TCONS_00003110 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00003110
Unique NameTCONS_00003110
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length4570

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00003110 ID=TCONS_00003110|Name=TCONS_00003110|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4570bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000025:674065..687598+

Legend: exon
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>TCONS_00003110 ID=TCONS_00003110|Name=TCONS_00003110|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13534bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000025:674065..687598+ (Clytia hemisphaerica)
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TCTTTGGGGTTAAACAACATATCACAGCTCCGGCTCTTGTTGTAggcttt tgttcttttttcttttactcctTTCAGCAACGTCACACAGGAAGCTCCGG CTCTCCTTAGTAGGCTaaggtttctatttttttttatcttttttctttga ttactCCTCTTAGAACAGCGTCACGGCTTCCGGCTCTCGTTGCACTCTTT GGGGTTAAACAACATATCACAGCTCCGGCTCTTG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_001730XLOC_001730Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00003110-exon-sc0000025-1491911889:674065..674123TCONS_00003110-exon-sc0000025-1491911889:674065..674123Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003110-exon-sc0000025-1510915933:674065..674123TCONS_00003110-exon-sc0000025-1510915933:674065..674123Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003110-exon-sc0000025-1575043694:674065..674123TCONS_00003110-exon-sc0000025-1575043694:674065..674123Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003110-exon-sc0000025-1491911889:683088..687598TCONS_00003110-exon-sc0000025-1491911889:683088..687598Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003110-exon-sc0000025-1510915933:683088..687598TCONS_00003110-exon-sc0000025-1510915933:683088..687598Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003110-exon-sc0000025-1575043694:683088..687598TCONS_00003110-exon-sc0000025-1575043694:683088..687598Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000025supercontigsc0000025:674065..687598 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0 0 0 0 1.59334e-05 0.00021615 1.335e-09 0.424971 0 0.55052 1.98988e-08 0 0 1.11721e-10 8.75681e-11 0.000409354 6.22978e-11 0 0 0 0 0 0 0.531509 0 0 0 0 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00003110 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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