGACGCTAATATTGACAAA
AACAAAGTTATAAATCAAAAACTTAATTGCGGAGAGTTCTTGGTTTAAAG
TCGAAGCCACAAGTTTGTACCTCAAAGAGACATGATTTAATTGCGTTAAA
TTGCTTCTAATTAAGCTGCGGCTTTTGATAATTCATTTTTCGTATTGCGA
TTTTTCATTAAAAGGTCATTTACTTTATGGGTCGCTTTTCTCTCATGTTC
TGTCACTTCAAAAGATCTTCTGTAGCCGACCTCTGACTTGATTTATTGCC
CAAAAGAAAACACAATCGACCCAGTTGACACACACAACGTTTTGCTAATG
TTCATCTAACGTTCGTGCAATGTAAGCTGGAAGAATTCTTATGACTGTTT
AGGTCATATTTATTTTGACTTTTAAGCCTAAAAAAGCTCTTAAAATTTTC
TTAATTCCACAATTTTGTGGGAGTTTTTATGCAATTACCTTGAGAAATTG
GGTTTTTTAGAGCCCATAGAACCTTGAAATGTTCTTAACTTATCGAAGTT
TCATATTCTTATCAAAAATGTTTAGTAGCCAAGCCTAACTTTCTAGTTCT
TGAAAAAGAAAGAGTGGAATTTAGGTAAAAAATGACGGCACAAACACACA
CTTTTGAGGAAGTTACCCTGACTTCTGGCAGCTCCTGGATCGGGTAATAA
ATTACTTTGTAGGAAGGCTCCTACCTTTTAAATGCATATGTCATTTTCGG
GTTTGATTTATAAATATCCTGTCTGTTTTTAGTTAATGACAAAGGCTCAA
TTATTAACAGGGTCCCTTCATCACCGCTCATTAAGTTGTTGCCATATTGA
AATAACTCGACATTGATTGATATGGAAATATTTCCCGAATTTTTGAATAT
TTGATTTATAATGACTTCAATCGCTTTCCAATTAAGAATATCAGAGTATC
TGGTTAACGCTTCTCTGCGACTGATACATTTGTAAACCTAAACGACATCT
TTTTTTAATAATATTTAGGCTGTTGTTTTTCTGCAAAGACCTCTGTCAGC
TAATTCTTGAAAAGGCCTGAAAATACGATTCTAATATACAATATAATTGA
TCGGGCTTAGATCCAACATGAGAATTCCATTTTTGTTATCCTTAAAAAGG
TTGTTTTTCTGCAGAGAGCTGGATCAGGCTTTTAATGAAAGATACTCAAC
CAATATATATCATCCATTTAAGACATTTAAGATAACATTTCAAAACAAAC
TTGAATAGTTGAATTTGAAATCTGAAAATAGCATATGAAGTGCGTATACA
TTAATTAAACCTATTTTGAACTTATGAGCATTTTTACAGAATCTTTTTTT
CAAAGCAGACGTTTTGTTTGTATTAGGGAGATTTAAAGCTCAATTTCCCG
TCTATTGTAGGCTTAAAAACTTATTTAAGCCTCTACTCTGCCTTTTACAA
ATTACTTTAAAGGCACTTTACTGTCTGTTATTAACTAACTATTTTTTTGA
AGATATTCTGGATGATAATCCTATTTTAACCCGATTGTGTATCTCCGTTC
CCTTCTCAATAGTCAAACAGTTAACTCTCGCTAATTCGAAATCGAACGGG
TTTCCAAATCTGTTCGAATAACAGAGGTATTCGAATTATAGAGGGTATTT
TACAAGGGTTTCTCATTTGACAGGAACTAAGAATTAGTTCGAATTATTGA
GAGATTTGACAAATAGAATTTCGAATTAGCGAGAGCATGTCTCGTGTGTC
GTCTTTGTAATTTCAAGCTGATGTAGGTTTCTCGTTGAGAATTATAAAAG
ATTGAGAATTTTAAAAGATTTCTATCATCATGCTATAAAAACTTTTAGAT
TAATTATACACTATTCGTTAACCTAACCTCCTCCCTGAACTTTCTTGACT
CTGATATGACCCAATATAATAATTCAACGTAGAATTCAAATTTTCGTTTT
CAATATTAATTTCTGTTTCATTTTTTCTAGTTGATGTCTCCTTGAAACTT
TACCAATGCGATTCCAAGTGTGTCCAAGAAGATGGTCAACCATGTCCATC
AAGCATCAAAATTGCAGACCAGATGGAAAACTTAACCGAACCGGGTGTTC
AATTCATTGTTTTTGATTACTATAGTGGAAGAATAGTATATAAAGTGACA
TTCAATTTCTTATCCAATACATTTAGGCGTGATCGTTTAAAACAGTTCTT
TAACGCCTTACCAATGAATGCTGTTGTTTTAATAACCGTCAATAAGAAAT
GCGAAGCAAAGATCGACCAATGGTATGATTTCTTATTACAACATTCGAAT
CTGGTTTTATTGAATATCGATTCTAACGAACCAGAAGTGTTGATCACGTG
TCAGGGACAATGTAAACGGGGCATTATTTCGACATCGCATGCACCGATTT
ATCGTTATAAAAGTGACGCACACCAAGGCGCGATACAAGAAGACTATCAA
CTAGTTTTAGGTAAGCCGACTCCTTATTTCCCTAATTTTATGGCTGACTA
CATTCAACTTGGAGATATAAAAGGCAAGCAGGGGGATTAATCCCTTAATA
GCCCTGTTTTTCTTTAATCACCCTAGTAAAAAAGTTTTTTGACCGGAAAA
ATATCGTTCAAAAACAACATTGAAACTAAGAAAAAGACATTATGAAAAAA
AGAAAACTTTAGCTTTTAAGGCTGTTTAAGGCCTTAATAATAAATCGAGG
GATAATATTTTTTCGGGTGATTTTGAGATAAATAGTCCCTCATTTCATTG
GATTTATTTTTTGGTTGTAGATTTTATCAAAATTCTTCTTTCATTTTCTC
TAGATAACGATAGTGGTAATTTCAAGACACACAAACAAGAAGGGGGTACG
ACTGATGACCAAAAGATTTTCGTTATTGTTCTCGTAGTTTCAATCACAGG
TGTTTTTATTATTTTCATTGCTGTCATCTCATTGGTCTATTGTTGTAAAA
GGAAAATGGCAGCCAAGAAGCGAGAAGAAGATGAAAGATTATCAAACCGA
AAACGATTGAATTGGAAAATCGATAATTGGTTTCGACAACGCGAGATTGA
AGGGATAAATCGTAAAATTGCGAAAGTGAACTCGTTAAGTGGAGATACAA
CTTTAACTCGTAGTCTCAAAGAATCGGTGCGGGATCGGAATCCATATCAC
CAAGGCGACTTTGTACGAACCTCCATTTCAACACCATCCGTCGTTGATTT
TCGGAATCACGATTTTGCATACGAAAATATTTTTGATCCCGATGAGATAT
CGCTATCAACTCGTTTTACGACGTTATCACGAGTTTATCCAGATAATATA
AGTAATATTGCTACCATAGCAACACCATATGATGCACAGGACCGATGGTT
GTCGCCTTTCGATGTAAACAGATATTCGGCGAGACGAGAATCGTCGGATC
AATTTTCAACGCTGACGAGTAGCGACTTTTCGAGCGTCTCGCAACACAAT
ACAATCGATCGTTTTTACGTCCGAGAGCACCAAACCTTACCACGTGGGCT
TCAATGGTTGTCGCCAGGCACTCGCCGACAAATATTTTTCTCGGCAGCCG
ACACAGAAACGAAAAACGAAAATGGAAGATTGTCGGTAAACGAGGATAAT
CGTTTTTCTGATTATTATCGTCATGATGTCGATGGTCATTTACATAAAAC
GCCAATGAACGGGAAAGATTTCACGCCGCCGGCTTACGTAGCTCGAAATT
CCCGGAAGACGTCGTCGAATTCCGACGACGGTGAATTGTCGGACTCTGGT
AATTATTCGGACCCAAGAGAATTGGATTCTAGCACGCTTTCGTTGTTCAA
AGATGAATTGCTGAAACGAAACTCGAACGCCTCTTTTTATGAGATCGCAA
CAAAAGTTTAAAATCGAAAAAAATAAAAATGAGTTTGGGCATTGGAGAAA
TGCTGGAAGGCGAGAAGAAGCCACTATTGAAAAATTGAAAAATTGAAATA
AAGACGCTTGCCTAATTACAATAGAGCAAATAACCCTCAACTTGATCAAA
CTTGATGAAGACTGAAAACTCCTTTACAAAGGATCGGGACGGAGGCACAT
TCATTCACCAAGTGAGTTACATCACCCAGTGGAAATCGAACCCCAACCTC
CTTGACGGCAGTCAAAAGATTTATAAAGACTACACTACTGTGTTCAAAAT
TCATGCTCTTGTGAGCGTACATAACCTTTTAGTT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_002468	XLOC_002468	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000044	supercontig	sc0000044:453823..467156 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.01097	1.25715	1.00555	0.681603	1.68977	1.16146	3.40094	2.00933	0.592157	0.000107518	1.27048	1.83472	0.495203	0.849694	4.17084	1.70943	0.227079	0.719192	0	4.19731e-09	0.877699	0.521638	0	0.497031	1.97	2.62303	1.27191	0.746853	0.146083	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00004413 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00004413 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00004413 (transcript) - C. hemisphaerica