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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00003756 ID=TCONS_00003756|Name=TCONS_00003756|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2492bp NNTTCCCTTTTTGTTAAAGTTTTGTCTCGAGATAATAATCACTAACCTTT ATCCAACCCTCTCTTATCCTGCTGTATAGAAAAACTTCTTTTCGGGATTT TCGAATGCGTTGGTCTTCTTTTTTTACTGTACATATATAATCAGAAGTTT CTGAAGAGAGGGGGGAAACGATACTTTCATGAGCGCACGCGCGACAATAT GACACGTTCCTAAAACGAGAGGGTGTATCAAAGAAAGTATCCAttcagaa tttaaaaatattaaaaaaagaatttaataataaaaaagGGTTATTATaga aaaagattattttttaaacagataaaatttttttccagaacTAATAATTT GTATTGTATTTTGTCAAACAGTCAGTATTTTTGTTGCCCTGTTCATTATT ATTTTAGTCCAAAGTGTTTTTTGTTAATCCATCTCTCTTTTCCTTTTCCT TGATCTACTACTTCAGTGCTTTCTGCAGCATTTAGGTTCTACCTGAACTA TTTTAAAACGTTTAGTGTTGTACAGGCTAGTTTCAATTTCTTAGACTTTA GAGTCTAGATCTTTGTCTAATTCTGAACTGTGGAAAGCAGACTTTTGGGT AATTTTAAAATGGTTACACTTTAGAAAAGGACTAAGAGAGGTCGATTGAC AATATCCACTCTAAAGATAAAATTTAGCTAAATAATTTCATCGCTTTATT AATAATATATAGTTTAAGAGAGAATTTTACTTGAGgttttttttcactaa aaattaTTACGCTAGGAGAGAATAATAATGGTATTATTATAATTGAGACA TTGTGAAaggtttatttttttatataaatattaCTACTAAAGAAAGATAT TATTGTTTTTGTCCTATCAGAGAAGCTATGACACACTTTACCTAacacaa aaacatcaaaaacaatacaaaaaaaacaatttttgataattttttatcaa ggaattattttttttcgtttttgttgttTATAAAACGAACACTTTACTTA ATATAGTTATTATTATGATCATagagaaagaaaattattaaatacATTTT GACCTATATCGAGAGACTGAGTGATGGTGCATTTTTGAGTGtgcgagaga aaaaaaatactttcgaatatgataattttttataaaatataaatagttga aaaaggttggaaaatattattattatttagaaAACACGCCTGAAAAATGT TCGTTTTTCAGTAATTCATTTTGCATTTTAGAGTTTTTGTAGTATATATG CTTATAATTATAATTAGTGATATgggtttatttttttcttctgttcAATT TTAACGGTTTATTTTTGTCTTTCTCACTCAACaaattattttgcaatttt aacctttccttttttttgtatattttttcataGCGGCAAAAATTATCTTC TCAAAGTTAAAGAGTCATTAATCTTAAATTGGTCTAGGTAATAGGTATGC TTTCCAAATCAATTAAGAGAAACATCAAGAGTGCTTTCCTGTATATTGCA ATTTTCCTGTCCCGAAGTAGTTATCTTAAATTGCCGAAAATCAATCTTTC TCATTATTTGTTATGGTGAAATTATAATCAAAGACTTTGGGCTTGCTTAG CCAATTTTCTTGATGATGTGTTTATTCATTTCAATTGTCACAAACTTCCT GAATTTGTCTCGATTAGTTAAGTCCCagctttcttttttcaaattcataa tggcggccTAATTATTTTGTTGGTTACAAGGAAACAAAGTTGcggaaaac attttcaaattggtCAGCTTTTTAACGACTTCCTCTGATGGtcattttca tcttttcttttaattacgttgagaaaaacattcaaaagaaGAGCGGAACC TTTCTTCATAAATTACCATGTGTTTGTGTTTACTTTAGatgtttcgaatt tttgaaTGTCTTTCCCATTGCATTCAGTGAGGTATTTTGTGACATGATAA TTAATGTTTTATTCACTACTCATCTGAAAATTAGCTTAGTTTTAGTAAcc cattttaagaaaatttgcactccttaaaaaatgcactttttacAGACAGC ACCTACTTCGATTTATGAAACGACCAGATTATTTTGATGTGTTTGTTTGT GACAATTGTAAAAGAAAAAGTATATTTTGCTGTGAAAAATGCTATAACAT AAAAtgtttgataaaataattattagTAGTAGATAACGataatgatattt tttgctTTATATATATAATTAATACTACTTTTTCTGTTAGAGATTTATAC CTtatatacaataataaaaaatctACTTTGCAATGACCTTACTACTTATG AGAGATGAGAAAACGAAATTATTGTATGTAACGAAAACAACAATTTTATG ATATATAATAATGACGATTTCGcctattttttaatatttaaaatgtatat gtattatcagacaatattctccaaaaaattattattactaTACAGTCGaa tagaaaaatttttatctttcaaGTGAAAGAATTCcattgttg Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000031:706951..709442+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00003756 ID=TCONS_00003756|Name=TCONS_00003756|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2492bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031:706951..709442+ (Clytia hemisphaerica) NNTTCCCTTTTTGTTAAAGTTTTGTCTCGAGATAATAATCACTAACCTTT
ATCCAACCCTCTCTTATCCTGCTGTATAGAAAAACTTCTTTTCGGGATTT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00003756-exon-sc0000031-1491911889:706951..709442 | TCONS_00003756-exon-sc0000031-1491911889:706951..709442 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003756-exon-sc0000031-1510915933:706951..709442 | TCONS_00003756-exon-sc0000031-1510915933:706951..709442 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003756-exon-sc0000031-1575043694:706951..709442 | TCONS_00003756-exon-sc0000031-1575043694:706951..709442 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000031 | supercontig | sc0000031:706951..709442 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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