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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00002237 ID=TCONS_00002237|Name=TCONS_00002237|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1090bp
AGGCAACCCAATATAATTTGGAATTCGAAGAAAATGGTTCGAAATACAAC
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tatatgtcctgttaaacctacctttttagaatttaaaaat Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000019:266742..277096+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00002237 ID=TCONS_00002237|Name=TCONS_00002237|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10355bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019:266742..277096+ (Clytia hemisphaerica)
AGGCAACCCAATATAATTTGGAATTCGAAGAAAATGGTTCGAAATACAAC
GAACGAATTATTGTTGacaaaaagaaaggatttttaCTTTATGATGTACC
AAAACATGGTGATATCGAGGCTGCCAAATTCTTGAAAGACTTCAACACTG
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tacgttatgaacatcacttgccccgtttcaaaattattgccatgatgatt
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gtgatgttcctgacgtaatttatgaaaaggtctggTATTGGTGCTCTTAA
TTTTTTACCTCGATTTATTATTTATCCACCTGTTAATATCGATTATGTTA
TCGATTATTATCGATGATCAATTTTATCAAGCCATATTTCCCCTACTTTC
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GCTGTAACACGTAGCACTCCCCTACACGTAGTAAATATAAAGAAGCTTCT
TACGGTTGCGGCAATCTTATGTGAACAAAATTCTATTATTATTCTCCATC
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aatttttgctGGTCCAGAACTTAAAGAAGACTCTTTATCCGCTCTCATGA
AGCAATTCTGTCAAGGAATGCAAAAGTTGAGCATCGTTCGAAAATCAAGC
AAAGATATGGAACAAATCTTAAAGCAACAAATCATCAGTAAGGAATCTTT
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GACTTAGATGTCCGTTGCCCAACAAATGTAATAGTCCACCACCAAACAag
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TGTGATTATGTTTTACATACAGTTCTTGTATTAAAAGCTACAGCCCTCTA
GAAAGAAGCTTGCTGGAGTCGAAAaaccttgttttttttatacttCAACC
AGTCACTTTCTAGAACCTGTGTCTTTTGATGCAATAATTCTATAGAAGAA
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CATTTAcacttttctcaagatttctcAAATTGACACAATATGACTTAAAT
ATTGCTTTCCAAATAAAACAAGTCCTGCACGCGATAGGTCTTCGTctttt
atgacgttttattttGCCCAGTGATTATGGGGCCAATTATGTTTTAACAA
GCACACTTCATGTCAATTTATTTTTGAGTATTCGCTGTCTTTTATGGAGA
TCATAGTTATATATACGGCAGCGtggtgtcctccccccccccaacAAGAG
GCCTGCTTTTAGGGTTTGCCACAAACGGTGCCATTGCTTGCTAATTTCGG
CACTTCCTTTGCTTTTGAACTAAAGGAAGggaaattatgcaaaaaatctc
ttaaaaagaaaacaaaacaatttatttttctatCCAAGACAGACATTCGA
CCCGTTCACATAGCTGCAGCACacagtttttcactttttcattcCTTGAA
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CGATTATTTTGAACTATTCCCAAGTCTCTATGAGGGCATCagaaaaatac
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ACAGCCGAGTCTCTCCCTACAATAATACCTGAAGTTTCATTTCAATTCAG
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TTAGTCCGTCTAGCTAATGCTTTTACTGACTCTTCATTTTAGTGTGTTAC
GGTGTTGTTCAAATTAAACTAAGGGTTCAAATGCTTCACTTTCTAGGAAC
AGAAGGCGATATCATGTATTTTACTTTTCTgagaaaacacccctgtgtta
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CCCCGGttggaaaatacccttgaatttcagccccactgagaaatcgactt
tgatttcatccccttctcgaaattccatgtttaaaaattgcactccaaaa
ccatccccaatttgttttttttaccttggaacaatagaatttccatccca
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ttccctttttagtgatcttgtgtagacgataggatcgtctacctGAAATA
TAGAGCTGACATTATTAGAAAATCTGGAGAAAATTACACCACTAAATTAt
catttttctacaaaaagctTGTATTTTGTTGAAGCCAATATATCTCAAAA
GGTTTTTGCTTTGGTTCCTTAAATGGGGAAATTTCCGACTCCTTTTTTCG
TAGAGTTGGTGAATTGTGAGTAGTATTCCatctaaattatatttttttcg
aagATCTTGTGGATCAAATTCCAGCTTCTAGGCCGGTCAGCTCAAAGTTT
TTAGCATATTTTAACAAGCAGTACTGACAAAAAGGTCTTCTCTAATTTTT
GCTTCAGGCTGGGTATAATTTTAGACTTCATATTTTGCATCAACAGCGGG
AGTCATTCGAACTGAAAGCAACCCGCATATGATGCATCACGACCAAAAGT
AAGGCCTTTAGAATCGACCTGAGtagtctttcaaaaaaaaaaatattgac
atttcCCATTTCTATCCAAAATTTCTCCTTTGATTTCCAGTTTACAATTA
TCACTCCTCTTTAGCAATACAAAATCTAGTTATGACAATgcttttctctt
tctttctgttAAATTTGAGCTACACGCATCTCTGGAACACTTTTTGTAGA
GTCTGTAGAGTCCCCCGGGAAGTCTAATTTTATCGAATTATGGAgggatt
cgaataatagagagtAAGGTTATAAAAAACGTACATTGAGGTAACAGTAT
GAATGCTACAACATTCAACACCAAGCATCTTAGAGAGATGCTGGCTGGGC
GAGAGCCTAATGAATGATAGGTCCCAGACAATGTCGTAATCGTAATGTTT
ACATATTTACATTTCAACTAATTGGACAACTGTCAAGTGTGACCGAATAT
TGacttatttgaaaataatcttaaaatatttatcaaactcaaactacacg
ttttttaataagaacaatcaaaatttttgaagccttctaatggtcttaac
tttttgagttttaagtctaaaaatattcttaagatgttcttgttttcact
gtcttgttattattttgtcaattttgctataaaattgggtgttttcgagt
ccgcgaagccttagactgttcttagcttgttcttaatattttggccatcg
aagcctcatggtcttataataaaaaatgcGTATTCGGTCTATGGACTAAG
CACAACACGATTTTGCGTTTGCGAAATTCAACATTTAAAAAATCGTGAAT
GGTTTGTTTGAACACCTTTCAAGGGCTATTACCAATCACACTCATTACCA
GACCCTTACGAAGAAGACTGGTGActaatttggtaaaaattgaGGTGTAT
TTAAATCGAGATTTTGAGCAGTGAAGAATCACATTTTAATTCAACTTCAA
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AGCTCCTcgcaattttttaactttgtattttcaagttgcctttatgattt
ttttgtcttttttatagctttccttttattttaagaaatttcttcCAGTT
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taaaatctttttcaggATGATTTCCGTACAAAACATTTTGTTGGTTGCTT
GCGTCGCCCTGGCTTCTGTAAGTCGTTATTAACTTCTTTTTTcatagtat
tttttgaaatttaattttagcATCACTTCAGGGCTTCAGAGTTACAACCG
ACTTTCTTCAAAATATTCAGAGTTTCTTCCATCATACAACTAAATACAAA
AGATTACTTATTTAATACCAACAACTCTCTCTAGTTCGAACTTCTGTTTC
TCAAATCTCTCTActataattcgaattaaaaCGTCGAGCTTTTCGAAGAA
GATTTTCTCTTTCTCGAAAGTCGAATAAGAGAGAGATGACTGTTCTCCAT
TACAAAATTTCTCAATATTTATAAAACTACAAATTCTTACTTTATTCAGG
CAACCCAATACAATTTGGAATTCGAAGAAAATGGTTCGAAATACAACGAA
CGAATCATTGTTGacaaaaagaaaggatttttaCTTTATGATGTACCAAA
ACATGGTGATATCGAGGCTGCCAAATTCTTGAAAGACTTCAACACTGTAA
GTAGATTGTTAGATAACTTTTATTCCCTTCTTATTttcacccctgtgtca
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TATTCCAACAGAAACAATAAAttctatattttatatataGAAAACGACAG
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AATATTAAACCTTTGCCCAATGGGCTACTCCAAGAGGATGGTAACGCCCC
TAACTCAACATCACGGCTGTTGTTCCGATAAGTAACCCTATACACGTTTT
CTGAATAAAAATTTTCCTCGTGAGAAAAATGACCCAAAATTTTATAGCCA
TTGGAAAACAATAAGAAAAGACTTTTGAATATCTGAACTGGATTTCTGAA
CTTAAAGgtcttgtttttaaataagagtggtatcgtttgcttactcatca
attttaatacaCAAGCtgtttcacattggattgacacggatgtggagcaa
gattggtcagaaataggaaaagaaaaacttttttttgcttatatcagcat
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tatgaaacggtaACACTTATGTCAAACTAAACCTTTAAGCAATAAAAAGT
CATTTTATCTCTCCAATGGCTAGAATATTGTCATAGGGACAGGGGTGTAT
ATCTTGTCACATtgtgatttatttatttttcccttTTCAGCGATTCAACG
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GACGAACCAACCCCAGATAGCATCGAAGATGGTCTCAAAATGGTAAGGTT
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CGATGCTAATAATCTGCCTCTGAAACTACATGATATGAAACCACTAATTC
AAACTTTCTAAGAACTTTACAAGTCTTCGGCAACACCTAGATGTGGCCAA
AAAGAGATATATATGAAcaaattaaagtttttaaatttgtataCATCATT
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tttccagaaaagattGTAAAGGGGGGTTGGGGATATGGGACATCCACGGG
ATGCATTTACATGGATCAAAAGGGCTGAATATCAAGGGGGATTTAGTCTT
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CACACCTCCACACAATTCTTTACTCTCTTTGCTTTAATCCACTCTAGGTT
CAAGGCCACTTCCCAAACAACAAATTCTTGGTTGAAaatgacgaaatttt
tgctGGTCCAGAACTTAAAGAAGACTCTTTATCTGCTCTCATCAAGCAAT
TCTGTCAAGGAATGCAAAAATTGAGCATCGTCCGAAAATCAAGCAAAGAT
ATGGAACAAATCTTGAAACAACAAATTATCAGTAAGAatccttttgtttt
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TTGGCGACTTCAATGggatttaaatttcatttttttcaagtcagaaaatt
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ttagccAACTTTTACAGTTTGGGGTCCCAGTTGGTCTATGAGAAGATGGT
ATATTtaagcattttcaaatttttccgaTCCTGCCCTTATTTTAAGAGCA
GAAGTCCCCTAATTATGTAATTTTTGATTTGCTTTCATTTGCTTAAGACT
CAGCAACTCCATTCTCAaagtttttcataaattaaTATATAGGGTGAAAC
TGAAAATTGACAGTGCAAAAACTgattctcttttttcatgtcTTACCCAG
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CTCATGCAACCGAATGGATCTCATCAAATTGAACTGCGATATCACATACA
CCAAATACTGCGGATACACCGTTCGCCGTGGAATGTGGACTGCCGACTGC
ACTAAATCAACCAGCGGACGTCACGGAggtttcgaatgccgtcttccATC
GCATACTCGCGCCACGGTCAAATGTTGCCGTCTTAAATGTCCATTGGCTA
ACAAATGCAACAACCCACCACCAAACAAGAaaacattttagattttctat
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GACTATGTCGTATGCTTATTTCGTTTCAtctttgtttgtattttatatGT
ATCGTATTTATCAGCCATATCTGAACCCCAAATGACAGGACATGAAAAAA
AGTTGGCCAAATTCTTGTAAATTCTTCagggctctggacatacccaattt
ttcaattttacaatAACTTAAATGgtaatttctgcattttaaaaagatta
atgtataactttttttatatgtcctgttaaacctacctttttagaattta
aaaat
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00002237-exon-sc0000019-1491911889:266742..266890 | TCONS_00002237-exon-sc0000019-1491911889:266742..266890 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00002237-exon-sc0000019-1491911889:267701..267802 | TCONS_00002237-exon-sc0000019-1491911889:267701..267802 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002237-exon-sc0000019-1510915933:267701..267802 | TCONS_00002237-exon-sc0000019-1510915933:267701..267802 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00002237-exon-sc0000019-1575043694:275789..275972 | TCONS_00002237-exon-sc0000019-1575043694:275789..275972 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002237-exon-sc0000019-1491911889:276442..277096 | TCONS_00002237-exon-sc0000019-1491911889:276442..277096 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002237-exon-sc0000019-1510915933:276442..277096 | TCONS_00002237-exon-sc0000019-1510915933:276442..277096 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002237-exon-sc0000019-1575043694:276442..277096 | TCONS_00002237-exon-sc0000019-1575043694:276442..277096 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000019 | supercontig | sc0000019:266742..277096 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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