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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00001565 ID=TCONS_00001565|Name=TCONS_00001565|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2615bp
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ttctttagaTTAGAC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000011:48114..64644+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00001565 ID=TCONS_00001565|Name=TCONS_00001565|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16531bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000011:48114..64644+ (Clytia hemisphaerica)
CTGATCAATCGACTCTAGTCGAGGTACATGTAGAACTCAAATaggttttt
caataaaattattattagtattttttgttggaatattttttctttcaata
aaaaaaaagataattgttataaatttacaatttaattATCCTTAAAAAAG
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TGCTTGCAGGGTACCAGTTCGCTCGAGAGCATGATGTCTACCCAGAAATG
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GCAAAGTTACAGCGTTGAAGACCACCCACAcatttgttttagttcttttc
CCATCCCTTTTAatataaaatgcaaaaaaaaccgCAACAGCTGTACAGGG
GAAATGCTCGACATTTGAAGAAGGAGCCTGAGAAAATTtgttcatgaaaa
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GCTTGTGACATAGTTTCTAGaggtaagaggacccccccccttaagtgcta
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TATTTAagagaccccccccccttaggtaagaagaccccccctaatacacc
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gcttgggcccgtaaaacaaaaaattaagttgGCCTCGTCTCATAAGATTT
TCTTTAGTGATTCTTAAATTCTTAAGGAGAGAAGGGAATTTTAAACAGGT
TAAAATTTATAGTCTCGAACGTGTGTAGAAAATGAggaaagaaaaatcat
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ttgcaaatttgagcCTTGTGATTAATtgccccagccccactggaaaattt
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CATAAGGGCGTCTTCTATAAACAAGAACATTTTGGCTGTCTTCTTGACCA
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ATGGATGCGATTTTACTTGGAGCATTGTCAAGAATGATACCAAAACCTAT
GAAAAAAGAGTATTTTTATTAGGTTATAACAGCACAAAGATGTGTTATAC
TcttcttaaaaaataattctttagaTTAGAC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00001565-exon-sc0000011-1491911889:48114..49830 | TCONS_00001565-exon-sc0000011-1491911889:48114..49830 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00001565-exon-sc0000011-1510915933:48114..49830 | TCONS_00001565-exon-sc0000011-1510915933:48114..49830 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00001565-exon-sc0000011-1575043694:48114..49830 | TCONS_00001565-exon-sc0000011-1575043694:48114..49830 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00001565-exon-sc0000011-1491911889:63747..64644 | TCONS_00001565-exon-sc0000011-1491911889:63747..64644 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00001565-exon-sc0000011-1510915933:63747..64644 | TCONS_00001565-exon-sc0000011-1510915933:63747..64644 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00001565-exon-sc0000011-1575043694:63747..64644 | TCONS_00001565-exon-sc0000011-1575043694:63747..64644 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000011 | supercontig | sc0000011:48114..64644 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
