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transcript sequence >TCONS_00001466 ID=TCONS_00001466|Name=TCONS_00001466|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2758bp CGTTTATTGAtgtgaattttttgttttgtcattttattttccttcgcttt tttataaaagcaagAGTTTGACAGGGGATTGGCTTCAGTTGGCTTccatt caaaacattcgaaaatagcGTTTTTATAtcattcttttgaatttttattt tgcaaCTTGTTTTGTCTGGACATATTTATTTGAGTTTGTAGAACTTGTTG GAACTATTTCATTTGGACCATTTACTGTAAGAGATTGTGACTTTCTGGAG TTGTCATCTCCAACTTGAACGAGCTTTTTCCGCCATAGACATAAAGGAAA CATAAAGAAATCAGTATTTGAATTGTGAGCCGGACGAACACGGAAAAGGT ATGGACGATATCATCGATTCGTATAAAAAGAATCGGGAAAGTTTACACGA TACAAACGAAAACATCGTACTTCATAATGGGCACGAGAGCGATCAATATA TGTGGGTCCCGGCTGGACTAGACGCTAATCTAATCGAAGATTACATGGCT TCTCTACCACGTCACAAAGTTCCACATTTCAAGAATCCTGATGGCATCTC TTACCATAACAAACAACTTATCCAACAAATACCTCTACAAGATTCCAATT TCGAAAACATCTCCACTCTCGAAGATGATGAACGACAAATTTTTAACGGA TTTAAAAGAGAACGTGACTCCCAAATGGATTCGGGCAAAGTCATAGTGGC AGATGATAATTATGTCTGTCGAAAATGCGGAAAAGAAATCTACCAAGATG ATTTACTAGTCAGGGCTTCAGCCCTCGGAGAAGAAGCTGTCTGGCATCCA GGCTGTTTCGAATGTTGTAAATGCAACGAGCTGTTAGCAGATCTTATTTA CTGCTACAAGGATGGTGATATTTTTTGCGTCCGCCATTTTGGAGAAGAGT TGAAACCAAGATGCTGTATGTGTGACGAGCTCATTTTCAACGGCGAATAC GTGCGTACGGACGAGAAAGCATACCACGCTCAACATTTCGTGTGTCATAT ctgtgaatgtagtttaacagGAGAACAACATCTAGTTGACGATGGACTGC CCATCTGCATTGCTTGTTATGATGATAAATTTGCATCGGTTTGCCACAAG TGCAACAAATCTATCGGTGTTGACGAAGAGGATGTCATTTACGATGACGA ACATTGGCATGATTACTGTTTAGTTTGTAGTCTTTGCAATTGCCGGTTAA GCGGTACAAGTTTTGTTATTCGTGATGACAATTTCTTATGCTCGGATTGC TACCAAAAGACTGATGACAAAAGATGTAAAACGTGCGGCAAAGGATTTGA ACCGGGTGCCAAAAGgtTGGAACTGAAAGGAGAATTTTGGCATGACACGT GTTTCGTATGTGATATCTGCAAGTCACCTATCACGTCCAAGAAATTCATT CAACACGAAGGATCACAAGTTTGTTGTCCGTGTTTCGATCAGAAATTCGC GAAACGTTGCGCGAAATGTGAAGAGGTTTTACGCGAGGGAGGTGTAGCTT GCGGTGGAGCTTTCTATCACCGTGATTGCTTCCAATGCGAGATTTGTAAC GCGTCCATCGCTAATCAAGCTTTCCAACAGAAAGACGGATTCCGTTACTG CATGCCGTGTTACAAACAACAGTACGCCAAACGTTGCGCCGGTTGTGATA GTTATATAGTGAACGGAGAGTACTATACTGTCGATTCAGATAGCTGGCAT AAAGAGTGTTTCAAATGTGAAGTTTGTCATATTGTTCTCCAACAACAAAC GTTTGTTCAAGAGAATGGTAAAGTTAAATTGGTATGTGAAAGCTGTCTTT AAACAAAGAAGTGCGTTGTGGAATGTACCCTCTTCTTTGATTGGCTGTTG TAGAAGGGCCTACCAAGTGCCGAAAAGAGAAGCTTTTGAATTCAACAAGG GTTTCATGGAGCTGATGGGTCTTGTGCATTCATAAGATCTACCTACAACG CTGTAAAAAAGACTCTGTCGATTAAACCTAAGAACGCATTTATTATGAAA GAAGCCGCATAAAAAGAAAGGAATATTTGGTATAGACAGACAAACTCATG AAGCATTATGGGAATGTTCTATGCGTTTAATCAATCCTGattcaaaaagt gaagaagtCAGGCATTGAAACTTACAAAATGAACCTTGCTTActtataaa gtaaaaaaaaagtaataccTTGAAGAAGTTTGACAAAATTGTAAATGAAT AATGAACTGGAAAATTTCACATTCATATTTCTCAAatggaagaaaaagaa attaactATTTTGTATTAAAGGTTTTAATAGTATCATTAGTTgtcaatta attaattaattatgtTTTTGTTTAACTAAAATGGTGCAGTCAGATGCTCA GGGAATATATTCCTTAGTTTCTGTTAACTTGATTGTAAACTATCAAGGAT GTAATCGTAACTTCGGCATAGGCACCATAAACCTTGGGTTATCTGACTGT ATTTTGCTTTTAACTGCACTTTTTCTGTTAATTTTCTTATTACTTCACTT TAGATTCTTTAGAGTTTAAAAGTTTGAGGGAAGGGGTTTCGGGGTTGTTG CAACCCATATTCAcacattgtttttattattcCACATGATACACtttcaa ttaatttattttGTGTTATCGTTAAATTATTTCGgttgtatttaattttt tttttttttgcttttacattttttttacatcTCTAACAATAAAATTCTCT ATTCTTCTAAATCGGAAATGATAAAAATTCGATTAAAATTATCTGGATTT GTTGCAAC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000010:371541..396712- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00001466 ID=TCONS_00001466|Name=TCONS_00001466|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=25172bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000010:371541..396712- (Clytia hemisphaerica) CGTTTATTGATGTGAATTTTTTGTTTTGTCATTTTATTTTCCTTCGCTTT
TTTATAAAAGCAAGAGTTTGACAGGGGATTGGCTTCAGTTGGCTTCCATT
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GTTTATCAGCAAATAAAGTAGAAAATTTTAGAATATTACATATTAGTTGC
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AATGATATAAACAGTCTAAAGCAGCTTAACTTTGCGAAAATTTACGTTTC
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CCAGGAACTCGAGGAATATAAATTACCTGATGATGGTTTTTTTGATATAG
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GCACTAATTATGGCGGTGGTGTTGGATCAGATTTGGTGATCCATAACAAG
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CCATCATCACTCGAAAGGTAAGTATCATGTTCTCTCTTAATTCAATTATT
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CCATTTATAGGTTTGTTACGTCTGCTAGAAATGTGACCATAGTGCAGTGG
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AGTCTGGAAAGTCTGGAAAGAGTCTAGAATTGGCATACCTGTCTGGAAAA
CATATGGAATTGGAAACATATTAGATTTACATTTTTCCGAACTGATAACT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
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Blast
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Query: 792 WHPGCFECCKCNELLADLIYCYKDGDIFCVRHFGEELKPRCCMCDELIFNGEY-VRTDEKAYHAQHFVCHICECSLTGEQHLVDDGLPICIACYDDKFASVCHKCNKSIGVDEEDVIYDDEHWHDYCLVCSLCNCRLSGTSFVIRDDNFLCSDCYQKTDDKRCKTCGKGFE--PGAKRLELKGEFWHDTCFVCDICKSPITSKKFIQHEGSQVC 1424
WH GCF+C KCN L + + KD + C + E +C C I G + +H FVC C + + + + C+ C++ +FA C+ C K I + + D+ WH C +CS C L F+ RDD C DCY +C C K GAK + + WH CF C C + K F+ C
Sbjct: 62 WHEGCFKCTKCNHSLVEKPFAAKDERLLCTECYSNECSSKCFHCKRTIMPGSRKMEFKGNYWHETCFVCENCRQPIGTKPLISKESGNYCVPCFEKEFAHYCNFCKKVI--TSGGITFCDQLWHKECFLCSGCRKDLCEEQFMSRDDYPFCVDCYNHLYANKCVACSKPISGLTGAKFICFQDSQWHSECFNCGKCSVSLVGKGFLTQNKEIFC 273 HSP 3 Score: 88.5817 bits (218), Expect = 7.820e-19 Identity = 63/276 (22.83%), Postives = 113/276 (40.94%), Query Frame = 3
Query: 807 FECCKCNELLADLIYCYKDGDIFCVRHFGEELKPRCCMCDELI-FNGEYVRTDEKAYHAQHFVCHICECSLTGEQHLVDDGLPICIACYDDKFASVCHKCNKSIGVDEEDVIYDDEHWHDYCLVCSLCNCRLSGTSFVIRDDNFLCSDCYQKTDDKRCKTCGKGFEPGAKRLELKGEFWHDTCFVCDICKSPITSKKFIQHEGSQVCCPCFDQKFAKRCAKCEEVLREGGVACGGAF-------YHRDCFQCEICNASIANQAFQQKDGFRYCMPC 1610
F C C L Y KD +CV + C C + I + + + ++ +H F C C SL + D +C CY ++ +S C C ++I + + +WH+ C VC C + + ++ C C++K C C K G + + WH CF+C C+ + ++F+ + C C++ +A +C C + + G+ G F +H +CF C C+ S+ + F ++ +C C
Sbjct: 6 FYCQYCTASLLGKKYVLKDDSPYCVTCYDRVFSNYCEECKKPIESDSKDLCYKDRHWHEGCFKCTKCNHSLVEKPFAAKDERLLCTECYSNECSSKCFHCKRTIMPGSRKMEFKGNYWHETCFVCENCRQPIGTKPLISKESGNYCVPCFEKEFAHYCNFCKKVITSGG--ITFCDQLWHKECFLCSGCRKDLCEEQFMSRDDYPFCVDCYNHLYANKCVACSKPI--SGLT-GAKFICFQDSQWHSECFNCGKCSVSLVGKGFLTQNKEIFCQKC 276
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