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transcript sequence >TCONS_00002857 ID=TCONS_00002857|Name=TCONS_00002857|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1540bp CCGGACTTATGAAAATATCTTGAAATACAATGAAGCAAAGAATTTCATCG AGGTACTGAAGAGAACGAGAATAAACAACACAAATATCAATTCAATGTTA ACGATATCAACCGTAAAGAAGAAAAGATACAAAATGCAGAACTGCATCTC TTCAAACAATATCAACCGAACGGCCAGGGTCGGCCTCGTAGCGCCATGAT CCAGATCGATATTATAAACATGCACAACGAGCGTGTAATCAGCTCGCGTA TCGTCAGCGTTCATGTACACGGATGGTTACGTTTTCCCGTCACGAAAATA GTTAAACGTTGGGTACGCAAACGTAAGAATAATAAAGGTTTACAAGTTCG CATCCGTAATATTGGAGATGATAAAAACAATGTAAAATTCGGAACCAAAA ACACTTTACGGCGTGAACCTATGCTGGTCGTATTCACGAAGCGCGTGAAA GGAAGTAGCCTTGCTGCTCTGCTGAACGGTAATGGACTCAATATTTTACA GAATAACGAGAAAAAGAAACGAGTTAAGCGGACCATAGTCACTATGAATG ATGACAAACCAAATAATCATATAGAGCATCATCACAAAGATGGGCATTTA GAATGCCAGTTAAAACCATTGCGTATAAACACTAGAAACATGGGTTTCGG AGAAAACATTATAAACCCTACAGAAATCAATATTAACCAATGTGTTGGGT CATGCCCAGCTAGAATTAAAGAAGACTTTTTAAACAATCGCCATACTTCA CACGCTATTTTTCAAGCTATCGTGGCTGATTCCAGTAGACCAGGCGCAAC TCACGACCAACCGGCGCTGCCTTGTTGTTCGCCGTCCGAATTTAAAGATG AGGTGATGATAATTAGCGGACGGAAGGGCTCACAAGAACTAATACAGTTG GTGAAGTTTGAGAAATTGATTGCCACCAAATGTGCTTGTTTGTAGAGCAA TGGTAGCTGAATTCGGGACAATCTTATCCCATTGACACTCGCACGCTAGT ACAATAAAGTCCATTAAAAGACTCGACAGGCACAATTGGCCAAATAACTT TCTTTAGTTTGTCTGTAGTTATGTTGATGCAATCGTAGAACCATTTCTTC TCCCGATAATTTATCCTGGAAATTGCCCTTTAATTTTCCCTTTTTGtata aattttatatataatatgtAGTATAGCTTTTATggtaacttttttttgtt caagttGCTCATCAGAAAAATTTGCGAACAGCGTCCTACTTACTCAAAGA TGTTTCGGGTTTAACAGGAATGGAAAATCGGAATTACTTATCGGATTTCC CTGTataaaataggaaaaaaaaaacccggCAGTCAACCGTGACGcttttg acaaatatttttgACCGTTTTACTTTCGTTTAGAGAGAGAAAGAATATTT ATATAGTCAACCCCCTTTtcgtttttttacaaaatgaagAGAAATTCCTT AATTTATATAATGTGAATAATATTATATAGTCATAAATTCTTACagatat ttaaaattttaaagaaaaagaaatattttatacaTACAGA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000023:242176..258349- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00002857 ID=TCONS_00002857|Name=TCONS_00002857|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16174bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023:242176..258349- (Clytia hemisphaerica) CCGGACTTATGAAAATATCTTGAAATACAATGAAGCAAAGAATTTCATCG
AGGTATGTCTTATATTTTTACTAAGTCTATGGTCATCGCCTAAATAAGAT
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GTTACTGTTCTCGATCATCTTGGCTTTCAAATCTTAGACATTTTACAAAC
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ATTTAAAGGGTATATGGAACAACATGCCACTAGCATTCAAAAGACGTCCC
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AGTTCTGTTTTATCATTTTTTATAAATCTGAGTATTTGAAATCTTGAAGC
TGTAAAAATACACAAATTCAGTACACTTCTTGGTAAATTTTAAAATACAA
GGTTTTCAATGTGTTCTTAAATTTTAATCGAATTTCAGCCTCATGTTCTT
ATAAATAAAAAATAATTTTCGCCACGTGCACCTATTCCATAAAGAATTCT
CCTTGCCAGAACGTTTTCCTTAGTTGACAGCACTTTGAGATAAGTTTCAA
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GTTTTAAGTAGTGTTTATTTTCTTGTGGTCACGAAATCATTGAATTCTAC
AATAAAGAAGCATGCTTTAAGAAGGTGTATGAAAAATTCGCCTTTAGCAC
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TCCAGTGTCCAGATCCCATCTTATGTAGAAATTTGGTAATCGTCTTTATT
GACTGCAATATTTCACCTGAAACCCATTTGTCTTGATTTTTATCTTATCC
TTAACTTAAAGTGTTTCTTTCCTTTTCATCGATCAGGTACTGAAGAGAAC
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AAAGACTCGACAGGCACAATTGGCCAAATAACTTTCTTTAGTTTGTCTGT
AGTTATGTTGATGCAATCGTAGAACCATTTCTTCTCCCGATAATTTATCC
TGGAAATTGCCCTTTAATTTTCCCTTTTTGTATAAATTTTATATATAATA
TGTAGTATAGCTTTTATGGTAACTTTTTTTTGTTCAAGTTGCTCATCAGA
AAAATTTGCGAACAGCGTCCTACTTACTCAAAGATGTTTCGGGTTTAACA
GGAATGGAAAATCGGAATTACTTATCGGATTTCCCTGTATAAAATAGGAA
AAAAAAAACCCGGCAGTCAACCGTGACGCTTTTGACAAATATTTTTGACC
GTTTTACTTTCGTTTAGAGAGAGAAAGAATATTTATATAGTCAACCCCCT
TTTCGTTTTTTTACAAAATGAAGAGAAATTCCTTAATTTATATAATGTGA
ATAATATTATATAGTCATAAATTCTTACAGATATTTAAAATTTTAAAGAA
AAAGAAATATTTTATACATACAGA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00002857-exon-sc0000023-1575043694:258298..258349 | TCONS_00002857-exon-sc0000023-1575043694:258298..258349 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002857-exon-sc0000023-1575043694:242176..243663 | TCONS_00002857-exon-sc0000023-1575043694:242176..243663 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002857-exon-sc0000023-1510915933:258298..258349 | TCONS_00002857-exon-sc0000023-1510915933:258298..258349 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002857-exon-sc0000023-1510915933:242176..243663 | TCONS_00002857-exon-sc0000023-1510915933:242176..243663 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002857-exon-sc0000023-1491911889:258298..258349 | TCONS_00002857-exon-sc0000023-1491911889:258298..258349 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002857-exon-sc0000023-1491911889:242176..243663 | TCONS_00002857-exon-sc0000023-1491911889:242176..243663 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000023 | supercontig | sc0000023:242176..258349 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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