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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00003815 ID=TCONS_00003815|Name=TCONS_00003815|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4593bp
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ATAATTTATTAACcattctattcaataaaataatatttgaaac Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000031:718282..723081- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00003815 ID=TCONS_00003815|Name=TCONS_00003815|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4800bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031:718282..723081- (Clytia hemisphaerica)
GAAAATTACTTTCTTTATTGTGAAATTAATATTCAGATCTATAAAGGAAC
TTATTGATTAAACCCCCGTGTTGGTAGAGATCGCGGACTTATTTTGTTAC
AGAATTAGGCGGTAAACTTGCAGAAGACGAAAGACAGACAGCGGAACAAC
TGCACGATCAAAAGGTAAAATTTGTCTTTTGTTTTTTATTCTACTTTCGC
TTTTGACTGATTGAGTTGGAAAATCAGACAAAATCATGAAATATGGAGTG
ATGTACATCAATATTTGGTATTTGCATTTGAAATGGAACATGATTTGATA
ATATTTGGAATGAGAAGTACTTAATCTCCTTGGCTGATAACTAAAGCTGA
TTTGATTTGCCCCATTTAAAACTTGTAATTTTATAAAGCTGTAAAAGAAG
CAAGAAGGGATATATAGGAAAAAAAAACTTTTAGGAAGGCTCCCATTTTT
GCACAATATGACAGAAAGAGCAAGAGATCTTCCAGGGCACATACAATTGT
TGGAATATTGCTGGTTATTAACAGCTGGGCTTTATATTTTGTAAACATTC
TGATGAACATTTTTGCTACTTTCACGACAAAAAAAAGAGAGATAAGTTTG
GCCTGACTGAAAAGTTAGCTTTATAATTGAGGCTGGTTACTGTGGAGTCG
TGGGTAACTTTGCTTTGGCACTGTTTTTCTTGAAAATTATGGTATATATT
GTTTGAGCTGAAAATCTGGTTTTGGTTTTCATTAGCCTGGGAGACCAGGC
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AATTCCATACTCTGTATTTCAGTGAAGTTGTTGGGATTTTTATAACAGGA
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TCAAAGAAAAATGTTTGATAGCCAAGCCAGCCAAAACGACCGTGTGTTTG
GCGTGGTTTCAATTTATGACCTTTGTTTTGAACACTGTGACCTTTGACAC
AAAACGAATGCGCTAGAAATTGCTCGCAAAAAATTGGCAATTATAAAATT
TTTGAGCGAAGAAAACGTCAACGCAAAAATTCCGAATTTACCGACTCTCC
GACTCGATTCTACTCAATTTTCAAGAGTCGGTCGGGCGACGAGAAACGAA
GATATTTGCGATTGCCGCCCTAACTGTCAGAACTTTCATTGATAAACATT
TTCTGCTGTTTCTAATAAATACCGTAAGTTAGATTGATGTCAACATCCGT
CCTCTAATTTTGACACCCTTATTAGATATGTGAATGACAGAAATGTCGAT
ATACAAAAGATTTTTATGATAAGCAAAGAAAAATGTTTTCATCAACGATT
TCAACCTTCATGTTATTCCTAAAACACTAAAGAAAGGTGTTGGAATTAGA
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AACCTGTTCGAGCGTCAGCCAATTAGGAGGGGGAGCAGGGGGGTCAAGTC
AGTGTACTGGACCATAGGGTACTAACTTTTTTTTTGGATTTTTTTCCAAA
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TCCGGGCTTTGACACCACCCTCAGTACATTGTACTAACTTTTTTTCACCG
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TTAACTAGATTTTTATTACCACCCTTTCAGTACACTGTACTAGCTGTTTT
TTCGATCAGATAAGTTTAGAAACCACCCCTTATAGTGCACTGTTCTAATT
TCTTCTTGGCCAGATAAGTTTAATTGCCAGCATATATGGGCCAGTACACT
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GTTATCTGGTCTGCAGAAATTGAGGCCCGAGTTATTTTTTCAAGTTTTTT
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TTAAAAGTTATTTAAANTACTTGAAATCAAAATTTTTCTATTTATTTAGA
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TGCCAACCTATAAAAAAACAGGCTAAAATCCATACGCCTAACTATAGTTA
TTTGTTTTTCAGATCTTTATTTTCATTTCATATTTATAAACTTTATACCA
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AATTGTATTCTAGTAACAATTGTATAATTGCATATTAATAATTGTATAGT
ATATTCCATAATTTATTAACCATTCTATTCAATAAAATAATATTTGAAAC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00003815-exon-sc0000031-1575043694:719188..723081 | TCONS_00003815-exon-sc0000031-1575043694:719188..723081 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00003815-exon-sc0000031-1510915933:719188..723081 | TCONS_00003815-exon-sc0000031-1510915933:719188..723081 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00003815-exon-sc0000031-1510915933:718282..718980 | TCONS_00003815-exon-sc0000031-1510915933:718282..718980 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00003815-exon-sc0000031-1491911889:719188..723081 | TCONS_00003815-exon-sc0000031-1491911889:719188..723081 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00003815-exon-sc0000031-1491911889:718282..718980 | TCONS_00003815-exon-sc0000031-1491911889:718282..718980 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000031 | supercontig | sc0000031:718282..723081 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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