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transcript sequence >TCONS_00001854 ID=TCONS_00001854|Name=TCONS_00001854|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3141bp ttttaaacttttattagTTTGATTATGATTTTCTTAGATATGCCTTAGCT TTCTGTACTCGGAGGAAAATGCTTGGTCATCGTTTTTAATCTCGGAAGTG AAGCTCATGGtagactttcaaaacttttttatggaaacTAGCGGATTAAC GAAAATAAATTTCTCGTGTTGAATAAGCACTATACAATTATCCATTTCTG AAATGATTAAATAAATGGTCTGCGAATTATGAATTTGCTTTACATTTTCA CAAAATCGAACCTTTGAGATTTGAActtatgaaataaattttgtaacTTT ATTCCAATTCTTTATTGAAGACCCTTATTAGAATTTATGTGTAAAATACT AAATTTAGCCTTTTAAATTGGTCAAGTCCATCGTGAGTTTTTAAGAATCA GACAAGCGAGATAGCATAACGTTCTTACAAGCTGTTCACTTCCCTCTATT CGAGAGATCTTGTTTACATAACAATACCAAATGACGTAGCCACAGTCTAA AATTTTTTACATCCACGACAAAACTATAAAGTAGGCGACAATACGCATTA TAATATTTTGTTGTAGTATATAATTCCTATTAATCATTATgtatatagat ttttttttcataacaccTTTATTATACGTATGGGTACTATCCTTGGTCGT TGGCGGCGGtattttatgtttataataCCTCTTTAAAGTACATATTTGAT GGATGATGGTATTTAGTTGGAAATAGGGAAGCACTTGAGAAGCATGTTGG ATGGAGCTTTCTGCATCGACGAAGACAGaaaattatccGATACACAACAA CAACAGTCACAAGTGGATAACGGAGAAATAAACGCCTGTCGTGATAGCGG AAGAAAAATGATTGATCGTCAGccTGGAACAAAACGGTTTTACAACTTGA CATCTGAATATGAGAAGACGGCGGCTGGTGATCATGAAGATGTTTCGGAC TCCGATGAAAGCCGCTTATTTGTAGTAAACGACGGTTATTCATCCGACTT ATCCGACATGTCGTCAATTCAtcgtcatcaaaataatttgtcaACAAAAC GCGTCTTAAAAACACGACAAGTGCTCGATTCAAAACGAAACAGCGTGGTT ATCGACGAATATTTATCCGATACAGATCTTGATTCGTTAAGGACATCAAC TCGAAACGAACAACGTAAAAAGAGATCGAAAAGTCACCGATTGATGAAAG ACGAATCGAAGATTTATcgagaaaatttgttcgagaAAGACGATAAAGAT CGTAAACGAAGATCGTGGACTGATTCGGGTGTTTCACTTTCGTTATCGAG AACTGACCAATCGAGATGTGGAACTTTTGATCACGGTGTATCGATTAGAA ACACtgaaatggaaaatgaaaacCAAACACATTTAGAAGTTCCTTTACGG CGTCGAACGGCTAGTCAACTTCGAAAGACATCGACTGAAGCAACTAAATC GTTTAATCGATTGTCTCAAATCACGAATCGAAGCTCTTTAACGAATGTAT CGATCTTAACAACGACATCGATGACTTCTCTCAGTTCGATCATCTCACCA TCGGAATTAGAATATATTTCAGAATCTGAAAGTTATAGTTCATctgatga tgatattcttaCTGATTCCCTCTTGAGAAATTTGAAACATACTCCTGGCG GTGGCTCACAATTATCAATGACATCTACAGCTTCTACAATCAAAGCTGAT AACGAGAATATTTCAGCCACCGATCCTGAGAAATATATAGATATGCAATT AAGGTTATATCAAAAGCAAAAACAACAAACGAATAAATGTCAAAAACAAT CACATTCTCGTAAAAGAAGCAACAGCCTCATTCAGAAATTCAAATCGCAT TTTCATAAATCAAAACAGCAGAGTCCGAATCGTAGCTCCAAAGATGTGTC GTCAGAATTCTCCTTtgagaaagttgaaaaagattCTAATCAGAAATATG AAGTCATTACGACTGATTTTCTAAAGAAACTGAGAGACGAAGAATCAGCG CCTTTAGATTTTTATGTTGATGACGTTCAGTATGAAGATGATCTAAGTGA TGAAGATGATGAGAACCAATCAAAAGACCCATTGGAAAATTTCTCATCCA AGCCACATAacaaagaacataaaacttttcttggtaaattttttaaaagg acACGCTCTTATTCGGTTTCACCAcaacttgaaaagaaaacaccGAAATC ACGATTTAGTAGAAATTCGTTTCGAGCAAGCACTCGATCGAATCCTGAAA TGCCATCTAAAgaagataatttttcaaatgttggaCGATATACATCGATG gataatttgaatttgaaagaagGTGGCCACCAACAAGACTCTGAAAATTA TACACCGAAAATGAACAGAAGTGAGACTTTTAGTGGAGCTATTTCATATA ATCATGAAAATCGAACCATGTACGATTCAAACTTTAATCGAAACCAATTG CCAACACAATCACCTACTATAATGCAAAAACAATGTCTCGGTATTCCGGC TCACGGTTCTGTTACTCCGAAAGCGAGCAGTCCAGATTTCTCGAAAGAAT CACCAATTCCACCCCCTTCACCGACGCCAAGCGTttttgatttagaaaaa ttccaaCAAGTACACATGCCGTTAGACCGTTGTAACTGTGAAGAATGTAT GTACGCAGACTATCTAGACTATCTTGAGTTTCAACGATTTCGAAGGTATT ATTCTCAATCTTGTTGTGGACCGTGTTGTATGGCTCCAACTGATCTCCCT GTATCTCCACATACACCACAAATGGCGNACCGTGTTGTATGGCTCCAACT GATCTCCCTGTATCTCCACATACACCACAAATGGCGCCCATGCGTATTTC TCCACGCCATGTACACCCTGAAGCAAATATCATAGCACCTTTACCGGTGA CCaaagaaactgaaaaacaaGCCAAAAATCTTCGCACCTCAATTTACGAA TCTTTTGTATAATACtatatttttaatgaaatcaatatttttcttaaagc AGTTTTTATTTATAATGTTGAAATAATTAGAATAACCATTTTTAATACAA AACTTCAGCCTCACTTCAAACGCAGTCAGGGATATATGTTCAAATTAGCC GATTATCGGTTGTTTAGCCTATTATCGGTTTAGACGATATC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000012:1003078..1018801+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00001854 ID=TCONS_00001854|Name=TCONS_00001854|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15724bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000012:1003078..1018801+ (Clytia hemisphaerica) ttttaaacttttattagTTTGATTATGATTTTCTTAGATATGCCTTAGCT
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CCTATTATCGGTTTAGACGATATC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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TCONS_00001854-exon-sc0000012-1575043694:1016533..1018801 | TCONS_00001854-exon-sc0000012-1575043694:1016533..1018801 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000012 | supercontig | sc0000012:1003078..1018801 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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