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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00002316 ID=TCONS_00002316|Name=TCONS_00002316|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2507bp
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CCGTTGACGCAGGTTTTTGCTGGCCTATGCTTGTTATGTCTTCTACAATT
TATTTTCTCTTGTTTGGAACATTGTATTCTTATGGTGTTTGGTTGCCAAG
AATCATGGAAGAATTCAATTGTAATCAAGAACAAGCTGCTTGGGTTGGTT
CAATGGCCAGTGGTTTATTGGTGTTACTTGCAATGCCTGCATCTATATCG
TGTAATTATCTTGGAGTTTTCACGATGTCCATACTCGGTTCAATTATGTG
CGGATCAGGACTCATAATATCGTCACATCTTCAAAATATCTATCATCTTT
ATTTATCGTTTGGAGTGTTGCTAGGCATTGGTTTAGCCCTTCTTTACACA
CCGACTTTGGTCATGGTTGGACGATGGTTTGACAAATACCAAACGCAAGC
TACTACTTTTATGATGATTGGAGCTCCAATAGGGTCGCTTATATTTAACC
CGCTGATGGAGAAAATCATGGAGAATTATAACCTAAGGTCTGCGATGAAT
CTCTATGGTATTATGTTCCTGGGAATAACATTTATATGCTCTTTTGGTTA
TCTTCCCTTCAGCCAAAAGCTTATCAAAAAAGATGTTGATATAGAATCTA
AATTGGAAAAGAATAAAATTGATTGTGGATTCAAGTTCCGTAAGAAATTG
CTTAGGAACAACGCATTTTGGTTGTTCTGCGTGTGCAGATTCTTTGCAAT
CCTGGCTTACTACGTCCCCCTGTTTCACTTGATCAAATACGCAATGACGA
TAGGAATCAGCAGTTCAACAGCTAGTCTTATGTTAGCTGTATGGTCTGGA
AGTAATTTGTTTGGTCGGATCTGTTATGGCTGCTTTATTGCAAATCACCG
AGAAAAATTATTGGCAACATATCAAATCTCGATGTTTTTAAGCGGAGTGG
TCAGCATTGCAGCTTATTTTGCCGACAATACATGGAGTTTGTTTCTCTAT
TGTTGTGTTTATGGAATTTTTGATAGTTCGAATATTGGACTAGCCAGTCT
GGTGACGATTGATTTGACAAGTCCACTTGATTTGGGAGCAGCTTGGGGTA
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GGTGCGATGAACGATGCGAAATTATTGAGTGCAAATTACATGTTTGTTTT
TACTGGTGGTACATTCATCCTTGGAAGTATTTTCATGAACTTTGCACGGA
TCACACATAATCGAACTCGTCAATCAGAGATTCCAAACACAGAGCTCAAG
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CTTCGGAATTGCCAAAACAAACCTCAgtggaaaatttttcatttgataat
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GTTTTAATAACAAAGCTTTTGTCTATGCCAATGAAAACTGAAAAGAGCGA
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ATTTAAAAGCAATCGAGTCTCTGTAAGTgttccaaaatcacgaaaatgaa
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ttgaaaattttgcttgAAATCTTAGGGAAGCTGTCTCTCTAAGTGTGACA
AAAACGTCAAGAATTTAGTCTCTCGCAGGTTCTATTTTCGTACTTTGGCT
CGTCTCGCAAACCTGGTACACCCCCTGCATAAGCAGTAGCAAACCCTTGT
CAGACATCCCATTTGGAAAagtttgaccaaaatatcgtcccactGGTAAA
ATTTctcactgagaaattgactttgattttattttcatttagctTTCGTA
AGAAATTTATATTCCCATTGGGGCTGCGAACAGGGATGTCAGCAGATGCG
ATAATACAGTATTATAATATTATAGATAATTTGTACAATTTTTACATACA
TATATAAGAACCTTTATAACTTCAAACGATAGTGTACTTTAATTGGAAGG
TCTAGTAGAGACCAttagtttttaaaatgaaaattagtcGACGGAAGGTT
AGACAAACAATGAACGGTATAATTCGATGTAATTAAGCTAATTTATTGCT
TATTTTGATAATGTCTGGTTATTTTTATCTATTTGCCATAAGATAACTCA
TGCCATGAAGAAATAGAGTCTCATTTGCTCGTTACTCAGGAGTTGCTCAG
CTATCGT Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00002316-protein >TCONS_00002316-protein ID=TCONS_00002316-protein|Name=TCONS_00002316-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=504bp
MLRFKSPTVDAGFCWPMLVMSSTIYFLLFGTLYSYGVWLPRIMEEFNCNQ
EQAAWVGSMASGLLVLLAMPASISCNYLGVFTMSILGSIMCGSGLIISSH
LQNIYHLYLSFGVLLGIGLALLYTPTLVMVGRWFDKYQTQATTFMMIGAP
IGSLIFNPLMEKIMENYNLRSAMNLYGIMFLGITFICSFGYLPFSQKLIK
KDVDIESKLEKNKIDCGFKFRKKLLRNNAFWLFCVCRFFAILAYYVPLFH
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ISKENVKSSELPKQTSVENFSFDNKTFDVDIIRNEKESLSSVDFSKDTQN
GKIV Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000019:528105..542524- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00002316 ID=TCONS_00002316|Name=TCONS_00002316|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14420bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019:528105..542524- (Clytia hemisphaerica)
AAACATCAATTAAAAACTATTTATCGTCATGTTAAGATTCAAATCACCGA
CCGTTGACGCAGGTTTTTGCTGGCCTATGCTTGTTATGTCTTCTACAATT
TATTTTCTCTTGTTTGGAACATTGTATTCTTATGGTGTTTGGTTGCCAAG
AATCATGGAAGAATTCAATTGTAATCAAGAACAAGCTGGTAAGCGTCATG
GTTTATTTTTTTGTTGGAAAGTTAATTTAGAATGGCCGATGAAAGTTAGG
CTTTGAGCTAGACGATCCTATCGTCTACACCATATCACTGAATAAGGGAA
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GTAAACAGTGGCGGATGTGTTTACAGTGTTCTAAACTCTACTGCCACTAT
TTTCCCCGTAAATCACCATGATGGTTGTAAACTTTTCCTGCACTATCCAT
CCAACATACGATAGCATCGTCTAGCTTTAAGTGTGGAGTCAAGTTCTCCT
TTTTAATCAGAGTAATGATACCACTAGGTGAAGACATCGGCGCTCGAATC
CCCACTTTTTTCAATATCCCACGTTCAGTTCTAGATACCTGAGCCGGCCT
GTAAAAACAATCGAAAGAATGTCTGAAAATCCTGGATTACTGTTTACTGA
AGGTCTTATTTTACGCCATCACCGCACTCTAGAATGCTGAGGCTGCGGGG
TTATTGTGTAAAATAACGTTATTAGGGATATTAGGGCCCATGCTACTTTG
ACCTTAGAAAAGTATCACTACGTATATTTTAAGGAATATGTACGACTTAC
CTTTTTTTCCATGTAGCTTGGGTTGGTTCAATGGCCAGTGGTTTATTGGT
GTTACTTGCAATGCCTGCATCTATATCGTGTAATTATCTTGGAGTTTTCA
CGATGTCCATACTCGGTTCAATTATGTGCGGATCAGGACTCATAATATCG
TCACATCTTCAAAATATCTATCATCTTTATTTATCGTTTGGAGTGTTGCT
AGGCATTGGTTTAGCCCTTCTTTACACACCGACTTTGGTCATGGTTGGAC
GATGGTTTGACAAATACCAAACGCAAGCTACTACTTTTATGATGATTGGA
GCTCCAATAGGGTCGCTTATATTTAACCCGCTGATGGAGAAAATCATGGA
GAATTATAACCTAAGGTCTGCGATGAATCTCTATGGTATTATGTTCCTGG
GAATAACATTTATATGCTCTTTTGGTTATCTTCCCTTCAGCCAAAAGCTT
ATCAAAAAAGATGTTGATATAGAATCTAAATTGGAAAAGAATAAAATTGA
TTGTGGATTCAAGTTCCGTAAGAAATTGCTTAGGAACAACGCATTTTGGT
TGTTCTGCGTGTGCAGATTCTTTGCAATCCTGGCTTACTACGTCCCCCTG
TTTCACTTGGTAAGTTATAAAGTTCCTTAGTCTTACCAAAAATTGGCATA
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AGTGACCAGGTGAGCAATTTTTGCAAGTTTGAATGATTTAGGAGTTAATT
TAATCGGGTTGTACAAATGTATTAGACTAGCAAGCAACTGTCTTTCTTTG
GACACAGGAACGCGGGAATAGTGCTTATCTATAAAGAGTTCTTTAAAAAA
ATAGAAATTGCCGCGGGAGAGTGGTTTGGAAACACAATTGTATTCAGTGT
AAATAGACATAGAGTGCATTGCAAGCTTAAGCTGCAGCGAAATACAACGA
TACAACAATGGTTTATTAATCTATAAATGTATCAATTTCAGATCAAATAC
GCAATGACGATAGGAATCAGCAGTTCAACAGCTAGTCTTATGTTAGCTGT
ATGGTCTGGAAGTAATTTGTTTGGTCGGATCTGTTATGGCTGCTTTATTG
CAAATCACCGAGAAAAATTATTGGCAACATATCAAATCTCGATGTTTTTA
AGCGGAGTGGTCAGCATTGCAGCTTATTTTGCCGACAATACATGGAGTTT
GTTTCTCTATTGTTGTGTTTATGGAATTTTTGATAGTTCGAATATTGGAC
TAGCCAGTCTGGTGACGATTGATTTGACAAGTCCACTTGATTTGGGAGCA
GCTTGGGGTATACAACAAACGATCAATGGGATTCCAAGCATTGCTGGTCC
TGTACTGATCGGTATGGTTAATTTTCGCCTTTTTATTTGCTATTTGAAAA
CTCAGTAGGTATTAGGTTTGCGAAAAGATGGGGTGTGCAACTTGTGACCT
TTGGACCCTTAGTGGGACTAAAGAGGAGAAAAAATTGGAAGTATTTGTTA
ATTTCACGACCCTTATTGTACTGGGACAAATGACCAAATTTCAATGCATT
TAGGGGCAGAAATTGAAAATTTTCCTATTTTTCCGATCTTTAATTGGACT
CAGATTTAATTTTCTGATTTTTCCAGACCTTACGGAGACTGCCAGGTCCA
AAAAGGTATCCTTGAGGGCGGCACATACCAGTACCGTTACTCGCCAAATA
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TCGCCAAATAACCCCTGGGTTACACCCTCTATTCTAAAGACACGATTGGG
CTCCTTCCCACTAGAAAAAATGGCCAAAATATTCTTGCCAGTGGAAAAGT
TATTCACTCAAATTTTTGTCGCTGGTTAAAATAATAAAAGAAACAAATCT
TCTTTGCAAAATATAGTGCTTTTTCTCACTTTTGAGTTTCCGTCCGTTCT
TTTTATCGCCACTGGTTAATAGATCCCCCCGGATTAGTGACTACTTTTTA
TAAACATTCTTAGAATTGAGTGGAATTCGTCAATAATATCTGACACGAAA
AAATCTTGCAAAATTTTAGAAAATTTCTCGAGTCTTCAAAATCTTTCCGA
CATCTTCATTTTCTAGGTAGATTTTGTTTCTTTTTGAGAATCTCTACCAT
TCATTTTCAATATATTTTTCTCAACAGGTGCGATGAACGATGCGAAATTA
TTGAGTGCAAATTACATGTTTGTTTTTACTGGTGGTACATTCATCCTTGG
AAGTATTTTCATGAACTTTGCACGGATCACACATAATCGAACTCGTCAAT
CAGAGATTCCAAACACAGAGCTCAAGGATGTCTACAATACTGACCAGAAC
GAGAGCTTGGACGAATCACACTTACAAAAGGATGTGTATATTACTAACCA
GAAAATTTCTAAAGAGAACGTAAAGTCTTCGGAATTGCCAAAACAAACCT
CAGTGGAAAATTTTTCATTTGATAATAAAACTTTCGATGTTGATATTATC
CGGAATGAAAAGGAGTCATTGTCCTCAGTTGATTTTTCTAAAGATACACA
AAATGGGAAAATTGTCTGATGAATTTGTTTTAATAACAAAGCTTTTGTCT
ATGCCAATGAAAACTGAAAAGAGCGATAAGAAATCTACCAAATGATCAAA
AGAAAATAAAGAACACAGCATTGAAGATTTCGATATGGACTTAATGAATA
TTAATTTGAACACAAAGAATTTTATATTAATGTAAAGAATATTCTATACT
CGACAGGGCGTAACCGACGGGGGGATACTTAGGCGAATTGGGCGCCGGGT
AAGTACGAGCCATATTGGGTATAATCATTTAAAAGCAATCGAGTCTCTGT
AAGTGTTCCAAAATCACGAAAAAAAAAATCGGCTCCCTCAAAAGATCATG
AATTTTTTTTTAATTTGGACTAGAATTGAATTTGAAAATTTTGCTTGAAA
TCTTAGGGAAGCTGTCTCTTTAAGTGTGACAAAAACGTCAAGAATTTAGT
GTCTCGCAGGTTCTATTTTCGTACTTTGGCTCGTCTCGCAAACCTGGTAC
ACCCCCTGCATAACCAGTAGCAAACCCTTGTCAGACATCCCATTTGGAAA
AGTTTGACCAAAATATCGTCCCACTGGTAAAATTTCTCACTGAGAAATTG
ACTTTGATTTTATTTTCATTTAGCTTTCGTAAGAAATTTATATTCCCATT
GGGGCTGCGAACAGGGATGTCAGCAGATGCGATAATACAGTATTATAATA
TTATAGATAATTTGTACAATTTTTACATACATATATAAGAACCTTTATAA
CTTCAAACGATAGTGTACTTTAATTGGAAGGTCTAGTAGAGACCATTAGT
TTTTAAAATGATAATTAGTCGACGGAAGGTTAGACAAACAATGAACGGTA
TAATTCGATGTAATAATTTATTGCTTATTTTGATAATGTCTGGTTATTTT
TATCTATTTGCCAAAGATAACTCATGCCATGAAGAAATAGAGTCTCATTT
GCTCGTTAGTCAGGAGTTGCTCAGCTATCGTGGTTAGCCATTTTAAATGG
ACATTCGAAGGTGGACGACCTTCGAGGGTGGACATTCGAGGGTGACCTTG
AAAGACTTTGAAAGGCTTTGAACGAAATTTGATATTTGGAAAAGGAAAAA
AGAATGAGTAATCAAATTTCAAAGCGCTCTTGAAAATGTTCAAATAAGAA
GATTAGAAAAAGAAAAAAAATACACACTTTCACAGTTATCATTTTGAGGC
TGAAAATTGACCAATTGAAAGATCAATACAGAAAAGGCGCCAGAAATAAT
TCCTAGATGCTTAAAAATCGCTAGCGAAAAGCTTCATGCCAGAATGAGAG
AGTTCCGATTTAAATGTCTTACTAGCCATAATTTTCATTAAAGTGCCACC
GCAGAAGAATGGTCAAATAAATTTTTGAATTTGGAAAGAAATGTTACTGA
TAGCCGTTACTTCAGTTTGAATGGCATCTCATCTGAAGCAAAATTTAGTC
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CGCATATTTCTTGGACTACCGTCAACACCGACAGCAAAATTTGGTAAAAT
CCTTAATTTTGTCACCGTATGGCATGTTTGACACCGAAATACCGTCACTT
TTTTCTTCAAACACCGAATATTACCAAAATAATGGTATATTATGGTTTGT
TTATATCATACTAAACGCTACTGTACTAAACTGCCATTTTACTGTAATAT
GCAAACGACAAGTTTTTGAAAGGATGAAAATTTCTAATTTGCGTTGCTCA
GAGCGGTTAATAAATAGGGAATTTCCCAACAAAAAAGGAATTTCCCTTAA
TTCGACTCCCTGAGGTAATAAAAAAAGACATATAGAGCTTTGAAAATGGG
TAATCAGATCAAAAAAAATCCGGAAAAGTACAATACAGTCAAGCTAAGAA
TGTTACCGGTACACAATTTAACCGGAACTAAAATACTGAAAAACGTGCGC
AAAATCCCGCGATGGCAATAGTATAGATGTATATCATCTTTATTGGAAAA
CCGCATCAATGTTAACCCGAATGCCTTCTCGGGTAACTTAATGCGAGACT
TAATGCATGTCGGGTAACTGCATGTCCCAAAATTGCATTAATTTTTCGCC
CCCAGTTCCAGTTCATAAACAATAAAAAATTATATATTTTTGTGAGCGTA
ATTGGATGTAGAATATCGGATTTGGTGTTACTTAAATTTTTTCTCAGTAT
AATTAGAGATATCTTAAGAAAACCTGCTTATGACGTCATAATATTGATGA
CGTCATAAATACAAAATGTTGAATATCTCAAGAAATATAAATCAAAACTT
TATGAAATTTGGACCAGTGATAGAGCACATTGAGATAATTCTAGACTAGT
CATAGCTTTCACTATCCTAAATGCCCCCACTGAAAGGTCATGTCATGCAC
TTNAAAGTACAAAGTATTTCCAAAAATTGATGACGTCAGCAGCAACTGCA
GAAATTCGAATTTTTGCAATAAAATGCTGACATCAGCTAATTTTCAATTT
TTTTGAAAACATTTCTCCTACTCTTGATGAGTTCTATCATTGGTGCAAAT
TTCATTAGCATTAGTTCTTGAGATATTCAACTTTTTAAATTATGACGTCA
TGAATAATGACGTCATAATTAGGTTTTCTTACAAAAACTCTAATTATGCT
GAGAAAAAAATTAGGTATCACCAAATCCAACATTCTATATCCAAATACGC
TTCCAAAAATGTATACCTAATTTGTTATGGTTTAAGGGCTGGAATTCGGG
GCGAAGACGAAAAGCAGATTTTGAATAATTTGGGACATGCATTAAGTTAC
CCGAGTTGGTTTACCCATAAAAGCCCACGATTGTATCTACGAAACACAAG
GTGAGAATTTTAGCTGTCAGCAATAATAAGAATAAGTCTCTATAGAAGAA
TCTGAGATGAACAGCTTGTATTTCCATATTAATGATATGTGTAACCAATA
TAATATTTAAAAGTTCATTTTGTTCAGCTGCTATGGTAGCAAAAATCCTT
ATTCAATTATAGAATTCCAAAAGACAAAAAGAGTATAAGGCATTAAAAAT
TCCACCAAAGATTTATCAGCTTCAAGCTGTGTTCATTCTTACATAATTGA
AAATTATGGCAATTAAGATTTTACATTGATAATTGGAGGCTATGGAGACA
CGAATTTATTTAATGACTTTTCTTCCTCTCCATACATGTGGTTTACCGTC
TCAATGTAGAAATATCATAAGTCAGACAAAAAATTATACTAGTCAAAGAT
TGATTAAATGATTCAGTGAGGGTACTCATTAATCACCCCGAAGTCGACCT
CATACCTAGNTTACATTTACCGTTTCAATGTAGAAATATATCATAAGTTA
GATAAGAAAAATATACTAGAGTCAAAGATTGATTAAATGATACATATTCA
GTGAGGGCACTCATTAATCACCCTGAAGTCGACCTCATACCTAGAGCAAT
TTAACCTTAACAAGAAACTCTTTGATTTTACTGTTCTTCGTAGATTTTCG
AAAAGAGGATATTTTCAATATGTTAAGTTTCAGAGCACCAACGGTAGATA
AAAGCCTATGTTGGCCTATGTTTATTTCTTCAATGATAATCTATTTTCTC
CTGTTTGGAACGTTGTATTCTTACGGTGTTTGGTTGCCAAGAATCATGGA
AGAATTTAATTGTAATCAAGAACAAGCTGGTAAGCGTCATAGTTTATTTT
TTTGCAGACAGAAATTCTCCCGATGAAAATTTTCTGATCGGTGAGCCAAA
AGCTAGAGACGAATCTCCTACGTAGGGTTTGAAACGACTTTTTTCATACA
TAAGTCTCATGGTCAAAGTGGTTTTCATACAAATGTAGTCTGCTATACTA
GATTACTAATTCAGACATAGTAGACACTAAGCGAATAAGCAAAAATAAGT
AAGTAAGTCTGCGACCGCTGTCGGAAGCGACCCGAAGGCTCCTCTTTCGA
TACACCTATATCTACCCGAAGGTAGAGGAGTTTGTCACTCTTTCTCACTG
GATTTCTTCACTTACCTTTGGTCCTTTTCTTAAATGTTGGGCATCAAGCA
GAGCAGAAAGGCATCAAGTACCATTTTGAGGATCTTTGGTATGACCTGAA
CCGTAGTCGGATGCTCTACCACTGCACCACGGTTCGCAAAAATAATGGAA
GGGAGGAATTGTAAAAATCATCATATTATCATATAACGTACTCGTGCATA
GGCGTATCGAGAATTTTTGAGGGAGTGCAGACGTTTATGACATATTCATT
ATCTTTTGATAAAACAAAGACAATAATTACAGTGCCGTAAAAACCGCTCT
CATACATAAATTTTGCAGGGTATCTCGCTACGACTATAACACCCCCTGAT
ACGGATAGAGTTGAGGTAGCAAAAATATTTTTAAAAGCATGCCACCCTAT
GGTTAAATATCTTTTTAGATCTACAGCTTTGGGGTCAGCCTAGTTTCTAA
TATTTCGAAAACGTTCTTGAAGACGGAACTGATGAACTACATGTTAGTTT
GGTCTAACTAAAACTTTTCACACCTGACCACTTAACTTATTCTCAAATAT
TGCATGGCATGTTCACTTTGACATTTTGACAAATGTTCTTGTGTAAGGAG
AGATAGATATTACAAAGTACTCATAAAAAAAAAACACATGTTTGAAACTT
CAATTCAGCTGAGTGGATTTTATTTTGAGATTCGACAAGAGGATAAGAAT
TCATGGCTCAGGCAGAGCTCAAATACTCTCCTTTACATCTATTTTACAAT
ATAATCTTGCACTGAGGCCCCCTTTTGGTTTGGATTAAGGTCATTAAGAG
GTTAAACTATNATGGAAGGGAGGAATTGTAAAAATCATCATATTATCATA
TAACGTACTCGTGCATAGGCGTATCGAGAATTTTTGAGGGAGTGCAGACG
TTTATGACATATTCATTATCTTTTGATAAAACAAAGACAATAATTACAGT
GCCGTAAAAACCGCTCTCATACATAAATTTTGCAGGGTATCTCGCTACGA
CTATAACACCCCCTGATACGGATAGAGTTGAGGTAGCAAAAATATTTTTA
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TTGATCAACTAGATTTAGATTTTTCTTCTTCAGAAGAGGCTGGTTTAAAT
GTACAGAAGGCGAGTCAAGGCAGAAGATTGACAAAAGCCAATACAACTCA
AGTAGAATAATATATGGTAAACCAGGAAATCAGTGTTTTTGTTTTAAAGG
GTGACAATTTAGTTGAATAAAGCTTGGGCATAGAAGATGAGCTAACAATT
TTCTGGAAATATTCCAGACCAAAGTATACACAGAACATCGACCAACATTA
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TGCAAAATCAGTCTTCTTTCTGCAGTAAAATTGAATCTTGGAAAATCATG
AAATTAGTTCTTGGTTAATTCAAAGGCTAGGCCAGTGGCACTCCAGATGT
TACAATAAATACGAGAGCTTTGTGAGTGTGTTATGTGTGTTTATTTCCCA
GGTCGGGTCCTAGTTAAGGGGAGTCACTTCTTTGAGAGAATTTCGAACGG
CGGTACGGTTCTCTCAGAAACTTCGACAGCCGTCTGGTAACCTCGACAGT
GGTCTGGTTACCTCGGCGGCGGCTTGGTTTCAACCATAAAAGTGTCTCAG
GTCGGGTCCTATTAAGGGGAGTCACTTCTTGAGGGAATTTCGTAACGGCG
GTTCGGTTCTCTCAGAAACCTCGACAGCCGTCTGGTAACCTTGACGGCGG
TCTGGTTACCTCGACGGCGGCTTGGTTTCAACCCTAAAAGTGTCTCAGGT
CGGGTCCTACTCAAGGGAGTCACTTCTTTGAGGGAATTTCGAACGGCGGT
TCGGTTCTCTCAGAAACCTTGACGGCGGTCTGGTTTCAACCCTAAAAGTG
TCTCAGGTCGGGTCCTACTCAAGGGAGTCACTTCTTTGAGGGAATTTCGA
ACGGCGGTTCGGTTCTCTCAGAAACCTTGACGGCGGTCTGGTTTCAACCC
TAAAAGTGTCTCAGGTCCGGTCCTACTCAAAGGGAGTCACTTCTTTGAGG
GAATTTCGAATGGCGGTTCGGTTCTCTCAGAAACCTTGACGGCGGTCTGG
TCTGCAACCATTGTCTTGTTTTGGGGATACCTTCGGTTGGGACTAAATTT
TCCCCAAAACTGATTATGGGTTAGCCAAATATGTGAACGCCAAACTTAAT
TGAAAAATGTCTCAATCTATTCTACTCCCCTCCAAACACATGAACGAATT
TGGAAATTAAACACAGATCTAATATGAAAACAAAAAGAAAGATTTAATAA
TGCAAAGATCTAGCCCGGGGTCCACTCAAAGCCTTTTTTATAGACTGATG
ACACGATTAAAGTGGCCCAGTAGTATGTGGTAATACACAAAGACGGACAG
AGATAGTTATTTTTGAATACCGCAGATGGGTAGGCTATCGCCATTATTAG
CTGTAAACCCTATGTAGGGTTATTTTCTCCCTGTTTGATATTCTTATAAA
CGGGAAATATATATCGTTTTAATTTCTAGAAACATCAATTAAAAAACTAT
TTATCGTCATGTTAAGATTCAAATCACCGACCGTTGACGCAGGTTTTTGC
TGGCCTATGCTTGTTATGTCTTCTACTATATATTTCTTGTTATTTGGAAC
GTTGTTTTCTTACGGTGTTTGGCTGCCAAGAATCATGGAAGAATTTAATT
GCAATCAAGAACAAGCTGGTAAGTGTCATCGTTTATTTTTTTGTTTGAAA
ATGTTAATTCAGAATGGCCAATGAAAATTAGGCGTTGAGCTAGACGATCC
TATCGTCTACACCATGTCACTGAAAAAGAAAATAAATCGGGAGGCGGGAT
AGATTTGAAAATTGAGTTTAGCATGGGATGGAGTAAACAGAGGCGGAGGT
GTTTACAGTGTTCTAAACTCTACTGCTTCTATTTTCTCGTAAACCACCGT
CATGGCTGTAAACTTTTCCCGCGCTATCCCTCTAACGGACGATAGCATCG
TCTAGCTTTGAGCGCGGAGTCAAGATCTCCTTTTTAATCAGAGTAGTGAC
CACTAGGTCAAGGCATTGGTGCTCAAATCCCCACTTTTTCCAATATCCCA
CGTTCAGTTCTAGGTAGCTGAGGCGGCCTGTAAAAACAATCGAAAGAATG
TCTGAAAATCCTGGATTACTGTTTACTGAAGGTCTTATTTTACGCCATCA
CCCATCTCTAGAATGCTGATGCTGCGGAGTTATTGTGTAAAATATCGTTA
TTAGGGATATTAGGGCCCATGCTACTTTGACCTTAATTTTTTTACTTACT
TTTTTTCATGTAGCTTGGGTTGTTTCAATGGCCAGTGGTTTATTGGTGTT
ACTTGCAATGCCTGCATCAGTATCGTGCAATTATCTTGGAGTTTTCACGA
TGTCCATACTCGGTTCAATTATGTGCGGATCAGGACTCATAATATCGTCA
CGTCTTCAAAATATCTATCATCTTTATTTATCGTTTGGAGTCTTGCTAGG
CATTGGTTTAGCCCTTCTTTACACACCGACTTTGGTCATGGTTGGACGAT
GGTTTGACAAATACCAAACGCAAGCTACAACTTTTATGATGATTGGAGCT
CCAATAGGGTCGCTTATATTTAACCCGCTGATGGAGAAAATCATGGAGAA
TTATAACCTAAGGTCTGCGATGAATCTCTATGGTATTATGTTCCTGGGAA
TAACATTTATATGCTCTTTTGGTTATCTTCCCTTCAGCCAAAAGCTTATC
AAAAAAGATGTTGATATAGAATCTAAATTGGAAAAGAATAAAATTGATTG
TGGATTCAAGTTCCGTAAGAATTTACTTAGGAACAACGCATTGTGGTTGT
TCTGTGCATGCAGATTCTTTGCAATCTTGTCTTCCTACGTCCCCCTGTTT
CACTTGGTAAGTTATAAAGTTCTTTAGTCTTACCAAAATTTACCATAAAA
CTTAACTTTGTTTTGGACAGAAGATTGCATAATATACGATTTGTTGCTCA
AATTTGCCCAAATGTGGTAAAACTTTCTCCCTATCGTTAGAGTTAAATTT
TGAAATCCTAAATTTTTGATCCCTTCTTCCAAGAAATTTGAACACTTTCC
TAATAGGTAATAGCTCGAATCAAATAAGTGACCCGGTGAGAAATTTTTGC
AAGTTTGGATAGTTTAGGGGTTAAATATAATTGGGTTGTAAATGTATTAG
ACTAGCAAGCGTCTGTCACAGGAACGCGGGACTAGTGCTTATCTATAAAG
AGTTCTTATAAAAAATAGAAATTGCCGTGGGAAAGTGGTTTGGAAACACA
ATTGTATGCAGTGTACATATAGACATAGAGCCCATTGCAAGCTTAAGCTG
CAGCGAAATACAACGATACAACGATACAACAATGGTTTATTAATCTATAA
ATGTATCAATTTCAGATCAAATACGCAATGACGATAGGAATAAGCAGTTC
AACAGCTAGTCTTATGTTAGCTGTATGGTCTGGAAGTAATTTGTTTGGTC
GGATCTGTTATGGCTGCTTTATTGCAAATCACCGAGAAAAATTATTGGCA
ACATATCAAATCTCGATGTTTTTAAGCGGAGTGGTCAGCATTGCAGCTTA
TTTTGCCGACAATACATGGAGTTTGTTTCTCTATTGTTGTGTTTATGGAA
TTTTTGATAGTTCGAATATTGGACTAGCCAGTCTGGTGACGATTGATTTG
ACAAGTCCACTTGATTTGGGAGCAGCTTGGGGTATGCAACAAACGATCAA
TGGGATTCCAAGCATTGCTGGTCCTGTACTGATCGGTATGGTTAATTTTC
GCCTTTTTATTTGCTATTTGAAAACTCAGTAGGTATTAGGTTTGAGAAAG
GATGGGGTGTGCAACTTGTGACCTTTGGACCCTTAGAGGGACTAAAGAGG
AGAAAAAATTGGAAATATTTGTTAATTATACGACCCTTATTGTACTTTAA
TGGGACAAATGACCAAATTTCAATGCATTTAGGGGCAGAAATTGAAAATT
TTCCTATTTTTCCGATCTTTAATTGGACTCAGATTTAATTTTCTGATTTT
TCCAGACCTTACGGAGACTGCCAGGTCCAAAAAGGTATCCTTGAGGGCGG
CACATACCAGTACCGTTACTCGCCAAATAACCCCCTGGGTTTGAAAAAGA
CTCCCTTTATACACCCTCTATTCTAAAGACACGATTGGGCTCCTTCCCAC
TAGAAAAAATGGCCAAAATATTCTTGCCAGTGGAAAAGTTCACTCAAATT
TTTGTCGCTGGTTGAAATAATAAAAGAAACAAATCTTCTCTGCAAAATAT
ATTTCTTTTTCTCACTTTTGAGTTTCCGTCCGTTCTTTTTATCGCCACTG
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ATTGAGTGGAATTCGTCAATAATATCTGACACGAAAAAATCTTGCAAAAT
TTTAGGAAATTTCTCGAGTCTTCAAAATCTTTCCGATATCTTCATTTTCT
AGGTAGATTTTGTTTCTTTTTGAGAATCTCTACCATTCATTTTCAATATA
TTTTTCTCAACAGGTGCGATGAACGATGCGAAATTATTGAGTGCAAATTA
CATGTTTGTTTTTACTGGTGGTACATTCATCCTTGGAAGTATTTTCATGA
ACTTTGCACGGATCACACATAATCGAACTCGTCAATCAGAGATTCCAAAC
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AGAACGTAAATTCTTCGCAATTGCCAAAACAAACCTCAGTCGAAAATTTC
TCATTTGATAATAAAACTTTCAATGTTGATATTATCCGGAATGAAAAGGA
GTCATTGTCCTCAGTTGAATTTTCTAAAGATACACAAAATGGGAAAATTG
TCTGATGAATTTTGTTTTAATAACAAAGCATTTGTCTATACCAATGAAAA
CTGAAAAGAGCGATAAGAAATCTACCAAATGATCAAAAGAAAATAAAGAA
CACAGCATTGAAGATTTCGATATGGAATCAATGAATATTAATTTGAACAC
AAAGAATTTTATATTAATGTAAAGAATATTCTATACTCGACATGGCGTAA
CCGACGGGGGGATACTTAGGCGAATTGGGCGCCGGGTAAGTGCGAGCCAT
ATGGGGTATAATCATTTAAAAGCAATCGAGTCTCTGTAAGTGTTCCAAAA
TCACGAAAATGAAAAATCGGCTCCCTCAAAAGATCATGAATTTTTTTTAA
TTTGGACTAGAATTTGAAAATTTTGCTTGAAATCTTAGGGAAGCTGTCTC
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AGCAAACCCTTGTCAGACATCCCATTTGGAAAAGTTTGACCAAAATATCG
TCCCACTGGTAAAATTTCTCACTGAGAAATTGACTTTGATTTTATTTTCA
TTTAGCTTTCGTAAGAAATTTATATTCCCATTGGGGCTGCGAACAGGGAT
GTCAGCAGATGCGATAATACAGTATTATAATATTATAGATAATTTGTACA
ATTTTTACATACATATATAAGAACCTTTATAACTTCAAACGATAGTGTAC
TTTAATTGGAAGGTCTAGTAGAGACCATTAGTTTTTAAAATGAAAATTAG
TCGACGGAAGGTTAGACAAACAATGAACGGTATAATTCGATGTAATTAAG
CTAATTTATTGCTTATTTTGATAATGTCTGGTTATTTTTATCTATTTGCC
ATAAGATAACTCATGCCATGAAGAAATAGAGTCTCATTTGCTCGTTACTC
AGGAGTTGCTCAGCTATCGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000019:528105..542524- >TCONS_00002316 ID=TCONS_00002316|Name=TCONS_00002316|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=6060bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019:528105..542524- (Clytia hemisphaerica)
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ATTGGCAACATATCAAATCTCGATGTTTTTAAGCGGAGTGGTCAGCATTG
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CTTTATTTATCGTTTGGAGTGTTGCTAGGCATTGGTTTAGCCCTTCTTTA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000019 | supercontig | sc0000019:528105..542524 - |
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
|---|
| GO:0055085 | transmembrane transport |
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
|---|
| GO:0016021 | integral component of membrane |
GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
| Category |
Term Accession |
Term Name |
| biological_process |
GO:0055085 |
transmembrane transport |
| cellular_component |
GO:0016021 |
integral component of membrane |
Blast
BLAST of TCONS_00002316 vs. Swiss-Prot (Human)
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F + Q AW+ S+ + +L A S+ N+L +LG ++ +GLI+SS ++ HLYL+ GVL G+G AL Y+P + MVG++F + + A M G+ IG+ I P+++ ++E ++ R A+ + G L + +C P +QK K V S L K + C + L + F + V F +AY PLF +L+ YA+++G+S A+ ++++ ++ G I +G ++ + R L YQ +L G+ + + L + C +G FD + + L +VT ++ L +A G+ ++ +P + P + G + D S F+ G + I S+ + FAR+ R R++++
Sbjct: 50 FTQDYAQTAWIHSIVDCVTMLCAPLGSVVSNHLSCQVGIMLGGLLASTGLILSSFATSLKHLYLTLGVLTGLGFALCYSPAIAMVGKYFSRRKALAYGIAMSGSGIGTFILAPVVQLLIEQFSWRGALLILGGFVLNLC-VCGALMRPITLKEDHTTPEQNHVCRTQKEDIKRVSPYSSLTKEWAQTCLCCCLQQEYSFLLMSDFVVLAVSVLF--MAYGCSPLFVYLVPYALSVGVSHQQAAFLMSILGVIDIIGNITFG-WLTDRR--CLKNYQYVCYLFAVGMDGLCYLCLPMLQSLPLLVPFSCTFGYFDGAYVTLIPVVTTEIVGTTSLSSALGVVYFLHAVPYLVSPPIAGRLVDTT-GSYTAAFLLCGFSMIFSSVLLGFARLI-KRMRKTQL 441
The following BLAST results are available for this feature:
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