TCONS_00001229 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00001229
Unique Name	TCONS_00001229
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2416

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000007:1136849..1147707-

transcript sequence

>TCONS_00001229 ID=TCONS_00001229|Name=TCONS_00001229|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2416bp
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CTGTCCAAGCAGCTGATTCTTTTAtcatttgtatttattttatttagaca
taaaaaataaaaaacaatatgCAGCTTAAACACTTAAAAACTACACTGGC
TCCCCAGGATGGAGCTGCTAAGATCACAGCAATGGCATGGGCTCCTAACA
ATACCAAAATGGCAATAGTATCAACTGATCGtgtagttgttctttttgat
gAACATGGAGAAAAAAGGGACAAATTTGGAACAAAACCTGGTGATGCTAA
AACTGGGAAGAAAGGTTACCAAGTGAAAGGACTAGCATTTTCTCCTGATT
CCACCAAGATAGCTGTTGGACAAACAGATAACATTGTTTTTGTATACAAG
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ACAGAGTGCTGTTACATGTTTGGTTTGGCCCCCAGAAAATCAATATATTA
TTTTTGGTCTTGCTGATGGAAAGgTCAGGATGGCAAGTctaaaaaccaac
aaatcacaAACTGTCTATGGAACTGGTATCCATTGTATATCTTTGTGTGT
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GTGAAACATGGCTGTCCACCGTATGCCTTGTGTTGGGGCTCATCAATCAT
TGCAGCAGGATGTGATAAAAGAATTGTTGCATATGGAAAAGAAGGGCGGG
TATTACAAAACTTCGACTATTCAAAAGATGATGAGGAAAAAGAGTTCACA
GTTGCAATAGCAAGTCCAAGTGGTCAGTCAGTGGTGGTTGGAAGTTATGA
TAGATTACGTGTTTTCAATTGGAGTCCCCGAAGAGGAGCCTGGGAAGAAT
CTAAACCAAAAGAGATCAATAATTTATACACCATCAGCTCACTTTCTTGG
AAAAGAGATGGTTCAAGGCTTTGTGCTGGCACACTCTGTGGTGGAGTTGA
ACTGTTTGATTGCTGTTTGAGAAGATCTATTTTCAAGAATAAATTTGAAA
TGACTTATGTTGGGTTGAGCCAGGTTATTGTCAAAAATTTGGCATCAGGA
GCCAGAGTTGTTTTAAAATCACATTATGGATACGAGATTGATGAAGTGAA
AATAATGGGGAAGGACAGATTTCTTGTTGGACACACTTCAGAAACATTGC
TTGTGGGAGATCTAAACGAAAACAAGCTTAGTGAGCTTCCATGGCATAAT
TCAGGTGGAAATGAGAAGttcttctttgaaaatgaaacaGTTTGTATGGT
ATTCAATGCAGGAGAATTATCTTTGATCGAGTATGGTCAAAATGAAGTGT
TAGCTACAGTCAGAACAGAATTCATGAACCCTCATCTTATAAGCGTACGT
TTGAATGAAAGAAAGCTGAAAGATCAAGAAGACAATAAAAAATTGGGTTA
TTTGATTGACCTGAAAACTATATGTGTCAtgGACTTGATGTCAGGGATGG
TTGTAGCCAATATTTCACATGATgtcaaaattgactggttagaGATGAAT
GAGACTGGAAAGAAGCTCTTATTCCGAGACAAAAAACTGAGGTTATTATT
GGCAGATATTCAAAGTGAAACAAAAACCACTATTTCTACATATTGCTCTT
ATGTGCAATGGGTGCCTTTGAGTGATGTTGTGGTAGCTCAAAGCAGAAGC
GATCTTTGTGTTTGGTACAATATTGAATCACCTGAACGAGTGACTATCGT
TCCCATCAAAGGTGACATCACAGACCTTGAGAAGATCGAGGGTAAAACAA
ACGTGATCGTACAAGAAGGTGTACAATCGATCAATTACACATTAGACGAA
GGGCTAATCGAGTTTGGAACTGCTATGGAAGATGGTGATTATGCTAGGGC
TGTTTCGTTTCTGGAAGGATTGGAGATGTCACCTGAAACAGAAGCTATGT
GGAAGACTCTCAGCAAGGTTGCCATGGAGAATAAAGAGCTTTTCATCGCC
GAAAGGTGTTTTGCTGCACTAGGAGATGTTTCTAAAGCTCGCTATTTACG
TGGAATCAACGACTTGATCGATGAACTGAACCCAAGTTATGGAGATCCTA
TGTATCATCCGACTATTCGCGCCAAACTGGCCATTTTTGAGAAACAATTC
AAACTTGCAGAAAGTATTTACTTGGAACAAGGACAAGTTGATGAAGCGAT
GGAGATGTACCAAGAAGTTCACAAGTGGGATGAATCTTTGGCCATCGCCG
AAGCCAAAAGACATCCAGAACTAGAGAACCTTAGAAGCTATTACTTGCAA
TATTTGATGAAGTCAGGCCAAGAAGAAAAAGCTGGAGAGGTTAAAACCTT
GAATTTAGTTAACAGA

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000007:1136849..1147707-

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00001229 ID=TCONS_00001229|Name=TCONS_00001229|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10859bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007:1136849..1147707- (Clytia hemisphaerica)
GTGATGTTCCCATACATTCTGATTATACTAAATTTACTAATTGTATCACG
CTGTCCAAGCAGCTGATTCTTTTATCATTTGTATTTATTTTATTTAGACA
TAAAAAATAAAAAACAATATGCAGCTTAAACACTTAAAAACTACACTGGC
TCCCCAGGTATGAAAACTTTCTTTTTTACAGTGTTGTAACTTTTCTCTTC
ATATAAAAAACTATTTAGGAATGAAATATTAAAGAACTCAAAATATAACC
ATTGCTGAACTTTATCTTTTTCATTTCACCCAGAGGCAAGACTGTTTAAT
CCTTTCTAGTATGATTTATTGTTATACCTTTAAATTGTAATTTTTATGAA
GGATGGAGCTGCTAAGATCACAGCAATGGCATGGGCTCCTAACAATACCA
AAATGGCAATAGTATCAACTGATCGTGTAGTTGTTCTTTTTGATGAACAT
GGAGAAAAAAGGGACAAATTTGGAACAAAACCTGGTGATGCTAAAGTAAG
CTCTATCTAAGTCAAAAAATCCCTTTGTGATAGAACAAATAAAAGTTATC
ACATGATATCGATTACAATATGGGATGTATTATATTAAGTTAAACTTTTT
CCTCATATTTTTGAGCCCGTATGCCAGGAAACTATCAAAAACTTTGAACA
AGAAAAATATATCCAATATTGTGCGAGTAAGTTTGATAATTGGTTTAGCA
TTAACTTGAAAAATACGACCAAACTTTTCTCTCTCCATTTGTGTCTTTTT
CTATGTTTTTTTTTCTCTTCATGCATTTTGTTCTTCCTCTATTTTGATGA
AATTAACACCAAAACATTTATAAAAAATCCAAAGGTCATTAAAATGTTAA
AAACATTCTTTTGTATAACTCTTCGGATGATTTGCTGCTCTATCAGCCAA
TCAGATTGCTCATATTTTTCATGTTGATGAAAAGATTAAATTATTTTAGT
AGTCACATAAGCATAAGCCTTGGATGAAATAATGAATCTTCTTCATTTAT
TGATTTCAAATCTTTCTTACTATCCACACCAAAGTTACCTTTCTAAATGA
TTGTTCTTTTAGACTGGGAAGAAAGGTTACCAAGTGAAAGGACTAGCATT
TTCTCCTGATTCCACCAAGATAGCTGTTGGACAAACAGATAACATTGTTT
TTGTATACAAGATTGGTGACGAATGGTAAGACTAAGAACATTGATCTTTC
TAAAAACTGAAACATCTACAGTCAGATATTATTTACTTATATTTGAAGAT
CGAACATAATATGAAAATGTTATTTATATATATTAATTAATTTTTGATTT
TATTTTAGGGGCGAAAGAAAAGTTATATGCAACAAGTTTCTCCAACAGGT
AAAGTATCTTTTTAAATTGATTATTATTTCATCACAAGAGAAATTTTTTT
AACATTTGATACCATAGTATTGTATTATCCTATACTGTGTTAAATGAATG
ATTTTACTTTACACATCTGCTATAATAATATAATTTAATGAGGATCAATT
TTTACATTAGAGTGCTGTTACATGTTTGGTTTGGCCCCCAGAAAATCAAT
ATATTATTTTTGGTCTTGCTGATGGAAAGGTTTGTGACTTTTGACATTTT
GACTTTTATGATGGATGATATCTCTTTTGGGATTCAAATTTTATAAATTG
ATAAAGTAAAATAGTTGTCTGTTTGACCATACCTCCTAAATCTATAGGGC
TGACAAAATGAATGGCAAAAAAAGTGTTTTTAAAACCAGCCTAATGTCAC
CCCATAAGTGACCATTTCTTAGCTGAACAGTTAATTTATTTTTTTGAAAA
CAAATAATTAATTTTACTATACTCATGAATTTTAAAAATCAAAAGGTGAT
CCTAAAAGTCTCAGCTTTCAAAGATGGTTACATTTAAGAGATGGTATTGG
TAGGAAAGGGAGATCTACTTTTTAACCTGGAAATATATATTGACGATATA
AAGCATACAAACACCTAAAATTTTAGATCACACTTCAAATGATTGAGTTT
GAGAATGATTATTTTCTTCATCTTTCTGTAATGTTTTAAAATTTCCATTT
TTTTTTAGGTCAGGATGGCAAGTCTAAAAACCAACAAATCACAAACTGTC
TATGGAACTGGTATCCATTGTATATCTTTGTGTGTCAGGTTGGCATTCTG
TTTTAATTACATAAATGATTTTCAAACTATAAAATGAAAGCAATATTACT
ATTATGTTAAGTCTTTGAAGCTTGTAAATGAAGACATAATTGAGTACAGC
TTTCAAGAAACTACTTTAACAATTCATATTTAAGCATTTTCACAACAGAT
AATAAACTAAAAATTTTTTTGAAAAAGTTTCATTTAATATAAACATTTTC
TTGACTGGACAAATCCAATAACTGTTTCAGGTTAAATTATCTTTGCCATC
TGTTCTCTTTTTAGTCCTGATGGGAAAGGTGTTTTGTCAGGGCATGCAGA
TGGAGCCATTGTCAGATATATGTTTGAAGATACTGGGACAGGTTTGACCC
AGGTATTTTACATATTAAATGTTAAAACATTTAAAGTAGACAAACTAAAC
TAATATTAGGTATATTTCTTTTTGAGAAGTCCGACTGTTACTAGAAGAGT
CAATTGCACTTCAGACAAACAATCATTCCAAAGAATAATTTGCAAATTTC
TTTTTTTTTGAAGTGCATTACACAAAGAATAATACAAAGAATTATATGCT
ATCCTAATATTCAAATCTCAAGATTGGTTCGATTTTTTCCATAGGGGCAA
GTTGTGAAACATGGCTGTCCACCGTATGCCTTGTGTTGGGGCNTACAAGA
GAAAATTTTTTAACATTTGATACCACAGTATTGTATTATCCTATACTGTG
TTAAATGAATGATTTTACTTTACACATCTGCTATAATAATATAATTTAAT
GAGAATCAATTTTTACATTAGAGTGCTGTTACATGTTTGGTTTGGCCCCC
AGAAAATCAATATATTATTTTTGGTCTTGCTGATGGAAAGGTTTGTGACT
TATGACATTTTGACTTTTATTATATCATGATATAATGATGGATGATATCT
CTTTTAGGATTCAAATTTTATAAATTGATGAAGTAAAATAGTTGTCTGTT
TGACCATACCTCCTAAATCTATAGGGCTGACAAAATGAATTGCAAAAAAA
GTGTTTTTAAAACCAGCCTAATGTCACCCCATAAGTGGCCATTTCTTAGC
TGAACAGTTAATTTATTTTTTTGAAAACATATAATTAATTTTACTATACT
CGTGAATTTTAAATATCAAAAGGTGGTCCTAAAAGTCTCAGCTTTCAAGA
TGGTTACATTTAAGAGATGGTATTGTTAGGAAAGGGAGATCTACTTTTTA
ACCTGGAAATATATATTGACGATATAAAGCATACAAACACCTAAAATTTT
AGATCACACTTCAAATGATTGAGTTTGAGAATGATTATTTTCTTCATCTT
TCTGTAATGTTTTAAAATTTCCATTTTTTTTTAGGTCAGGATGGCAAGTC
TAAAAACCAACAAATCACAAACTGTCTATGGAACTGGTATCCATTGTATA
TCTTTGTGTGTCAGGTTGGCATTCTGTTTTAATTACATAAATGATTTTCA
AACTATAAAATGAAAGCAATATTACTATTATGTTAAGTCTTTGAAGCTTG
TAAATGAAGACATAATTGAGTACAGCTTTCAAGAAACTACTTTAACAATT
CATATTTAAGCATTTTCACAACAGATAATAAACTAAAAATTTTTTTGAAA
AAGTTTCATTTAATATAAACATTTTCTTGACTGGACAAATCCAATAACTG
TTTCAGGTTAAATTATCTTTGCCATCTGTTCTCTTTTTAGTCCTGATGGG
AAAGGTGTTTTGTCAGGGCATGCAGATGGAGCCATTGTCAGATATATGTT
TGAAGATACTGGGACAGGTTTGACCCAGGTATTTTACATATTAAATGTTA
AAACATTTAAAGTAGACAAACTAAACTAATATTAGGTATATTTCTTTTTG
AGAAGTCCGACTGTTACTAGAAGAGTCAATTGCACTTCAGACAAACAATC
ATTCCAAAGAATAATTTGCAAATTTCTTTTTTTTTGAAGTGCATTACACA
AAGAATAATACAAAGAATTATATGCTATCCTAATATTCAAATCTCAAGAT
TGGTTCGATTTTTTCCATAGGGGCAAGTTGTGAAACATGGCTGTCCACCG
TATGCCTTGTGTTGGGGCTCATCAATCATTGCAGCAGGATGTGATAAAAG
AATTGTTGCATATGGAAAAGAAGGTATTGTTTTTTGAGCTTATGTTTCAC
GAGAAAATCATTTTTATTTAACAAATGATTAATCCTAATATTTCATTTCC
CTAAACTCTCTTTAGGGCGGGTATTACAAAACTTCGACTATTCAAAAGAT
GATGAGGAAAAAGAGTTCACAGTTGCAATAGCAAGTCCAAGTGGTCAGTC
AGTGGTGGTTGGAAGTTATGATAGATTACGTGTTTTCAATTGGAGTCCCC
GAAGAGGAGCCTGGGAAGAATCTAAACCAAAAGAGATCAATAATTTATAC
ACCATCAGCTCACTTTCTTGGAAAAGAGATGGTTCAAGGCTTTGTGCTGT
AAGTTAGATAATTCCCTCTTATTTTTTGTCCTGCTGGAATATAGGTTTTA
ATACATAAAGACAGTTTGACTTACATATGGATGAAAAGTTTCAATTAGTA
TTCTACATGCAAATATAAAGAATTTTTTTAAATGGTATTTACAAATATAT
CATAATACAGTAGCTAAATCTTACTGAATAATATTATTTCTGACTTCAGG
GCACACTCTGTGGTGGAGTTGAACTGTTTGATTGCTGTTTGAGAAGATCT
ATTTTCAAGAATAAATTTGAAATGACTTATGTTGGGTTGAGCCAGGTAAA
ATGAAGGATTTTTTGTTATACTTTTGAAGATATTAACCCTTCAACCCTTT
CAGACCCGGTACACACGATTTAAATCTGCCAAAATACCAAGTCCTGACCA
CTTGATTTAAAAGGGCATACACCGGATGCTGTTAGAAAGAGTACAAAAAT
ATCTTTTCAATGGTACAAAAACCATTGCCTAAGTCTCAAGTTAAAACCTT
TTATGCCAATTTGAAAATTTGGAAAAAATGTTGCGCGCTGGAAAGGTTAA
GAAAAAATTAAATAAGAATCTGTATTTTGTAAAAAATATCTAAAAAATTG
TCCAGAGGAAAACCAATTTTCTCTGTCTGTGCGAGAGTGTGGAACATATA
ACATAGTTGAAAATAACACATCATCTTTCTTATGAAAATTTCTGCCAACT
GGCCTTTTTCAACATAAAAATGAATTTAATGTTCTTCATTCGCCGCTGTG
AGGAGACATTCTTAATGTTAGCAAAGGAAAGCTTACGTTCTGCTCTCTAA
AGAGCAAATCATCTCGTTTCGGTTCTCTAGCCTTCAGAATTTCTCGACTG
ACTAGTTGGTCACTATCCTTGTTTTTTTTTAGCCACAGTGCTAGCTGGTT
GCAATTGAGGTCAAAAAAAGAAATGTTCTGAACAGATGCGATTCAAGCGC
AGGCCCTGGCCATAAGGAATGGCCTTTTTTGAATGAAATGCACAATTATA
AAAAAATATTTAGTTATTTTCACTAACATTACAAATACAAAGAAACTTTG
TTATTATTAATGCTAACTGTTGATTTCTAGGTTATTGTCAAAAATTTGGC
ATCAGGAGCCAGAGTTGTTTTAAAATCACATTATGGATACGAGGTTTGTA
TATAAATAATTTTTATAAGTAGAAAATCTATCATCAATATTTCTGCCTAA
TCAACTTTTTCTCAAGAATCTGTAATATCATATTTTAAAGTTATATTTCT
TGGCCCATTATTATCCCTTGCTGATGTTTTTAGATTGATGAAGTGAAAAT
AATGGGGAAGGACNTTGTCCACCGTATGCCTTGTGTTGGGGCTCATCAAT
CATTGCAGCAGGATGTGATAAAAGAATTGTTGCATATGGAAAAGAAGGTT
TTGTTTTTTGAGCTTATGTTTCACGAGAAAATCATTTTTATTTAACAAAT
GATTAATCCTAATATTTCATTTCCCTAAACTCTCTTTAGGGCGGGTATTA
CAAAACTTCGACTATTCAAAAGATGATGAGGAAAAAGAGTTCACAGTTGC
AATAGCAAGTCCAAGTGGTCAGTCAGTGGTGGTTGGAAGTTATGATAGAT
TACGTGTTTTCAATTGGAGTCCCCGAAGAGGAGCCTGGGAAGAATCTAAA
CCAAAAGAGATCAATAATTTATACACCATCAGCTCACTTTCTTGGAAAAG
AGATGGTTCAAGGCTTTGTGCTGTAAGTTAGATAATTCCCTCTTATTTTT
TGTCCTGCTGGAATATAGGTTTTAATACATAAAGACAGTTTGACTTACAT
ATGGATGAAAAGTTTCAATTACTATTCTACATGCAAATATAAAGAATTTT
TTTAAATGGTATTTACAAATATATCATAATACAGTAGCTACATCTTACTG
AATAATATTATTTCTGACTTCAGGGCACACTCTGTGGTGGAGTTGAACTG
TTTGATTGCTGTTTGAGAAGATCTATTTTCAAGAATAAATTTGAAATGAC
TTATGTTGGGTTGAGCCAGGTAAAATGAAGGATTTTTTGTTATACTTTTG
AAGATATTAACCCTTCAACCCTTTCAGACCCGGTACACACGATTTAAATC
TGCCAAAATACCAAGTCCTGACCACTTGATTTAAAAGGGCATACACCGGA
TGCTGTTAGAAAGAGTACAAAAATATCTTTTCAATGGTACAAAAACCATT
GCCTAACTCTCAAGTTAAAACCTTTTATGCCAATTTGAAAATTTGGAAAA
AATGTTGCGCGCTGGAAAGGTTAAGAAAAAATTAAATAAGAATCTGTATT
TTGTAAAAAATATCTAAAAAATTGTCCAGAGGAAAACCAATTTTCTCTGT
CTGTGCGAGAGTGTGGAACATATAACATAGTTGAAAATAACACATCATCT
TTCTTATGAAAATTTCTGCCAACTGGCCTTTTTCAACATAAAAATGAATT
TAATGTTCTTCATTCGCCGCTGTGAGGAGACATTCTTAATGTTAGCAAAG
GAAAGCTTACGTTCTGCTCTCTAAAGAGCAAATCATCTCGTTTCGGTTCT
CTAGCCTTCAGAATTTCTCGACTGACTAGTTGGTCACTATCCTTGTTTTT
TTTTAGCCACAGTGCTAGCTGGTTGCAATTGAGGTCAAAAAAAGAAATGT
TCTGAACAGATGCGATTCAAGCGCAGGCCCTGGCCATAAGGAATGGCCTT
TTTTGAATGAAATGCACAATTATAAAAAAATATTTAGTTATTTTCACTAA
CATTACAAATACAAAGAAACTTTGTTATTATTAATGCTAACTGTTGATTT
CTAGGTTATTGTCAAAAATTTGGCATCAGGAGCCAGAGTTGTTTTAAAAT
CACATTATGGATACGAGGTTTGTATATAAATAATTTTTATAAGTAGAAAA
TCTATCATCAATATTTCTGCCTAATCAACTTTTTCTCAAGAATCTGTAAT
ATCATATTTTAAAGTTATATTTCTTGGCCCATTATTATCCCTTGCTGATG
TTTTTAGATTGATGAAGTGAAAATAATGGGGAAGGACAGATTTCTTGTTG
GACACACTTCAGAAACATTGCTTGTGGGAGATCTAAACGAAAACAAGCTT
AGTGAGGTAAGTTCCTTCCTCAAGAACTATTTTTGAAATTAATATCATAA
GATCTTTCAAGTGACATTATGGAACATAAAAAATAACAGAACTTGATTTT
GATAATTATACTGTTTTGTTTTTATGATTCAGCTTCCATGGCATAATTCA
GGTGGAAATGAGAAGTTCTTCTTTGAAAATGAAACAGTAAGTTTGTTTAA
AATTCAATACATTTTTCTTTTGGAAAAAGTAAAACAAAGAAAGTAGATTA
CTTCAAAACAATTTTAAATCTTTCAAAGGTTCCTTAGCTTGCCACTGCTA
AAATCATACCTTGTTAGCATTACGAGTTTCAGGACTTCTATGTGTTACTT
TGTTATTGTTTTAATCAATTAGGTTTGTATGGTATTCAATGCAGGAGAAT
TATCTTTGATCGAGTATGGTCAAAATGAAGTGTTAGCTACAGTCAGAACA
GAATTCATGAACCCTCATCTTATAAGGTAATGATTTTTCAAATGCAGATA
TGAAACGATTGTGAAATGTATTCTAGGGTTATGATATTTAGAATTTGATT
TTTGAATAGTCTATTCCATTAAACAAATTTCTTTAGATATTTCAGAATAA
TTTACCCTGCTGCCTCACATTCCTGCCTTGGTATTTTTACCGGAAAGAAT
TGAAACTCCATTCTTTCTTACCAGCCATCCCTCTGTAAGAACTAGACTGG
ACGCTAGTCAGTATGATTCTCAATAGCAGTATTTCTTGACTTAACTTTTT
CAGCGTACGTTTGAATGAAAGAAAGCTGAAAGATCAAGAAGACAATAAAA
AATTGGGTTATTTGATTGACCTGAAAACTATATGTGTCAGTAAGTAAACG
TTTTGTAAAAAATCGACTATTTTGGCATTATTAGCAGCATTTCTCATTTC
TATCGGGTGAATACAGATTTGAAATATTTGGGCTATTATGCTAAGCTCAG
TTGTAAATTAGCCTTAGGATTTTAGTTTTTTTTTACTTTAAATTTCTTTA
ATTTTCAGTGGACTTGATGTCAGGGATGGTTGTAGCCAATATTTCACATG
ATGTCAAAATTGACTGGTTAGAGGTACTCCACTCTCATCTCTTATTGTCT
CTAAGTTATGAATTTCCAAGATAATATATTTATATTTAGATGCAAATCTC
AAGAGTTTGAGTGGTTGACAAATCTTGAATTTTCTCTGTTTATAGATGAA
TGAGACTGGAAAGAAGCTCTTATTCCGAGACAAAAAACTGAGGGTAAGTA
ATTTAGATAATTTCCGATACTCTTCCTCAAATTAGGACAGTTGTTTTAAA
GTGTGAAGTGATTTCTGGTTTCAACTTCTAATTATAGTACACTTACCTCT
CAACTTTTAGTTATTATTGGCAGATATTCAAAGTGAAACAAAAACCACTA
TTTCTACATATTGCTCTTATGTGCAATGGGTGCCTTTGAGTGATGTTGTG
GTAGCTCAAAGCAGAAGCGATCTTTGTGTTTGGTACAATATTGAATCACC
TGAACGAGTGACTATCGTTCCCATCAAAGTAAGAGACCATTTTGTTCATT
TCCTCTCAAAGGCTTAACGGCGATCAAAAATAAACTATTTAAAAACTATT
TTTTATGTCTTTTGATTCTTTCTAATGACTTGTAATAATGACTTGTAATT
TGAGGGGTCGTTTGTTAAATTTGGTCAACTAGGTAAAAAGCTATGGCCTA
AATGCTAAAATATTACTTTTCAAAAAAGTAAAAAAAATGGCGAAAAATGA
GGGTATTAAATCATCATAAAGATATCATAAAGAAATCTTTCTTTTATCAA
TTTATTAACGATCGAAGTCTCTTCGTCCTCTTCGTGGCCAGTTTCCAAGA
AAGGTGGTCAACAATCGAGGAGATGTTGAGTGACCCCTAAGTTCGCCTGA
GCTTACAGTGTGTGATTTCTTTTTGTGGGGTTACACGAAACAAGAAATCT
GGGAGCAACTCACAAATTTGCAATTCCAGACCCTTGATCAATGAAAGCTT
CAATCAAATATGAAGACTTGGCAAATCGATTTTATATTATTTTCTCATGA
TAAAAAATTACATTAATTGACTTTGTGACCCTTGTTTTACACGGTTTAGC
CTACGATCGAGGCACCCTTATTCTGGATTTGTTATTCGAATTTCAAATCA
AAGTTGAAAAGACACTGGTTTGGAATGTTAAGTTAAACTTTCCTTGCATG
TTTAGGGTGACATCACAGACCTTGAGAAGATCGAGGGTAAAACAAACGTG
ATCGTACAAGAAGGTGTACAATCGATCAATTACACATTAGACGAAGGGCT
AATCGAGTTTGGAACTGCTATGGAAGATGGTGATTATGCTAGGTTTGTCT
TATTGGTTATTTTAATTAGATTTTAAGACATTGATCTTCTAATGCTGCAG
CAAATTTTTTAACATAAACAAACTTATTAAGATAAGGGTTATTTTTTATT
GAGATTTTCTTCTCAAAATGCTTCAACTGAGAGATTTTACCTGTCGTCTT
TTCTTCGTTGTATTACTTTTTTTTGCTCAGAAATCTGATATAAAATTGTA
TTTTGTTCAGGGCTGTTTCGTTTCTGGAAGGATTGGAGATGTCACCTGAA
ACAGAAGCTATGTGGAAGACTCTCAGCAAGGTTGCCATGGAGAATAAAGA
GCTTTTCATCGCCGAAAGGTAAGACATAAATATGATCCAACAATCATGAT
TCAATGCATAGTCCGAAACATTTTTTCTACAAAGGCTCTTTTAAGAGGAT
TCTGTAATGGGGTTCTTAAACTTTTCAAAATATATTTTTGCTTTGTAGGT
GTTTTGCTGCACTAGGAGATGTTTCTAAAGCTCGCTATTTACGTGGAATC
AACGACTTGATCGATGAACTGAACCCAAGTTATGGAGATCCTATGTATCA
TCCGACTATTCGCGCCAAACTGGCCATTTTTGAGAAACAATTCAAACTTG
CAGAAAGTATTTACTTGGAACAAGGACAAGTTGATGAAGCGATGGAGATG
TACCAAGAAGTTCACAAGTGGGATGAATCTTTGGCCATCGCCGAAGCCAA
AAGACATCCAGAACTAGAGAACCTTAGAAGCTATTACTTGCAATATTTGA
TGAAGTCAGGCCAAGAAGAAAAAGCTGGAGAGGTTAAAACCTTGAATTTA
GTTAACAGA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_000661	XLOC_000661	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00001229 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: IF172 (Intraflagellar transport protein 172 homolog OS=Homo sapiens GN=IFT172 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 1090.1 bits (2818), Expect = 0.000e+0
Identity = 510/761 (67.02%), Postives = 636/761 (83.57%), Query Frame = 2

Query:  119 MQLKHLKTTLAPQDGAAKITAMAWAPNNTKMAIVSTDRVVVLFDEHGEKRDKFGTKPGDAKTGKKGYQVKGLAFSPDSTKIAVGQTDNIVFVYKIGDEWGERKVICNKFLQQSAVTCLVWPPENQYIIFGLADGKVRMASLKTNKSQTVYGTGIHCISLCVSPDGKGVLSGHADGAIVRYMFEDTGTGLTQGQVVKHGCPPYALCWGS-SIIAAGCDKRIVAYGKEGRVLQNFDYSKDDEEKEFTVAIASPSGQSVVVGSYDRLRVFNWSPRRGAWEESKPKEINNLYTISSLSWKRDGSRLCAGTLCGGVELFDCCLRRSIFKNKFEMTYVGLSQVIVKNLASGARVVLKSHYGYEIDEVKIMGKDRFLVGHTSETLLVGDLNENKLSELPWHNSGGNEKFFFENETVCMVFNAGELSLIEYGQNEVLATVRTEFMNPHLISVRLNERKLKDQEDNKKLGYLIDLKTICVMDLMSGMVVANISHDVKIDWLEMNETGXXXXXXXXXXXXXXADIQSETKTTISTYCSYVQWVPLSDVVVAQSRSDLCVWYNIESPERVTIVPIKGDITDLEKIEGKTNVIVQEGVQSINYTLDEGLIEFGTAMEDGDYARAVSFLEGLEMSPETEAMWKTLSKVAMENKELFIAERCFAALGDVSKARYLRGINDLIDELNPSY-GDPMYHPTIRAKLAIFEKQFKLAESIYLEQGQVDEAMEMYQEVHKWDESLAIAEAKRHPELENLRSYYLQYLMKSGQEEKAGEVK 2395
            M LKHL+T L+PQDGAAK+T MAW+ NN K A+ + DRVV+L+DEHGE+RDKF TKP D K G+K Y VKG+AFSPDSTKIA+GQTDNI++VYKIG++WG++KVICNKF+Q SAVTCL WP E   I+FGLA+GKVR+A+ KTNKS T+YGT  + +SL  +  GKG+LSGHADG IVRY F+D G+G +QG++V H CPPYAL W + SI+AAGCD++IVAYGKEG +LQ FDYS+D +E+EFT A++SP GQSVV+GSYDRLRVFNW PRR  WEE+KPKEI NLYTI++L+WKRDGSRLC GTLCGGVE FDCCLRRSI+KNKFE+TYVG SQVIVKNL+SG RVVLKSHYGYE++EVKI+GK+R+LV HTSETLL+GDLN N+LSE+ W  SGGNEK+FFENE VCM+FNAGEL+L+EYG N+ L +VRTEFMNPHLISVR+NER  +  EDNKKL YLID+KTI ++DL+ G  +  +SH+ ++DWLE+NETG KLLFRD+KLRL L DI+S +KT I  +CSY+QWVP SDV+VAQ+R+ LCVWYNIE+PERVT+  I+GD+  LE+  GKT V+V EGV ++ YTLDEGLIEFGTA++DG+Y RA +FLE LEM+PETEAMWKTLSK+A+E ++L IAERCF+ALG V+KAR+L   N++ D+++  Y G+      +RA+LA+ EK +KLAE I+LEQ  V+EAM MYQE+H+WDE +A+AEAK HP LE LR  Y Q+LM + QEE+AGE++
Sbjct:    1 MHLKHLRTLLSPQDGAAKVTCMAWSQNNAKFAVCTVDRVVLLYDEHGERRDKFSTKPADMKYGRKSYMVKGMAFSPDSTKIAIGQTDNIIYVYKIGEDWGDKKVICNKFIQTSAVTCLQWPAE-YIIVFGLAEGKVRLANTKTNKSSTIYGTESYVVSLTTNCSGKGILSGHADGTIVRYFFDDEGSGESQGKLVNHPCPPYALAWATNSIVAAGCDRKIVAYGKEGHMLQTFDYSRDPQEREFTTAVSSPGGQSVVLGSYDRLRVFNWIPRRSIWEEAKPKEITNLYTITALAWKRDGSRLCVGTLCGGVEQFDCCLRRSIYKNKFELTYVGPSQVIVKNLSSGTRVVLKSHYGYEVEEVKILGKERYLVAHTSETLLLGDLNTNRLSEIAWQGSGGNEKYFFENENVCMIFNAGELTLVEYGNNDTLGSVRTEFMNPHLISVRINERCQRGTEDNKKLAYLIDIKTIAIVDLIGGYNIGTVSHESRVDWLELNETGHKLLFRDRKLRLHLYDIESCSKTMILNFCSYMQWVPGSDVLVAQNRNSLCVWYNIEAPERVTMFTIRGDVIGLERGGGKTEVMVMEGVTTVAYTLDEGLIEFGTAIDDGNYIRATAFLETLEMTPETEAMWKTLSKLALEARQLHIAERCFSALGQVAKARFLHETNEIADQVSREYGGEGTDFYQVRARLAMLEKNYKLAEMIFLEQNAVEEAMGMYQELHRWDECIAVAEAKGHPALEKLRRSYYQWLMDTQQEERAGELQ 760

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00001229 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00001229 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
IF172	0.000e+0	67.02	Intraflagellar transport protein 172 homolog OS=Ho...	[more]

You are here

TCONS_00001229 (transcript) - C. hemisphaerica