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Sequence
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transcript sequence >TCONS_00004383 ID=TCONS_00004383|Name=TCONS_00004383|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2585bp
AAGAGATTCGTGAATAAGATATGAGTTTTGTACTTAATGTTTTCAGTTTC
CAATGGTTTTCGTACCTGATATGAAAGGAAAATCTTTCTTCATTGTTACT
AGATCCAGCTCCTGGGTTCGCCAATACATCAAACGAGAAGTCTGTTACAA
CGCCTTCTAAAAGAGAGCTTGGATTTAGAAATTCCAATGGTACTAACCTT
TTGCAAAGTCCCTTAGCTGACGCATCGGAAATAATATCATTCAGCTGTCC
TACTGCAAACTCAACAAAGGGCCAAAATGAAGTGTTGTTTTGTTCAGTTT
TACGCCAGCCCTTGCATATACAATAGGTGCTGTTAGAGGAACGAAGGCTA
ACGGAAAGCGTCAAGACTGGGCAAACAAAAATGCGAGCTCCTAATTCTCT
GCGGATATTAATCCCAATACTTGGAGTAATTTTACTTTtgagtttgttta
cattcaagGATAGCTCTTACATAAGATTCACTCCGACCAACACCCAATCG
AATGATTTGAATGATGTCAAAATAATACACGAAGAAGAACTTCGGGGTAT
GCAAGAATTGAGAGAaatgattgacaaaaattcactctCGCTTGGTCAAA
TTGCAAAATCTTTGAATGTCTCACTTGACAACAAATCCAGACAGAAAAAG
ATGGACACCATTGACAAACAAAGCCCTCGTGTTTCTGGAAACGAAAAACC
CAACGTTAAACTACTTAACGaagaagatttgaaaacatttgacggtcaaa
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ATTCGACGTACTTGGGGGGCACCAATGAATTTCCCTAAACAAAGAGCAAT
GTTTAAAAATGCAACATACAAAGTACTCTTTATAACTGGTTTTGTAGCCG
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ATTACCAACCGAACTGAAAATTATTTCGATATTTCACGAAGAACACAATT
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CCGATGATGATGTCTTTGTAAGTATTCCAAAcacttataattttttttac
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GCATATGCGTGGTGGCCCGAATCGAAACAAAAATTCCAAATGGTATATTG
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GCTATCATATTATCGAGAAATGTTGCTGAGCGTATTGAACCATATTTCCA
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ttgttgcaaaagtCCCAAATATTGGAGTGAGGCCGTCCAAAGGAGCAGAA
TTCGTACTGGATTACACTGGGGCCGTTTGTAATCATTATAAAAGGAAAAC
TATCACTATGCACTCTGTGAAGACTGAAGCTTGTATGAAAAAGTTGATGC
AGGAAAGCTTAAAGTATTAAGGTGAttcgttaaaaaaataaaatgactcT
CTTATCATTATTAGTAGATGGCCTGCCGTATTAAATCACACGCCACTAGA
TTGTAAGCAAAAATAAAATGGGACCCAAAAATGGGGCATTGCTGCGTTTA
CATTTTACCGTCAATTCACCTAAGATTTCTTAAGATTTCCGGAATGTTTT
CGCTAGTTATTTTCTGGACCAGCTAGCTGGTTAAAGTAAAAGGTTACATC
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GGCAGAAGTGGTATTTTAGTTCGGGAGGTAGAATCCTTGTTAAAGCTTTC
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ATCCGgcttggtattctagccttactttcaaagttttttccctgcaaagg
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TCTCAAAATCAGATACAtttgagccgccatgacagttgtcctttgcggac
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tctccaccgttttatgagtCATTTATCCAGTGTCTCTTATAATTCCTTGG
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ttcaaatttgggaGGTTGTATTTACGAATTCATTTAGCTGCATCCTCGTT
AGCATTATTTNAGCtttaatctttttcttttcgtgTATTGAAAGACTTAC
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GTTTTAAGTAACTCTTATATGAGAAAAGTCTGTATTGACGATGTCTACTT
TAaattaaaactttgaatttgaGATCTGGCGTAGAGTTTagccaaggatt
tattatacactggatatacaagtaacagatttttgccgatttctcgtgta
ctagctatgtccgcagtaatgatgtTATTGTTCAC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000044:43794..53835- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00004383 ID=TCONS_00004383|Name=TCONS_00004383|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10042bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044:43794..53835- (Clytia hemisphaerica)
AAGAGATTCGTGAATAAGATATGAGTTTTGTACTTAATGTTTTCAGTTTC
CAATGGTTTTCGTACCTGATATGAAAGGAAAATCTTTCTTCATTGTTACT
AGATCCAGCTCCTGGGTTCGCCAATACATCAAACGAGAAGTCTGTTACAA
CGCCTTCTAAAAGAGAGCTTGGATTTAGAAATTCCAATGGTACTAACCTT
TTGCAAAGTCCCTTAGCTGACGCATCGGAAATAATATCATTCAGCTGTCC
TACTGCAAACTCAACAAAGGGCCAAAATGAAGTGTTGTTTTGTTCAGTTT
TACGCCAGCCCTTGCATATACAATAGGTAGGTTTTGATAATTCGAGAGTG
CTACACGTTCTGTAGGTAGGAACTTCTGTTAGGATACCTTTATTATGATA
ACTAGAGTTTACCAGATACTTGATAGTGTGGTGAACATCTATCAAGGTGA
CCATTCGAAGCCGATTTCTACGTAGTGCATCAATTGATGCTTTCCCGATT
TTCTCGATAACTTTTCCTGGTAAAATTGCAAAGAAATGAGGATTGAACTG
TTCATGACGTCCGTCTAACCAACCGGCGTAACGTGTATACGTGTTGCCGT
GATCCGCAAATAGGAGCGTGATCGTGTTCTCAAGTTGGCTCATTTCCGTA
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ATCGTGTGGAATACAAAGTATGGAGAACATGAATAAACCCGACGGCATGG
CTTTAAGTTTCTTTGCGATATGACGTACGTAATACGTATTGTAGTTCAGG
CCGTTGTAACAAAAATCTCCCGTACCACTAAAAATATTACGACCCTTGGA
ATATATCTCACCAATCATTTTGCAGGAAGCAAACGTTAGACCTGAAATAG
GAAAACAAGAAATAAATTGATAGTTTTGAGATGATTAGATCTGTGCAGAA
GTATAGAGATAACTATTATATTAGCCGTTCTTTCACAGAGTAGGAATCTC
TCTGTCTGTCCCTAATGTCCAGGACGAAGCAGAAGTTCTACTACATGTTT
TTTATTAAGAAACACAATTTTAAAAAACACGAGGCTCAGAATGCCTAAAA
ACTAAGAAACATGTAAGAAACATGCTGAGGCTGAGAATGAGAAAATAACA
TTTTTTAATTCGTTTTTTTTTAAGAACCTTCCAATCAAATTTTCTTTGCA
TGAAAAATAGACTGATTATGTCAAAAAATTTAGAAACATGTAAGAAACAT
TTCAGGCTCATAAGGTCAATTTCTTAAGAAACATTGCTTGGTAAAACTAG
CTTCTTAAAAAAAACGTGTAGCTAATTCGAAAAAGTACTCTGTAATGTCA
CCTGTATTATCTATGGCGAATTTCTTGATTCCTTTGACAATATTTTTCCA
CTTTCCATGAGATTTTGAGATGCTATTGAAACCCCATCCTCCTTTATAGC
ACATGTCCTCCTGGTAGATATTCCGGTAACCAGCTTGTCTTGTGAAGTTC
AATAGATTGTCAAGGTGTGGTTTTCGCCCTCCTTTCCTTTCCTGAGCCTT
TAAAACGCGCCCTTCAAAGAAAGCGATCAAATTATGGTGCGTGTGTCCAT
CGACTGCTTGCATCATTTCAAAATCTAAAATTTCAGTTTTGGTTGATTGG
TCTTTGTTTATGTCGGTCATTCTCTGTATGGTTTTTTGTAACGAACGATA
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TACTGGTTTTTGGATGGGATTCTCTTTTGGTATTTTGATCCTTGACATCT
TTGAGATATGTTGAATCAAAATGGACTAGTTGTGTTCTTGTCTTATTCTC
ACCGCAACTTAAGAAAGCAAAATCTTGTGCAATTTTCAATTTCTTGACAT
GTTCTAGTAAAGCCTCTTCCAGTGATTTAGAGTCATTAAATACTGGTCTC
ACGACTTCGTACCATCCTGTATCATCCTTAAAAACATGTATGAAAATACT
TTGATTGCCATCGCATGCTTTAGAATTGCATTTAAATCGAACATCTTTTT
CAATGAATTGGCAAATATTGACCGTTTCTGTCTCATCTTTTTCTGTCCCA
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AGATTTCGTTGTTAATGTGTGAGGTTTACAAGTGGTTTGTTCTNTATATG
ACCTTGACACATAACTGCAAGATTTCGTTGTTAACGTGTGAGGTTTGCAA
GTGGTTTGTTCTTTATTTTGGATATCAGTTTTATGCGGGAGTGTTGGGTG
AGGGCAGAGATCAGGTTGTTTTGTGCTCATTGGTTTTGATGTTTTTGAAG
GTGCTGGTGTCAGGGGAATGGATTTCGTTTGTAATGGCGTGTTTTTGGAT
AGAGTGGGCGTTGTTTTTGGTGTTACTGGTTGAGTGGAGATTTTCGTTTT
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GCTGGGCTTGATGTGGGTTTTATTGTCGAAGTTGTTGTGAGAAGCTTTTT
GGCGGTTGATCGTTTCTTGGTAGATGTTCCTGCTGTGATAAAGGATACAG
TAGGTTTCTTGGTTGACATTGAAGTCAATTCTTTGTCTTTTGATTTCCCA
CTTTTAGTCCTTGTTGGTGTTGTTGAAACCAGATCTTTAGTTGCTTTTGT
TGAAAATTTCGTTTTGATTGATTGCTGAGCGGGTTTTTTCTTGGATAGTT
GAAGCTAACGTACTTTGAATTTGAGTCGTAGTTTTCGGTGAAGTTCGAGG
AGTACTGAAAGATTTGCTGTCGATCATTAAATCTTTGTTAACTGTGGCTT
TCTCTTGTGGTGGAATGAAGTGTTTCAATCTGGTAGAATCAAAAGTTTCA
TTTCCAGTGATGTAGACAGGAAACAAATAAAAAAATCCATAAGCGACAAA
CACCAGTGCCAAAAAAAAGAAATATTTCTTAACACTCATGGCTTTTTACA
AGGATATCCGATCCAAATAAAAATAGGCAATCAAATTATTTGTTAATACA
TCTAAAAGTACAAAATTCTTTAACCATTCCTTCTATTACTTTATGATTAT
AAAATTTTCCCTTCCAATCTTATATGAAGGTTCATATATCATATATCCGT
CTGATACCGTTAATTGATAAATAATTACGTTATTAACTCCGCCTTAGCGA
AAGCATTACAATAGGCATTCTGCAGCGGTGAGAAAAAAGATTAGAAAACG
AAAGTACTCGATACGGTGGACAAACTCACTAAATTTAATTTGTTTTTCGC
CCTTTTCTCGGTCACACTAATGAGTTGGTTGAGATAAGCGTAATCACCTA
ATATGGATAATATACCTTTCGGTTTCTAGTTAGTTACTTTCGGTAATTAG
TTCTTACAAAGTAGACATGGGACTACTGGATACCAGTTTTTAGTATGGCT
CATCCTCGCTTATCCATTATAAAAATGACTGTGTCTAAATCATTTCTCAT
GACTCGACCTAAACCTTTTTTTTCTAATCCATCTCGTATTTTTCTTAACA
GCTTTTTCAGAGCCGGCATTTTAGCATACTTCTTACCAATATTTGGCGAA
ATTTTCGACTTCAAGTCGTCTTGTTGATTTTTTAATCAAATTGATAATCG
TCATTGATTTTTTTATCAAATACATTGAAATTGAGGTATAAGAAAAACAG
CTGGCTTAATATTTTAGCTATATACAGCTACAGATTTTCATTAATTTAAT
TAATCAGGTTTTGTTTTTAAAAAAATGCTATCTTTTTTTACTCGTCAAAT
CAAAGATAACATGCTTTCGTATATTTTATTGACAAAAATCAGTTCGGTAA
AGTGCATAGTTCCTCAGCCGTGTAGTTTGTGACCGAAAATTATGAACTCA
AAGTAGTTTTTTTTGAAATTTTTCTTGAATTTTGAAATAAATCAGGCTTA
TTGTCAAAAGCGATTGTGAAGAAGAGAAGTCCAGGAGCAGTCTTAGTTGA
CAAAGTCCCTTTGGACTTCAAAAAAATCTTTGCCAAGTTGGCTAAGCAGA
GAAAAGTTTACTAAGTAGTTTCAAAAAGGGTAGAGTCATTTGGCTTAGAG
ACCCTTAGATAATCACTTTTTAAAGTTCATTTTTACAAAAGCTAATTTGT
AAAACTAACCTAACTACCTAATTTGGTTAACTTCTACCACCGAATAGAAG
ACAGTTTACCGTCGGGCACTTATTATCACCCACGCAATGTTATAAGAATA
TCTCACATAATTTTGGATGTCACTTGGTTCCTGACACCCACTGGGACACA
AGCGTGTTAATTAAGAAAAATTATCGTTCTAATACTAGTTCTTAATTAAC
CTAAAAACCGTTATAACGACTTTCGATTCAGACGGTTCACATGGGTCACT
TTAGAATACACATAGAGCTTTATTGGATTAGTTAAGCAAGAATAAGAATA
CGCAGGCTACTGATGATAGATAATTATTTCTGCAGATTACATATCTCCAT
CAATAAGATAACTCAATTAATATTGGCTTTGATGTAATTATGAGAAGTGC
TTTCTTTCATTCCATTAATAGCTGATTTGAAAACACGAATTTATCATCTT
TATTGCCCCACAGATGCTTAGTTCGCTTCGACATTATTAGCGAGATTAAA
TACCAATAGATAAAAATCATAACGCCGGACAATTTAGCTCTCGCTTTCGT
CACAGCACTTTATCAAAAGGCTAATTGGGAAAGCGCTAGGAATAGGAATA
GGAATCTTTTTTCTCAAGCAAGAAAAATTTTAAGCCTTAAGATTTACCCC
GCATTTAGAAATTTTGTTTGAAAACCTACGATAAACGAGTTTTCATTGAC
ATCAATGAAAGCAAGGTCACTTACCCCGCATCGTATATCCGCTATAAGTT
AATAAGAAGTTAGTTTCTTCGATATACTTAACCTCGCTATAGTCGACATT
CCCAAATTAAAAACTTCTTTGGAAATAGAAATTACCTCTGTCATGTGGGC
CACTTAGCTTTTTTTAGTCGCCGAACGACGCGCACGGCTCGATTATTGCA
TAAATTAAATAAATTAAGCCTTCAAGGCTTGTCGAAATGAACGGTGTGAG
CATAGTATAAGAAAGCCGCGGCTGGAATATGTACCGCATTGTCTTTTCAG
TTAATTGCTGTTCTATCTCTGTCTCCGAGCTTTATAAGAACATCANTGCA
TTGTTTTTTTCAGTTAATTGCTGTTCTATCTCTGTCTCCGAGCTTTATAA
GAGCATCAAGATTTTCAGTTTATTATTGGTAGATAGTTTTTGAAATTTTT
CCCGCATTTTCCTTCACAAAAAGTTTTTTTATTGCTAGATATCTTTGAAT
CTGTACCTAATAGAACACTTGAATTAATTTTGGACATATTTTAGGGATAT
TTTGTGGAAAAAATAGTTTTTCGCCAAAATTGAAATCATAAGAACTATAT
ATTTAAGATGACAACTTTCCTGTCAATTTGAATGATAAATTTTGAAGGTG
CTGGCTTGAAACTTTCACAGTTTTATCTTGATGTACTTTTTCATTGATTT
ATAAAAAGATTTCACTGAAATATTGTGAAGGCATTCGAGGCACTTTGTTT
ATTTTTGAGTTCTTTCAGCTCAGTCATTTTGTGCTTGTTTAAATTTCTTC
TTGTTAATCTTTCCTTTAAAATGATTTTGAAATGCAAGTGTGTTATCAAG
GGTATATCATTAATGTCTAAAACGCACTGAGAAGTAAGTATTAACGACAA
ACCAATAAAATTTACCATTAAAGATGCTACATTACTGATCTCTTGATCAA
AAGATAGTCATCAAATACGACAGAGATAGAACAACAGAAGTTCAGATGTT
ATCATTCCAGTCGCAGCTTTCTTATACTATGGTGTGAGCTTTTTAGAAAG
TTAAAAAAATTTCAACTTTGTGCGCAAAGCTGTTTGTTTCTTCTATTTCT
CTTTTTGAAGTAGTCAATCAGCGAGAAAAAGGAAAATTTTTCGATTTCCA
AGGTTGGAAATTCAATATTTTTGAGTTGGAAATTTTGTTTTTATAATTGA
AGGTTGGAAATTCGAGCGATTACCTTAAGCTGATTTGGAAAACGTAAATT
ACCCATAGGTTTTTAGAATAAACCAATGCCCTTGAAAAATCAAGGGAAAA
AAAACAATGTAGAAATGACAATTTCCAAGGCTGGTTGGAAAACATGACTT
TTTGGGTGGGAAATTTTTATATTCCAAACAGTTTGGGAATTGAAAAAAAG
GTCAAAAATCGATGTGAAAATGCATATTTTTGTAAATTTGATACCTCGGG
TTGAAAAAATAGACTTTTGGGTCGGAAATTTGTGTTTTTCCAAAACAGTT
TGGAAAACGTTAAAAATCCATGTGGAAATTACATTTTTGTGAAATTGAAA
CTCTTTTAATTTGAAAACTAGACTTTTTGGGTCGGAAATTTGTGTTTTTC
CAAAACAGTTTGGAAAACGTTAAAAATCCATGTGGAAATTACACTTGTTT
GAAATTGAAACTCCTCCTTGGAAAACTAGACCTTTTGGGTTGGAAATTTG
TATTTCTCCAAACAGTTTGAAAAACGTTAAAAATCCATGTGGAAATTACA
TTTTTGTGAAATTGAAACTCTTTTAATTTGAAAACTAGACTTTTTGGGTT
GGAAATTTGTGTTTCGGGTGTTTCTCCAAACAGTTTGGAAAACGTTAAAA
ATCCATGTGGATATTACATTTTTGTGAAGTTGAGACTTCTCCTTGGAAAA
CTAGACCTTTTTTGGTTGGAAATTTGTGTTTCTCCAAACAGTTTGGAAAA
CATTAAAAATCCATGTGGAAATTACATTTTTGTACCATTTTCTGCACATG
TCTTTTGAGAAGACCACAAGCGATTTTTCGCACAGAACTGTTTTGATGTA
TAGCTAACCCAGATATTAGGCTATAATGTGAGCAGTCAAGCTGTAAGTTT
CCGTCAGGTGAGGCGTCCCTTCGGCCTCAGTCAGTCACAGTGAGTTCGCA
CAGTGAAGCACATAGGGTACTTGTGTCATAGTTTCAAATGGAGCCCTGCT
GAGCTGTGTGAGTGATCTAAGATCAACCACGTATCTATGCGAACAATAAC
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GGATTTTCTCTTACGTGCAANTTTTTCCTGTGTTTATCATGTACAATTGC
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CTAACGGAAAGCGTCAAGACTGGGCAAACAAAAATGCGAGCTCCTAATTC
TCTGCGGATATTAATCCCAATACTTGGAGTAATTTTACTTTTGAGTTTGT
TTACATTCAAGGATAGCTCTTACATAAGATTCACTCCGACCAACACCCAA
TCGAATGATTTGAATGATGTCAAAATAATACACGAAGAAGAACTTCGGGG
TATGCAAGAATTGAGAGAAATGATTGACAAAAATTCACTCTCGCTTGGTC
AAATTGCAAAATCTTTGAATGTCTCACTTGACAACAAATCCAGACAGAAA
AAGATGGACACCATTGACAAACAAAGCCCTCGTGTTTCTGGAAACGAAAA
ACCCAACGTTAAACTACTTAACGAAGAAGATTTGAAAACATTTGACGGTC
AAATTTTGTTTCTTGTCTTTTCCCATATTGGAAATGTCGATAGGCGCACA
GCGATTCGACGTACTTGGGGGGCACCAATGAATTTCCCTAAACAAAGAGC
AATGTTTAAAAATGCAACATACAAAGTACTCTTTATAACTGGTTTTGTAG
CCGACAAAATTAAAAAGGCGAAAGAAGAATCAAAAACACACAGAGACATG
TTGATTACCAACCGAACTGAAAATTATTTCGATATTTCACGAAGAACACA
ATTTGGTATACATTGGACAATCAGAAATTGCAAATTTGACTATTTCTTTA
AAACTGATGATNTACATTGGACAATCAGAAATTGCAAATTTGACTTTTTC
TTTAAAACCGATGATGATGTCTTTGTAAGTATTCCAAACACTTATAATTT
TTTTTACAAAGACCCTTTTGCTGTTGAGCACAAGACTTCTTTATATGCTG
GTTTAATGCATATGCGTGGTGGCCCGAATCGAAACAAAAATTCCAAATGG
TATATTGACAAAAAGAGATGGGGACAGACAGTATACGCTCCATTTGCTAC
TGGGATGGCTATCATATTATCGAGAAATGTTGCTGAGCGTATTGAACCAT
ATTTCCAATGGGAAAATGTTTTCCCACTTGAAGATGTCAATATTGGCTTC
TATGTTTTTGTTGCAAAAGTCCCAAATATTGGAGTGAGGCCGTCCAAAGG
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TTGATGCAGGAAAGCTTAAAGTATTAAGGTGATTCGTTAAAAAAATAAAA
TGACTCTCTTATCATTATTAGTAGATGGCCTGCCGTATTAAATCACACGC
CACTAGATTGTAAGCAAAAATAAAATGGGACCCAAAAATGGGGCATTGCT
GCGTTTACATTTTACCGTCAATTCACCTAAGATTTCTTAAGATTTCCGGA
ATGTTTTCGCTAGTTATTTTCTGGACCAGCTAGCTGGTTAAAGTAAAAGG
TTACATCCAGAGACACCAGATGCAATGATTAGCACGGTCTAATCGAGAGA
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AGCTTTCTATAAATTACTTCATATTGTACTCAAAGCCATCGAAAGCTGAG
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TGCGGACATAGCTAGAACATCAATTGTTTTCTGAAACAAAGAAAAAACAA
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CCTCGTTAGCATTATTTNAGCTTTAATCTTTTTCTTTTCGTGTATTGAAA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
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| TCONS_00004383-exon-sc0000044-1510915933:45425..46106 | TCONS_00004383-exon-sc0000044-1510915933:45425..46106 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00004383-exon-sc0000044-1510915933:43794..45370 | TCONS_00004383-exon-sc0000044-1510915933:43794..45370 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00004383-exon-sc0000044-1491911889:53510..53835 | TCONS_00004383-exon-sc0000044-1491911889:53510..53835 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00004383-exon-sc0000044-1491911889:45425..46106 | TCONS_00004383-exon-sc0000044-1491911889:45425..46106 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00004383-exon-sc0000044-1491911889:43794..45370 | TCONS_00004383-exon-sc0000044-1491911889:43794..45370 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000044 | supercontig | sc0000044:43794..53835 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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