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transcript sequence >TCONS_00003424 ID=TCONS_00003424|Name=TCONS_00003424|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1333bp TTTGTTCTCAATAAACGACGATTAAAACTGGATCATTTCTCTTGGAAAGT TTTATAATCAAAAGTTTAACTTGTGAAGAGAGGAGTTAAgcgtaaaaatt ttcaaaaaaagacgatttgaaggaaaaaagtttcaaagaacAAGAAAGgg atataaaaaagaacaaaaaggaaGAATTGGACCCTAACGTTATTACAGGA CAAACAAGTCAATCATCTATAGGCGGAAGTAGGAACTAGACTGACGGAAA CTTGATATAATATTAACACTGGCTATCATCTTACCGGAAAACGGAGGAAA GACATTATAGAGACAATCGGTATTGGATATAGTTACagattacacatttt ttatgcTGAAAGCAAATTCCGAAGATCTTAAGGGCAAACTGAAAAGCAAC ATACGTCGTAAAACCAATAGATACATTGACACaagatttcattgaaaata gatcATTTTGACGAAGCTACCGCCACGATGACTGATTATTTTACATCCAG CGCACAATTGGACGAGCACATGGCAAAAGTGGTACAAGACTACCCGTTGT TGTATGACAAACAGAAGCATGGATATCGTGACGAAGGGATGAAAGCACAA ACATGGCAGAAAGTTGCAGACGAGTGCGACGTAGGCACAGGTGATGCCGC ACGAAAACTCTTCGACAATCTTAAGAAACGATTTTTAAAGAAACGACTGA AATTCCGTAAACTCAAGCAAGCCGGTAACATGCCTCCTGAAGTTGTGAAT GCTGCTAGAGATGAGATGGATTCTTACGCATTCTTAAACTGGTTGGTACC TCATATACGCATGCGTAGAACAAAACGTGATCTGAATGTCATGGAGCTAT CCGGAATGATGGAAGTGAAACGCGAGTTTTACAACAGTGACGAGGGCGGC TCAGAATCTTTTGACGAACACGAGACATTTGACGAAGACCCTGAGATGGA AAACGCCTCTATGGTTTCATCTTCCGTTAATTACCTCAAGAGCGCTCCGC CTNAAAAACTCGcattctcaaaaactaaaaacgaaagtactttatTACTG GTGGATATTTAAAGGGTGGATTCGAAATATCGACAGATAGTTATTAACGA AAAGTGTCCCATAAAAGGGTTCCTTgttaaacaaaagaacaaatttcAAA TCTATTGTTTTTNTAGTCCCCTGACAAATGGTCATGTGACAAGCAATGGT GATTTAAAACGAGGCCGACCGCATAATAGTAGCATCTTGACAGTCAAAAC GGAGATGAATGGTACAAACGGAGTCAGCAACCCTCCTTATAAGAAGAAGT GTTACGGATACAACGGGTATGCATCACCTAACC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000028:398567..418216+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00003424 ID=TCONS_00003424|Name=TCONS_00003424|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=19650bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000028:398567..418216+ (Clytia hemisphaerica) TTTGTTCTCAATAAACGACGATTAAAACTGGATCATTTCTCTTGGAAAGT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00003424-exon-sc0000028-1491911889:398567..398714 | TCONS_00003424-exon-sc0000028-1491911889:398567..398714 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003424-exon-sc0000028-1510915933:398567..398714 | TCONS_00003424-exon-sc0000028-1510915933:398567..398714 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003424-exon-sc0000028-1575043694:398567..398714 | TCONS_00003424-exon-sc0000028-1575043694:398567..398714 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003424-exon-sc0000028-1491911889:413424..413915 | TCONS_00003424-exon-sc0000028-1491911889:413424..413915 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003424-exon-sc0000028-1510915933:413424..413915 | TCONS_00003424-exon-sc0000028-1510915933:413424..413915 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00003424-exon-sc0000028-1575043694:417524..418216 | TCONS_00003424-exon-sc0000028-1575043694:417524..418216 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000028 | supercontig | sc0000028:398567..418216 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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