TCONS_00004307 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00004307
Unique Name	TCONS_00004307
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2885

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000041:771753..786075-

transcript sequence

>TCONS_00004307 ID=TCONS_00004307|Name=TCONS_00004307|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2885bp
tTTCTTCAATGGTCCTTTAGCAAGAACTCAAGAACTTGAAAATTCCGGAT
GGTAAAAACATGTGCGATAAAAGTCGCGGTTGATTCATACTGCTGTTTTT
AAAGACGATTTGATTGGCTAGTCAAGAAAATGACAcatagcctcgttttg
gtgttACTACTTCAGTTCGTGGGTTATGCCTCGTCAACGGATACAGCTAT
GTCAGGTCAATGTCGGTCAGGACAGATCTACAAAGAGATGACCTTGAAAG
GAGGTATCAATGCTGGTACATATAAAGATGTTGGAGGTGTCAAAACCATG
GAAGAATGCCAAAAGAAATGCTGCGAATTCTCAGCTTGTGATCTGGCTTT
TATGTTAGCTGGAAGTTGTTATTTGGTTGGTtgtaaagacaagaaacaat
gCGTGATGCAACCTGCCAAAGAATCTTCATTTAAACCTGAGATTTCGTAC
GTGATGCGATGGAACAGCGAAGGTGTCAAACACTCAGTATCGTCTACTTC
CAAAGAAGACCAATTCACTTGTCCCAAAATAAACGCCATTAATAAAGTCA
CGCTCAAGGGCGGTCTACAGGCGGGCGATTTCACTGATATCGGTCGCGTG
GGGACGTTCGAAGAATGTTATAACACGTGCTGTCAGCAAGAGAAATGCGA
CCTGGCTTTCATGTTAGGACAAAACTGTTTCACTGTGACGTGTAAAGACA
AGAAGCTCTGCGTAACAACACCTGCTCAACCGTCTATCTTCAATCCACAA
ATTGCATACGTCACTAAGAGGACGCTCGGCGGACAAAAAACTGaCGACGT
TTCTACAGCATCAACGCAACCAAAGCCGCTCGCAGATTTGAAACCACCCA
CAACAACCGCTAGCCCGCCAAAGACATGTCCGAACACAAAAATACTTGAT
AACATGACGTTAAAAGGGGGCGTAGATGCAGGGGCGTACAAAGACCATGG
GAAAATTGAAAACATGGTTTTATGTCGGCGCATTTGTTGTGAAATGCCAT
CATGCCATTTAGCTTTTATGTTgggaaaaacttgtttttcagTAAAATGC
GCAAACGTGGATTCGTGTCGAGCTCAACCTGCTAAAGCGTCTACTTACAG
CCCAAAGATTTCATATGTACGTAAAGTCAGCTCTAATGAATTCTTAGTGG
ATGCACCACTACAAAACATTATCACAACTACAACCATAACACCGCCCATT
ACCACATCACCTCCGCCCGTCGTCATGACAACTACAGCAACTAACACATT
ACAACCGCAGCCTGTGGTGCCACAAGCTGTTGCTACAAACGAAATCAAAC
AAGATCAAGCACCAAAAGCAGCTTTAGCCGCACTTGAAAACATTGCTTCA
GCGGGTGCTGCAATTCCTCAAACACCTGCTCCACCCTCGACGACGCTTTC
CACCCAAACTACACCTCCCACTCCACCCACCGCTCCACCCACCACCATCA
CTACTGTTGCAGTTACAAACGACTTATTGAGCGCTCTTCAGAAAGCTGAT
GTTAAATCAACCACACCTTGTTCGCTGGGGAAAATGAGATATAACGTCAC
GTTAAAAGGCGGTCGAAAATCTGGTGAGTTCATTGAACAGAAAGATGTTG
CAACCATGGAACAATGTTCTGAAAAGTGTTGTAACGACCCCGACAAAAAA
TGTAGTCTGGCGTTCATGTTAGGAAAAGCGTGCTATTCAGTCAGGTGTGA
TAATGCGGATTTGTGTCAGACGATCAATGCACCGCCTACCAAATTCAACC
CAATTGTGCAATATGTGAGAGGATTAGACGATTCGGCGAGTAATCAAGCG
CAACCAGAAGCATCCGCAGTTGTACAACAACCATCACCGACCACAACCAC
AACCACCACCACAACAACTACAACAGAAAACAAACCAGTTTGTCGCACGC
AACCTGTCGTACACGGAAAGTCTATCAAAGGTGGCAAAAAAGCAGGTAAA
TTCAAGATATTCAGAGCCATCAAAACACTGGATACTTGTATCGCCAAATG
TTGCACATTGAAAGACCAATGCGACGTAGCGTACATGGAAGATGGCAATT
GTTACAGTATACAATGCTTCAAGAAATCCGCATGTACGGCCATACCGCTC
CGTGATTCTGACGTTAATCCGGCGTTCGCTTACATGGATCATTTCTTAGA
AAAAGTTGACAAAGAAGAATCAACTGCGGCCGCTGAAGTTGATATAACGA
CAGAGCTGGACCAAACAGATGTCAACACTTGTAAAAACACTGAAGTTATA
CACGGCAAAACGCTCAAAGGCGGTATGAAAGCGGGCAAATTTCATCCGCT
CGGTAAGAAAACAATGAGTAGTTGCATCTCAAGCTGTTGTGATCGTCCAA
ACTGTGACATCGCATACATGATGAACGAGCGATGTTTTTCCGTGCAATGT
TTGGATTCCAAACTATGTCAACCGTCTAACGAGCACGTGGAGAAAGGGAA
AACCGTACAACTGGCGTACATGAATCGACCTGAAAGCGCTGATAAAAAAC
GAGATTTCATGGTCGTTTATGTCATTGTTGGTATGGTCGTAATCCTATCA
GTCATTGGCGGTTTAATATGGGCGGTTTTTGTGGTGAAGAGGCGTAAAAA
GATTGACAACGCCAAACAACCTTTACTAACGCccgaagatgaagaagaaa
ctATTGATAATATTATGCACAAAAAACCTTCAAGATTAAAACGACAACCT
TACAGACAGCCACGATTCTAAATGGAAATGATGAATAACGTTTTTGGACA
ATTGCCGGTTGATTGATGGGCCCTCAGGATCGCTGAATATTCATAATTGA
TGGCTTTGTCACGAAATAACTGGAGAGGGGCTCCTACGCAAAGGACCTTT
TTGGACCTTCGAAATTCCGCAAAAGTCGTATTACA

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000041:771753..786075-

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00004307 ID=TCONS_00004307|Name=TCONS_00004307|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14323bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000041:771753..786075- (Clytia hemisphaerica)
TTTCTTCAATGGTCCTTTAGCAAGAACTCAAGGTTCGAATTTCTGTGCTG
TTTGAATAATACACGTTTTTTTTTATAAGAACGTCAAAAATTTTCGAAGC
CTTCGGATGTTCTTAGTTTTTTGGATTTGAAGCCTAAAAATGTTCTTAAA
ATGTTCTTATTTTCAGCATTTTTTGAGCATTTTGATGTAATTTCTTAAGA
AAATGCATGTTTTTAAGTCTCCAAAGCCCTATAATGTTCTTAGAATGTTC
TTAAATTTTTGGGCCTCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTAT
AAAAAAACGTATAGTCAAAAGAGTCTCAACTTGAGCGTTGTGTGGAGTAC
CCAAATACATCTTTTTTAACTTGTTCTTATTTGTAGGGCAAACTTGAGCT
TGATTTTAGGCTATATACCCAATTTTGTTTCTTTGAACCTTAAATCATAT
AGCAATTAAAGAGGCTCTGCCTTGTTTATAAATGTTCTTTTTCTTGAAGA
TTTGAGATTCGCTAACATTTTTCTTTTTAAATTGCTTTTAAAAAAGTGTT
AAATTTAAAATCGCCTTTTCGTGTTTTCGGTTTTCCGAGTACTACACTTT
TTTTTATAAGAACAATTTTACAAGAACAATGAGGCTCGAAATGGCCAAAT
AATAAGAACAGTTTAAGAACAATGCTGAGCCTACACTTACTCAATCTCAA
TCAATTTATGGTCAAAGTAGTACGAATTGAGTATAAAGCCTAAATACCTC
AATTTCACACAATACAATAAGAACAGGATAAGAACAATTTGAGGCTCAAA
GTGCCAAAAAATAAGAACGGTCGAGTCTGATCAAAAGTCGACCGATTCTT
ATAAAAAAGAATATAATTCGTACAAAAATGTTTACAGGTGCATTACAAAG
AGTCCTTTAGAACCTTGGACGAAATTTTTGGGTCGAAAATTATTTTTTAT
AGTGTTTCTTTCTAGAACTCATTTGAAGAACTTGAAAATTCCGGATGGTA
AAAACATGTGCGATAAAAGTCGCGGTTGATTCATACTGCTGTTTTTAAAG
ACGATTTGATTGGCTAGTCAAGAAAATGACACATAGCCTCGTTTTGGTGT
TACTACTTCAGTTCGTGGGTTATGGTAGGTCGAATATTTGTATTTTTTAC
CGATTTTCACTCGATTATCGCCTCTTATGTATCTAAGAACGAGGGCCCTC
CTGCTGACAGACCAAGCCAGAAACCCTAGGCAGAAAAAAGAAATGGGTAA
AAAATTACTCTGAATTTCCGTCATGGCAAAAGTTGGCACTAATTCGACTG
CTGAATTTTGATGTTACTGTGACCAGAGTCGACTAAGAGAGCTTCTGAGG
TTGCCATTTTGAAAGAAAATACCAACACTCCTCAATTTAGCGATACAGTT
ATTTTTCCCATTAAGTTCTTGTGTCTGAGATTACAGGTTCTAGAGGGTAG
CTCGTTGATGTCGAAAACTTCTATTCTTTTCTGTTGTTTTTACTCCAACG
GGTTACCCTTCTAAGACCAATAACTAGTCTCAGAAACTTATATGCAAAAT
CGTCTGCAAAGTCATGATTGGTCATTTTAAGCCGCGGTTACTCCTGCGCA
GATAAATTTGGTTTTGATTCGTTAGAGGCTGTTCATATGGGTTGGCCAAG
CTAGGTGAGGTGGGATGGATTTTCGAACGTTACGTCACAGTCCTTGACGA
ATCAAATGGCTAAAAATAGATCACGCGACGTTCGAAAATCTATTCCACCC
CACCTAGCCGGGTCAGCCTGCCTCCTTAAGAGCAGCCCCTTAGTTGGAGG
TTGTGCTCCATCTGCTAAACGGCTCATCCCCTAAAACAGTTTTTCATTTT
TTCCTTTCACAGCCTCGTCAACGGATACAGCTATGTCAGGTCAATGTCGG
TCAGGACAGATCTACAAAGAGATGACCTTGAAAGGAGGTATCAATGCTGG
TACATATAAAGATGTTGGAGGTGTCAAAACCATGGAAGAATGCCAAAAGA
AATGCTGCGAATTCTCAGCTTGTGATCTGGCTTTTATGTTAGCTGGTGAG
GTTCTGAATTTCGTATTTTACGAAAAAGTTACCCCGGGGGGGGAGGCACT
TAGGCAAAATTTGGTACGGGGACGTGCCGCTGGTCAGGATTTCTTTTTTA
AAGGCTCTGAAGATATCTGACAGGATCTTAAGTTTACTAATTTTGAAGAT
GTTTATCTGACAGGGTCGACTTTTGGTAATTTTTGACAATTTTCAGGGTG
ACAAGGTACATTTTTCAAACTCCAGCGGTGAGTTACCCAGCCGAGTTGTT
AGGCTTTTTTCGTCAAATGTTGGTTGCATGAAATGTTTAAAAAATGATAT
CTTACTTCAATAAAACTCTCAACACTACTAAAAACCAAAACACCCACATT
GATGATGACTCCCCGCCCGCCGCCATCAGCCATTTTGTTTACAAATGAAT
CTAGAGTCAAATCACGCTTTTACTCGAAGTTTTTATGTGCTTGTTTCTGA
TTGGTTCGAGTTTATTGACACTATTAAAGTAATTAAATTTGAGTTGTAAA
GCAAGTAACATGGGAATAATATCACTCGAACTTTTTCGAGTAATCACATG
TTTTGACTACACTGCTATAATCTTGCAACCCGTGTATTTCGTCTTCTTAT
TCATTCTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTCATAGGAAGTTGTTATTTGGTTGG
TTGTAAAGACAAGAAACAATGCGTGATGCAACCTGCCAAAGAATCTTCAT
TTAAACCTGAGATTTCGTACGTGATGCGATGGAACAGCGAAGGTGTCAAA
CACTCAGGTAAGATTAATCTAGACGAGGCTCCTCTTTCGATAGCTATCTA
CCCGAAGGTAGGGGAGGGCGCCACTCTTTCTCCCTGGATTGCTCCACTTA
CCCTTGATCCTTCTCTTAATTACTGAGCATCAAGCGGAGAGGCATCAAGT
ACCATTTTGGAAATCTTTGGTGTGACCCGGCTGGGGGTTGAACTCACAAC
CTTGCGAACCGTAGCTGGGTGCTCTACTACTGCACTACGGTCACTTAAAT
CCAGACGAAGGCTACCTAATCTTTGGATACGCTGAACACATCCACTCTGA
TATGTTTTTATATATGGGATGCTCCTGTCCAATAGCCGTCTTTGAGTTTT
CGAGTTTTAGAAACTTCATTAGCTTGATTAGTAAAGGGATTCGAAATACC
TTTTCCCGTCAAAATTTTGGCTGAATCCCGGAATGCCGGACATTAATAAA
ACGTCAAGCCCGTCACCGGCATGTTTCATGGCTACTTGACACAAAATATC
TACAACAGCAAAAGAAATTAGTGGTTTTATAAAGAAAGGCAGTAAAAACC
AAGTACTTTGAATAACATTTTGGGGTATTTTTCCATTTTTTGCTGAAAAC
GCCTTTTTAAGGTGTAAAAAAATAAAGGAAATCTGTAGACGCCTTTTTGT
TCCCCTTGTTAGAGGTTCATTTTCAAAAAACCGATCTCAACACCCCCTTG
AATAACTTTTAAATATGTAACATTACAAATTTATAAACCCTAAATAAAAC
AGCAAAATTAAAACCCACGAAATACAACTTTTGCGAATTTTTAAAAAAAT
ATTTCGTCTTAAAAGAATCAAAGGCGAGGAAATTACTCCTAAGGATAAAT
TTGCTTCGACTACAAAAACCAGTTCCTTTAAAGTTCATGTTTTTTCCTTT
GTATAGTATCGTCTACTTCCAAAGAAGACCAATTCACTTGTCCCAAAATA
AACGCCATTAATAAAGTCACGCTCAAGGGCGGTCTACAGGCGGGCGATTT
CACTGATATCGGTCGCGTGGGGACGTTCGAAGAATGTTATAACACGTGCT
GTCAGCAAGAGAAATGCGACCTGGCTTTCATGTTAGGACAAAACTGTTTC
ACTGTGACGTGTAAAGACAAGAAGCTCTGCGTAACAACACCTGCTCAACC
GTCTATCTTCAATCCACAAATTGCATACGTCACTAAGAGGACGCTCGGCG
GACAAAAAACTGGTAATACATACTTATTTCGTTGGATAATTTCTCTTGCA
ACGGAGACGGTTAGGTTCTAACTTGTTTAAATCCTGATCACTTGTGGACG
ACAGTAAATATGTACTTTTACCGTCCAGTCAGAACTGTAGGTTATTTTAA
ATAATGTCAGTCACTCCACCGTCCTCAAAAGTTCAAAAACATAAACTCGC
TAATATCTTGTACTCTTGGTTTTCCTCAGAATACTAAAAAAAGATTTGAA
TCCAAGAAAATATGTTCTAGTGAATATAGTTGAATTCTAAAGTCTCGAAT
CAAAAATAATTGATCATAAGTTTGTTGTTATTTTCAGACGACGTTTCTAC
AGCATCAACGCAACCAAAGCCGCTCGCAGATTTGAAACCACCCACAACAA
CCGCTAGCCCGCCAAAGACATGTCCGAACACAAAAATACTTGATAACATG
ACGTTAAAAGGGGGCGTAGATGCAGGGGCGTACAAAGACCATGGGAAAAT
TGAAAACATGGTTTTATGTCGGCGCATTTGTTGTGAAATGCCATCATGCC
ATTTAGCTTTTATGTTGGGAAAAACTTGTTTTTCAGTAAAATGCGCAAAC
GTGGATTCGTGTCGAGCTCAACCTGCTAAAGCGTCTACTTACAGCCCAAA
GGTAGTTGTAATAGATCGATTCCGTGTGACGTCATTTCCACCCCAATGAT
TTAACAAACCCCAAAGGGCTAGATCCGCGGCCTTTATTGAAAAGTGAAGC
AAGTTTTGATAAGATTTCCTACCAAAGAAATCACGTGGTAACAAGCAATT
TCACTGGTTTGAGGGATGCGAAATAGCGTTTGCCGCCTATTTTTTTTATC
TCGCGCTCCGAAAACAATTAAAATGCTAGATCCTGTCCATCGGCACGAAA
TTTAAAAAGTCAAATTTTTGCTTCACTTTTTTTTGCTGGAGAAAGCTTAA
AGTTGCCTATCTAGCCCTTTTTGGCTTTACAGATCCATCCACGATCAGAC
ATTTTTCTAAGAAATGGTAGAAAGAAAATGTACAGGATGATTTAGTAACA
TCATCATGGCTCCACTTCTTCAAATATTTCCCGTTTGAGCCTGCGCATAC
TTTTTTGTTTGTTTTTGTTTTTCCACATCGTTTTATTTCACTGGAGCTTA
CCCTGGCGCAATCTTTGACAATGCAATACTGTACTGTAGATTTTATTTCA
AAATTAAAATAAAACTTACAATCCACTGCATTGCCTGGCCTGGTGATTGC
GCAAGTATGAAACACCGTGTAACAATTGTAAGTTAGTTCTTTATGTATTT
CTCGATATTTCGCTCAATTGTTTTCAAATTTTCTGGAGCACTTTGTGATT
CTATTTAATTCACTGTATATCATTTTCTCTACAGATTTCATATGTACGTA
AAGTCAGCTCTAATGAATTCTTAGTGGATGCACCACTACAAAACATTATC
ACAACTACAACCATAACACCGCCCATTACCACATCACCTCCGCCCGTCGT
CATGACAACTACAGCAACTAACACATTACAACCGCAGCCTGTGGTGCCAC
AAGCTGTTGCTACAAACGAAATCAAACAAGGTAAATATCCTATTAGTCTG
AATCGCAGACCTCTATAGATATACTTCCTACAATCTGGGTCAAAATATAT
TGAGAATTTTGGTTAATTCCTTGTTTTTAGCAATTTAAAGTTCGGGCGAG
AAAGTTGCTTTTGGGCTTATTGATTAATTTATTCAAATATTTCAATTCGG
GAGGGGTTTATAGACTTCCAGGCTATATTCTGAACCCTATTGGACCATTC
TTGGACTTTTGGATCCTCAGATCATCAGTTTTAAGTCTAGCGTTAAAACT
TAGAGTTAAAACTCTACCGTTCCAACCTAAGTTAGAGCGCTTCCAAATCG
ATTGTGGCTATAAGATTTCGTGGGAATTTCCCTTTTTTCTCAAATATTAC
GACCATGATTGTATATAGGTCTGCTTAATAAGTGTACGGCATACCTTCTC
GATGTGGTGGCTCTTATGGTGGCCGATTTGACTTTGCCTCTTTTGGAGAG
TTACGGAATTTCTATAAGAAAGTCTTTATACTAGAGGATAAGAAGAAGTC
TAACATCCTATAAGAATCCTGGCAATACACTTACCTTTCGACGCCCTTTA
AGGTGTTATTTCTTGCCCCGTAGGGGATTGAGAACCGGTGTAAAAAGGGC
CGTAATTTTGCATTTCAAACAAAAAAGAGGCCTCAATTGTTTACCGTTTT
TAAAAACATTTAGTTTGACTAAATTTTTCAATGGCGGATAAAAGACCGGC
GTAAAAGAGGTCGGCGTTAACTTAGGGCAAGCGTAAAAAGGGCCGATAAG
GTATTACATAATTATTACGTGAGAATCTTTTCTCTGTTTTCTACCGTGGC
TTGTTAGTGCCATGTGTAAACTACTTATACTTATAGGTTCTAAGTCAACT
TACAAGCACTAAGAAGTCGATTTAATAGGGCTAACTTATAAGTGATAAGT
CGAAGACTTATAAGTACTAAGTCGACTTATAAGTACTAAGTCATAAGTTA
ACTCCGTAAGAAGCGGGCCTTTCATTGTTGTGTTTATAAAAGGGGTACAT
ATTGTTGTGCAAAGCAAGGGTGGGCATATTATGTTGTGTACGGCAATAAT
GGACATGTTTTGTGGCCGAGGTCGTGATATGCAGTTAAAGAAGAAAAATG
AGTGTAATGTAAAGCTCAAGAAAGTGTTGTGGTGGTGGTATTTGGTTGCT
GTGTAAGATCAATTCACAATATGCGATTTTTCGATTTTGCTTCGGGTCCA
GACCTTTTTTAAATTTCACTAGATATATGCCAGAGAGACTCCCGTGCTTT
TTGACTTAACACTCCTAAGTCGACTTAGCACTTCTAAGTTGACTTAGCCC
AATTAAATTGACTTAGCGCTTCTAAGTCGACTTAGAACCTCTAAGTATAA
GTAGTTTAAACATGGCAACAACAAGCCACGGTAGTTTTCAATATCTAAAT
CGAATATAATAAATATCTTCTTTTAGATCAAGCACCAAAAGCAGCTTTAG
CCGCACTTGAAAACATTGCTTCAGCGGGTGCTGCAATTCCTCAAACACCT
GCTCCACCCTCGACGACGCTTTCCACCCAAACTACACCTCCCACTCCACC
CACCGCTCCACCCACCACCATCACTACTGTTGCAGTTACAAACGACTTAT
TGAGCGCTCTTCAGAAAGCTGATGTTAAATCAACCACACCTTGTTCGCTG
GGGAAAATGAGATATAACGTCACGTTAAAAGGTAATCTTTTTCAAACTCG
TACCCAGTCCGTTAGCTCGTAGACTAGCAAACTAGTCTGTTAATTAACCA
TGTCAGAGGGCGGTAACATAAAGGTGGCGGGCGTTAATAAGAATAGGAGC
TGCGTAGGAGAACGAGCAAAAGTTGGTGAGAGGCTGCTAATTAACAGCCC
TTGCCGCCGACAAAGTTTCATCTTACGCTTACCTAACTCCTACGCTCACT
TTTCCAGCATGAAACCGTTCTTACTCGACTGGCGTGCCAGTTTATTTAGC
TCGCTTTTTGATGATTCGGATAGCACTCACACATTGTNCGCATGAAACCG
TTCCAGCCTGACTGGCGTGCCAGTTTATTTAGCTCGCTTTTTGATGATTC
TGATAGCACTCACACATTGTATCACGTCCATCAATAGAGTAAAAAAGTAG
CACAAGTGGCTCTGAGTAAGAGATAGAATATTTTTCAATGTAAGATTTTA
CTTAAGATTGCCATCCTATATGCAATGATGAAACTTTGAGTATGAAATTT
ACCTAACTCATTTTCTTTACTACTAGTAAAGGGTATAATGATAATTTGTA
GTTCGATCTTGGGAGAATTAAACCTGAGATCAGATTATAATTACTTTCTG
TCCACCATGCTGAAGCTCGAAAGGGATGGGTGAAAACATAATAATCTGAC
GAATATCCAGTCTCTATTTCGTAAGGACTGTGCTCCTCTCAAAGGACTGA
GAATGACAACAAAGTTGCGTGATTGTGTTTGAGAATATAGATGATAGATG
GTTAATTTTCAAGCGCCTTCAGAGGTTTACCGTGAGCGTAAGAAAATATG
ATTTTTTTATTGTCCTGGTAACCCAAGATTAGATTTTCTACAGGTAGACG
CTTCTCACTATACAGGGTGTCCGGAAAAGTATCGTGTCGTACCACTTCTA
TAGAAAGAAAGTTCTTCTGTGTGTTACAGCAAATTTGCAATGTTCGAACT
CGTCGAACCACTATCGAATGGGTGGTCAAAATTAAACTTTTTTTCGGGAC
AGGGATCTTTCTAAGAGAAGATATTAGACCTTGTCATAAATTACGATACG
TGAAACGCTTACCTTTCTTTTAAAATATTGTTATGGTAATTGATTCACAG
AGGAGTTCACATAAGAAGTTTACTCTATTTAAAAAGGAACACTTGAATCC
TCAAGGGATATAATCACCTTGGTAATGGTTTTAAAGTTTTATATGAAAAT
CCCTTCACAGTGTGTCCCAAAAAATGTGGATGAATTTTTAGTTAAGTAAA
ATCCTCATATAATATATGCGAAGTTTTATCACTTGTATACTCAAATATCA
ATCTTACAGAACTATTCAATCTTCTTGGGAATCGAGTATCTATCTATTGA
ACAGAGAAATTTAATCTCATTCCAATTATTCTAAGCCCAGTGAAGATGCT
TATTTTTGAGAGGACCCATATAAAGATTTGCTCACTTTTTTGGGACACAC
TGATCATATTTATATCTCGAAATTTTCCTTTTCCTTTTTAGGCGGTCGAA
AATCTGGTGAGTTCATTGAACAGAAAGATGTTGCAACCATGGAACAATGT
TCTGAAAAGTGTTGTAACGACCCCGACAAAAAATGTAGTCTGGCGTTCAT
GTTAGGAAAAGCGTGCTATTCAGTCAGGTGTGATAATGCGGATTTGTGTC
AGACGATCAATGCACCGCCTACCAAATTCAACCCAATTGTGCAATATGTG
AGAGGATTAGACGATTCGGCGAGTAATCAAGGTATCAATCTAACAACAGA
TTTTATTTTTGACATAATAATTACTCTCGATGTGTTTGTACGAGTTCCAA
TCCCATCAACCTTTGCGTTAATCTCTTTTGCACGTTAATTGCATCATTTG
ACAAAAGATATATGACAACTTGCACGTATCTTTAATTGAATTGTGAGATT
GCAACTCGTACAAATGTTAAAGAAAGTGAAATATAACAATTATAATGTAT
GCGTTGTGGAGCGCTATTAGAGTATATACTAGACGGTTCCTGACGTCGCA
AACGTCGGTTAAGTGTTGTTGGACGCACACAATGCTCTTAGAGATAGCTA
TCATAACAAAATGATAAAATCTATATCTTGCCGTCACCCGGTGTTGTATC
TGCCTAAACGAGTGAAGCTGAACGCGTAGGCCCTTTGGATAGAAAATGGG
TGTAAAAACTTGAATTTTTAAGCCGAAAAACAAAATATGTGTAAAAACTT
TTCGAAAATGGTTTTTCTTCGCCGAAAATACGGTCCTCAAAGTTGAAATA
CTTGTCTTCGCAAATGTCCTAATTTACTTCTTCATCAAATTTTTCAATTA
AATTTTTGAATTTTCAGATTCAGGAAAAGTCAGTCTAACAGAAAATGTTT
AAAATGCTATAGTTTTTTGGTTACATCAGTCAGAAAAACACATTTTATAC
ATGACAATTATGAAAAATTCACTATGGTCAGAGCCCTTAAAATGGTTTAA
AACTTATATATATTATATATTGTAAACTTAGTGTTTTGTGACGTCGTCGA
AAGGGTCACTGAAATTAATTTCTCATTGTTCCAAGAGATTATTTCGATGA
TTACCGATCGAATGAGGGGTCAATTTGTTAAATCATATTCTCAAACTCAA
AATATCGGATTTTTCATGTTTTAATGACGACATTGGACCCAAAATACCCC
AAATTACACCTACTTATTTTTGAAACTCATCATTTACTCGAGATTTCACA
TTTTAAAGTTTTTCCAAAATCTTTTGCTCCTTTTAACCCTAATGTCTTCA
ACGTTCAATTCGCGAATTTTGGAATTTTTGCGGTCAACGGGTACTTTAGG
CCCGAAGAATCCGAAAAATTTTGGTTGTTTCTTGCCTGTGACCCATCTAA
ATATTTCAGTTTTAATAATGGAAAGGCAATATAAGTTTTGAACGTATAAT
GATTATTAAATTTTTAAAAAATCCGAGCTAAATTATGCTTATATAGCAAA
GTATTTTGTTACAAAAAACGTATATATAATGTTTGTGTATGGTTTATTTT
TAGCGCAACCAGAAGCATCCGCAGTTGTACAACAACCATCACCGACCACA
ACCACAACCACCACCACAACAACTACAACAGAAAACAAACCAGTTTGTCG
CACGCAACCTGTCGTACACGGAAAGTCTATCAAAGGTGGCAAAAAAGCAG
GTAAGCCTTTAATGATTGCTCGATCCAATCCCCTTTGTCACAGACCCGCT
GGGACCCCAGCCTTACTGGAAAATTTGGCAAAAATTTGGGCACCGGTTTC
AGTCCCCCCCCCCTCCTGGGAATTTACTGATTTCATCCTCATTCGAGATT
TGATGTTTAAAAACTGCGCTCCAAAACCATTGGAACCCCACTGAACTTTT
AATCTTGGAACAATAGAATTTCTATTCCCATTGAGATTTTAAAAGGAATT
TTTATCCACACTGAGGAAAGAAATTCCAACGGGGCTGTGAGACAGGGGTA
TAATTCAGAAGTACTCAATTCATCTATGTAGTCCTGGAGAGTCTGATACT
GAGAAACCATCAAGCAACCTCGTCCTTGTATCCCAGGCTTCATGATTGAC
GCCAGAGAATACCTCAGGCGCTATCTGGCATTATTACCAGTCAGCGTTTA
AAAGCAGATAATACGCAGGGAACGAGGTTGGTTGCCGGTTTCCCGCAATG
AAAAGAATTATCTTTCCACTACCTTCTTGAAAAATATTTTATATTAGCTG
TCAGCCTGAATTCTTTGCCTTTTCTTTTTAAGTATTCGCGGAATGAATTA
AATGTCATTTCATTTGCCCACTTGACTAAAACAATAATGAAAGGCGGTTT
GATTTCACAAAATTCCCCATTTAATAAGTTTTCTTAAATTGACTGATTGG
TAGATTTTATTTTATCCCAACAAGTTTGATTTCATTTTTTCAAATTTTGG
TGCAAGTTTTTGAGATTTTCGGACCCATTCCCATTTTAAAGGGTAGATTG
GGCAAAGAATAAAGATACGTAACAGACCCGGCGGAACAACCGTTAAAGTG
GGGGAGGCTGAAGGCTCAAAATGGGATAAAATTTGTTAGGACATTAAGAA
AGAAATCTCAAAAGTGGAGGGGGTAAAGTCTCCCCAGTCTCCCCGCTTCC
GCCGGGCTTGCGTAACTGGGTTATTTACTTCTAGGTAAATTCAAGATATT
CAGAGCCATCAAAACACTGGATACTTGTATCGCCAAATGTTGCACATTGA
AAGACCAATGCGACGTAGCGTACATGGAAGATGGCAATTGTTACAGTATA
CAATGCTTCAAGAAATCCGCATGTACGGCCATACCGCTCCGTGATTCTGA
CGTTAATCCGGCGTTCGCTTACATGGATCATTTCTTAGAAAAAGTTGACA
AAGAAGAATCAACTGCGGCCGCTGAAGTTGATATAACGACAGGTAAGGAT
TTATTTTGATGATTACGGGTCGACCTCGTGCCCGTGTATCCCAGGCTTTA
TTTACTTTACTGATAGACGCCAGAGAATATTATCTAGCGCTATCAGTAAG
CGTAAAAAAGCTGATAATACGCAGGGAACGAGGTTGATACCGAGTTTGCT
TAAAAAAAACACCTCTACTGTCCGATTTAATTAAAGTGCGTTTTTCTATT
TGCTCAAATCACTTAAAAAATCACGTTTTAAAATTGTAAGCGGGGGTGGG
GGCAATGAATATAGAGTCTAAAGAGGCGCAACCAAAAATCTTTACTTTGC
AAAAAAGTGGGGGCCATGGCCTAGGACTTTATAGTTTTGCCTGTAACATA
GCGCTAATTCTTTCTACAAATTATGAGATAAAAGCATACCCCAAGCCCCC
TATCCATCAATTTACAATGTTCAAGGAATGGCGAGACTTCCGTACACAAT
GATCATTGTAAATGGGGGGAGGGGAGTTTTTATTTCATTTCTGATATGTT
TCCTTGTTTTTTCTCAAAGATTTATGTCCATGATTGTACATGTGGTTGTG
ACATACCCTGAAGGTTTTGATAGAAGAGGCCCCCAAGCCATCTGCGTGAT
GACGTGATAGTGACTTTTTTCTAGCTTAATTAAGTGATTTAGAAATTTTT
TGTTGTGTTACGTGATCGTGACAAAAAGTTGCGTGATATCGGGATTAGAG
TTATCGCTGGGTGGGCCTCATAGTATTTTTCCTGATGGAATTTTTGAAAT
GAAACTAAATGATATCCTTTTGTCTCCCTTACAGAGCTGGACCAAACAGA
TGTCAACACTTGTAAAAACACTGAAGTTATACACGGCAAAACGCTCAAAG
GCGGTATGAAAGCGGGCAAATTTCATCCGCTCGGTAAGAAAACAATGAGT
AGTTGCATCTCAAGCTGTTGTGATCGTCCAAACTGTGACATCGCATACAT
GATGAACGAGCGATGTTTTTCCGTGCAATGTTTGGATTCCAAACTATGTC
AACCGTCTAACGAGCACGTGGAGAAAGGGAAAACCGTACAACTGGCGTAC
ATGAATCGACCTGAAAGCGCTGATAAAAAACGAGGTATAAATAGTGATTT
TCTTTATAAATTATAATAACGCTTCATCAGAATTTGAAGAAGTTGAACGC
TTATAAGCATACCAAGCCCGGGGGGGGGACACTGGATTTCTAAACGACCA
AAACTTGGCTTTCAAAAGGGTACCCTTACAGTGCATTTTCCAATCTTCAA
CCCTTATAGTGTAGCATAGAACAATGTCTTGGAAAATTTTTTTCCTTAAA
CTGAGCCTCAGCTGTTTGTAAAATGGTCAAACGTATAAATTTCGGGGTTT
ATAAAGTAAAACGCAGTTATTATATTAGGACAGTTTTGGCTGAACAGATA
ATGATTTAAAACTGATTCTGCTTTTGACTTTCTCGATTATTTAGATTTTT
GCACACACTTTTTTTATAAAAATTATTTCAAAAACATAGCAAGACTCAGA
TTTGATGCAAAGCTTTAAGATCTTTTAAGAATAACAAAATACATCTAAAA
ACGTTCAAATATTCTCAATGTATTTTGAGCTTGATTGTAAGGTTTATTCA
AAATTTATACAAGTTATGCTTTATTGAAAACTTACAAAAATTCCATTTTC
TCTATTAGATTTCATGGTCGTTTATGTCATTGTTGGTATGGTCGTAATCC
TATCAGTCATTGGCGGTTTAATATGGGCGGTTTTTGTGGTGAAGAGGCGT
AAAAAGATTGACAACGCCAAACAACCTTTACTAACGCCCGAAGATGAAGA
AGAAACTATTGATAATATTATGCACAAAAAACGTAAGTCGAGGAGTATTA
GTAAAAACTTTTTTTGGCCAAGAAACTGACAGATCATATTCTACCAGCCC
TAGGCTCTGCTTTCAAAATTTCAGTAAGTAAAAGTAAGCTTTTTCAATAT
AATTTTCCAAAACGACCCCCTTTTTAGGCCAAAACACTAACTTTTTGGTA
AAATAGAGTCATCTGCCAAAATTAGTTATCACCAAAATAAAAATATAAGC
AAACTAGCCGCATGTTTTCACCAAAATTAGTTCCCTTTAGATGGATTTTG
GCGTAGCGAGTCTAACTTTATAGTCTAAAACGAGTTTCAATTAAGAGGCA
CAAACGTGAAGATAGGAATATTTTCAAGGGAAGCTGTTCTATAATCCATC
ACTCCTGCCGCGTTTCTACTATACTCATGAGCGGCTTCAATTCGAATGTT
TTCTTCCATAATGGTGGAAATTACAACGAAGTGATACGCAGCCTGCTATT
ATCCAAATTTGAAACTAATCCTATATTTTTAATCATTTTAAGAGCAATAT
ATGTAATGTGTAATTTGCCTCATCTTTATAATCATTCAAAGTTTCATCTT
CATTCAATATTTTAGCTTCAAGATTAAAACGACAACCTTACAGACAGCCA
CGATTCTAAATGGAAATGATGAATAACGTTTTTGGACAATTGCCGGTTGA
TTGATGGGCCCTCAGGATCGCTGAATATTCATAATTGATGGCTTTGTCAC
GAAATAACTGGAGAGGGGCTCCTACGCAAAGGACCTTTTTGGACCTTCGA
AATTCCGCAAAAGTCGTATTACA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_002390	XLOC_002390	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000041	supercontig	sc0000041:771753..786075 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.461291	0.942698	0.345686	0.00366029	2.52189	3.2361	13.6781	11.5032	3.73468	2.91568	16.7122	11.8937	14.8266	11.3615	9.28945	25.8533	17.7515	18.1913	0	0	6.72597	7.99882	3.74994	5.66765	6.22585	8.84278	1.32894	0.362272	0.53001	1.02146

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00004307 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00004307 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00004307 (transcript) - C. hemisphaerica