TCONS_00000558 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00000558
Unique Name	TCONS_00000558
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2743

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at sc0000002:601440..628417-
coding sequence from alignment at sc0000002:601440..628417-

transcript sequence

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TGATTGGTTGTGTAAAAATGAAGTCGTTACAAAGCTACAATTTTGCAATC
CGCATCAAAATGTGACTGACATCTGAAAATGCATTTCAAAGATGAACTAT
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TCGATACAGATCGATCAACATCGGAAGATTCAATCGAATCAGCAAGCTCA
GTCGATGAATATTTAACGGTTTCGATGAAGTTAGGTCACATCTGTGATAT
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GTGATGAGATGCAACCCAAGATTTAAAAGACTATATGGcaattaaatttt
aatttttcgaacctcaTTGAGACATTtagatattttggtttgtaaaatac
ttaaagggacattaaagtagtaagatgtaaacattgcgcaaac

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00000558-protein

>TCONS_00000558-protein ID=TCONS_00000558-protein|Name=TCONS_00000558-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=629bp
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SSASQRPSTTPLPKKLLFVLFLLQIFSAMADTMVFSYLPKMVKSFGISEV
KTGFYAGWIASAFFLGRIPFSFAWGYISDIKGRRFAAILSSLTMSLATIF
FGFSTTFWWALSFRLIQGCLNGLPIICKAIVSAMCDNTNLSNAMTLVLAS
YNTGIIIGPSLAGFLVFPHDAYPSVFSEDNIFHKYPISMPNFVLAFGLST
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SGGFEDRKVTDITVSFFNPTLEFDGDDQL

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000002:601440..628417-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00000558 ID=TCONS_00000558|Name=TCONS_00000558|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=26978bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000002:601440..628417- (Clytia hemisphaerica)
GAAAAGAATGGTTACGGGTATCGTTTGATTGACATCAGCTGTTTTGACCA
TGATTGGTTGTGTAAAAATGAAGTCGTTACAAAGCTACAATTTTGGTATG
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GAAGAGACTCTCTTGCATTACATTAACACTATACTGTATATCTTATTCCA
CCTTCTAATCGTTTGACCTTCTGATTTTCCAATCATCTTTTGTAAAGAAA
GGTTCCGACTGAATGTAAGTAAGTAAGTAAGTATATTCATCTGGTGGCTG
TCGGCGGAGCCGGGAGTGAGGGAGTCTATTCCCTTTTCTATTTGCGCTAG
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CAGTACCTTACCGCCTATATCAGATTACCCAATTTAAGCTACTCATCCGC
TGAGTTGGCGGTGACCGGGCTCGAACCCACAAACCTTAGATTGTAAGGCG
AATGCTCTACCGACTGAGCTACCCGGCCCGACTGAATGTACTTACCCTTA
ACACTTTGCTGAGATTTTTATGTTTTCTCTTGATAGCAATCCGCATCAAA
ATGTGACTGACATCTGAAAATGCATTTCAAAGATGAACTATCTTATGGAC
GAGCTGATTCAAATGGTTAAAACAAGGTTTGTGCTACACGTTTGTTTCTT
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TCGAGTTTTAAACCTAAAAAAATTTCTAAACATGGTCTTATTTTCACCAT
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GTCTACAAAGCCGTAAAATGTTCTTAACTTGCTCTTAACATTTTGGCCAC
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TCTGATTGGTGATCAATCTTGTTGTATTTCAATTTTGATATTTGTTTATC
TGGCAGGATCACGTGATTTTTCATAATTCTATCGTGTTTGGCTTTCCAGC
GAATGTCAACCCCATCATTAAACAGTAAATAATAATTGAATTTCTAAAGC
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CCCTATATCAGGCTTTTTACCCGGGCTTGCATCATGCTTAGCATTCTATT
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TCAACCAATCATAGTGTGCAGAGGGTCCAGCCCCCAGCATTTTTCAGGGG
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CAGAAAGCAAAATACCAAAGAAAGTTGGTTCCGACCTCTAAAATTTTTAA
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ATGTTCCAATAAGGCTGATAATATAGCCTGGAAGCCACTTAACCCCTCTC
AAATAGAAAAACCCAATAAAACAAAGTGGAAGTACTGAAACTTCAATTCT
CGCCCGATCTTTAAATTCTGAAAAACGTTAAAATACCCAAAAGTGCCAAT
ATATTTCGGCGCCGATTGTAGGTAGGATTTCCTACCTAACCTCGGTACAC
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GAATCACACTTTTAAGAAACACGAGGTTCAGAATGCATAAAAAAGAAACA
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GTTTTTTTTAAGAACCTTCCAATCCAGAGCATTCCATGAGGCTGATTATG
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TTCTTAAGAAACATTGAGGCTGCTTGGTAAAACTAGTTTCTCAGAAAAAA
ACGTATACATAAAATGAACGTAATCATCATTATTTGCATTCTCATATGCA
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TTTTATATACTAAGCTATCTCTTTCTAAATTGTGAACTTTGGTCTTTGGT
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ACAAAAAAGTGCCGAATTTTTGCCGTGTATTTTCTTCGCCTAAAGGCTCG
AAAAATATCGTAAGGAAAAATCCTCGGAGCTCATAAAATATTTCTCATAT
TGTACTCGCAACTGTCCAATAGCTATTACGTATCGGATTTACCTGCGTAC
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TTCTTGAACTAACGGAGTGTACCGTTCGGGTTCCCAAAAGTTGATCTTTA
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TGGAACTAAAATACCAAAATTTTCTCGAGATATTGTACTTTATTGTACCT
TAAGAGAAGAAATTTTTGCGGAACAAAATTTTCGCGGAATTAAATTTCGC
GGTTTTTCGACAAATCCGCGAAATTAAATTCCGTGAAACACGAAAATTCT
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CTATATTGCAAATATCTTTGGATTTCATAAGCGCGTACATGCCCCCAACT
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TAATTTAGAGATGTGGTATGATACCAGAAGTACTTAATAGAAAAATTTAG
GGCTACAGGGACTCTATAACACCCAATTTCTTAAGAACTTACACTAAAAT
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GAACCGAATCAGTCAAGAATATCAAACAAAGGCTTACAAAATTTTTGAAC
GTTCTTTTGAAAATAATAAGTACCATCCAAACAAAAAGTCACGAAGTTTG
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GAGGTTTGGATAAAAAAATCGAGGTTTGAATCAGAATCACGCCATTTAGT
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ATCAAGCTTTGGTTATTGATACGTTTGAAGTTTGTCTTATGAGTACCCGT
GGATACAGATTTACTAGAGAAAATGAATAATATGGCGTGGGCCTGTAAAG
TTTCAACGGTTTTTTTAACGAATGCTACTTTTTGTTGTTAATCATCTTGA
AATGTTTTTTTTAATTTACGCTTCTATCATGGCATTGATATTTTTTAACG
GTATATTTCTCTGAATATACGAATACATAGTTTTTGATTGTCTTGCCAAA
AAATGGTGTATCTTCGAATTTTAACATTTGTATTTCTCATTTATTGTGGT
TTTAATTTTTATACACCTCCTGCTCAAAGACCCACGGGGACCCCTTCCCA
CATTCATATCGTCTCCGGTGGAAAATCAACCTCCAATTTTTGTTCCCACT
GAAGATAATCAAATAAACTAATCCTCACTGCATAATAATTTACTTTTTTC
CCACCCTCAAAACCTCATTGAAAAGTCTGAAGCATCACAGTAGCGGATCT
GAGGGAGGGCCTCAAAATGTACGACAGAGAGTCTTTATTTCCTTATAAGA
TCATGCTTAAAAGAAAAAAATCGAGCAAGTAAGTAAAAAACGGAGCAAAA
TCACCAAATTTCAAATAACTGGTCAAAAATCAAAAAAAGTTAATATATCC
ATCATCCATCATCGTATATAATTTTGTAGAAAATACTCTATCCGTACACG
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GTCGAATTCGTTTGGTGTGTTTAACTGTAGGCTTCTGCTCATCCCCTAGC
AAAAAAATTTCTTATATAGGAAGTATATCTATAGAGGTCTGCGATTCAGA
CTAGTTTAACTGTGACCTGGTGTAAAAGATATTTTTCTATTTTTTAAGAC
GCGGTGAAAATTTGGATCACTTTTGAAGTCATCTGTTATTTTATCCCTGA
GGAATACTTTCATGAAGGTCACCTTTCGTGCGTTGATTTGAAATCTATTG
TCTCTTAAACGTTTTTTATAAGAACAAACTATGTAAGAACATAAGGCTTC
GATAGCCAAAAAGTTAAGAACACTTTATGGATTTGCGGACACACATTTCT
TAAGAAAATGTTGAAAATAAGAACATGTGAAAAATATTTTTAGGCTTAAA
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TGAATACCCATGACAAGTATTAAGTTCCATGCTGGCAAATCATTTAAAGA
AAACGTAGATTTAAGACAAGTGTTATAATAATTTGCGAAATTCCGAGGAA
GGGTATCTCGATAATCTAAAGTTGCGTAAAATATGGTAAAATCATGTTAA
GATTATCTTTTGGGTTAGATGTTGGTTTTCCCGCTTATGGTTATCTAAAT
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TAAATGTCTGGTTTGAAAGGAGTCAATTAGTAGATGGATATACGGTCCTT
TTGGGATAATGTCTATCCTACCCCCGTCTTTTTCATCGTTTCATGTTTCA
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AGCTCGAAGGGCTAGATGGTGCTGAAAAGTGTGCCGAGATTAGGTAGGAA
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CCGGCTTTATAAATCTATGCATACGTTCCTTTTGGGATGGTGTCTCCGCT
ATCCTACCCCCGTGTTGTTCATGGTATCATGTTTCATTAGACTACAAGAC
AGTCGTTTTGTTCGTACTCAAACATCCTTGAAATAAGTTTTAACGGGAAT
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TGAGTTACAAGAATCATATAAACCTTGCTAAAGGTTAGAATTTCATGTTA
CTTTTTGTTATTGTCATGTTTTATTTTTGCTTTTTTGGCGAAATTGAATC
CGGGTTGTAGAGAAATGCAGTTTCGCAATCTTTTCCTCAGACATTTTGTT
GACCTGGTGGTGTCTAAAATTATTTTTTAAAGGATTTTAAAATTTTATAG
CAACAATCTGTGAGAATAATTTTGAATAAAGTTGTGTAAGATAGCACAGT
TAGAAAATGTTTCCCGAGGGTCAAGGTTATTGGATGAAAATAAAACACAA
GAAGAAAATTTCTTTAAAAGTGTTTTGATGATTTGGATGCCATTAAAATA
TTTTTGGATTTTATTTGGTTTTGAATCGTCCGTGTATTTTGAAGCTCTTG
AAAAACTATATAGTTTTTGAATCTGTTGTACTTACGAATCATATGTAAGC
GTTTAAAAAGTTACTTTCAGTCGTCAGTTATGCTAGGCTAAAAGTAATCA
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TTTGATATGATTGAAGGTTTGAGCCCTTTGGCCTGTTTAAATGGAATTTT
CTCTTCTTCTAAAATCATTTCGGTATTAGGCGAGATCAATTTAATTTGCT
GTTCTACGGGCCCGACCGAACCTATTTTTGCTAAAATCAAAAAAATGATG
ATATTGAATTTCCACTACAATATATTTTACGCACTAGTTATTTGTAAGAA
TTAAATTTGATTAAAGCTGAAAATTAATTCAAGAAATTGAAAAATTTAGA
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AAAAACAAGAATCGCAAAATTGCGACTAAATATTTCCTTAAAAATGAAGG
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TCTAATGTCAAAAGCGTTTTCAGACACAACTTTTTGGACATTTAAATGTC
TCCGTAAAGCGGATTTACATTTTTGAGATAATTCAAAATAGAAAAAACAA
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GATAACATTACTATTATCAAGGGTTCTTGGCAAAACATTGCAAACTTCTT
CAGTTTCAATAGCTGTATATTGCAAACTATCCCTTTAATTTTTGGGAATT
GTCCTTTTGGCATTATTTTGACTTTAGCCAACAAAATACGCTGTGAAACG
ACTGCGCGTTCAAGCTTGTTGATGTCTTGTAAATGGCTTGGCAAGTCATG
CAATTCAAGTTTATTTTTCACACTTTGACAAGGAACTTCCTGTTTCAAAA
GTTTTTCATCACATGTTTCACATATGTAATACATATTGTCATAGCTAATG
ACAAGATCAAAGTCTATATCAAACCCATCTTTTATATATTTTTCTTCCTT
AAAAATTAAAAAAAACTTTTAAAAAGACATCTATGACAACAAACACAAAT
AAAAAATGGTCCTTTTACTTTTAAAATTGATACTTTTCTGAAAATTTGTT
ATTCTTTTGTTTCTGTCGGAACTCTTTTTATCGTTTTTATTCTTGTAGTT
TGTTTTCCTATCTTCTTTAATACTGGTTGAGTTTTTATTATAATACTCTT
TGTTACTTTCTTTAATATAACAATAGCGTTCAGTTTGAGGTCGTTGTTGT
TATTTTCTGCTTGCGCAGTTTGATTATTAGCCCGAGATTGTCATTTGGGA
TGGCACTAGAGGGCTAATAATCAAACTGTATCAGGGGGGGGGTCAGGGTC
AGAATTCGCCGGAAATTCGGCCGTCGAAATAGTACCTCGGCCGGCGGAAT
AATCGTCCGGCCGGCGGAAATGATATCCGGCCGTCGGAAAAGTCATCCGG
CCGGCGAAATAGTCATCCGGCCCGCGGAAAATTGGCCGTCAGAAAAGTTA
TCCGGTCCGCAGAAAGTGAGATCGAGTTATTTTTTTCGAGTTTTTATTTC
GAGCTACGAAAAACCGAGTTATGATAACATTTTCCGTAAATTTTGGTTAA
ACTATGATGTCATTCATCATCAATATCGTTATCGGTTTTTTTTGTTTACT
TTAATTTGAGTTCGAGTTGTTTCCTGTTGTTAACTAACTACTCGGTTATT
TTAAATTGAATAACTTTTAGATTAGCATAGCTATTTAAAATTCCCTTATT
TTTAACTATTCTATTCTATAACTCGGTTCCCGAATACCAGATGGTTGATA
AGGTTATTATAATCAAGCCAAAAATTACGAAAAAGGACGCAACAACTCGA
TTTTTCATAACTAAAAAAAAAAATAACTCGAAAAAAATAACTCGACCTCA
ATTTATATAACTTTATAACCGAATAACTTTTCCGACGACCAATTTTCTGC
CGGCCGGATAACTGTTCCGACGGCCGGATGACTATTCCGACGGCTAATTT
TCTGCCAGCCGGATAACATTTCCACCGGCCGGACGACTATTCCGCCGACC
GAGGAACTATTTCGACGGCCGAATTTCCGGCGAAATCTGACCCGGATCCC
CCCTGATAAAACTGTAAGGGCAGAATTAATGACCAAAAAGTGTTTTTTTC
TGACGTCAGTTTAGTCTCACTGCTTCAATGCAACGACTTCAATAAAGTTC
CGAGCTGGCTGCAAATGACGTTATCGCCCTATAACCAGGGCGGTTAATGA
TATTTCAACCCTCTGAAGCGCGACGCCTTAGGAGTTTTTCCTCTTTCTCC
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ATCTCACCCCTGTCTCACCTACAGAGATTATAAAGCCACGTGCAAAACGC
GTAGAGCAGCCAACATTTCAACGCTCTTGGAGCTTGAATAGAGTGTCAAT
TTCTTTCCTTTTGTATTTTCGGCATCAAATTAATTAGTGGCAAAATTTAC
CCTCCGGGGTAATAGTATTTTCCGCCACTCTTTGTGGGTAATAGTATATT
CCGCCACTCTTTGTGGGTAATAGTATTTTTTTGCCGTGAACCTTTTGTGA
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TAGGACACTTTGGCTATGATCATGAAGTTCATGCTATGATGGTACAATAG
AATATTTCATCCAAATATTTCCAGAACCCTTTGAAAAAGAAGTCTGAAAG
TTTAAAGGTTAAATAATCTTTAAAGCTCTGTAAAAAGAAATCTGAAAGTA
AAAAATCTTAGGAAGTAAAAAAACCTTCTCGTTGTCACTGTATACGTGAA
ATGAAACTAGCAACCACGCACCAACCAAGTCAGAATGATATGTTTATGTA
CACAATCTTGTTTGAATATCTTCCTCTTACTACTGCAACCCGACTTGACC
TGTACATAGCTATAACCTCCTCCGCAAAGATCAGCCTCCTTCGCATTTAC
TTTCTTTAGGCGCTAAAACGGGCGTCCGTCAGGGCGTACGGAAGGCGTTT
TGACATCTGAACCTCCTGAAGAAAGCCCGTTTTAACAAATATTTCCCTTT
TGGAAAACAGGAAATATTTAAAAATTGAGTTTTTGATCCAGATATTTTTT
GGAAAATATTTTCAGTACCTTACCAACCCTGATAAATGAAAAATCTATTC
TTATTTTACCAACTGACCGACCCATATTTTTCTAAAGATCTGCCTGTAGA
ACAACAAAATTGGTCCTTTAATAAAAGAAAGACGTTTTCTTTTCTAGAAA
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ATACAGAAATGGTTCAGAAGTTTACGAAGACGAGATACAGTCATCGAAGA
AATTCAATCCTCATCTATCTCATCTTCAGCATCACAAAGACCTTCAACGA
CTCCTCTACCCAAGAAATTGTTGTTCGTATTGTTCTTGCTGCAGGTAAAC
AAATTCATTCATTCTCAGCCATTCAATGTTTTGAATATTATTAATTATTT
TTCAGTCATCTATACAAGTCAACACAATATAATAGCTCATGAGCCAATCA
CATGGGTTTTAGTGAAAGTAGTCCTCCATCGGAGATATATATTCGCAACT
ACAGTTGACTCTCTCTAATTCGATCTTCAAGGGACCAAAAATTTTCTTCG
AATTACAGAGAGTAATATAAACAACTTTCCAGCTGATGGGACCAATATTT
TAGTTCGAATTATAGAAAAGCTCGAATAATGGAGTTTCGAATTAGAGAGA
GTTGGCTGAATCAATTATTTGGTAGACTTTGTAACAATTATGTTGGACTT
CTTTCTATTTCAGATCTTTTCTGCTATGGCTGACACCATGGTTTTTTCTT
ATCTCCCCAAAATGGTCAAGGTGAGTCCTGATTTTTTCACCCAAACCTAT
CTGAAAAGTATCAACGTCCACTCTAGACTATGCTATAGTCTAAGACAAAT
CACTACCTAAGAAATGAGCCCAAAGCCGAAGAAAATTAGCAAACGGATTT
TTTTGCTGAAAAGAGTTTACAGCGGGTAGAGTTTGCCAGTTCTTCGAAAT
TCCCCCACCGATTTTTTATCCATATACCACCATAACGCCAGACCGCCATA
TTTTCCCGCCTTTACTATCACTGTAACGAACGATAACATCGTCGACGCCC
GCTCTTTTACATTGTATGAAAACATTTTCAGCCATTCATTCTGTCTCTTT
CTGTTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAATTTTTTTTTTTTTAA
AACCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTATTTTTTGTTTTTTTTTTTTT
TTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAAATCTTATTTCTTTTTCAAAAC
CGATTTTATTTTCAGTCATTCGGTATCTCAGAAGTCAAAACTGGTAAGCA
CTTTATTTACTTCAGATTAGTACAAATCTCACTTTCTAGTATTATATATT
CAAGGACCCTACAACAACGAAGGTTTCAATTCACAGAGACAGACTTTGTA
AGCTGAGGGGTTGTTGCTTATTGTTTTAATTACAGAAAATCTACTAGAGT
AAAGTTTGAATTAGATTGTATTTTCCAATAAGCCAAATGTTCAAACTGTT
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GAAATGTATTTTTTAGGATTTTATGCTGGTTGGATTGCATCAGCGTTTTT
CCTTGGAAGAATTCCGTTTAGGTTAGTATGATTTCATGTCGCTAATAATC
TAGATTCACGTTTTTCACGTTTTTTGTCTTGTCTTTGTTCCCTTGAAATG
TATAATAATGATTAAATTTGTTCCTTCCATTTTATTAAATGGATACAGTG
GAATCTCCATAACTCGAATATGCACGGGGAACACAAATCTGTTCGGGTTA
AGGAAGTTTCATGTTATGAGTAAAGTTTATAAGACATTATTATTAACTGT
CAACTGAAGTTAACGTGTTTGAGTTAAGGAGACATTTCAGAAAGAGGTTC
AAGTTAAAGAGACTCTGCTATAATGCATTTTCTTCTTTTTAGTTTCGCTT
GGGGATACATCTCCGATATCAAAGGGCGTCGTTTTGCCGCCATCCTCTCA
TCCCTCACAATGTCTCTCGCTACCATTTTCTTTGGATTCAGTACCACCTT
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CAATCATCTGTAAAGCAATCGTTAGTGCAATGTGTGATAATACGAACCTT
TCAAATGCCATGACTCTTGTGTTGGCTTCTTATAATACGGGCATCATTAT
TGGACCAAGTTTAGCAGGTATGATTATAGTTTATAAGATTCTAATATCAC
AGAGAACACTCGCCATACTGATGAAGGCGAGATTTGAGATGTAGGGTTTC
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CAATTTGTCATTATAGCACAAAAATACCAGCGAAATCATCACTATGACCA
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TGCTGAAAATTATTCTGAGAATGTCTTTTTGTTTATCTGTCTGTTTGCCA
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TTGAGGAAGTTTTGTGATAAAACAGTAAAAAAATCTATTTTTGCTTTAAG
TATGTCTTAAAAAGGCTGTGTTTCCAAAACATAGAAAATGTCATACCAAC
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GCTTCCAGCGAGAGTGTTTTGAGCCAAAACAAAAAAGTCTAAATGAGAAA
ATTTTCTTCGTCGGCGCTAATGATGATCGTCTTTCTGTAATCGCTTATAT
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GTGAAGGGTATTTGATTTTTCGATAATTTACAAAAGTAGGTAGATAGTTC
TAAAATTTTTTATATGATTGCATCATCGAACATTCAGAAAAAAACTCTTG
TGACGCCGCACCGTGTAAGGCAGGTACGTCACTCGCCGTACCAGTAAATG
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CCAAATTTTTACTAAAAACGGGGGCAAATATTGAGCTTTTTTTCTTTTTA
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AAATTTGAGCTCATTTTGATAAAAATTCCAGGAATTATTGATATTTTAAG
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GATGACGTCAGCAAAAATCAGCAATTTTCATTTTTCCTAAAAAAATGCTG
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TGCAACCTGTTATTACCATTATGAAAGAATTCTTTATTATGTGTGCGAGA
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AGTAGTAAGATGTAAACATTGCGCAAAC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000002:601440..628417-

>TCONS_00000558 ID=TCONS_00000558|Name=TCONS_00000558|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=28350bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000002:601440..628417- (Clytia hemisphaerica)
AATGATTGCACCATCGATGGTTGGTACTTTATTGACCTGGTCTCTACACA
ATGTTGAAATTGGAACAGACAATCAGAATGGAGCTGACCATACCAACGCA
ATGGGATTCCCTTTTAATCATTATTTCACTTTCTTCGTATTATCTCTCAT
CGCGTTCACCAACGCTATTATAGCCTTCTGGATACCTTCAACACTAGATA
ATAGACCTTCAAAACAGGATTTTCAAAATGATTGCACTTGCAGTGAGGAC
AGCAGTGGTGGATTTGAAGATCGCAAAGTAACGGATATAACTGTAAGCTT
TTTCAACCCAACTCTTGAATTCGACGGTGATGATCAATTGTAAATCAACA
ATGTGGGTGGTGCTGGTCCTTGTTTTGGTATTGTTGTTAAGCCCAATGGC
TGCTGGGTTTTTAGCGATCAATATTCTGGTCAATAACACTGTAGAAGAGG
ATTTATTGGGAAGTGCAAATGGCCTGGCGATGAGTATGTCTTCTATTGGA
AGCTCTACATTACGGGAAGTATAGCTTTTGGTTTGGCAATGCCCTTGCTC
CCTTTGACTGGTCGAATAAACAACGAGTCGCTAAAAGATATGGTGCCAGA
TTTGTGGCATGGCACTATCAACACGTGAGATTGGTGTCGCATTTTTAATT
TCTGCTGCTTTACTTCTGATATTACAACTCACTGTTATCACATGGTAACA
AATGGTGCGTAGTATGTTGTTTATTGTACGCTATTTTCTCTGTGGTTGGA
ATCGGATTGTCAGAGCTTATACCATTATATTTGGCCACGTCAAGAGACTA
TGTTCCAAAAACAACGAGAAGAATTATCTACTCGATCCAATCGAGAAAAG
AAAACGATACGATAACGTCTTCGATACAGATCGATCAACATCGGAAGATT
CAATCGAATCAGCAAGCTCAGTCGATGAATATTTAACGGTTTCGATGAAG
TTAGGTCACATCTGTGATATTGGTGGTTATTTCCAAATCATTGAACCGAA
GATAATTCATAATGAGGATAATAATATTAAGAATGGGAAGATGAAGAGAA
TGTCATTGCTGGAGAAATGGAAAACCTCGAAAGCAAGAAAATGTTTCAGA
TAATATTTTCCACAAGTATCCAATTTCGATGCCAAACTTCGTGCTTGCTT
TTGGACTGTCTACAAGTATCATCCTTGGATTCAAGTTTATTCCTCTCGAA
AGAAGGATTTCTAGTTTTTCCACATGATGCGTACCCTTCAGTATTTTCGG
AAGTTTCGCTTGGGGATACATCTCCGATATCAAAGGGCGTCGTTTTGCCG
CCATCCTCTCATCCCTCACAATGTCTCTCGCTACCATTTTCTTTGGATTC
AGTACCACCTTCTGGTGGGCGTTGAGTTTCCGATTAATCCAAGGCTGTTT
GAACGGACTTCCAATCATCTGTAAAGCAATCGTTAGTGCAATGTGTGATA
ATACGAACCTTTCAAATGCCATGACTCTTGTGTTGGCTTCTTATAATACG
GGCATCATTATTGGACCAAGTTTAGCAGGATTTTATGCTGGTTGGATTGC
ATCAGCGTTTTTCCTTGGAAGAATTCCGTTTAGTCATTCGGTATCTCAGA
AGTCAAAACTGATCTTTTCTGCTATGGCTGACACCATGGTTTTTTCTTAT
CTCCCCAAAATGGTCAAGAAAAATCATTCTAGCCGTCATCATGATCCCTA
AAATACAGAAATGGTTCAGAAGTTTACGAAGACGAGATACAGTCATCGAA
GAAATTCAATCCTCATCTATCTCATCTTCAGCATCACAAAGACCTTCAAC
GACTCCTCTACCCAAGAAATTGTTGTTCGTATTGTTCTTGCTGCAGATGA
ACTATCTTATGGACGAGCTGATTCAAATGGTTAAAACAAGAATGATTGCA
CCATCGATGGTTGGTACTTTATTGACCTGGTCTCTACACAATGTTGAAAT
TGGAACAGACAATCAGAATGGAGCTGACCATACCAACGCAATGGGATTCC
CTTTTAATCATTATTTCACTTTCTTCGTATTATCTCTCATCGCGTTCACC
AACGCTATTATAGCCTTCTGGATACCTTCAACACTAGATAATAGACCTTC
AAAACAGGATTTTCAAAATGATTGCACTTGCAGTGAGGACAGCAGTGGTG
GATTTGAAGATCGCAAAGTAACGGATATAACTGTAAGCTTTTTCAACCCA
ACTCTTGAATTCGACGGTGATGATCAATTGTAAATCAACAATGTGGGTGG
TGCTGGTCCTTGTTTTGGTATTGTTGTTAAGCCCAATGGCTGCTGGGTTT
TTAGCGATCAATATTCTGGTCAATAACACTGTAGAAGAGGATTTATTGGG
AAGTGCAAATGGCCTGGCGATGAGTATGTCTTCTATTGGAAGCTCTACAT
TACGGGAAGTATAGCTTTTGGTTTGGCAATGCCCTTGCTCCCTTTGACTG
GTCGAATAAACAACGAGTCGCTAAAAGATATGGTGCCAGATTTGTGGCAT
GGCACTATCAACACGTGAGATTGGTGTCGCATTTTTAATTTCTGCTGCTT
TACTTCTGATATTACAACTCACTGTTATCACATGGTAACAAATGGTGCGT
AGTATGTTGTTTATTGTACGCTATTTTCTCTGTGGTTGGAATCGGATTGT
CAGAGCTTATACCATTATATTTGGCCACGTCAAGAGACTATGTTCCAAAA
ACAACGAGAAGAATTATCTACTCGATCCAATCGAGAAAAGAAAACGATAC
GATAACGTCTTCGATACAGATCGATCAACATCGGAAGATTCAATCGAATC
AGCAAGCTCAGTCGATGAATATTTAACGGTTTCGATGAAGTTAGGTCACA
TCTGTGATATTGGTGGTTATTTCCAAATCATTGAACCGAAGATAATTCAT
AATGAGGATAATAATATTAAGAATGGGAAGATGAAGAGAATGTCATTGCT
GGAGAAATGGAAAACCTCGAAAGCAAGAAAATGTTTCAGATAATATTTTC
CACAAGTATCCAATTTCGATGCCAAACTTCGTGCTTGCTTTTGGACTGTC
TACAAGTATCATCCTTGGATTCAAGTTTATTCCTCTCGAAAGAAGGATTT
CTAGTTTTTCCACATGATGCGTACCCTTCAGTATTTTCGGAAGTTTCGCT
TGGGGATACATCTCCGATATCAAAGGGCGTCGTTTTGCCGCCATCCTCTC
ATCCCTCACAATGTCTCTCGCTACCATTTTCTTTGGATTCAGTACCACCT
TCTGGTGGGCGTTGAGTTTCCGATTAATCCAAGGCTGTTTGAACGGACTT
CCAATCATCTGTAAAGCAATCGTTAGTGCAATGTGTGATAATACGAACCT
TTCAAATGCCATGACTCTTGTGTTGGCTTCTTATAATACGGGCATCATTA
TTGGACCAAGTTTAGCAGGATTTTATGCTGGTTGGATTGCATCAGCGTTT
TTCCTTGGAAGAATTCCGTTTAGTCATTCGGTATCTCAGAAGTCAAAACT
GATCTTTTCTGCTATGGCTGACACCATGGTTTTTTCTTATCTCCCCAAAA
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ATGGTTCAGAAGTTTACGAAGACGAGATACAGTCATCGAAGAAATTCAAT
CCTCATCTATCTCATCTTCAGCATCACAAAGACCTTCAACGACTCCTCTA
CCCAAGAAATTGTTGTTCGTATTGTTCTTGCTGCAGATGAACTATCTTAT
GGACGAGCTGATTCAAATGGTTAAAACAAGAATGATTGCACCATCGATGG
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GTATCTCAGAAGTCAAAACTGATCTTTTCTGCTATGGCTGACACCATGGT
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CGCGTTCACCAACGCTATTATAGCCTTCTGGATACCTTCAACACTAGATA
ATAGACCTTCAAAACAGGATTTTCAAAATGATTGCACTTGCAGTGAGGAC
AGCAGTGGTGGATTTGAAGATCGCAAAGTAACGGATATAACTGTAAGCTT
TTTCAACCCAACTCTTGAATTCGACGGTGATGATCAATTGTAAATCAACA
ATGTGGGTGGTGCTGGTCCTTGTTTTGGTATTGTTGTTAAGCCCAATGGC
TGCTGGGTTTTTAGCGATCAATATTCTGGTCAATAACACTGTAGAAGAGG
ATTTATTGGGAAGTGCAAATGGCCTGGCGATGAGTATGTCTTCTATTGGA
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CCTTTGACTGGTCGAATAAACAACGAGTCGCTAAAAGATATGGTGCCAGA
TTTGTGGCATGGCACTATCAACACGTGAGATTGGTGTCGCATTTTTAATT
TCTGCTGCTTTACTTCTGATATTACAACTCACTGTTATCACATGGTAACA
AATGGTGCGTAGTATGTTGTTTATTGTACGCTATTTTCTCTGTGGTTGGA
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TGTTCCAAAAACAACGAGAAGAATTATCTACTCGATCCAATCGAGAAAAG
AAAACGATACGATAACGTCTTCGATACAGATCGATCAACATCGGAAGATT
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GATAATTCATAATGAGGATAATAATATTAAGAATGGGAAGATGAAGAGAA
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GAACGGACTTCCAATCATCTGTAAAGCAATCGTTAGTGCAATGTGTGATA
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ATCAGCGTTTTTCCTTGGAAGAATTCCGTTTAGTCATTCGGTATCTCAGA
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TACTTCTGATATTACAACTCACTGTTATCACATGGTAACAAATGGTGCGT
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ACAACGAGAAGAATTATCTACTCGATCCAATCGAGAAAAGAAAACGATAC
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AATGAGGATAATAATATTAAGAATGGGAAGATGAAGAGAATGTCATTGCT
GGAGAAATGGAAAACCTCGAAAGCAAGAAAATGTTTCAGATAATATTTTC
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TACAAGTATCATCCTTGGATTCAAGTTTATTCCTCTCGAAAGAAGGATTT
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TGGGGATACATCTCCGATATCAAAGGGCGTCGTTTTGCCGCCATCCTCTC
ATCCCTCACAATGTCTCTCGCTACCATTTTCTTTGGATTCAGTACCACCT
TCTGGTGGGCGTTGAGTTTCCGATTAATCCAAGGCTGTTTGAACGGACTT
CCAATCATCTGTAAAGCAATCGTTAGTGCAATGTGTGATAATACGAACCT
TTCAAATGCCATGACTCTTGTGTTGGCTTCTTATAATACGGGCATCATTA
TTGGACCAAGTTTAGCAGGATTTTATGCTGGTTGGATTGCATCAGCGTTT
TTCCTTGGAAGAATTCCGTTTAGTCATTCGGTATCTCAGAAGTCAAAACT
GATCTTTTCTGCTATGGCTGACACCATGGTTTTTTCTTATCTCCCCAAAA
TGGTCAAGAAAAATCATTCTAGCCGTCATCATGATCCCTAAAATACAGAA
ATGGTTCAGAAGTTTACGAAGACGAGATACAGTCATCGAAGAAATTCAAT
CCTCATCTATCTCATCTTCAGCATCACAAAGACCTTCAACGACTCCTCTA
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GGACGAGCTGATTCAAATGGTTAAAACAAGAATGATTGCACCATCGATGG
TTGGTACTTTATTGACCTGGTCTCTACACAATGTTGAAATTGGAACAGAC
AATCAGAATGGAGCTGACCATACCAACGCAATGGGATTCCCTTTTAATCA
TTATTTCACTTTCTTCGTATTATCTCTCATCGCGTTCACCAACGCTATTA
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TCGCAAAGTAACGGATATAACTGTAAGCTTTTTCAACCCAACTCTTGAAT
TCGACGGTGATGATCAATTGTAAATCAACAATGTGGGTGGTGCTGGTCCT
TGTTTTGGTATTGTTGTTAAGCCCAATGGCTGCTGGGTTTTTAGCGATCA
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GGCCTGGCGATGAGTATGTCTTCTATTGGAAGCTCTACATTACGGGAAGT
ATAGCTTTTGGTTTGGCAATGCCCTTGCTCCCTTTGACTGGTCGAATAAA
CAACGAGTCGCTAAAAGATATGGTGCCAGATTTGTGGCATGGCACTATCA
ACACGTGAGATTGGTGTCGCATTTTTAATTTCTGCTGCTTTACTTCTGAT
ATTACAACTCACTGTTATCACATGGTAACAAATGGTGCGTAGTATGTTGT
TTATTGTACGCTATTTTCTCTGTGGTTGGAATCGGATTGTCAGAGCTTAT
ACCATTATATTTGGCCACGTCAAGAGACTATGTTCCAAAAACAACGAGAA
GAATTATCTACTCGATCCAATCGAGAAAAGAAAACGATACGATAACGTCT
TCGATACAGATCGATCAACATCGGAAGATTCAATCGAATCAGCAAGCTCA
GTCGATGAATATTTAACGGTTTCGATGAAGTTAGGTCACATCTGTGATAT
TGGTGGTTATTTCCAAATCATTGAACCGAAGATAATTCATAATGAGGATA
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CAATTTCGATGCCAAACTTCGTGCTTGCTTTTGGACTGTCTACAAGTATC
ATCCTTGGATTCAAGTTTATTCCTCTCGAAAGAAGGATTTCTAGTTTTTC
CACATGATGCGTACCCTTCAGTATTTTCGGAAGTTTCGCTTGGGGATACA
TCTCCGATATCAAAGGGCGTCGTTTTGCCGCCATCCTCTCATCCCTCACA
ATGTCTCTCGCTACCATTTTCTTTGGATTCAGTACCACCTTCTGGTGGGC
GTTGAGTTTCCGATTAATCCAAGGCTGTTTGAACGGACTTCCAATCATCT
GTAAAGCAATCGTTAGTGCAATGTGTGATAATACGAACCTTTCAAATGCC
ATGACTCTTGTGTTGGCTTCTTATAATACGGGCATCATTATTGGACCAAG
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GAATTCCGTTTAGTCATTCGGTATCTCAGAAGTCAAAACTGATCTTTTCT
GCTATGGCTGACACCATGGTTTTTTCTTATCTCCCCAAAATGGTCAAGAA
AAATCATTCTAGCCGTCATCATGATCCCTAAAATACAGAAATGGTTCAGA
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CTCATCTTCAGCATCACAAAGACCTTCAACGACTCCTCTACCCAAGAAAT
TGTTGTTCGTATTGTTCTTGCTGCAGATGAACTATCTTATGGACGAGCTG
ATTCAAATGGTTAAAACAAGAATGATTGCACCATCGATGGTTGGTACTTT
ATTGACCTGGTCTCTACACAATGTTGAAATTGGAACAGACAATCAGAATG
GAGCTGACCATACCAACGCAATGGGATTCCCTTTTAATCATTATTTCACT
TTCTTCGTATTATCTCTCATCGCGTTCACCAACGCTATTATAGCCTTCTG
GATACCTTCAACACTAGATAATAGACCTTCAAAACAGGATTTTCAAAATG
ATTGCACTTGCAGTGAGGACAGCAGTGGTGGATTTGAAGATCGCAAAGTA
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CAATAACACTGTAGAAGAGGATTTATTGGGAAGTGCAAATGGCCTGGCGA
TGAGTATGTCTTCTATTGGAAGCTCTACATTACGGGAAGTATAGCTTTTG
GTTTGGCAATGCCCTTGCTCCCTTTGACTGGTCGAATAAACAACGAGTCG
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TCGATCAACATCGGAAGATTCAATCGAATCAGCAAGCTCAGTCGATGAAT
ATTTAACGGTTTCGATGAAGTTAGGTCACATCTGTGATATTGGTGGTTAT
TTCCAAATCATTGAACCGAAGATAATTCATAATGAGGATAATAATATTAA
GAATGGGAAGATGAAGAGAATGTCATTGCTGGAGAAATGGAAAACCTCGA
AAGCAAGAAAATGTTTCAGATAATATTTTCCACAAGTATCCAATTTCGAT
GCCAAACTTCGTGCTTGCTTTTGGACTGTCTACAAGTATCATCCTTGGAT
TCAAGTTTATTCCTCTCGAAAGAAGGATTTCTAGTTTTTCCACATGATGC
GTACCCTTCAGTATTTTCGGAAGTTTCGCTTGGGGATACATCTCCGATAT
CAAAGGGCGTCGTTTTGCCGCCATCCTCTCATCCCTCACAATGTCTCTCG
CTACCATTTTCTTTGGATTCAGTACCACCTTCTGGTGGGCGTTGAGTTTC
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CGTTAGTGCAATGTGTGATAATACGAACCTTTCAAATGCCATGACTCTTG
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TTTTATGCTGGTTGGATTGCATCAGCGTTTTTCCTTGGAAGAATTCCGTT
TAGTCATTCGGTATCTCAGAAGTCAAAACTGATCTTTTCTGCTATGGCTG
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GTAGAAGAGGATTTATTGGGAAGTGCAAATGGCCTGGCGATGAGTATGTC
TTCTATTGGAAGCTCTACATTACGGGAAGTATAGCTTTTGGTTTGGCAAT
GCCCTTGCTCCCTTTGACTGGTCGAATAAACAACGAGTCGCTAAAAGATA
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CTGCAGATGAACTATCTTATGGACGAGCTGATTCAAATGGTTAAAACAAG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_000330	XLOC_000330	Clytia hemisphaerica	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00000558-protein	TCONS_00000558-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000002	supercontig	sc0000002:601440..628417 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR011701	MFS
IPR020846	MFS_dom

Vocabulary: **Biological Process**
Term	Definition
GO:0055085	transmembrane transport

Vocabulary: **Cellular Component**
Term	Definition
GO:0016021	integral component of membrane

GO Annotation

GO Assignments

This transcript is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0055085	transmembrane transport
cellular_component	GO:0016021	integral component of membrane

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00000558 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00000558 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00000558 (transcript) - C. hemisphaerica