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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00001369 ID=TCONS_00001369|Name=TCONS_00001369|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2462bp tgtgaccttattgggctaaatttaacatttttatgGTCTCTATTAAACAG ATTAACCTATTCTTATAACAAATTGACCTCTTAAAAGGCTCATAAAATCA GATTTTTATTGTATGTTTTTATCCAGACAGTCataatcaataaaatcaat aaaatcgcATATTTTATGGATTACGGTTTTATTTATATTGTATTTTTGTG TCCATAAACTCAGCATTTAACAGGAATGAGTCTACTTTTCTGCAACAGAG ACCatgacaaatgaaatttcactgCTGGTAACCGCGcccttttaaatttt ctttgttctcTTTCAAAATGGCCAAAGTTTATTGGAAAATTATAAAGCAA GAAACATGCGATTTCacaaatttttgccttttttgtgaaattaaaactcg caGAATCGCTTTGAGATTTCTGACTcgtattttaaaattaaatccaccac aaaatttttaaaattgcattttaggcAGAGAAGCCAGTCCAAAGTCTaca tttgtggcaaaaatggctattttttagctgttttcaggcttattcacaaa attaaatttttcaacaacaaagaacaaagaaaaaaagaagtcattgtatt gctatgacgcataatcaaaaaagaaaaaagaaaagacaggGGTAAGTTGG GACGGAAATATTTTAGACCTTACACATCCCCTACAGTATATCAAAtcatc agaggggatgcgtgcagtcTAATGTCAAACAGGAACTATAGTTCCAGTTT CTGTGtattttaatgtcaaataaCACTTTAATTTGTAGATCAGCAAAATG taaaactctaaaaatattaaacataTCTAAAACGatgtcaaaaacaattt ttattggTGTTGCTGCTGTAGTAATTgctggcattttttatttttacaac aCTTATGATCTTGGTGTTAACTCTTTTAGCAGTGAAAAAGATAAACCTGT AGCCACTTTGAAAAGCGTGCAATATTCAATGATGGGTAACAAATCTACAA CAGCTTGTAAAGATTTTTCTGTCTTAACATGGAATGTATGGTTTGGTACT GGCCAGAAATGGGATGCACCGGCAAAAAGATGGGTAGAGCTGTTGCATAT TGTGGTTGGCAAAAAGCCAGATGTTATTGGATTTCAGGAATGCACTGCTG ACTTCTTGAAAATTGTACAAGGACACACagaattttcaaatctttatgTT GCACTCAATGACAAACCTGCTCATTCAAGATACTTTGTAATGATTTATAA AAGGAAAGAATTGAAGACTTTGAAGAAAGATACAATTACTTTCAAAACAC AACATGATAGAAGATGTGAATATTTGGATGTCGAAAAAGAAGGAGCTAAA TTTCGCTTTGGTACTGTTCATATCGAGTCCTATGTCACATCACCAAATAT CAGGGAAATTCAAATGGGAGCCATATTTGATGTTTTACAAGacaaaaaag ctaagaacaaaGAGCTTGCTTTTTTGGTTGGTGATTTCAATTTCCATGAA ACAGACAAAGAAAATAAGTTTATAGAGACCAGTCAATTTAAGGATACATG GCGGGTTGTCCATAAGGAGGCACCTGGATATTCTTTTGAGTCCAAACATA ATTTGATGAATCAACATGCAATGCTTGTTGGAGAAGGCATCTCCACTCCA ACTTTCTTAAGGTTAGATAGAATTTTGTTTTGGCAAGATGATACAAAGGT ATGGAAACCTACCCATATTGAACTTCTTGGACAGAAATCATTTGATGAAA TCATGTTAAAGGATGGCACTAAAGTACCATTGTTCCCTTCAGATCACTAT GgtttattttcaagatttgagCTAATTGCTGATTAATTTGTTGGATAATA TTTTTTCACTATAGATCTTATTGGAGTtgattgatttttctaaaaaagtg atgcattgtgggattctTTCGGGattattacaatagaattccctcaagaa attcctaagagatttctattgtaatattcctaaaacaatcccacaatgca tcgcttttttagaaaaatcaaaaactccgctAAGGTCTGTTGAACTTTTC ACCGTTTTCATGtatatttgaaatcattttttggGGGGTCGTTATTGATT TTATCTTTTGTCTGTATTCTTAAGAGCAGTGGAAAATGGTTCAAACTGTG GTCAATGAATCTACAAAGTTAAAAATTAGCTCAACAAACAGATTTTTACT CTCGACTTCGTTATGTTATCTTCTTTGTTACGTGGTTGCACTAATGAAAT TATAGTAATTAATTtaaatttgtaaattatttgataaaattttatggTTT TGTAGAGTATATACACGATTATTTAGgggattgttttctttttaatttat atTACAATTATAAATCAAGTATTAGCAAAACATCTCAACTTACTCATTGA AAACTCTTCTTTTCGccatttcatttctttttttgaataaatggttttaa tttcacttttgc Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000010:694632..697093+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00001369 ID=TCONS_00001369|Name=TCONS_00001369|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2462bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000010:694632..697093+ (Clytia hemisphaerica) tgtgaccttattgggctaaatttaacatttttatgGTCTCTATTAAACAG
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00001369-exon-sc0000010-1491911889:694632..697093 | TCONS_00001369-exon-sc0000010-1491911889:694632..697093 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001369-exon-sc0000010-1510915933:694632..697093 | TCONS_00001369-exon-sc0000010-1510915933:694632..697093 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001369-exon-sc0000010-1575043694:694632..697093 | TCONS_00001369-exon-sc0000010-1575043694:694632..697093 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000010 | supercontig | sc0000010:694632..697093 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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