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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00001856 ID=TCONS_00001856|Name=TCONS_00001856|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2387bp GTTGTTACCTTAAACGTGGAAACGaaaattatccGATACACAACAACAAC AGTCACAAGTGGATAACGGAGAAATAAACGCCTGTCGTGATAGCGGAAGA AAAATGATTGATCGTCAGccTGGAACAAAACGGTTTTACAACTTGACATC TGAATATGAGAAGACGGCGGCTGGTGATCATGAAGATGTTTCGGACTCCG ATGAAAGCCGCTTATTTGTAGTAAACGACGGTTATTCATCCGACTTATCC GACATGTCGTCAATTCAtcgtcatcaaaataatttgtcaACAAAACGCGT CTTAAAAACACGACAAGTGCTCGATTCAAAACGAAACAGCGTGGTTATCG ACGAATATTTATCCGATACAGATCTTGATTCGTTAAGGACATCAACTCGA AACGAACAACGTAAAAAGAGATCGAAAAGTCACCGATTGATGAAAGACGA ATCGAAGATTTATcgagaaaatttgttcgagaAAGACGATAAAGATCGTA AACGAAGATCGTGGACTGATTCGGGTGTTTCACTTTCGTTATCGAGAACT GACCAATCGAGATGTGGAACTTTTGATCACGGTGTATCGATTAGAAACAC tgaaatggaaaatgaaaacCAAACACATTTAGAAGTTCCTTTACGGCGTC GAACGGCTAGTCAACTTCGAAAGACATCGACTGAAGCAACTAAATCGTTT AATCGATTGTCTCAAATCACGAATCGAAGCTCTTTAACGAATGTATCGAT CTTAACAACGACATCGATGACTTCTCTCAGTTCGATCATCTCACCATCGG AATTAGAATATATTTCAGAATCTGAAAGTTATAGTTCATctgatgatgat attcttaCTGATTCCCTCTTGAGAAATTTGAAACATACTCCTGGCGGTGG CTCACAATTATCAATGACATCTACAGCTTCTACAATCAAAGCTGATAACG AGAATATTTCAGCCACCGATCCTGAGAAATATATAGATATGCAATTAAGG TTATATCAAAAGCAAAAACAACAAACGAATAAATGTCAAAAACAATCACA TTCTCGTAAAAGAAGCAACAGCCTCATTCAGAAATTCAAATCGCATTTTC ATAAATCAAAACAGCAGAGTCCGAATCGTAGCTCCAAAGATGTGTCGTCA GAATTCTCCTTtgagaaagttgaaaaagattCTAATCAGAAATATGAAGT CATTACGACTGATTTTCTAAAGAAACTGAGAGACGAAGAATCAGCGCCTT TAGATTTTTATGTTGATGACGTTCAGTATGAAGATGATCTAAGTGATGAA GATGATGAGAACCAATCAAAAGACCCATTGGAAAATTTCTCATCCAAGCC ACATAacaaagaacataaaacttttcttggtaaattttttaaaaggacAC GCTCTTATTCGGTTTCACCAcaacttgaaaagaaaacaccGAAATCACGA TTTAGTAGAAATTCGTTTCGAGCAAGCACTCGATCGAATCCTGAAATGCC ATCTAAAgaagataatttttcaaatgttggaCGATATACATCGATGgata atttgaatttgaaagaagGTGGCCACCAACAAGACTCTGAAAATTATACA CCGAAAATGAACAGAAGTGAGACTTTTAGTGGAGCTATTTCATATAATCA TGAAAATCGAACCATGTACGATTCAAACTTTAATCGAAACCAATTGCCAA CACAATCACCTACTATAATGCAAAAACAATGTCTCGGTATTCCGGCTCAC GGTTCTGTTACTCCGAAAGCGAGCAGTCCAGATTTCTCGAAAGAATCACC AATTCCACCCCCTTCACCGACGCCAAGCGTttttgatttagaaaaattcc aaCAAGTACACATGCCGTTAGACCGTTGTAACTGTGAAGAATGTATGTAC GCAGACTATCTAGACTATCTTGAGTTTCAACGATTTCGAAGGTATTATTC TCAATCTTGTTGTGGACCGTGTTGTATGGCTCCAACTGATCTCCCTGTAT CTCCACATACACCACAAATGGCGNACCGTGTTGTATGGCTCCAACTGATC TCCCTGTATCTCCACATACACCACAAATGGCGCCCATGCGTATTTCTCCA CGCCATGTACACCCTGAAGCAAATATCATAGCACCTTTACCGGTGACCaa agaaactgaaaaacaaGCCAAAAATCTTCGCACCTCAATTTACGAATCTT TTGTATAATACtatatttttaatgaaatcaatatttttcttaaagcAGTT TTTATTTATAATGTTGAAATAATTAGAATAACCATTTTTAATACAAAACT TCAGCCTCACTTCAAACGCAGTCAGGGATATATGTTCAAATTAGCCGATT ATCGGTTGTTTAGCCTATTATCGGTTTAGACGATATC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000012:1006813..1018801+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00001856 ID=TCONS_00001856|Name=TCONS_00001856|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11989bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000012:1006813..1018801+ (Clytia hemisphaerica) GTTGTTACCTTAAACGTGGAAACGGTAAACAGTTTTTCGTTATTGGAAGG
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CTTCAGCCTCACTTCAAACGCAGTCAGGGATATATGTTCAAATTAGCCGA
TTATCGGTTGTTTAGCCTATTATCGGTTTAGACGATATC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00001856-exon-sc0000012-1491911889:1006813..1006836 | TCONS_00001856-exon-sc0000012-1491911889:1006813..1006836 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00001856-exon-sc0000012-1575043694:1006813..1006836 | TCONS_00001856-exon-sc0000012-1575043694:1006813..1006836 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001856-exon-sc0000012-1491911889:1014090..1014183 | TCONS_00001856-exon-sc0000012-1491911889:1014090..1014183 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001856-exon-sc0000012-1510915933:1014090..1014183 | TCONS_00001856-exon-sc0000012-1510915933:1014090..1014183 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001856-exon-sc0000012-1575043694:1014090..1014183 | TCONS_00001856-exon-sc0000012-1575043694:1014090..1014183 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001856-exon-sc0000012-1491911889:1016533..1018801 | TCONS_00001856-exon-sc0000012-1491911889:1016533..1018801 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001856-exon-sc0000012-1510915933:1016533..1018801 | TCONS_00001856-exon-sc0000012-1510915933:1016533..1018801 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001856-exon-sc0000012-1575043694:1016533..1018801 | TCONS_00001856-exon-sc0000012-1575043694:1016533..1018801 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000012 | supercontig | sc0000012:1006813..1018801 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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