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transcript sequence >TCONS_00001853 ID=TCONS_00001853|Name=TCONS_00001853|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2675bp CATAACAATACCAAATGACGTAGCCACAGTCTAAAATTTTTTACATCCAC GACAAAACTATAAAGTAGGCGACAATACGCATTATAATATTTTGTTGTAG TATATAATTCCTATTAATCATTATgtatatagatttttttttcataacac cTTTATTATACGTATGGGTACTGTCCTTGGTCGTTGGCGGCGGtatttta tgtttataataCCTCTTTAAAGTACATATTTGATGGATGATGGTATTTAG TTGGAAATAGGGAAGCACTTGAGAAGCATGTTGGATGGAGCTTTTTGCAT CGACGAAGACAGaaaattatccGATACACAACAACAACAGTCACAAGTGG ATAACGGAGAAATAAACGCCTGTCGTGATAGCGGAAGAAAAATGATTGAT CGTCAGccTGGAACAAAACGGTTTTACAACTTGACATCTGAATATGAGAA GACGGCGGCTGGTGATCATGAAGATGTTTCGGACTCCGATGAAAGCCGCT TATTTGTAGTAAACGACGGTTATTCATCCGACTTATCCGACATGTCGTCA ATTCAtcgtcatcaaaataatttgtcaACAAAACGCGTCTTAAAAACACG ACAAGTGCTCGATTCAAAACGAAACAGCGTGGTTATCGACGAATATTTAT CCGATACAGATCTTGATTCGTTAAGGACATCAACTCGAAACGAACAACGT AAAAAGAGATCGAAAAGTCACCGATTGATGAAAGACGAATCGAAGATTTA TcgagaaaatttgttcgagaAAGACGATAAAGATCGTAAACGAAGATCGT GGACTGATTCGGGTGTTTCACTTTCGTTATCGAGAACTGACCAATCGAGA TGTGGAACTTTTGATCACGGTGTATCGATTAGAAACACtgaaatggaaaa tgaaaacCAAACACATTTAGAAGTTCCTTTACGGCGTCGAACGGCTAGTC AACTTCGAAAGACATCGACTGAAGCAACTAAATCGTTTAATCGATTGTCT CAAATCACGAATCGAAGCTCTTTAACGAATGTATCGATCTTAACAACGAC ATCGATGACTTCTCTCAGTTCGATCATCTCACCATCGGAATTAGAATATA TTTCAGAATCTGAAAGTTATAGTTCATctgatgatgatattcttaCTGAT TCCCTCTTGAGAAATTTGAAACATACTCCTGGCGGTGGCTCACAATTATC AATGACATCTACAGCTTCTACAATCAAAGCTGATAACGAGAATATTTCAG CCACCGATCCTGAGAAATATATAGATATGCAATTAAGGTTATATCAAAAG CAAAAACAACAAACGAATAAATGTCAAAAACAATCACATTCTCGTAAAAG AAGCAACAGCCTCATTCAGAAATTCAAATCGCATTTTCATAAATCAAAAC AGCAGAGTCCGAATCGTAGCTCCAAAGATGTGTCGTCAGAATTCTCCTTt gagaaagttgaaaaagattCTAATCAGAAATATGAAGTCATTACGACTGA TTTTCTAAAGAAACTGAGAGACGAAGAATCAGCGCCTTTAGATTTTTATG TTGATGACGTTCAGTATGAAGATGATCTAAGTGATGAAGATGATGAGAAC CAATCAAAAGACCCATTGGAAAATTTCTCATCCAAGCCACATAacaaaga acataaaacttttcttggtaaattttttaaaaggacACGCTCTTATTCGG TTTCACCAcaacttgaaaagaaaacaccGAAATCACGATTTAGTAGAAAT TCGTTTCGAGCAAGCACTCGATCGAATCCTGAAATGCCATCTAAAgaaga taatttttcaaatgttggaCGATATACATCGATGgataatttgaatttga aagaagGTGGCCACCAACAAGACTCTGAAAATTATACACCGAAAATGAAC AGAAGTGAGACTTTTAGTGGAGCTATTTCATATAATCATGAAAATCGAAC CATGTACGATTCAAACTTTAATCGAAACCAATTGCCAACACAATCACCTA CTATAATGCAAAAACAATGTCTCGGTATTCCGGCTCACGGTTCTGTTACT CCGAAAGCGAGCAGTCCAGATTTCTCGAAAGAATCACCAATTCCACCCCC TTCACCGACGCCAAGCGTttttgatttagaaaaattccaaCAAGTACACA TGCCGTTAGACCGTTGTAACTGTGAAGAATGTATGTACGCAGACTATCTA GACTATCTTGAGTTTCAACGATTTCGAAGGTATTATTCTCAATCTTGTTG TGGACCGTGTTGTATGGCTCCAACTGATCTCCCTGTATCTCCACATACAC CACAAATGGCGNACCGTGTTGTATGGCTCCAACTGATCTCCCTGTATCTC CACATACACCACAAATGGCGCCCATGCGTATTTCTCCACGCCATGTACAC CCTGAAGCAAATATCATAGCACCTTTACCGGTGACCaaagaaactgaaaa acaaGCCAAAAATCTTCGCACCTCAATTTACGAATCTTTTGTATAATACt atatttttaatgaaatcaatatttttcttaaagcAGTTTTTATTTATAAT GTTGAAATAATTAGAATAACCATTTTTAATACAAAACTTCAGCCTCACTT CAAACGCAGTCAGGGATATATGTTCAAATTAGCCGATTATCGGTTGTTTA GCCTATTATCGGTTTAGACGATATC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000012:1002449..1018801+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00001853 ID=TCONS_00001853|Name=TCONS_00001853|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16353bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000012:1002449..1018801+ (Clytia hemisphaerica) CATAACAATACCAAATGACGTAGCCACAGTCTAAAATTTTTTACATCCAC
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TTCAAATTAGCCGATTATCGGTTGTTTAGCCTATTATCGGTTTAGACGAT
ATC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00001853-exon-sc0000012-1491911889:1002449..1002760 | TCONS_00001853-exon-sc0000012-1491911889:1002449..1002760 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001853-exon-sc0000012-1510915933:1002449..1002760 | TCONS_00001853-exon-sc0000012-1510915933:1002449..1002760 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001853-exon-sc0000012-1575043694:1002449..1002760 | TCONS_00001853-exon-sc0000012-1575043694:1002449..1002760 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001853-exon-sc0000012-1491911889:1014090..1014183 | TCONS_00001853-exon-sc0000012-1491911889:1014090..1014183 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001853-exon-sc0000012-1510915933:1014090..1014183 | TCONS_00001853-exon-sc0000012-1510915933:1014090..1014183 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001853-exon-sc0000012-1575043694:1014090..1014183 | TCONS_00001853-exon-sc0000012-1575043694:1014090..1014183 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001853-exon-sc0000012-1491911889:1016533..1018801 | TCONS_00001853-exon-sc0000012-1491911889:1016533..1018801 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001853-exon-sc0000012-1510915933:1016533..1018801 | TCONS_00001853-exon-sc0000012-1510915933:1016533..1018801 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001853-exon-sc0000012-1575043694:1016533..1018801 | TCONS_00001853-exon-sc0000012-1575043694:1016533..1018801 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000012 | supercontig | sc0000012:1002449..1018801 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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