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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00001568 ID=TCONS_00001568|Name=TCONS_00001568|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1878bp AACTAAACATAAATGAAGTCTACTTACAGTTCGAGCACCTGTGATTTCTG CTAAAGCATCCTGGATTGCACCACCGTCATTACGATTGTCTAATTCAATG ACAACATATTTTGCTCCAACTTTATCAAGACTTCCCTTTGCCATTTTACA GTATGGACAAtatgtctttgaaaatacaacAACTTTGTCTTTGAGAAAGT ATCAAATGGAGTCTATTTTATCTCTCCTGCAAAATAACAAGGAACTTGAC AATGTGGAATTAATGTCTGAGATTGCACTGTTTGCATACCTTAGTGACAA TGCTTATGGTAAAAATGCTTTGAAACTCGTCACTGGTGCAAAAGTCATCC AAGAATTGTATCGTCGGTTCACTAAACAAGACCAAATTATTGAAGCTCTG AGGGCTGATGCAGTTCGAAAGATAGCATTGTATGTTGAGAAAAACCCTCG TGCAAGTACAAATGATCAAGCTCGTGAAATTCAAAAACACGTGGATGATT TTGCCGCTAAAGTTGCCTTAGTCAATGGTGCATAATTAATTTGTACAATA TTTAGAATATGTAGCTATTATTTAAATCTttacgaaagcagccggcgagg cgacctttttttccgatgtgttctgagagcatatttcagctagaaatttt gatcttttcTGATCAgagcttcgaaaattaatcagctagaaataatgatg tgttctgacgagacaggggtataatcaaatTCATCTAACGTgctcttgtt gtctaggtaaccctagaaagcttcagaacacatcttttaaggagaccgag gtataatcaagagaaaattgatgtaatctttcgtggaaaaaaacaaatat ctttcaAGTTTATCTTGCCAACTGTTTTTCCTATATTTGAGGACACATCA AACCATGATGTAGTGACAAGTTTAGGaagacaaatagtgcgataaggttt cctagaaatcagaacacataatttgcataaaaatttgaaaggtcataata tttggtctcctagaagaaaagaacacatatttctaaaaaatctctccgcc ggctgcttctgtcTTTATATATAAATTACAATTTAAAACATTCTTTTCCA TATATTATCATGTGCACTTTAAGATTTTATGGGGTTTTATAAGCAGGTTT GGTTTTAAACGAGTTTGATTTTGGATAATAACCATTTTATCTTGATCGGT AAACACAAATATTTCTTCCatcaaaatttggtttttctttAACTACACTT TTCGACAAGTTTAGTATTCAGTTATTCTATCTTAttttcaacttcagttg agctaaaATCCCAGAATGTATGTTTGTCcgcaaactttggggcagcgtag AGAGCGGAATAATTGATTTACggagatgaaatttggcacgCACCTTCCTT AGGATAAAACTtagagattttatttttttccccgaGTTATCCCCATTTAA CTGAAATTTTGCGCTCATTTAACGTCATTAAATTGAAATAgttaacttga aatttttttttgaattctaaaaatacaaaaaaataatcacCCTGGGGTTA CAATCGGGTCTCTCTTATCCCGAACACCTATAACTCTGGGTAATGTCGAG AGAGAGCTCATCACTCtgtttaaaaaaagtgtttacaattgggctTCCAC TTTCACACgagttgagcccagtgcttcAGCACGTtatagttttcatttat ttgtataatttgataatttttttcagataattaTTTGTATGATTATTATA GAGGATGTATATAATAAACTCAACATGAAATTCTCGATCAAACacttttt ttgccaattttactaaaatattcAAACATATTCCCTCAAACAATCAAgta ctttaaaggaagaaattttcgcgaggcg Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00001568-protein >TCONS_00001568-protein ID=TCONS_00001568-protein|Name=TCONS_00001568-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=145bp
MTTYFAPTLSRLPFAILQYGQYVFENTTTLSLRKYQMESILSLLQNNKEL DNVELMSEIALFAYLSDNAYGKNALKLVTGAKVIQELYRRFTKQDQIIEA LRADAVRKIALYVEKNPRASTNDQAREIQKHVDDFAAKVALVNGA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000011:101035..109826+ Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00001568 ID=TCONS_00001568|Name=TCONS_00001568|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8792bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000011:101035..109826+ (Clytia hemisphaerica) AACTAAACATAAATGAAGTCTACTTACAGTTCGAGCACCTGTGATTTCTG
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AACGTgctcttgttgtctaggtaaccctagaaagcttcagaacacatctt
ttaaggagaccgaggtataatcaagagaaaattgatgtaatctttcgtgg
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TTATAAGCAGGTTTGGTTTTAAACGAGTTTGATTTTGGATAATAACCATT
TTATCTTGATCGGTAAACACAAATATTTCTTCCatcaaaatttggttttt
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ATCAAACactttttttgccaattttactaaaatattcAAACATATTCCCT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
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TCONS_00001568-exon-sc0000011-1510915933:101781..101858 | TCONS_00001568-exon-sc0000011-1510915933:101781..101858 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001568-exon-sc0000011-1575043694:101781..101858 | TCONS_00001568-exon-sc0000011-1575043694:101781..101858 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00001568-exon-sc0000011-1510915933:107782..107913 | TCONS_00001568-exon-sc0000011-1510915933:107782..107913 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001568-exon-sc0000011-1575043694:107782..107913 | TCONS_00001568-exon-sc0000011-1575043694:107782..107913 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00001568-exon-sc0000011-1510915933:108352..109826 | TCONS_00001568-exon-sc0000011-1510915933:108352..109826 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001568-exon-sc0000011-1575043694:108352..109826 | TCONS_00001568-exon-sc0000011-1575043694:108352..109826 | Clytia hemisphaerica | exon |
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000011 | supercontig | sc0000011:101035..109826 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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