TCONS_00000837 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00000837
Unique Name	TCONS_00000837
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1787

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at sc0000005:846935..857067-
coding sequence from alignment at sc0000005:846935..857067-

transcript sequence

>TCONS_00000837 ID=TCONS_00000837|Name=TCONS_00000837|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1787bp
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TTGCAGTCACATTTGTGATATTTGTACTGATTTTGCACAAAACTTCTGGG
AATGACATTGCTAGAAACTTTTTCATAGGTCCTTATGAGAACAACACCAC
ATGCACTTTAGATTGGTTCAACAAGACTTTGATTGGAAAGgATCTTGGAA
TGACGACTTCATTTTTCGATGATTACAAAAAACTGTGTTATGAGAAACAA
CATGGTGCGAAACAAAAAGCTTGTCGAACAGGGGATGCTTATATTACGTA
CGCGGAAGCTCAAAAGACATCACAGTTTTATTGGATTTTCGATGTATTCA
ATCTAAACCATACAAAAGACGACTGTTGGGGTATGTATGCAGATATTCGT
GCCGGAGACGGTCAATTGGTGGATATGAGATATGTGAACTTCTTTAACCC
TgACACAGATAACCTTGCAATGTATACTAGAGCGAGAAAGAATGTCCATT
ACACGTTCAGTTTGTACCCAGTACCGTTCGGTGACAAACTTCAGATTAAA
GTTCGAACACCAGgaGATTGCGAAAATGCAGCTCTTGAGACGATTTATGA
CATGTTGATGATAATTCAAACAAGTCCATCAAATGAATGTAGTGGCAGTG
ATAGTATAGACTTCACAACTCGGAATGAACTAGCAACTCTCATTTGCCGA
ATCTCACCTGATTCCGCTAAACAACGTAGAGATTTGATCCTAAATAAAGT
ACGGACCCGATTCAACAAAGTGAAAGGACGATGTGAATTTTATCTTAAAA
CTGACGATGGCAATTCTAAGCCACCAGAAACTCCTCAAGTAAATTATTTA
ACGCCGGCTAATATTTCACTGGCAGCGATTAGTATGGTCCTGGTTGTTGC
CCTAATCATTATTGTGATAATGTATTTTCGATGCAAAAGACAAGAAATTG
CCAGAGTAACATCAGTTGAGAGCACTAATGTACATTTAGATAACGTGGAA
AGAGTGACTTATAAAGTTGCTGCCGAAGGTGACTATTTGATGGTTAGATA
ACAAAGCTATAAAAGATTACCGGTAATAAATCATGATAATATAATGATCG
TCTTTAAACCTAagatttcatttgattttgcggaatgtttcaattctttt
taCCGAGATCTTCGGCCAAAATTAATCGTTGCAATgcaataaataacttt
tgaatgTCAATTTTCAACTTGTGGTGGTTGTAGTCCGGGGAAAAGAATTA
TCATCCCAAACAAGGGTACCATTGAATTGGAGCTGTTAATAAATTTCATA
TTCATGAATAATCGGATAAAGTCGGACAATGTGTTTATAGTATTAAATTG
TGTTTTTGGCTGATATTGACGAAGACGTTAAGGTTGGATAATTTGTATAT
TATAAGATACTTAGATATGAAAATGCAGAGCATTCGAAACTCATATCCAC
GGAGAAATTAATGAACTGCGGGTTATAGGCACACAATACCTAATCAATGC
TGACTTATTCTCCAAACAAAAGAAGTCAAAAACTTTATTGGAAAAGTTTT
AACCTATCATCAAAGTCTGTTGGCACTACTCTTTCCTATCGTGAAAATTA
CCTCTTTGTTGAACCCCCTTTGCATCCTCCaatgttaaaaatgtttattt
cattattttttataaaatttatcGTATTAAAAAGATTATTGTATATATTC
AGGTAATTTTATATTATGTGTAAAAGACAAAACCCTGGTTGATTTTTATA
TACAGTGAATTGTATTCTCTGTTATCATTGTATTAGC

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00000837-protein

>TCONS_00000837-protein ID=TCONS_00000837-protein|Name=TCONS_00000837-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=339bp
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IGKDLGMTTSFFDDYKKLCYEKQHGAKQKACRTGDAYITYAEAQKTSQFY
WIFDVFNLNHTKDDCWGMYADIRAGDGQLVDMRYVNFFNPDTDNLAMYTR
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CKRQEIARVTSVESTNVHLDNVERVTYKVAAEGDYLMVR

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000005:846935..857067-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00000837 ID=TCONS_00000837|Name=TCONS_00000837|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10133bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005:846935..857067- (Clytia hemisphaerica)
ATAGTGTAAAGAAAAAAACAAACAATTCAAGATGACAACGACAAACGTTT
TTGCAGTCACATTTGTGATATTTGTACTGGTGAGGAAATTCTCAAAATAA
TGGATTCATTCAAAATCTCGCTATTTTAATAAATTTTAACATCATACTTT
CTAAAATTCGGAAAAGTATTGTTTGTGATTGATGTTGCAGAGTGATCAAT
GAAAACCAGAGCCAAGTAAAATATTAAAAGATATCTTTCATCACAAAAAT
TAAAAAAGTACACTACTCCGAGGTTCGTGCTACTGCACTTTTCAGTTCAA
ATGTACAAAATAAAATGAACCTATTTAGAAATTCTCTTCAATTTCTAAAA
TTCTAAAACTTTAAGATCTTTAGAAGTCTTTGAGACATTTGAATTTAATT
GGCAGGGAGTTTTGTTCGGGGTTCGTTTCCATTTTTTCAACGTAAGGGCC
TCTTTAACGGAGGCAAGAGAAGTTTTAAATTGAAATTTTTTAAAGAGCGT
TTCATTTGATATGATGATTGGGCCGAATTTATTGAAAACAATTGATGCTT
GAAGTCTACAAAATTGAAACAGAAATCTGTTAATGTCAGAGCTTATCAAA
TCTTACCAAATTTCTTCTCTTTTAGATTTTGCACAAAACTTCTGGGAATG
ACATTGCTAGAAACTTTTTCATAGGTTTGTCTTTTATATTTTTCTTAAAT
AAATAATTATTTTGTCTTTTCGTCTTTTGTCTAAAAAGTCCCCTGAAGTG
AAACTAGCAGTGACGCCCTTCTCATAGCCCCTCTGGAAACCCTTCCCACT
GGTAAAATTGGCCAAACATCGTCCCCAGTGGAAAATTATACTATTACAAT
TTTTGTCTCCGCTGAAAATAATTAGATAAGCAAACTCTCTTTGCCAAATA
TTGTGCTATTTTTTCCATCACCACCGAATTTTCTGGCTAGAAAACAAAAG
AATTTAAATTCCCAGTCATTAAAAGACACGAGAATATCCCCATCGAGTTT
TTGCCCGTTGTTTTATCGCCAATGGCTGATAAAACCCCACTGGGTCTATG
AGAAGGGGGTGTACAGTGATGTTCCCGATAGAGGTTGGAAAATTGTTTAC
GAACAATGAGCCAGCTCCATTGGAAACAATTAATAATTAGAAATCCTCAC
TTATTATTATTATTATTATTTTTGCGCAAATAGATTGCGAAACACTTCTA
GATAATTGAAGATTGCTGACCTCAAGGCATCAATATGTTAATAAATTATT
GTTGTTTTGAATAAAATTCCTAAAGTCAAGTGGTGTTCCTTAGGACCCTC
CTCAGTCCAACGTCAAATACAGTGAAAAAAGTTTAATAAATTCTGCTGTG
TTATTATAATTATTGTAAATAAATACATGGACTGATCTTGGCCTTACTTT
TATTGTTAACATCTAAATAAGTTTCATTTTAAGGTTTCGTTTCTTGACAT
AAATATTCCTATTTTTAGACCCGATTTTGCAACTAAATCTTTAAAACTGT
TTCCGTGAAGTATAAGGTTCAGTATAAGATCTGAAAATTTAGTTCCGGGT
AAAATGGGTGCCCGGTATGTGTGACCCATACGGCCATAGGGACCATTTTC
ACACCCTCGAATATCCCTCAAACGGGAAAAACTGTTTAAAAGCAATTGAG
TTTCTGATAGTGTCCCAAAATTATCAAAATCGAAAATCGACTTCCTCAAA
GGGTCATAGATTTTTAAAATTTGGTCTAAAATTTAAAAATCTTAGCTGAA
ATTATGGGGAATAATAGTGTGTCTCTAACTGTCGCAAAAACGTCAAAAAA
AAGACTAAATTTTTGAAAGTCAGTCTCTCTAACGGTCGATTTCCGAGCTT
TGGCTTGGACATACCCCTTATTTATCTCGCAAACCTAGCACCCCCTCCCC
CCGGGATTAAGTCACTGTCAAAAAGATTATTTATTAACATTTTGTCGATT
TCAGGTCCTTATGAGAACAACACCACATGCACTTTAGATTGGTTCAACAA
GACTTTGATTGGAAAGGGTAATATTTTATTTATTGCTCTTGATATTTTGA
CTTGATTTCACTGACAATATTATTATTTAAGCCAAGAAATAATTCGCTAT
TATGACTTGTTCCTGCGTAAAAAAAAATATAAATAATTTTTACGGATTAT
CCCTTAAAATGGGACCTAACTTTTTGCAAGTTCAGACGATAATTCAAACC
TTTCAGGCGTTGAAATTTGTTCTGACTTTTAATGCCATTAATTGTTAAGT
AGCTAGATTTCTGGAGCCAAAAACCCTCTGAGAGAGTGCCAGGAGCACAC
TTTCATTTGTTGAATTTTTAAATAATGTAATTTCACACAGATCTTGGAAT
GACGACTTCATTTTTCGATGATTACAAAAAACTGTGTTATGAGAAACAAC
ATGGTGCGAAACAAAAAGCTTGTCGAACAGGGGATGCTTATATTACGTAC
GCGGAAGCTCAAAAGACATCACAGTTTTATTGGATTTTCGATGTATTCAA
TCTAAACCATACAAAAGACGGTATGTGCCTATAGATTTTCAAGTTGATTC
AACAGCGCACCGCGCTGAATCTAAAAATATATTTTATTTTTGACATAATC
ATTGCTCTCGATGTGTTTGTACGAGTTCCAATCCCATCAACCTTTGCGTT
AATCTCTCTGCACGTTAATTGCATCATTTGACAAAATATATACAGTATAA
CAACTTGCATGTATCTTTAATTGAGCCGCATTGAATTGTTGAATTTCAAC
GTGTACAAATATCAAAAAAGTGAAAAGTAATAATTATGCGTATGCGTTGG
GGAGCACTATTCCAACTGGTATGGAGTGTAAAGACAACGGCTGCGTCAGA
TAATTTCTCGCAGAACAATTCCCCACTAAGTCCTATCTTTTCCCTATTGT
GGTGTCATTACCAGTTCATTCGTGGTGATAAGTTTGATCCTTACAAAAAT
CATGAGTTATTAAACAGAAAAAGAGACATAAAAAACTCAAGCAAGAACAT
AACAAACTGTTAAAAATATTTAAATATCTTAACACGTTTCTGTCTCAGTG
AACCGGTGAGAACCATTAAACCAGTGGAATAGAATGAAGGAGCTATTTGC
GGGTTGAGTGTTGGGGAGGCGACTTTTAGTTTTTCCGATGCAAAATTTCC
CACAGTATTCTATCACCGGGGATATTCGTGGCTAATTTTTCCATTGGGTG
AGTGGTTCCACGTTGTCTGTAACACGTGCCTGTCTCATAATTTTAATTCA
CATTTCAGACTGTTGGGGTATGTATGCAGATATTCGTGCCGGAGACGGTC
AATTGGTGGATATGAGATATGTGAACTTCTTTAACCCTGTATGTATATAT
GGTTTTTGTTTGAAATTAACATGCTGTTATTTCGTCCCGTGAGGATATCA
CACATTGAGTCATGCGCGATAAAACAACTCTCGCAGTCTTTCGTCGCAGG
TTGAATTTAAGAGAAAGCTTGATTGCTTTTCTTATAGTATCGATATATAC
ATTGGAGCCTCGCCAATTTAAACCTATTTTGCTTGATTTTTTCCAGATAA
TCTAAGCCAGTTCCAACCCCTGTCACCGATTCATGAAATCCTAACAAAAT
ATTTTCTATATATCGAATCTTTGAACAAATTAGATTTCCCGTACATGAAG
AGCTTAAGCATTGGGAGTTCCTGTCGATAGTAATAATTTAGTCTAATAAA
AACCCTTGTTTTCCGATATTCCTGAAACAATAGTACGTACTGTAATTATC
TTTGGTAATTACTTAAGTCAGACAGCCTGGGCAGAACCTTTAGTATCAAT
TTACTTTTTTTAAATCACTTTTTTCTCTTTAGGACACAGATNGAGACAGC
CTGGGCAGAACCTTTAGTATCAATTGATTTTTTTTCTCTTTAGGACACAG
ATAACCTTGCAATGTATACTAGAGCGAGAAAGAATGTCCATTACACGTTC
AGTTTGTACCCAGTACCGTTCGGTGACAAACTTCAGATTAAAGTTCGAAC
ACCAGGTACAAAAAAATAGGTTTACTGATTTAGTTCGTCATAGATTTATG
TTTGACAAGATCTTAGCAAAATCTAGGCAAAATAAAATTTACTACCTTAT
CGGCCAAAACTTAGTTTGGCCTTAATTTTAGTGGGGCTTAATTATTGGCC
GGCCCTAATTTTAGTCACCTCGTCAAAATTATAGTCACTAAGGGCCAACT
AATTATTAAGACCGACTAAAAATTTGGGCCATTTCTAAATTTACAAGCAG
ATGGAAAATAGGAGAAAGCTTAATTATAGACTTTTAATTTGGCCCAAAAT
TTTTTACTCGGCCCTAATTTTAGTCACCAAGCCAAAATTTAGTCACTTAG
GGCTGACTAAGTTTTGGTCGATAAAGTATTTGAGTTTATAATTCGCAACT
TTTACTAACAAGGGATTAGAAATTATTCTTTTTTCTGGTTAGAAAGTCGA
TTTCAATAGGAACATTTTGACTTTTTTCGTAATATCAATGAAATTTAACC
TTCCCCTATTTTTCAAATTATTCAAGTACATGAGTTTGGAATAATAGCTT
TTGCTTTGATTCCGTATAACTTCAAAAAAAAAAATTATTCATTGGTTCAT
TACGCGATACACCATATTATTCAGGCAGATATTTTGTTTATTTGATATTG
TTTCGTGCCGTTTCCACAAATTCAAACGTAAAATTAATTCGAAACCTTTG
AACTGTAGATTCAAAATAGGATTAATGCTAAGATTTTTGTTTGTCAATTT
TTAGGAGATTGCGAAAATGCAGCTCTTGAGACGATTTATGACAGTAAGTA
AACATTCTCACATTGTAAATATTTCATAATTCTCACGCTCTCAGGGTTGC
AATTATTATCACATGAAAGTGCAAGCGAAAGAATACGTCCCGTTTCGTCT
ACCTTCGAAGCTTATGGGGGATGAAAATCATTGCTAAGGGACGTAATTGA
TAGTAGGGGCTAATCCTTAGGATCCTTCACATCTTTCGTGGGACTCAAAC
AAGCACATGTGTTTCAAAAGTAGATAGGATTTTATGAGACTTTATTGAAA
GATGGGCCCGCGATTTAGGCCTGGCAAAGGTTTTTCTAAGAAATTTCCAA
GCAAAAAAGTATACTACAACAAGGCTTGTACTCAAATATATAACGGCTTT
TGAAGCTCAAAATCCTGACAGTTTGAGTACGATTTCGACGTCAAATTTTA
TCTCAAACGTTACAGATTTCACAGGATTTCGAACTTTAATCCATCCTTCC
GATGGTATCAATCATTTTCATTTAATTCGACTTTGAAAAATCGTAAATTT
TTTACTCATTTTAGGGATTAAGAGTTTTGCCTACAACTTTAGTTTGTTGG
CCATAAAATCTTTTGCCAGGCCTAAATCGCGGCCCCTTTCAAAAAGGTTT
CAAAATACTATCTACTTTTGAACCAACCACATGCGGTTAAGTTCTACAAA
ATATGCTACGGATCCCTCCCTATACAATAAAGGTTTTATCCAAAAAATAA
TTAATTTTATTATTGATCTCATTTTCAGTGTTGATGATAATTCAAACAAG
TCCATCAAATGAATGTAGTGGCAGTGATAGTATAGGTATATGAAAAATAA
TGGGACTGGTTTAATAGAGCCTAGTAACAACTGAAGGCTGTTTTAGACAG
GGGGAAATCTTGGGGGAAAAAGATGAGAAAATCAGCTTCNCCGTTAAGGT
AATTTTAAAACACCCTGTAGGAATTATTTAATACCTTTTGAGTGATTTTC
GGAATTTCCAAAAATTCAAAAGTTAAGAAGGTATGATATAGTAACCGTAG
GGGCAGGAAAAAAGCCTTCATAGGAATTCTGAAAATCCCCTTAACTCTAA
AGGGGTCTTTATGTACCTCATAGGTACCTCATAAACAATTTTCAGTTTTT
CCGAAATTTCAAAGTATATTAAAATACCATTCGACGGTATAAAGTAGAGT
GTCATAATTCTCATTCACTCAGTAGAAATCCTTGGGATGTCATTTGAAAA
AAACTTAAGATTGAACGGCAAGACCTTGAGGAGTCTAGTTTGGCATTAAC
GAGCACGCAAGACAGATCATAAAGGTCTCTAATTGAACATTTTATGCTCT
GTGTTAGGGAATCGTTATAATCCAAGACTCTGAAAGTAATTTTTCTAACC
GTATTTCCGCTTGAAACCCTTTAAAGCTAAGTTAATTTCACTTTTAAAAG
CTATCTTTTAGCCTAAGGTTGTTCCATAGATGTTATCATGGGTTGGAGAT
ATGCTGCCTTTGAAGCCTCGGGGATAAGACGACAAAATAATACCTTTAGA
GGTATCTTTAATCGCGTCTATGATTCATGCCTAATCGTGTCTATGGAGTT
TCGCTACTTTTGATACCTTAGAGATACAAATTCGAACCTTTTGAGGTATT
TTTTNTCGTGTCTATGGAGTTTCGTACTACTTTTGATACCTTAGAGATAA
AAATTCCAACCCTTTGAGGTATTTTTGAATGTTTTCTTGCGGGAAAACAG
GCGGCAAAAAAAATACCTTTAGAGGTATTTTTAATCGCGTCTATGATTCT
TGCCTAATCGTGTCTATGGAGCTTCGCTACCTTTGATACCTTAGAGATAC
AAATTCGAACCCTTTGAGGTATTTTTGAATGTTTTCTTGCGGGAAAACAG
GCGGCAAAAAAATACCTTTAGAGGTATTTTTAATCGCGTCTATGATTCTT
GCCTAATCGTGTCTATGGAGCTTCGCTACTTTTGATACCTTAGAGATACA
AATTCGTACCCTTTCTGATAAAATCGATGCTCTTTGAGGTATCATTCCAA
AGAGTCCTGGGACGGTGAGAACGACGGGACGTTGTGAGAAAATGAAAACA
ATCATATTTCCGCGGTATAATTCCAGCACTAGAAAGAGTAAATTCTCCTT
AAAGTCCGAGAAAAACCCATAGCTCCCGCCTCTTTCAAAAATACACTTTT
TGATTGTGCCGCTCATTTCCTCTTTGTCTGTCAATCTGACAGGTCGAAGC
TCCCATTCGCAAATTATTTAAAGTCCGAATTTTAGCCGCTCGCTAGATTA
TCTAATAAATATTATTTTGTGATGCTGAAATTTTGGGGATTGATCAACTC
TCCCAAATATCCCTCGCTGGAGAAGATCAACATTCGGTTCAAAAGCATAT
TGAAACTCTGAAATCACAAACCTATTGCTCTAAGCAAAAAGAACGACTCG
TTTGGAGCTTATCCTGCACAATCGATGAGCAAAACTGATCAAGGATCACA
TATCCGTCAAAATTCTGATTGAAATATACCCAAACCTTGCGAATGGCGAA
CAGGTAAGCAAAATTCGGCTAATTGAATCAGGGGGGGGGGCAATTAGGTC
AGAGTCCCCCTTAAAGGCTCTGAAGATATCTGACAGGGCCCAAATTATCT
GGAAATGAGAAAAACCTCAATTTTTTGTTCTGATAGGGTCCCGATTTTAC
CAAAATTTCATATCTGACAGTGTCAACTTTGCAAACTACAGCGGCACGTC
CCCGTCGGCTGTCAAGGTCAGTGCCCCCAGGCATCTAATATGTTACTTTG
CAACAAGCGTATATAGGATCATTGAAATATCATTGAAAGTAAGAATATAA
CGAACAAAAGTTTTACAAAATGTAACTTTCTTTTTCAACAGATCGATGTG
CTGTTGTGGGAGTATTAATAATAACGTTACCGGTACTATTTCGAGAAGAT
ACCAAAAATTACTATGGAATCGAGAACCGCGCTTTCTCCTCGAATCGGCC
ATGCTAACCCTGACACTTTTTGAGGATTAAGATTTCTTCATTCACCTAGA
TGGCATCACCATAGGAAAGTCAAGAGATCCTCTGACGGCGTTGTGCTATG
AAATTGCTCTGTCTTATACAGAAAAAAATCACGACAGTGAATAAATGAGA
AAGATTGAATAATCTTACTGAATAGTAAATAGTGTATAATTATTAGCTGA
TATATAATCGGTTTACTAGTTTTTGTTAATTGTATGATACACCATTCCAT
TTATTGAATTATTTGGCTTTCTTCTATATTTATCAATATTGGAGCTTTGA
TCTCCCATAAACTTTATGAGTTTTTCGTTCATTTAGTATTCGCTTAGAAG
AAATGATAGGAAATTTAAAATACCTAGGAGGTAAAAGGAAAATACCTTTT
TCGCACCATCACATGTAAGTGATGAAAAACAACCCCGTGGGTAAAAACTA
AAACCGCTTTATCGGCACTTTTGAATCCTTTTGGTGGTGTTTTTAAAGCA
CATTAATGGTATATCAGACTAATTTTACCTTAAAAGGGTCGTTTTGCGGT
ATCGCTTGAAAACTACCTTTTTGGTGACTTAGGAATACCTTTTCGGGGGC
AAAAAAATTCTTTTGGAAGTATTATTTTCATACCTCAAAAGGTATCTAAA
AGTAACTGTAAGGTACAAATGAAAAAATACCTTATAGGAATTTTTTTAAT
TTGTACCTTTAAAGGGTCGTTTTGCGGTATCGCTGAAATAAACCTTTAAA
GGTACTAAAAAGAACCGCTAAAACTTTCAGTGAGAAAATCTTGGGGACAT
AATAAACGAGGTCTTATCATTTAATTGAAAACTTTATTTAGTTTTCAAAA
CACGGCTTTTTTACCCTCGTACCATCATGTTGAAATTCCAAAGTGGATAC
AATGGGCTTTTCCAGAAATTGTCCATACCCCCCCCTGTTGAGGATATCCA
TTTTTCGAGATTCAGAGCCCCCTGGATATCCGGCCTTAAAAAAAAGACCC
CCTGGATATCCAGTCTAAGGATAACACAGACCCCCTGGATGTCCGATATC
CCCAACAGGGGGGGGGGGGCACGGACTATTTCTGGAAAAGCCCAATCAAT
CTGTCTGCCTTTTTGGCGCCCGTCACCTTTATGGCCTCCCTTAAGATAGC
TTCACTTAGAAGCATAATGCTCCCCGCTATCGGACCCAACTGTTAGGCAC
TGTCCACTTCATATTTGAAAGATGGACCCTTCTGATCAAAATATTCCTAT
TTCAGACTTCACAACTCGGAATGAACTAGCAACTCTCATTTGCCGAATCT
CACCTGATTCCGCTAAACAACGTAGAGATTTGATCCTAAATAAAGTACGG
ACCCGATTCAACAAAGTGAAAGGACGATGTGAATTTTATCTTAAAACTGA
CGATGGCAATTCTAAGCCACCAGAAACTCCTCAAGTAAATTATTTAACGC
CGGCTAATATTTCACTGGCAGCGATTAGTATGGTCCTGGTTGTTGCCCTA
ATCATTATTGTGATAATGTATTTTCGATGCAAAAGACAAGAAATTGCCAG
AGTAACATCAGTTGAGAGCACTAATGTACATTTAGATAACGTGGAAAGAG
TGACTTATAAAGTTGCTGCCGAAGGTGACTATTTGATGGTTAGATAACAA
AGCTATAAAAGATTACCGGTAATAAATCATGATAATATAATGATCGTCTT
TAAACCTAAGATTTCATTTGATTTTGCGGAATGTTTCAATTCTTTTTACC
GAGATCTTCGGCCAAAATTAATCGTTGCAATGCAATAAATAACTTTTGAA
TGTCAATTTTCAACTTGTGGTGGTTGTAGTCCGGGGAAAAGAATTATCAT
CCCAAACAAGGGTACCATTGAATTGGAGCTGTTAATAAATTTCATATTCA
TGAATAATCGGATAAAGTCGGACAATGTGTTTATAGTATTAAATTGTGTT
TTTGGCTGATATTGACGAAGACGTTAAGGTTGGATAATTTGTATATTATA
AGATACTTAGATATGAAAATGCAGAGCATTCGAAACTCATATCCACGGAG
AAATTAATGAACTGCGGGTTATAGGCACACAATACCTAATCAATGCTGAC
TTATTCTCCAAACAAAAGAAGTCAAAAACTTTATTGGAAAAGTTTTAACC
TATCATCAAAGTCTGTTGGCACTACTCTTTCCTATCGTGAAAATTACCTC
TTTGTTGAACCCCCTTTGCATCCTCCAATGTTAAAAATGTTTATTTCATT
ATTTTTTATAAAATTTATCGTATTAAAAAGATTATTGTATATATTCAGGT
AATTTTATATTATGTGTAAAAGACAAAACCCTGGTTGATTTTTATATACA
GTGAATTGTATTCTCTGTTATCATTGTATTAGC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000005:846935..857067-

>TCONS_00000837 ID=TCONS_00000837|Name=TCONS_00000837|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=9180bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005:846935..857067- (Clytia hemisphaerica)
ACTTCACAACTCGGAATGAACTAGCAACTCTCATTTGCCGAATCTCACCT
GATTCCGCTAAACAACGTAGAGATTTGATCCTAAATAAAGTACGGACCCG
ATTCAACAAAGTGAAAGGACGATGTGAATTTTATCTTAAAACTGACGATG
GCAATTCTAAGCCACCAGAAACTCCTCAAGTAAATTATTTAACGCCGGCT
AATATTTCACTGGCAGCGATTAGTATGGTCCTGGTTGTTGCCCTAATCAT
TATTGTGATAATGTATTTTCGATGCAAAAGACAAGAAATTGCCAGAGTAA
CATCAGTTGAGAGCACTAATGTACATTTAGATAACGTGGAAAGAGTGACT
TATAAAGTTGCTGCCGAAGGTGACTATTTGATGGTTAGATAATGTTGATG
ATAATTCAAACAAGTCCATCAAATGAATGTAGTGGCAGTGATAGTATAGG
AGATTGCGAAAATGCAGCTCTTGAGACGATTTATGACAGACACAGATAAC
CTTGCAATGTATACTAGAGCGAGAAAGAATGTCCATTACACGTTCAGTTT
GTACCCAGTACCGTTCGGTGACAAACTTCAGATTAAAGTTCGAACACCAG
ACTGTTGGGGTATGTATGCAGATATTCGTGCCGGAGACGGTCAATTGGTG
GATATGAGATATGTGAACTTCTTTAACCCTATCTTGGAATGACGACTTCA
TTTTTCGATGATTACAAAAAACTGTGTTATGAGAAACAACATGGTGCGAA
ACAAAAAGCTTGTCGAACAGGGGATGCTTATATTACGTACGCGGAAGCTC
AAAAGACATCACAGTTTTATTGGATTTTCGATGTATTCAATCTAAACCAT
ACAAAAGACGGTCCTTATGAGAACAACACCACATGCACTTTAGATTGGTT
CAACAAGACTTTGATTGGAAAGGATTTTGCACAAAACTTCTGGGAATGAC
ATTGCTAGAAACTTTTTCATAGATGACAACGACAAACGTTTTTGCAGTCA
CATTTGTGATATTTGTACTGACTTCACAACTCGGAATGAACTAGCAACTC
TCATTTGCCGAATCTCACCTGATTCCGCTAAACAACGTAGAGATTTGATC
CTAAATAAAGTACGGACCCGATTCAACAAAGTGAAAGGACGATGTGAATT
TTATCTTAAAACTGACGATGGCAATTCTAAGCCACCAGAAACTCCTCAAG
TAAATTATTTAACGCCGGCTAATATTTCACTGGCAGCGATTAGTATGGTC
CTGGTTGTTGCCCTAATCATTATTGTGATAATGTATTTTCGATGCAAAAG
ACAAGAAATTGCCAGAGTAACATCAGTTGAGAGCACTAATGTACATTTAG
ATAACGTGGAAAGAGTGACTTATAAAGTTGCTGCCGAAGGTGACTATTTG
ATGGTTAGATAATGTTGATGATAATTCAAACAAGTCCATCAAATGAATGT
AGTGGCAGTGATAGTATAGGAGATTGCGAAAATGCAGCTCTTGAGACGAT
TTATGACAGACACAGATAACCTTGCAATGTATACTAGAGCGAGAAAGAAT
GTCCATTACACGTTCAGTTTGTACCCAGTACCGTTCGGTGACAAACTTCA
GATTAAAGTTCGAACACCAGACTGTTGGGGTATGTATGCAGATATTCGTG
CCGGAGACGGTCAATTGGTGGATATGAGATATGTGAACTTCTTTAACCCT
ATCTTGGAATGACGACTTCATTTTTCGATGATTACAAAAAACTGTGTTAT
GAGAAACAACATGGTGCGAAACAAAAAGCTTGTCGAACAGGGGATGCTTA
TATTACGTACGCGGAAGCTCAAAAGACATCACAGTTTTATTGGATTTTCG
ATGTATTCAATCTAAACCATACAAAAGACGGTCCTTATGAGAACAACACC
ACATGCACTTTAGATTGGTTCAACAAGACTTTGATTGGAAAGGATTTTGC
ACAAAACTTCTGGGAATGACATTGCTAGAAACTTTTTCATAGATGACAAC
GACAAACGTTTTTGCAGTCACATTTGTGATATTTGTACTGACTTCACAAC
TCGGAATGAACTAGCAACTCTCATTTGCCGAATCTCACCTGATTCCGCTA
AACAACGTAGAGATTTGATCCTAAATAAAGTACGGACCCGATTCAACAAA
GTGAAAGGACGATGTGAATTTTATCTTAAAACTGACGATGGCAATTCTAA
GCCACCAGAAACTCCTCAAGTAAATTATTTAACGCCGGCTAATATTTCAC
TGGCAGCGATTAGTATGGTCCTGGTTGTTGCCCTAATCATTATTGTGATA
ATGTATTTTCGATGCAAAAGACAAGAAATTGCCAGAGTAACATCAGTTGA
GAGCACTAATGTACATTTAGATAACGTGGAAAGAGTGACTTATAAAGTTG
CTGCCGAAGGTGACTATTTGATGGTTAGATAATGTTGATGATAATTCAAA
CAAGTCCATCAAATGAATGTAGTGGCAGTGATAGTATAGGAGATTGCGAA
AATGCAGCTCTTGAGACGATTTATGACAGACACAGATAACCTTGCAATGT
ATACTAGAGCGAGAAAGAATGTCCATTACACGTTCAGTTTGTACCCAGTA
CCGTTCGGTGACAAACTTCAGATTAAAGTTCGAACACCAGACTGTTGGGG
TATGTATGCAGATATTCGTGCCGGAGACGGTCAATTGGTGGATATGAGAT
ATGTGAACTTCTTTAACCCTATCTTGGAATGACGACTTCATTTTTCGATG
ATTACAAAAAACTGTGTTATGAGAAACAACATGGTGCGAAACAAAAAGCT
TGTCGAACAGGGGATGCTTATATTACGTACGCGGAAGCTCAAAAGACATC
ACAGTTTTATTGGATTTTCGATGTATTCAATCTAAACCATACAAAAGACG
GTCCTTATGAGAACAACACCACATGCACTTTAGATTGGTTCAACAAGACT
TTGATTGGAAAGGATTTTGCACAAAACTTCTGGGAATGACATTGCTAGAA
ACTTTTTCATAGATGACAACGACAAACGTTTTTGCAGTCACATTTGTGAT
ATTTGTACTGACTTCACAACTCGGAATGAACTAGCAACTCTCATTTGCCG
AATCTCACCTGATTCCGCTAAACAACGTAGAGATTTGATCCTAAATAAAG
TACGGACCCGATTCAACAAAGTGAAAGGACGATGTGAATTTTATCTTAAA
ACTGACGATGGCAATTCTAAGCCACCAGAAACTCCTCAAGTAAATTATTT
AACGCCGGCTAATATTTCACTGGCAGCGATTAGTATGGTCCTGGTTGTTG
CCCTAATCATTATTGTGATAATGTATTTTCGATGCAAAAGACAAGAAATT
GCCAGAGTAACATCAGTTGAGAGCACTAATGTACATTTAGATAACGTGGA
AAGAGTGACTTATAAAGTTGCTGCCGAAGGTGACTATTTGATGGTTAGAT
AATGTTGATGATAATTCAAACAAGTCCATCAAATGAATGTAGTGGCAGTG
ATAGTATAGGAGATTGCGAAAATGCAGCTCTTGAGACGATTTATGACAGA
CACAGATAACCTTGCAATGTATACTAGAGCGAGAAAGAATGTCCATTACA
CGTTCAGTTTGTACCCAGTACCGTTCGGTGACAAACTTCAGATTAAAGTT
CGAACACCAGACTGTTGGGGTATGTATGCAGATATTCGTGCCGGAGACGG
TCAATTGGTGGATATGAGATATGTGAACTTCTTTAACCCTATCTTGGAAT
GACGACTTCATTTTTCGATGATTACAAAAAACTGTGTTATGAGAAACAAC
ATGGTGCGAAACAAAAAGCTTGTCGAACAGGGGATGCTTATATTACGTAC
GCGGAAGCTCAAAAGACATCACAGTTTTATTGGATTTTCGATGTATTCAA
TCTAAACCATACAAAAGACGGTCCTTATGAGAACAACACCACATGCACTT
TAGATTGGTTCAACAAGACTTTGATTGGAAAGGATTTTGCACAAAACTTC
TGGGAATGACATTGCTAGAAACTTTTTCATAGATGACAACGACAAACGTT
TTTGCAGTCACATTTGTGATATTTGTACTGACTTCACAACTCGGAATGAA
CTAGCAACTCTCATTTGCCGAATCTCACCTGATTCCGCTAAACAACGTAG
AGATTTGATCCTAAATAAAGTACGGACCCGATTCAACAAAGTGAAAGGAC
GATGTGAATTTTATCTTAAAACTGACGATGGCAATTCTAAGCCACCAGAA
ACTCCTCAAGTAAATTATTTAACGCCGGCTAATATTTCACTGGCAGCGAT
TAGTATGGTCCTGGTTGTTGCCCTAATCATTATTGTGATAATGTATTTTC
GATGCAAAAGACAAGAAATTGCCAGAGTAACATCAGTTGAGAGCACTAAT
GTACATTTAGATAACGTGGAAAGAGTGACTTATAAAGTTGCTGCCGAAGG
TGACTATTTGATGGTTAGATAATGTTGATGATAATTCAAACAAGTCCATC
AAATGAATGTAGTGGCAGTGATAGTATAGGAGATTGCGAAAATGCAGCTC
TTGAGACGATTTATGACAGACACAGATAACCTTGCAATGTATACTAGAGC
GAGAAAGAATGTCCATTACACGTTCAGTTTGTACCCAGTACCGTTCGGTG
ACAAACTTCAGATTAAAGTTCGAACACCAGACTGTTGGGGTATGTATGCA
GATATTCGTGCCGGAGACGGTCAATTGGTGGATATGAGATATGTGAACTT
CTTTAACCCTATCTTGGAATGACGACTTCATTTTTCGATGATTACAAAAA
ACTGTGTTATGAGAAACAACATGGTGCGAAACAAAAAGCTTGTCGAACAG
GGGATGCTTATATTACGTACGCGGAAGCTCAAAAGACATCACAGTTTTAT
TGGATTTTCGATGTATTCAATCTAAACCATACAAAAGACGGTCCTTATGA
GAACAACACCACATGCACTTTAGATTGGTTCAACAAGACTTTGATTGGAA
AGGATTTTGCACAAAACTTCTGGGAATGACATTGCTAGAAACTTTTTCAT
AGATGACAACGACAAACGTTTTTGCAGTCACATTTGTGATATTTGTACTG
ACTTCACAACTCGGAATGAACTAGCAACTCTCATTTGCCGAATCTCACCT
GATTCCGCTAAACAACGTAGAGATTTGATCCTAAATAAAGTACGGACCCG
ATTCAACAAAGTGAAAGGACGATGTGAATTTTATCTTAAAACTGACGATG
GCAATTCTAAGCCACCAGAAACTCCTCAAGTAAATTATTTAACGCCGGCT
AATATTTCACTGGCAGCGATTAGTATGGTCCTGGTTGTTGCCCTAATCAT
TATTGTGATAATGTATTTTCGATGCAAAAGACAAGAAATTGCCAGAGTAA
CATCAGTTGAGAGCACTAATGTACATTTAGATAACGTGGAAAGAGTGACT
TATAAAGTTGCTGCCGAAGGTGACTATTTGATGGTTAGATAATGTTGATG
ATAATTCAAACAAGTCCATCAAATGAATGTAGTGGCAGTGATAGTATAGG
AGATTGCGAAAATGCAGCTCTTGAGACGATTTATGACAGACACAGATAAC
CTTGCAATGTATACTAGAGCGAGAAAGAATGTCCATTACACGTTCAGTTT
GTACCCAGTACCGTTCGGTGACAAACTTCAGATTAAAGTTCGAACACCAG
ACTGTTGGGGTATGTATGCAGATATTCGTGCCGGAGACGGTCAATTGGTG
GATATGAGATATGTGAACTTCTTTAACCCTATCTTGGAATGACGACTTCA
TTTTTCGATGATTACAAAAAACTGTGTTATGAGAAACAACATGGTGCGAA
ACAAAAAGCTTGTCGAACAGGGGATGCTTATATTACGTACGCGGAAGCTC
AAAAGACATCACAGTTTTATTGGATTTTCGATGTATTCAATCTAAACCAT
ACAAAAGACGGTCCTTATGAGAACAACACCACATGCACTTTAGATTGGTT
CAACAAGACTTTGATTGGAAAGGATTTTGCACAAAACTTCTGGGAATGAC
ATTGCTAGAAACTTTTTCATAGATGACAACGACAAACGTTTTTGCAGTCA
CATTTGTGATATTTGTACTGACTTCACAACTCGGAATGAACTAGCAACTC
TCATTTGCCGAATCTCACCTGATTCCGCTAAACAACGTAGAGATTTGATC
CTAAATAAAGTACGGACCCGATTCAACAAAGTGAAAGGACGATGTGAATT
TTATCTTAAAACTGACGATGGCAATTCTAAGCCACCAGAAACTCCTCAAG
TAAATTATTTAACGCCGGCTAATATTTCACTGGCAGCGATTAGTATGGTC
CTGGTTGTTGCCCTAATCATTATTGTGATAATGTATTTTCGATGCAAAAG
ACAAGAAATTGCCAGAGTAACATCAGTTGAGAGCACTAATGTACATTTAG
ATAACGTGGAAAGAGTGACTTATAAAGTTGCTGCCGAAGGTGACTATTTG
ATGGTTAGATAATGTTGATGATAATTCAAACAAGTCCATCAAATGAATGT
AGTGGCAGTGATAGTATAGGAGATTGCGAAAATGCAGCTCTTGAGACGAT
TTATGACAGACACAGATAACCTTGCAATGTATACTAGAGCGAGAAAGAAT
GTCCATTACACGTTCAGTTTGTACCCAGTACCGTTCGGTGACAAACTTCA
GATTAAAGTTCGAACACCAGACTGTTGGGGTATGTATGCAGATATTCGTG
CCGGAGACGGTCAATTGGTGGATATGAGATATGTGAACTTCTTTAACCCT
ATCTTGGAATGACGACTTCATTTTTCGATGATTACAAAAAACTGTGTTAT
GAGAAACAACATGGTGCGAAACAAAAAGCTTGTCGAACAGGGGATGCTTA
TATTACGTACGCGGAAGCTCAAAAGACATCACAGTTTTATTGGATTTTCG
ATGTATTCAATCTAAACCATACAAAAGACGGTCCTTATGAGAACAACACC
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GACAAACGTTTTTGCAGTCACATTTGTGATATTTGTACTGACTTCACAAC
TCGGAATGAACTAGCAACTCTCATTTGCCGAATCTCACCTGATTCCGCTA
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GCCACCAGAAACTCCTCAAGTAAATTATTTAACGCCGGCTAATATTTCAC
TGGCAGCGATTAGTATGGTCCTGGTTGTTGCCCTAATCATTATTGTGATA
ATGTATTTTCGATGCAAAAGACAAGAAATTGCCAGAGTAACATCAGTTGA
GAGCACTAATGTACATTTAGATAACGTGGAAAGAGTGACTTATAAAGTTG
CTGCCGAAGGTGACTATTTGATGGTTAGATAATGTTGATGATAATTCAAA
CAAGTCCATCAAATGAATGTAGTGGCAGTGATAGTATAGGAGATTGCGAA
AATGCAGCTCTTGAGACGATTTATGACAGACACAGATAACCTTGCAATGT
ATACTAGAGCGAGAAAGAATGTCCATTACACGTTCAGTTTGTACCCAGTA
CCGTTCGGTGACAAACTTCAGATTAAAGTTCGAACACCAGACTGTTGGGG
TATGTATGCAGATATTCGTGCCGGAGACGGTCAATTGGTGGATATGAGAT
ATGTGAACTTCTTTAACCCTATCTTGGAATGACGACTTCATTTTTCGATG
ATTACAAAAAACTGTGTTATGAGAAACAACATGGTGCGAAACAAAAAGCT
TGTCGAACAGGGGATGCTTATATTACGTACGCGGAAGCTCAAAAGACATC
ACAGTTTTATTGGATTTTCGATGTATTCAATCTAAACCATACAAAAGACG
GTCCTTATGAGAACAACACCACATGCACTTTAGATTGGTTCAACAAGACT
TTGATTGGAAAGGATTTTGCACAAAACTTCTGGGAATGACATTGCTAGAA
ACTTTTTCATAGATGACAACGACAAACGTTTTTGCAGTCACATTTGTGAT
ATTTGTACTGACTTCACAACTCGGAATGAACTAGCAACTCTCATTTGCCG
AATCTCACCTGATTCCGCTAAACAACGTAGAGATTTGATCCTAAATAAAG
TACGGACCCGATTCAACAAAGTGAAAGGACGATGTGAATTTTATCTTAAA
ACTGACGATGGCAATTCTAAGCCACCAGAAACTCCTCAAGTAAATTATTT
AACGCCGGCTAATATTTCACTGGCAGCGATTAGTATGGTCCTGGTTGTTG
CCCTAATCATTATTGTGATAATGTATTTTCGATGCAAAAGACAAGAAATT
GCCAGAGTAACATCAGTTGAGAGCACTAATGTACATTTAGATAACGTGGA
AAGAGTGACTTATAAAGTTGCTGCCGAAGGTGACTATTTGATGGTTAGAT
AATGTTGATGATAATTCAAACAAGTCCATCAAATGAATGTAGTGGCAGTG
ATAGTATAGGAGATTGCGAAAATGCAGCTCTTGAGACGATTTATGACAGA
CACAGATAACCTTGCAATGTATACTAGAGCGAGAAAGAATGTCCATTACA
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CGAACACCAGACTGTTGGGGTATGTATGCAGATATTCGTGCCGGAGACGG
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GACGACTTCATTTTTCGATGATTACAAAAAACTGTGTTATGAGAAACAAC
ATGGTGCGAAACAAAAAGCTTGTCGAACAGGGGATGCTTATATTACGTAC
GCGGAAGCTCAAAAGACATCACAGTTTTATTGGATTTTCGATGTATTCAA
TCTAAACCATACAAAAGACGGTCCTTATGAGAACAACACCACATGCACTT
TAGATTGGTTCAACAAGACTTTGATTGGAAAGGATTTTGCACAAAACTTC
TGGGAATGACATTGCTAGAAACTTTTTCATAGATGACAACGACAAACGTT
TTTGCAGTCACATTTGTGATATTTGTACTG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_000502	XLOC_000502	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00000837-protein	TCONS_00000837-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000005	supercontig	sc0000005:846935..857067 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.112414	0.0219242	0.0254561	0.0498096	0.515427	0.670842	3.20847	2.65194	3.61864	4.50574	2.91559	2.24601	11.1696	10.5127	16.724	25.1812	2.05908	2.76786	10.946	17.1313	0.152163	0.190851	0.103113	0.281234	0.241387	0.193889	0.0924848	0.164504	0.0249541	0.101697

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00000837 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00000837 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00000837 (transcript) - C. hemisphaerica