TCONS_00003863 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00003863
Unique NameTCONS_00003863
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length605

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00003863 ID=TCONS_00003863|Name=TCONS_00003863|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=605bp
atttaatctattgttgAATTTGAGAAATCTAGAAATTCAAACCTTGTGCG
ACAAGAGATGtatttcatcattttgttcGTTATTTTACACCTCTCAAATG
CAATTACTTTGAAAAACTGTGaCAAAGATGCACCAATTCAACTATCACTC
ACTCAAGCACCAAAACAACTACCAATCCAAAACAATGCTACACTTCACAT
CTCAGCTGGTGTTCAAATCAAGAATTATACTGTTCCACGAAATATCAGAG
TTGAAGTAGATGTCTCTAAGAAAATCTTGTTTTGGGTCAAAATTCCCTGT
TTTGGGTGTGATTTTTCATTATCATGCGACAAGATGCCAGAGATTTGTAT
GGTGAACGACTTTTGTAAGGATTGTTCTGTCAATGTACGAAACATTAAAG
TTCGAATGCCAGCTGATATTGAACAACAACTTCCAAGATTTTTACCAAAC
TTTGTCATAAATGGTCATTATTGGGCAAGATTGAGGCTGATCAACAAAGA
CAAACCTAAAGAGACAGTGGCTTGTATAGAAGTTGAAACTGATGTAAAAA
GTCATGCTAAGAAGAAGTAAAATCTGAAAGCTAAGAAATTGAtcgttttt
atttt
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000038:73360..84023+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00003863 ID=TCONS_00003863|Name=TCONS_00003863|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10664bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000038:73360..84023+ (Clytia hemisphaerica)
atttaatctattgttgAATTTGAGAAATCTAGAAATTCAAACCTTGTGCG
ACAAGAGATGtatttcatcattttgttcGTTATTTTACACCTCTCAAATG
CAATTACTTTGAAAAACTGTGGTAAGTTTCGCTCCCATACATTTCTTATG
AAAACCAGTGCAGTGTGCTATTTAATCTTAttggtttttttatttgattt
ctagttTAAAGCCAGCTGAGGTTATggttattttcttcattttaaacTTT
AAGAGTCTgctatttttataattttctttcaacCCACTATTTGTAAATGT
TGTTAGTTTTAAGATTAACTCTATCAAAGTGAAACTAGATTATTAAAGgc
ttttgtaaaaaatcaaaaaaaaattgtatccAACATTTAAAAACCATTGT
TGAACGTAATGTTCCACAAAAAGTCACGTAGAAAAATTATGAAGTTGCAT
GAATAGTCATCTGTCCAACAACGTCCAACATAATTGGTCAGCCAAACTGA
GCTTTAAAATGGGTGTTTGCCTAAAGTGGCAACCGTATACTGGGAACTCT
AAGTGGGAACCCAAGTGGGAACTCTAAGTGGGAACCCAAGTGGGAACCTC
AAGGTGAGAACCCAAAAGTGGGaaccctaaagtgggaacccCAAAAAAAC
GAATCATGAAAACATATCGAAAACATCACTAATCCGCAAAAAcgatatgt
tttcattttttaatcttttaatcCCCTATTGTCCTAGAACCATTCATTAT
ATACTACTCCTATAGCTGTCGGTAGAGTCAATCAAATCTTGGgttatgtt
tacatttttagaCAAAGATGCACCAATTCAACTATCACTCACTCAAGCAC
CAAAACAACTACCAATCCAAAACAATGCTACACTTCACATCTCAGCTGGT
GTTCAAATCAAGAATTATACTGTTCCACGAAATATCAGAGTTGAAGTAGA
TGTCTCTAAGAAAATCTTGTTTTGGGTCAAAATTCCCTGTTTTGGGTGGT
ATGTtaattgttattgtttttatgtgTTGAATGACCTTGATACTCTTGGA
AATTGCTCGATGTGGGTACATCCGTTATATAAAGGCAAGATTCGCGCCAC
GTTGAGTAGTGCTTCCACGAGGGTACCAATTTTCTATAAACCTTGATTGT
GGAATTATCGGACACAGGTGTTCGTAACGTTATGAATTGATTGAAtgtat
gttcaaactgaaaaataagtttgataCAAATTGatctaagttgataaatt
acaaatttgattgaaaaacttACTTTAGAAAATTTGAGTTGACAAAGCCT
TGATATAAAATAAAGTTTAGAAAATATTAGCTTACCAGCCTGCCAAATGT
GAATTGATATGTGAAAATAATTCCAAATGGTTCAATGTAAATGTATATGT
AAATGTTCAAAATGAATGTTGAAAACTTGATTCAAGTTTGTTCACTGAGT
TCTTGAAAACATTCTGGTCTCTTCATACCACACTCACGCCTTATGATATG
TGATTACCACACTTTCGTCGATTTTGACGTCTTCGCATCCTTTGATGAGT
TGGCTACCAGAGTCGATGAAGAGCTTCTGAGGATAACCATGGTGAGATGC
AAATCGTACGAACGCTTGGATGAAGGCGACAGTGCTGTAGTCNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAGGAATTGTTGGTTGTTGATTGT
GATCGTTTGAAGTTGATAGATGGCATTATCATTGTTGGTGGACGAATGAT
GGCCTTCTTGTCGATTGAAGTGAAGTCCCATGTCTTTGACGAATGGTGGA
AGCTGTTCTCGTTTTCTCAATAGCATATCCTTGTATTGGGTGAGAAGTTG
GTCGTTTTCATGCTTGTGATCCTCACATACGAGTACGTGCTTTCTGGTTG
AGTACCTGCTATTGTTGTGAACTGGATTTTGACATGTAAAATTTCGTTGA
CAACGACCTTCCTTATGCTTGGGATGGGACAAAGACGCTCCAGGGAACAA
ACATTGGTAGCAAAGTCCTTTAGCCTTTAACTCGTTGAATCTTTCACGGG
GGGTGAGATtgacaaatttttcacaaaCGAAGTACTGGATGAGTCTAGAA
CCTCCTGGGCCACTTGTAACGACGTGGTCGGTGGCACCACAGATATAACA
TAAATTTGGATCTCTTACCCCTCCTCCTGAGTGGtgtccactttgacgat
ttttagGTGGATCATTCTTGGGTTGGTCGTTCTTTTGATCGTCAGTTCGA
TTCTTGATCAACACTTTTCCTTGGGTGATACGAATCTCCTTCTCCAGGAA
ACTGGTGAATTTTCCCCAGAGATCTTCTCCTTCCAGGTCTTCTTCACAAG
TGATTGATAACCAACGATTTTGTCTGTGTTCACCGATCACCTTGCATAAC
TTCTCGAGACTGTTGCTGTAGTACAATCTTCCTTCAACATTGTGTAGTTT
GGCGAGTTTCATGGTGTCTTTGATGAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNTACTGCGTTTTGTGATGTCTGCGTCACTTAGCTCTGGAAG
TTTGTCTGAGAGTTCATTCTCCAGTGATGATTTGAGGGAGGTTATGCTTG
AGCTGATGTCTTTGACCAAACGAGTGTCTTGATTCGtttctttctctctt
tttactTTCAATGTCTTGATGATTTCAGCTAGTAGAAGTTTGGCACCTTG
CTTCATTTGAAGAAAATCATTTCGGAATTCTTCTTTGATCGGGGACAACT
CTTCTAGACGAATGAATAAATCTCGAAGGGTGTTCCTTAATTTCTCTAAT
GATGTGAAATCCTTATCCAGGGATTTGATGCTTGCTGGTGGATCAACTTG
ATGCTCGTCTTTGAAGTCTGCAAGCTCAGCGTGAACGATCTTGTAATCGA
TGGCTAACGATGCAATTTCAGCAGCCATTGCGTGTGGGATAGCTACTTCT
GATGTAGGAGGTTGTTCTTTCACGACTTTACAAAAGGTCTTATAATTGAT
TTGGTCTTTTGTCTTCAAACGATCACTCCTTCTCATTGATTTGATATATG
GGTGTGTGAAATTGATTGGATGACGTGAACGTCAGCTTGAGTCTGTGTGC
GACGGTTTGTTGAGCGTCAGCAACGATTGGTTAAATGTCGTACGACAGTT
TGTTGAGTGTCGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGCTCTCGAATGCTCACGG
GAGACATTAattgataaatataaaaaactaattgacaaatgacgtcataa
tgaccTATGcgtataataattttttttttttttttaattgcttttcttat
aaataaataatatctTTTGCACGTTCGTGCTACATTGATCAAGACAATGA
TTGGTCGAAATCATAATAGTATATTCGGTGTTTAAATAGGGCTCAGTGGG
TGAAACAAGTGACAgtgatcttttcttttttaagtcTAGCTCTCTACAAT
CATcgtcaaaatctattgagaatttagcttatttctttgttcttcgaaat
ttggagtccaggcgagaaagtcgattttgggccatctcttaaatttaatc
tgaaatttcaatttggcacgggtttatagacttccaggctatctgcggag
ccttattggaccatttttgaacttttggatcctcagatcctaagtctTAA
AAGTCTAGCGTTGAAACGCTACCTTTCCAACCTTCCAAATCATTTGTAGT
GTTGAAAATTTGtgggaatttctcttttttctaaaatattacgaccatga
ttgtagatctACAATCAGCGCCGTAATATTTGGCATAAAAGTAGAATTCC
CTCAAAATTCTTAAATGCTTTAAATTAAAGTACAGTTGGAAAGAAGAGCT
TTAACTCTcactgagttttaacatgagacttaagttACAAGACTTaagat
ctcaggatctaaaagctcaaaagttttccaataaggctgagcaTGTATAG
CCTGAAAGAGGGTACCTCCCAAATCgtaaaatccaatgaaacaaagtgga
agtactgaaatcgtaattctcgcccgagctttaaattttgaaaaacgtta
aaattcccaaaattggCAATATGTTTCGGCACTGATCGTAGTGATTGTTT
TTTTGAGACTAGGATGTATGTAAACAATGTATTCAGAATTGAAATTTTGC
CTTTTCGCCATTAGTGttgtaaaatgtttttaaggttttagttttacata
agttttcttgtttcttatcagacacatgttttatATCAGGCTGGCATCTC
CTATTGATATATTGTGTTCGATTTCCTgttgaataaacaaaaatcctttt
tttcctTCTCTCTAACCAATGATGCTCcatatccgtgtcaattcaatatg
aaaaagcatgcaatttaaaattgatgagtaaccAAACGATATCAACTTAG
TTTAAAACTATGAAGTTTAAATTTCAGCAGCACAATTTTTaggacaaaat
ttcaaaaatttattcctTTTTATTCAACTTGTTTCTTTTAAGTGATTTTT
CATTATCATGCGACAAGATGCCAGAGATTTGTATGGTGAACGACTTTTGT
AAGGATTGTTCTGTCAATGTACGAAACATTAAAGTTCGAATGCCAGCTGA
TATTGAACAACAACTTCCAAGATTTTTACCAAACTTTGTCATAAATGTAA
GTATTGGTGTGGCTGCTCAAAATTTGTACCCAGTCCCTTAGTTAACGTTT
TCCTTCATTCTTATATtgcgtgtacattagtaaaatcaACAATTGCCCTG
GGtacgaaattttttttgtactGGCTgcgacttttttgttttaaagcaaT
CCTTGTACAGTTAAGTACCTTTAaactaccgggtgtgccacaaataagtt
accctctttgatttgatattgtaggcaTTGAAAAAAAGAGATTATTATAA
AGATTGTTTCGGAATCATCCAAAGGAAACCTAACTTAAATTgggtgtatt
actttttaattttacttcattggttcaaaagttatgttcaaaaacctaaa
atatcttgaaaaatgtcaaaaaaaggtcaaaaagtcATTCCTTTACTACT
TACTATACAAGTCAAAGAAATCATGGAAAACAGGTTTTCAAAAGTTGGGT
ATTGCTATTCATTGATTCTAATATACTAAGGGAAGAAAACCTTGAGGGTG
GTGGTAACCTTTGATAAATGTAACCTGCTACCACGTCAAAGATACTTTGC
AACTGTCTCTAAAAGGTAACTTTAACTTTCCCTGATTAATTTCTTGCTAT
TTTTCTATTCATATTTCGTAGGGTCATTATTGGGCAAGATTGAGGCTGAT
CAACAAAGACAAACCTAAAGAGACAGTGGCTTGTATAGAAGTTGAAACTG
ATGTAAAAAGTCATGCTAAGAAGAAGTAAAATCTGAAAGCTAAGAAATTG
Atcgtttttatttt
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_002169XLOC_002169Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00003863-exon-sc0000038-1491911889:73360..73480TCONS_00003863-exon-sc0000038-1491911889:73360..73480Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003863-exon-sc0000038-1510915933:73360..73480TCONS_00003863-exon-sc0000038-1510915933:73360..73480Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003863-exon-sc0000038-1575043694:73360..73480TCONS_00003863-exon-sc0000038-1575043694:73360..73480Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003863-exon-sc0000038-1491911889:74171..74357TCONS_00003863-exon-sc0000038-1491911889:74171..74357Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003863-exon-sc0000038-1510915933:74171..74357TCONS_00003863-exon-sc0000038-1510915933:74171..74357Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003863-exon-sc0000038-1575043694:74171..74357TCONS_00003863-exon-sc0000038-1575043694:74171..74357Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003863-exon-sc0000038-1491911889:83102..83255TCONS_00003863-exon-sc0000038-1491911889:83102..83255Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003863-exon-sc0000038-1510915933:83102..83255TCONS_00003863-exon-sc0000038-1510915933:83102..83255Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003863-exon-sc0000038-1575043694:83102..83255TCONS_00003863-exon-sc0000038-1575043694:83102..83255Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003863-exon-sc0000038-1491911889:83881..84023TCONS_00003863-exon-sc0000038-1491911889:83881..84023Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003863-exon-sc0000038-1510915933:83881..84023TCONS_00003863-exon-sc0000038-1510915933:83881..84023Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003863-exon-sc0000038-1575043694:83881..84023TCONS_00003863-exon-sc0000038-1575043694:83881..84023Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000038supercontigsc0000038:73360..84023 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0	0	0	0	0.22865	0.419264	0.256707	2.43552	10.9257	7.68221	8.05704	18.2618	0.593435	2.61991	34.7209	25.6231	3.37809	6.08817	1.16757	0.403923	0	0	0.15208	0	1.20516	1.59226
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00003863 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top