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transcript sequence >TCONS_00002317 ID=TCONS_00002317|Name=TCONS_00002317|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2527bp
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ATTTGCCATAAGATAACTCATGCCATGAAGAAATAGAGTCTCATTTGCTC
GTTACTCAGGAGTTGCTCAGCTATCGT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000019:528105..542543- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00002317 ID=TCONS_00002317|Name=TCONS_00002317|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14439bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019:528105..542543- (Clytia hemisphaerica)
ATATCGTTTTAATTTCTAGAAACATCAATTAAAAACTATTTATCGTCATG
TTAAGATTCAAATCACCGACCGTTGACGCAGGTTTTTGCTGGCCTATGCT
TGTTATGTCTTCTACAATTTATTTTCTCTTGTTTGGAACATTGTATTCTT
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ATTACAAACGATTTGTTGCTCAAACTTTTCTGAGAAATTTGACGCCTAGG
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AATAATATCTGACACGAAAAAATCTTGCAAAATTTTAGAAAATTTCTCGA
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TTTTGAGAATCTCTACCATTCATTTTCAATATATTTTTCTCAACAGGTGC
GATGAACGATGCGAAATTATTGAGTGCAAATTACATGTTTGTTTTTACTG
GTGGTACATTCATCCTTGGAAGTATTTTCATGAACTTTGCACGGATCACA
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AATAACAAAGCTTTTGTCTATGCCAATGAAAACTGAAAAGAGCGATAAGA
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GATATGGACTTAATGAATATTAATTTGAACACAAAGAATTTTATATTAAT
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GGCGAATTGGGCGCCGGGTAAGTACGAGCCATATTGGGTATAATCATTTA
AAAGCAATCGAGTCTCTGTAAGTGTTCCAAAATCACGAAAAAAAAAATCG
GCTCCCTCAAAAGATCATGAATTTTTTTTTAATTTGGACTAGAATTGAAT
TTGAAAATTTTGCTTGAAATCTTAGGGAAGCTGTCTCTTTAAGTGTGACA
AAAACGTCAAGAATTTAGTGTCTCGCAGGTTCTATTTTCGTACTTTGGCT
CGTCTCGCAAACCTGGTACACCCCCTGCATAACCAGTAGCAAACCCTTGT
CAGACATCCCATTTGGAAAAGTTTGACCAAAATATCGTCCCACTGGTAAA
ATTTCTCACTGAGAAATTGACTTTGATTTTATTTTCATTTAGCTTTCGTA
AGAAATTTATATTCCCATTGGGGCTGCGAACAGGGATGTCAGCAGATGCG
ATAATACAGTATTATAATATTATAGATAATTTGTACAATTTTTACATACA
TATATAAGAACCTTTATAACTTCAAACGATAGTGTACTTTAATTGGAAGG
TCTAGTAGAGACCATTAGTTTTTAAAATGATAATTAGTCGACGGAAGGTT
AGACAAACAATGAACGGTATAATTCGATGTAATAATTTATTGCTTATTTT
GATAATGTCTGGTTATTTTTATCTATTTGCCAAAGATAACTCATGCCATG
AAGAAATAGAGTCTCATTTGCTCGTTAGTCAGGAGTTGCTCAGCTATCGT
GGTTAGCCATTTTAAATGGACATTCGAAGGTGGACGACCTTCGAGGGTGG
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GAAAATGTTCAAATAAGAAGATTAGAAAAAGAAAAAAAATACACACTTTC
ACAGTTATCATTTTGAGGCTGAAAATTGACCAATTGAAAGATCAATACAG
AAAAGGCGCCAGAAATAATTCCTAGATGCTTAAAAATCGCTAGCGAAAAG
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TCTGAAGCAAAATTTAGTCTACAAATATTAGGAGGGGGCGTACGGGGGTC
ACAGACACCGAAATACCTACGCATATTTCTTGGACTACCGTCAACACCGA
CAGCAAAATTTGGTAAAATCCTTAATTTTGTCACCGTATGGCATGTTTGA
CACCGAAATACCGTCACTTTTTTCTTCAAACACCGAATATTACCAAAATA
ATGGTATATTATGGTTTGTTTATATCATACTAAACGCTACTGTACTAAAC
TGCCATTTTACTGTAATATGCAAACGACAAGTTTTTGAAAGGATGAAAAT
TTCTAATTTGCGTTGCTCAGAGCGGTTAATAAATAGGGAATTTCCCAACA
AAAAAGGAATTTCCCTTAATTCGACTCCCTGAGGTAATAAAAAAAGACAT
ATAGAGCTTTGAAAATGGGTAATCAGATCAAAAAAAATCCGGAAAAGTAC
AATACAGTCAAGCTAAGAATGTTACCGGTACACAATTTAACCGGAACTAA
AATACTGAAAAACGTGCGCAAAATCCCGCGATGGCAATAGTATAGATGTA
TATCATCTTTATTGGAAAACCGCATCAATGTTAACCCGAATGCCTTCTCG
GGTAACTTAATGCGAGACTTAATGCATGTCGGGTAACTGCATGTCCCAAA
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ATATATTTTTGTGAGCGTAATTGGATGTAGAATATCGGATTTGGTGTTAC
TTAAATTTTTTCTCAGTATAATTAGAGATATCTTAAGAAAACCTGCTTAT
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GAAATATAAATCAAAACTTTATGAAATTTGGACCAGTGATAGAGCACATT
GAGATAATTCTAGACTAGTCATAGCTTTCACTATCCTAAATGCCCCCACT
GAAAGGTCATGTCATGCACTTNAAAGTACAAAGTATTTCCAAAAATTGAT
GACGTCAGCAGCAACTGCAGAAATTCGAATTTTTGCAATAAAATGCTGAC
ATCAGCTAATTTTCAATTTTTTTGAAAACATTTCTCCTACTCTTGATGAG
TTCTATCATTGGTGCAAATTTCATTAGCATTAGTTCTTGAGATATTCAAC
TTTTTAAATTATGACGTCATGAATAATGACGTCATAATTAGGTTTTCTTA
CAAAAACTCTAATTATGCTGAGAAAAAAATTAGGTATCACCAAATCCAAC
ATTCTATATCCAAATACGCTTCCAAAAATGTATACCTAATTTGTTATGGT
TTAAGGGCTGGAATTCGGGGCGAAGACGAAAAGCAGATTTTGAATAATTT
GGGACATGCATTAAGTTACCCGAGTTGGTTTACCCATAAAAGCCCACGAT
TGTATCTACGAAACACAAGGTGAGAATTTTAGCTGTCAGCAATAATAAGA
ATAAGTCTCTATAGAAGAATCTGAGATGAACAGCTTGTATTTCCATATTA
ATGATATGTGTAACCAATATAATATTTAAAAGTTCATTTTGTTCAGCTGC
TATGGTAGCAAAAATCCTTATTCAATTATAGAATTCCAAAAGACAAAAAG
AGTATAAGGCATTAAAAATTCCACCAAAGATTTATCAGCTTCAAGCTGTG
TTCATTCTTACATAATTGAAAATTATGGCAATTAAGATTTTACATTGATA
ATTGGAGGCTATGGAGACACGAATTTATTTAATGACTTTTCTTCCTCTCC
ATACATGTGGTTTACCGTCTCAATGTAGAAATATCATAAGTCAGACAAAA
AATTATACTAGTCAAAGATTGATTAAATGATTCAGTGAGGGTACTCATTA
ATCACCCCGAAGTCGACCTCATACCTAGNTTACATTTACCGTTTCAATGT
AGAAATATATCATAAGTTAGATAAGAAAAATATACTAGAGTCAAAGATTG
ATTAAATGATACATATTCAGTGAGGGCACTCATTAATCACCCTGAAGTCG
ACCTCATACCTAGAGCAATTTAACCTTAACAAGAAACTCTTTGATTTTAC
TGTTCTTCGTAGATTTTCGAAAAGAGGATATTTTCAATATGTTAAGTTTC
AGAGCACCAACGGTAGATAAAAGCCTATGTTGGCCTATGTTTATTTCTTC
AATGATAATCTATTTTCTCCTGTTTGGAACGTTGTATTCTTACGGTGTTT
GGTTGCCAAGAATCATGGAAGAATTTAATTGTAATCAAGAACAAGCTGGT
AAGCGTCATAGTTTATTTTTTTGCAGACAGAAATTCTCCCGATGAAAATT
TTCTGATCGGTGAGCCAAAAGCTAGAGACGAATCTCCTACGTAGGGTTTG
AAACGACTTTTTTCATACATAAGTCTCATGGTCAAAGTGGTTTTCATACA
AATGTAGTCTGCTATACTAGATTACTAATTCAGACATAGTAGACACTAAG
CGAATAAGCAAAAATAAGTAAGTAAGTCTGCGACCGCTGTCGGAAGCGAC
CCGAAGGCTCCTCTTTCGATACACCTATATCTACCCGAAGGTAGAGGAGT
TTGTCACTCTTTCTCACTGGATTTCTTCACTTACCTTTGGTCCTTTTCTT
AAATGTTGGGCATCAAGCAGAGCAGAAAGGCATCAAGTACCATTTTGAGG
ATCTTTGGTATGACCTGAACCGTAGTCGGATGCTCTACCACTGCACCACG
GTTCGCAAAAATAATGGAAGGGAGGAATTGTAAAAATCATCATATTATCA
TATAACGTACTCGTGCATAGGCGTATCGAGAATTTTTGAGGGAGTGCAGA
CGTTTATGACATATTCATTATCTTTTGATAAAACAAAGACAATAATTACA
GTGCCGTAAAAACCGCTCTCATACATAAATTTTGCAGGGTATCTCGCTAC
GACTATAACACCCCCTGATACGGATAGAGTTGAGGTAGCAAAAATATTTT
TAAAAGCATGCCACCCTATGGTTAAATATCTTTTTAGATCTACAGCTTTG
GGGTCAGCCTAGTTTCTAATATTTCGAAAACGTTCTTGAAGACGGAACTG
ATGAACTACATGTTAGTTTGGTCTAACTAAAACTTTTCACACCTGACCAC
TTAACTTATTCTCAAATATTGCATGGCATGTTCACTTTGACATTTTGACA
AATGTTCTTGTGTAAGGAGAGATAGATATTACAAAGTACTCATAAAAAAA
AAACACATGTTTGAAACTTCAATTCAGCTGAGTGGATTTTATTTTGAGAT
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TTTACATCTATTTTACAATATAATCTTGCACTGAGGCCCCCTTTTGGTTT
GGATTAAGGTCATTAAGAGGTTAAACTATNATGGAAGGGAGGAATTGTAA
AAATCATCATATTATCATATAACGTACTCGTGCATAGGCGTATCGAGAAT
TTTTGAGGGAGTGCAGACGTTTATGACATATTCATTATCTTTTGATAAAA
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GCAGGGTATCTCGCTACGACTATAACACCCCCTGATACGGATAGAGTTGA
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AGTGTATCTAGAGTATTTGTTGATCAACTAGATTTAGATTTTTCTTCTTC
AGAAGAGGCTGGTTTAAATGTACAGAAGGCGAGTCAAGGCAGAAGATTGA
CAAAAGCCAATACAACTCAAGTAGAATAATATATGGTAAACCAGGAAATC
AGTGTTTTTGTTTTAAAGGGTGACAATTTAGTTGAATAAAGCTTGGGCAT
AGAAGATGAGCTAACAATTTTCTGGAAATATTCCAGACCAAAGTATACAC
AGAACATCGACCAACATTAACAGGCATAAAATGAAAGTTTAAGGGAAAAT
TCCGTTTATTTACGCATACTGCAAAATCAGTCTTCTTTCTGCAGTAAAAT
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CCAGTGGCACTCCAGATGTTACAATAAATACGAGAGCTTTGTGAGTGTGT
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TTGAGAGAATTTCGAACGGCGGTACGGTTCTCTCAGAAACTTCGACAGCC
GTCTGGTAACCTCGACAGTGGTCTGGTTACCTCGGCGGCGGCTTGGTTTC
AACCATAAAAGTGTCTCAGGTCGGGTCCTATTAAGGGGAGTCACTTCTTG
AGGGAATTTCGTAACGGCGGTTCGGTTCTCTCAGAAACCTCGACAGCCGT
CTGGTAACCTTGACGGCGGTCTGGTTACCTCGACGGCGGCTTGGTTTCAA
CCCTAAAAGTGTCTCAGGTCGGGTCCTACTCAAGGGAGTCACTTCTTTGA
GGGAATTTCGAACGGCGGTTCGGTTCTCTCAGAAACCTTGACGGCGGTCT
GGTTTCAACCCTAAAAGTGTCTCAGGTCGGGTCCTACTCAAGGGAGTCAC
TTCTTTGAGGGAATTTCGAACGGCGGTTCGGTTCTCTCAGAAACCTTGAC
GGCGGTCTGGTTTCAACCCTAAAAGTGTCTCAGGTCCGGTCCTACTCAAA
GGGAGTCACTTCTTTGAGGGAATTTCGAATGGCGGTTCGGTTCTCTCAGA
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TGTGAACGCCAAACTTAATTGAAAAATGTCTCAATCTATTCTACTCCCCT
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AAAAAGAAAGATTTAATAATGCAAAGATCTAGCCCGGGGTCCACTCAAAG
CCTTTTTTATAGACTGATGACACGATTAAAGTGGCCCAGTAGTATGTGGT
AATACACAAAGACGGACAGAGATAGTTATTTTTGAATACCGCAGATGGGT
AGGCTATCGCCATTATTAGCTGTAAACCCTATGTAGGGTTATTTTCTCCC
TGTTTGATATTCTTATAAACGGGAAATATATATCGTTTTAATTTCTAGAA
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CGTTGACGCAGGTTTTTGCTGGCCTATGCTTGTTATGTCTTCTACTATAT
ATTTCTTGTTATTTGGAACGTTGTTTTCTTACGGTGTTTGGCTGCCAAGA
ATCATGGAAGAATTTAATTGCAATCAAGAACAAGCTGGTAAGTGTCATCG
TTTATTTTTTTGTTTGAAAATGTTAATTCAGAATGGCCAATGAAAATTAG
GCGTTGAGCTAGACGATCCTATCGTCTACACCATGTCACTGAAAAAGAAA
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AGTAAACAGAGGCGGAGGTGTTTACAGTGTTCTAAACTCTACTGCTTCTA
TTTTCTCGTAAACCACCGTCATGGCTGTAAACTTTTCCCGCGCTATCCCT
CTAACGGACGATAGCATCGTCTAGCTTTGAGCGCGGAGTCAAGATCTCCT
TTTTAATCAGAGTAGTGACCACTAGGTCAAGGCATTGGTGCTCAAATCCC
CACTTTTTCCAATATCCCACGTTCAGTTCTAGGTAGCTGAGGCGGCCTGT
AAAAACAATCGAAAGAATGTCTGAAAATCCTGGATTACTGTTTACTGAAG
GTCTTATTTTACGCCATCACCCATCTCTAGAATGCTGATGCTGCGGAGTT
ATTGTGTAAAATATCGTTATTAGGGATATTAGGGCCCATGCTACTTTGAC
CTTAATTTTTTTACTTACTTTTTTTCATGTAGCTTGGGTTGTTTCAATGG
CCAGTGGTTTATTGGTGTTACTTGCAATGCCTGCATCAGTATCGTGCAAT
TATCTTGGAGTTTTCACGATGTCCATACTCGGTTCAATTATGTGCGGATC
AGGACTCATAATATCGTCACGTCTTCAAAATATCTATCATCTTTATTTAT
CGTTTGGAGTCTTGCTAGGCATTGGTTTAGCCCTTCTTTACACACCGACT
TTGGTCATGGTTGGACGATGGTTTGACAAATACCAAACGCAAGCTACAAC
TTTTATGATGATTGGAGCTCCAATAGGGTCGCTTATATTTAACCCGCTGA
TGGAGAAAATCATGGAGAATTATAACCTAAGGTCTGCGATGAATCTCTAT
GGTATTATGTTCCTGGGAATAACATTTATATGCTCTTTTGGTTATCTTCC
CTTCAGCCAAAAGCTTATCAAAAAAGATGTTGATATAGAATCTAAATTGG
AAAAGAATAAAATTGATTGTGGATTCAAGTTCCGTAAGAATTTACTTAGG
AACAACGCATTGTGGTTGTTCTGTGCATGCAGATTCTTTGCAATCTTGTC
TTCCTACGTCCCCCTGTTTCACTTGGTAAGTTATAAAGTTCTTTAGTCTT
ACCAAAATTTACCATAAAACTTAACTTTGTTTTGGACAGAAGATTGCATA
ATATACGATTTGTTGCTCAAATTTGCCCAAATGTGGTAAAACTTTCTCCC
TATCGTTAGAGTTAAATTTTGAAATCCTAAATTTTTGATCCCTTCTTCCA
AGAAATTTGAACACTTTCCTAATAGGTAATAGCTCGAATCAAATAAGTGA
CCCGGTGAGAAATTTTTGCAAGTTTGGATAGTTTAGGGGTTAAATATAAT
TGGGTTGTAAATGTATTAGACTAGCAAGCGTCTGTCACAGGAACGCGGGA
CTAGTGCTTATCTATAAAGAGTTCTTATAAAAAATAGAAATTGCCGTGGG
AAAGTGGTTTGGAAACACAATTGTATGCAGTGTACATATAGACATAGAGC
CCATTGCAAGCTTAAGCTGCAGCGAAATACAACGATACAACGATACAACA
ATGGTTTATTAATCTATAAATGTATCAATTTCAGATCAAATACGCAATGA
CGATAGGAATAAGCAGTTCAACAGCTAGTCTTATGTTAGCTGTATGGTCT
GGAAGTAATTTGTTTGGTCGGATCTGTTATGGCTGCTTTATTGCAAATCA
CCGAGAAAAATTATTGGCAACATATCAAATCTCGATGTTTTTAAGCGGAG
TGGTCAGCATTGCAGCTTATTTTGCCGACAATACATGGAGTTTGTTTCTC
TATTGTTGTGTTTATGGAATTTTTGATAGTTCGAATATTGGACTAGCCAG
TCTGGTGACGATTGATTTGACAAGTCCACTTGATTTGGGAGCAGCTTGGG
GTATGCAACAAACGATCAATGGGATTCCAAGCATTGCTGGTCCTGTACTG
ATCGGTATGGTTAATTTTCGCCTTTTTATTTGCTATTTGAAAACTCAGTA
GGTATTAGGTTTGAGAAAGGATGGGGTGTGCAACTTGTGACCTTTGGACC
CTTAGAGGGACTAAAGAGGAGAAAAAATTGGAAATATTTGTTAATTATAC
GACCCTTATTGTACTTTAATGGGACAAATGACCAAATTTCAATGCATTTA
GGGGCAGAAATTGAAAATTTTCCTATTTTTCCGATCTTTAATTGGACTCA
GATTTAATTTTCTGATTTTTCCAGACCTTACGGAGACTGCCAGGTCCAAA
AAGGTATCCTTGAGGGCGGCACATACCAGTACCGTTACTCGCCAAATAAC
CCCCTGGGTTTGAAAAAGACTCCCTTTATACACCCTCTATTCTAAAGACA
CGATTGGGCTCCTTCCCACTAGAAAAAATGGCCAAAATATTCTTGCCAGT
GGAAAAGTTCACTCAAATTTTTGTCGCTGGTTGAAATAATAAAAGAAACA
AATCTTCTCTGCAAAATATATTTCTTTTTCTCACTTTTGAGTTTCCGTCC
GTTCTTTTTATCGCCACTGGTTAATAGATCCTCCCGGATTAGTGACTACT
TTTTATAAACATTCTTAGAATTGAGTGGAATTCGTCAATAATATCTGACA
CGAAAAAATCTTGCAAAATTTTAGGAAATTTCTCGAGTCTTCAAAATCTT
TCCGATATCTTCATTTTCTAGGTAGATTTTGTTTCTTTTTGAGAATCTCT
ACCATTCATTTTCAATATATTTTTCTCAACAGGTGCGATGAACGATGCGA
AATTATTGAGTGCAAATTACATGTTTGTTTTTACTGGTGGTACATTCATC
CTTGGAAGTATTTTCATGAACTTTGCACGGATCACACATAATCGAACTCG
TCAATCAGAGATTCCAAACACAGAGCTCAAGGATGTCTACAATACTGACC
AGAACGAGAGCTTGGAGGAATCACACTTACAAAAGGATGTGTATATTACT
GACCAGAAAATTTCTAAAGAGAACGTAAATTCTTCGCAATTGCCAAAACA
AACCTCAGTCGAAAATTTCTCATTTGATAATAAAACTTTCAATGTTGATA
TTATCCGGAATGAAAAGGAGTCATTGTCCTCAGTTGAATTTTCTAAAGAT
ACACAAAATGGGAAAATTGTCTGATGAATTTTGTTTTAATAACAAAGCAT
TTGTCTATACCAATGAAAACTGAAAAGAGCGATAAGAAATCTACCAAATG
ATCAAAAGAAAATAAAGAACACAGCATTGAAGATTTCGATATGGAATCAA
TGAATATTAATTTGAACACAAAGAATTTTATATTAATGTAAAGAATATTC
TATACTCGACATGGCGTAACCGACGGGGGGATACTTAGGCGAATTGGGCG
CCGGGTAAGTGCGAGCCATATGGGGTATAATCATTTAAAAGCAATCGAGT
CTCTGTAAGTGTTCCAAAATCACGAAAATGAAAAATCGGCTCCCTCAAAA
GATCATGAATTTTTTTTAATTTGGACTAGAATTTGAAAATTTTGCTTGAA
ATCTTAGGGAAGCTGTCTCTCTAAGTGTGACAAAAACGTCAAGAATTTAG
TCTCTCGCAGGTTCTATTTTCGTACTTTGGCTCGTCTCGCAAACCTGGTA
CACCCCCTGCATAAGCAGTAGCAAACCCTTGTCAGACATCCCATTTGGAA
AAGTTTGACCAAAATATCGTCCCACTGGTAAAATTTCTCACTGAGAAATT
GACTTTGATTTTATTTTCATTTAGCTTTCGTAAGAAATTTATATTCCCAT
TGGGGCTGCGAACAGGGATGTCAGCAGATGCGATAATACAGTATTATAAT
ATTATAGATAATTTGTACAATTTTTACATACATATATAAGAACCTTTATA
ACTTCAAACGATAGTGTACTTTAATTGGAAGGTCTAGTAGAGACCATTAG
TTTTTAAAATGAAAATTAGTCGACGGAAGGTTAGACAAACAATGAACGGT
ATAATTCGATGTAATTAAGCTAATTTATTGCTTATTTTGATAATGTCTGG
TTATTTTTATCTATTTGCCATAAGATAACTCATGCCATGAAGAAATAGAG
TCTCATTTGCTCGTTACTCAGGAGTTGCTCAGCTATCGT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00002317-exon-sc0000019-1575043694:542337..542543 | TCONS_00002317-exon-sc0000019-1575043694:542337..542543 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002317-exon-sc0000019-1575043694:541116..541708 | TCONS_00002317-exon-sc0000019-1575043694:541116..541708 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002317-exon-sc0000019-1575043694:530240..530609 | TCONS_00002317-exon-sc0000019-1575043694:530240..530609 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002317-exon-sc0000019-1575043694:528105..529461 | TCONS_00002317-exon-sc0000019-1575043694:528105..529461 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002317-exon-sc0000019-1510915933:542337..542543 | TCONS_00002317-exon-sc0000019-1510915933:542337..542543 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002317-exon-sc0000019-1510915933:541116..541708 | TCONS_00002317-exon-sc0000019-1510915933:541116..541708 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002317-exon-sc0000019-1510915933:530240..530609 | TCONS_00002317-exon-sc0000019-1510915933:530240..530609 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002317-exon-sc0000019-1510915933:528105..529461 | TCONS_00002317-exon-sc0000019-1510915933:528105..529461 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002317-exon-sc0000019-1491911889:542337..542543 | TCONS_00002317-exon-sc0000019-1491911889:542337..542543 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002317-exon-sc0000019-1491911889:541116..541708 | TCONS_00002317-exon-sc0000019-1491911889:541116..541708 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002317-exon-sc0000019-1491911889:530240..530609 | TCONS_00002317-exon-sc0000019-1491911889:530240..530609 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002317-exon-sc0000019-1491911889:528105..529461 | TCONS_00002317-exon-sc0000019-1491911889:528105..529461 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000019 | supercontig | sc0000019:528105..542543 - |
Blast
BLAST of TCONS_00002317 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: MOT12 (Monocarboxylate transporter 12 OS=Homo sapiens GN=SLC16A12 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 130.568 bits (327), Expect = 8.824e-32 Identity = 105/400 (26.25%), Postives = 191/400 (47.75%), Query Frame = 3
Query: 183 FNCNQEQAAWVGSMASGLLVLLAMPASISCNYLGVFTMSILGSIMCGSGLIISSHLQNIYHLYLSFGVLLGIGLALLYTPTLVMVGRWFDKYQTQATTFMMIGAPIGSLIFNPLMEKIMENYNLRSAMNLYGIMFLGITFICSFGYLPF----------------SQKLIKKDVDIESKLEKN----KIDCGFKFRKKLLRNNAFWLFCVCRFFAILAYYV-PLF-HLIKYAMTIGISSSTASLMLAVWSGSNLFGRICYGCFIANHREKLLATYQISMFL-----SGVVSIAAYFADNTWSLFLYCCVYGIFDSSNIGLASLVTIDLTSPLDLGAAWGMQQTINGIPSIAGPVLIGAMNDAKLLSANYMFVFTGGTFILGSIFMNFARITHNRTRQSEI 1301
F + Q AW+ S+ + +L A S+ N+L +LG ++ +GLI+SS ++ HLYL+ GVL G+G AL Y+P + MVG++F + + A M G+ IG+ I P+++ ++E ++ R A+ + G L + +C P +QK K V S L K + C + L + F + V F +AY PLF +L+ YA+++G+S A+ ++++ ++ G I +G ++ + R L YQ +L G+ + + L + C +G FD + + L +VT ++ L +A G+ ++ +P + P + G + D S F+ G + I S+ + FAR+ R R++++
Sbjct: 50 FTQDYAQTAWIHSIVDCVTMLCAPLGSVVSNHLSCQVGIMLGGLLASTGLILSSFATSLKHLYLTLGVLTGLGFALCYSPAIAMVGKYFSRRKALAYGIAMSGSGIGTFILAPVVQLLIEQFSWRGALLILGGFVLNLC-VCGALMRPITLKEDHTTPEQNHVCRTQKEDIKRVSPYSSLTKEWAQTCLCCCLQQEYSFLLMSDFVVLAVSVLF--MAYGCSPLFVYLVPYALSVGVSHQQAAFLMSILGVIDIIGNITFG-WLTDRR--CLKNYQYVCYLFAVGMDGLCYLCLPMLQSLPLLVPFSCTFGYFDGAYVTLIPVVTTEIVGTTSLSSALGVVYFLHAVPYLVSPPIAGRLVDTT-GSYTAAFLLCGFSMIFSSVLLGFARLI-KRMRKTQL 441
The following BLAST results are available for this feature:
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