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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00000555 ID=TCONS_00000555|Name=TCONS_00000555|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1183bp
CGATTATACCATTTTATATCATGTTGGTGCTAAAACAGACAAATACAAAT
GTATCCAGTCTATCGATATTACGTGTACTGAGGCTAGTTCGTGTTTTCCG
TATTTTCAAATTATCAAGATACAGCAAAGGCTTGAAGATACTTGGTTACA
CATTTAGGGCCAGTTTGCAAGAGTTGGGTCTTCTGGCGTTCTTCTTACTA
ATTGGCATCATTTTATTTGCATCGGCTGCTTACTATTGTGAAGAACAAGT
CAAAGACACCAAATTTCGAAGTATCATTCATGGCTTCTGGTGGGCTATTG
TTACTATGACAACTGTTGGTTATGGTGATATGACGCCTGAAACACTAGGT
GGTCAACTCGTGGGTTCATTCTGTGTGTTGGTTGGTGTCTTAGCTATTGC
ATTCCCAGTACCTGTCATTGTCAACAATTTCACATATTATTACACGCNgc
tcccaaaatctgaacaaatttttacaaaatttctgaaatttcatttaaaa
cttggctcggggtgaatcataagcatgattcttaagcatataataagcat
aaattattcatggatgctttgagaacttaagcatacacgagcctgaccaa
ggggcatacacttgcttataaaaaaaaaaacatgtataataaAAGATAGC
AATAGCCACAGTCTAAACTAAACGTGACAAATGTTAATTATTATAGATTA
TTTTCACAACATTAGTGTGCGGATCAACANGAATCCGATTTAAATCCCGA
TATTAATCGGAATGAGACTTGTAAGAGTCGGAAGAAAAGTGGTGCAAATG
GTTTATTAAGCCTGCAAGATGACGACGAGGATGAAATTCATTACGATCTT
GAATCACCAGTGTGAGAGGTTAACTGATAGAGTGTGTTTTTGACCCTCCT
CCTGCTACTATGAAAGGTGGCTGGAAAGGTGCTCCATAATTGGAAAGAAC
CTGTCTGATGAAATAATGGTCGAAATCCTGCTTTAAAGCTGTTAAAAAAT
CTACCGACAAAACATCATGGATACTATGAATATGAAGAAGAATCGAGTTC
CACCATCCATGATTTGAATCATAGCCAGttcttgaagttttctttaccAT
CACTGGCATCGAACATAAAGCTGTAGATTTTTACAACGGAGATCGTTAAA
CCAGAGATCAGAAATTTTGATACTtcgtataca Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000002:503549..515349- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00000555 ID=TCONS_00000555|Name=TCONS_00000555|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11801bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000002:503549..515349- (Clytia hemisphaerica)
CGATTATACCATTTTATATCATGTTGGTGCTAAAACAGACAAATACAAAT
GTATCCAGTCTATCGATATTACGTGTACTGAGGCTAGTTCGTGTTTTCCG
TATTTTCAAATTATCAAGATACAGCAAAGGCTTGAAGATACTTGGTTACA
CATTTAGGGTAAGCCCCACCTTATTTTTTCTCTAGGGTCCCATAAAGTTT
CAGACGTTAGTTTTTAAATCCATGTTTGTTTATGATTAAAGCTTATACGG
ACAAAGTTTTTTTGTTTACATTTGATTTAGAGATTTTTAAATGCGCTCTC
AGTATAATTAAGTTTTCTCCTTTTTAAAAAGAGATTTGATCTCTCTATCA
TCCTATTTGCTGCTTTTTTGTTAAAAAAGACTTTATTTGAAAGATCTAGC
TTTAAACTCAACATGATTTTTTGAGATAGCTATCTTAAGGATTAAGAAAA
ATGTCGTCAATTTTTTTTGAGATTGACAGCCTCAAATGGCTCATTCGATT
GTCAGAATATAAATTTGTTTTCCAATCTACATGAGTACCTACTCGATAAA
ATCTATCTACACAATCTTTACTTTATATCAAGATTTAAATCAATGATTGA
AACACTCTAGTATTTTGTGTTCAAATGTTTTTTGTGGGGTTTTGATTTAG
ATTATGGTAGGGCTTAAGTATCCTTAGTACTGATCCCTCTTGAGGCTACT
TTTGACGTAGATTCAAGTTTGTTCCACTTCAAATTTTTCTTCTTAAATCT
GTTTTAAATCCTTTTATTTGACTAATAACCAAAGTGCCCGGGATCGTAGA
TTTTTTAGTACATTTACTTTTCACAAAGTATTCTCAAAACTACTTAAAAA
CCTGGTAACAAACACTTTTTCTTTTTCATTTATGTTTCTTTTATAAAACA
ATAGAAAAACAATGCGTACCTATTGTTTGAAAATAAAATCAAAAATGTAT
GTAATATAGTTTTGTATAAAGGGCTTCTAAAAGTTTCAAGAAAAACTTTG
TGTTTAGTTAATTTTTTCAACAAATCTAATTAGAACTTCTACCTCGCATA
GCTCTTCGGAATAGAGGCACCATTAATGGAAAATTCCATCTCTCTTATCA
TACAAACCTTTTTTTAATTGATCTTTTTATAGTGGTCAAATTAAAGTGCC
TCAGGACCACTTTTTTTAATGTTTTCAAGTTGCTGTGTCTTTTAAGTTGT
TAATCAAAATGTGGAGAGATAAAAAACAACAACAATAACGCATTTATTAG
GGTTCTGTGTGTGAATTTTTTCTCAATTTTATGATTTTTTGACAGTTCCT
TTGTCATTTCTGATTGTAAAATTTGACAATTAAGTCAGCCCCTTTTGAAA
AACTGCAGTGTCTTCTGAAAGGATGTTTTCACAGACNATGATTTTTTGAG
ATAGCTATCTTAAGGATTAAGAAAAATGTCGTCAATTTTTTTTGAGATTG
ACAGCCTCAAATGGCTCATTCGATTGTCAGAATATAAATTTGTTTTCCAA
TCTACATGAGTACCTACTCGATAAAATCTATCTACACAATCTTTACTTTA
TATCAAGATTTAAATCAATGATTGAAACACTCTAGTATTTTGTGTTCAAA
TGTTTTTTGTGGGGTTTTGATTTAGATTATGGTAGGGCTTAAGTATCCTT
AGTACTGATCCCTCTTGAGGCTACTTTTGACGTAGATTCAAGTTTGTTCC
ACTTCAAATTTTTCTTCTTAAATCTGTTTTAAATCCTTTTATTTGACTAA
TAACCAAAGTGCCCGGGATCGTAGATTTTTTAGTACATTTACTTTTCACA
AAGTATTCTCAAAACTACTTAAAAACCTGGTAACAAACACTTTTTCTTTT
TCATTTATGTTTCTTTTATAAAACAATAGAAAAACAATGCGTACCTATTG
TTTGAAAATAAAATCAAAAATGTATGTAATATAGTTTTGTATAAAGGGCT
TCTAAAAGTTTCAAGAAAAACTTTGTGTTTAGTTAATTTTTTCAACAAAT
CTAATTAGAACTTCTACCTCGCATAGCTCTTCGGAATAGAGGCACCATTA
ATGGAAAATTCCATCTCTCTTATCATACAAACCTTTTTTTAATTGATCTT
TTTATAGTGGTCAAATTAAAGTGCCTCAGGACCACTTTTTTTAATGTTTT
CAAGTTGCTGTGTCTTTTAAGTTGTTAATCAAAATGTGGAGAGATAAAAA
ACAACAACAATAACGCATTTATTAGGGTTCTGTGTGTGAATTTTTTCTCA
ATTTTATGATTTTTTGACAGTTCCTTTGTCATGTCTGATTGTAAAATTTG
ACAATTAAGTCAGCCCCTTTTGAAAAACTGCAGTGTCTTCTGAAAGGATG
TTTTCACAGAAACATATGACCTATTACTACATATATTAGACTTATTAAGT
GCATATGTGGTCGAGGTTTTTAATACAAAGGCACTTTAAAGTACCATTAG
AGACTACACTATTTAATGAGCTGAAAGTAAATTTCCGTAATTAGGGATTA
AGTTTTTTGATGAATGGGGATTTGTGTTAGTTTAGGTTATATATGAGATT
GCTTAAGTAATGCATAGTATAGTCGGTACCAATCATTTACAGATATATAC
CACCAAAGTCCTTACTAGAGGTTTATCAATAAAATTGCATTCTCTACTTG
TGAGATTGGAAGTAATGTTAAATCCATATTACAGGCTCATTTTGGAGATT
GATTTTTTAAAGATATTCTTTATATCTTTTTGAATATTTTATCTTCAAAT
AAAAAGTCAAAAATCTTGATTTAAGGTCTTGATCTTCTTAACATCAAGAC
TGGCGAGATGTGATAAAAAAATTAAAGTAACACTGTTTAGATTATAAATC
TTATGGAAAAATGAGAGAAAAAAACCAACAGTTTTTAATAAAATAACGAT
CGATTTGTTTATATAGTGGACTTAAATCTCCTACGTTGTTTGATGATTGA
CTGATGGATGCTAATAAGATAGTGTTTTAATATGTGTGACCTCAAGTGTC
TCAAAAAGTCATAAATATAAAAAATCTTGACACGATGTTTAAACCCAAGA
AAGAAATCTCTTTTTACTAGATAACTATCATAGTGAGCAACAGTGGCGGC
CTGGCAGGGGGTGCAGGGTGTGCAGTGCACCACCCAGAAAGACCTGAGAG
GGGCGCCAAAAAAGCTTTTCAAGGGGGCGCCAAAACTCTTTTTGATGTTT
GGTTGGGCGATTTTGCGCCCTTTGACACGTTTTTTTAGCGTCTTCTATAA
GTGCAATGTAAATTTTTTCGCCTGCGGCGCTTCGTTTTATTTTACGAATT
TTTTCAAAACTACTATCAACATTTAATTGCGATAATTCAAAGCAAGAGAA
GTGTTGTGTATCCACCAGGGGTTAAAGGGGATGCTCACCTTCAAAATGAG
AGATTGATCAAAACTGCTCGATGTGGTTTATGTGGTCTTATGCGGACTAA
CTTTCTCCTTTTAAGAATATCTTATAAGCTGTTTGATCTTTCTTACACAA
AAATTTTTTGCCTGCGGCGCCAGAATTAGAAACAACCCTTATTCTTGCCA
ACTTTAGAATTTTTGGGCCCTCTTTCAGCCATTGATCTTTAATGATAAAT
AAAAGTTTGTTAACTCAGAGATTCCGGGCGTTACTTTCAACCAGTCACTG
CTCTTACAGTAGTTTCACTTAATGGTATAGGGCGCAAACGAGGACAAAAA
TACCAGGGGCGCCAATTTCATAGTTTGCACCACCAAGAAAATTAAGCCAG
GCCGCTACTGGTGAGCAACACCAATAAGAATACACGTTTTTTTATAAGAA
CATCCAAAAATTTTGAAGCCTTAGGATGTTCATAGCTTTTTGAGTTTTTA
GCCTAAAAATGTTCTTAACATGTTCTTGTTTTCACCATTTTTTGAGTATT
TTTGTGCGCGTTTTTCTTAAGAAATTCGGTGTTTTAGAGTCCTTAAAGCT
TTAAAATGTCTTAACTTGTTCTTAACAATTTGGCCATTGAAGGCTTATGT
TCTTATATAGTTTGTTCTTATTAAAAAAAAACGTGTACCTTTTCATACTA
GTTTGAGATTTTCAGCTTGTTAAATTGAGTTAAATTTCATTCGCTTTAAA
AGTGTGCACTAATTCTTATTTTGCTTAAAATTTTCATAAACGTTCTATCG
TTGAAAAGATATTTTCAATTTTTCAATAAAGAAATTAAATTTATATCCTT
TTATGATAATAACTTTTTGATACAGAGGTACTTTGAACCTTGAGGATTCC
ATAAATGCAATAATTTTTCCACAGCTTTGTATTGTTAAAAGCTTAGAAAG
TTACATACAGCATGCTTATTCATCTTCTTTATTGATTGAAATCTTTTGAA
GTATGTCGTCTTTCTAATGAAAAAAAGCATATGCAAGGTATATCAATACA
CCCGCCCTTCTCACAGACTCAGTAAAATAACGGACCAAAACTCGATGGGG
ATTTATATTCCCATATTTTGTATAGCTGGAGATTCATATTCTTTTGTTTT
CAAGTCAGAAAATTGTGTGGGGATGGGAAAAATTGCATAATATTTTTGGT
TTATTTGATTATTTTTGGTGAGAACAAAAATTTAAGTATAATTTTCCACT
GGGGACAATATTTTGGCCAATTTTTCCAGTGGGAAGGGGTCCCAGTGGGT
CTGTGAGAAGGGGTATATCAATTGGGCTGTTCTAGAAAAATTTTTAATTG
GTGAGGTCATATTTTACAACAAGATACAGTACAAAGAACTTCATTACAAA
TCTGTCTAACATGTAGTCTACTTTGAGATAAGATCTCACTGCTTTTGGCT
TGTCACGCAACAGAAAAAAAAATCGTCTCATAGTTCACCAACACTTCAAG
TGTAGTCGAAATTTCTCTTGTCTGTTTTAAATATCCCCGTGACATGTATG
TCTTTGTTAGATAAACTCTTTTCGACCATCCACCCCCAGGGTGTGCTATA
CATTCAAATTCTCCTTTGCTTCTCAATGTTAAAGACAGTTTTGTGATTTA
TTGTATTTCATTTCAGGTAACTGTATTATAAGACTAAGCTATAAAAGTAA
TTGAAACTTAACACTTAACAGACCTTTATAATTTAACTTGACCAACTTGT
TCTCTGCTTATGAGCTTGTAAAGTCAAAATTCACTTTTCTAAAAGTGTAA
AAAACACGTAAAAAAGAGGTATCAAATTTGGTATTTTTAGACGTTTTTGA
TATACAGTTTTTGAAAAAAATCTATGAAAGCGCCAGTTTTTATAAAAACT
AGTCTAGTTTTAAACAAAAATTACTTTCAAAGGTGTTTTTATTAATTATT
AATGTCATAAAACTCGTTAAATAAGTCAATTTGTAATGATTTTCTAATTG
ATTGCATGAATTTAATACCTCTTTTTTACGTGTTTTTTACACTTTTAGAA
AAGTGAATTTTGACTTTAAAAGCTCAAAAGTAGAGAACAAGTTGGTCAAA
TTTAAAAAGTGATGGCTAAAATTTTAAGTTAGGATATTTACTTTCTAAAT
ATCAAAACTCCAAGCACTTTGGGACATTTGTTCGGCCTCAGGACGTCGGG
AAACGTCTGAACTTTTTCGTGGGTCACCCGATATGTTTTTATATTTGATT
TAAGCTTTTAAAAGAAATTCTATATGTACTAGGATATACCCTACGCATTT
TCTTGACTTTGACAGCTCCTACGTTTGGTTATTTCAATTGCTTTTCTTAT
AATTAAAGAAATACACATTGCAAACCTTATCATTGAATTTATTATTGTTA
AACTGAGACGATTTCATGTAGGTCTGTCTTCTTAAGAAATTATTAAAAAA
AGAGGCGGGTATCATTAAAATGATTGGCATCTTTTAATATGGGAAATCGG
AAAAAAAATATCAGTTTTTCTTCAGCAAAGCCTCGATGTTGAGATTCGGA
AGCATTTGTATTTTTTGTGTTGATAAGTCTTTTTTGTAATCAATTCATGA
AATGAATGACATAGACAGTCTCTTGGTGATATATTTTCCTGTCGTCATCA
AATTTTTCTTGGTTTAGAAAAATACAAGTGTTGTATTAAATTCATTTTCC
CTTAAATCCGGTGAAACGCTTTATCAAGCTCATGTTAATGCTCAGTTACA
ATTCTGAAAAGACTTGTTTTAATTAAGTGACTTTCAAATTGAAATAAAGT
CGTTGCTTGAATTCTGCAGTTGAACTTTGAGTTGAAGATGGTTAAGGTGT
CTCGTTTTCAAGACATCTCGGATATTTCATGACGTCACTATATACCTAAC
AAATCTCAGATACTTAGAATCACGGATATTCACTTAAAAATTGGTCAGCT
CGCTCGGATGTATTGTCTGATTTGAAAAGTCATATCATATTATATCGCCT
CATCCGCACGAGCTTCCCCTATTTTCAAATGTATAAGCTTAAAAGCCAGT
TGGCACTCTTTTTTGTAAGAACAAGGAATGGATTGGCAGTTTTTTGAGAC
TTTGAGCCACAATTGGGGTTTACCATATACACACCCCCTTCTCACAGACC
CAGTAAAATTTTTTCATTCATTGGGGGTAAAAATAACGGACTGAAACTCG
ATGGGGATCGATATTCCCTTATTTTTAATGACTGGGGATTTAAATTCTTT
TGTTTTATAAGTCAGTAAATTCAGTGGGGATGGTAAAAATAACATAATAT
TTTGTAGTGAGGATTGGTTTATTTGATTATTTTCAATGGGGACAAAAATT
GGTGTATAATTTTCCACCGGGGACGATTTTTTGTCCAGTGGGAAGGGTTC
CCAGTGGGTCTGTGAGAAGTGGGTGTATATACTATTTAAGGGTAAATGAA
GAATTTTATTTTAACTTTACCCTTCATTTACTTGAAAAATGAAGCCGTTC
TTGACTTGGGTTGTTGTTCAATTTCTTTAGTACATCGTTAATTAGTCATA
TGCTAGATTGGATGATTGCAGTAAGCTTTTGCTCAGGATTCTCTCCGAAT
TAAGATCATAATGACCAATAATTGGCTTCTTACAAAAACTGTTCATTACA
TCATACTTTGAAGATGGAGCAGTAATGCTCTCCTATTCTTTAGAAGGGAA
TAAAATGTTACATAACCAATATTCGTTTTAAGAAGGCTCGTCTTATGACA
TTGGCTCAATATTCGTGACGTTCATGACGTAATGTTTTATACGGAAGCAC
CGTAAAAGACCGGGTGTTTGCCACTAATTCTGAATTTGTACAATAAAACT
AGTGGCAAACGCCCGGGCAATTTAGCGTATAAAACATTACGTCATGAATA
TCATCAAATGGAATACTATGATGTTTCTATCTCATTTGACCTTGTTCTTT
GAACTAAACTGATCCAAACTCCATATAGTCAAGTTATCATAGTGAAGGCT
GTTTTGTATGAATGCAATTATGTGTATTTTTGAAGCGTGACCATCAAAAT
ATTGTATTTCTTGTGAAGGTCAAATTATTTGACTCTGACACAGCCAAGTT
TAAGTGGGGTGTCTTAAAATCGAAATACCGTCCAGACTTTGGGAATATAC
CCTATTACACAAGTTATTAAACGCGAATCGGTTACCCTCGCTTTAATTAC
AACCGTTTAACAAAGTGTGAGCCGTGGTAATTTTCGAAAACTCTTGCACC
TTAATAAATTGTAGCATTCATTTTTCCCGCGTTAAATACCTGATTAGTAA
GTGTAATAAGGTAATTTTCCTTTCTAAATATTCCTCAGAGCGATAATGTA
ACTGTAAGTGATAAACTATATAATAGTTGATATAGAAGATTCTTTTAGTT
CGGGGATGCTTTTTTAGTTTACTTCGTGTCTATGTGTCTTAACGCCGTTA
AAGTTTAACACATTCACTTTTTGCAACCAAAGTCTTCCGCAAAACCTGTG
GAAAAATTGAAATATTGGCAGACCTACCTAATCGAAGTAACGAAAGTGCC
AAATGAATTTCAAATTTAGAAATTTGAAAAGAAGTAAAAAATTTCAAATT
TCAAAATTTGAAAAATGAAAAATACAAAAAAATTTTGATTTTCAAATTTT
GAAATTTGAAAATTTTTACTTCATTTTAAATTTCAAAATTTGAAAAATGA
AAAATACAAAAAAATTTTGATTTTCAAATTTTGAAATTTGAAAATTTTTA
CTTCATTTTAAATTTCAAAATTTGAAAAATGAAAAATACAAAAAAATTTT
GATTTTCAAATTTTGAAATTTGAAAATTTTTACTTCATTTTAAATTTCAA
AATTTGAAAAATGAAAAATACAAAAAAATTTTGATTTTCAAATTTTGAAA
TTTGAAAATTTTTACTTCATTTTAAATTTCAAAATTTGAAAAATGAAAAA
TACAAAAAAATTTTGATTTTCAAATTTTGAAATTTGAAAATTTTTACTTC
ATTTTAAATTTCAAAATTTGAAAAATGAAAAATACAAAAAAATTTTGATT
TTCAAATTTTGAAATTTGAAAATTTTTACTTCATTTTAAATTTCAAAATT
TGAAAAATGAAAAATACAAAAAAATTTTGATTTTCAAATTTTGAAATTTG
AAAATTTTTACTTCATTTTAAATTTCAAAATTTGAAAAATGAAAAATACA
AAAAAATTTTGATTTTCAAATTTTGAAATTTGAAAATTTTTACTTCATTT
TAAATTTCAAAATTTGAAAAATGAAAAATACAAAAAAATTTTGATTTTCA
AATTTTGAAATTTGAAAATTTTTACTTCATTTTAAATTTCAAAATTTGAA
AAATGAAAAATACAAAAAAATTTTGATTTTCAAATTTTGAAATTTGAAAA
TTTTTACTTCATTTTAAATTTCAAAATTTGAAAAATGAAAAATACAAAAA
AATTTTGATTTTCAAATTTTGAAATTTGAAAATTTTTACTTCATTTTAAA
TTTCAAAATTTGAAAAATGAAAAATACAAAAAAATTTTGATTTTCAAATT
TTGAAATTTGAAAATTTTTACTTCATTTTAAATTTCAAAATTTGAAAATC
AAAATTTTTTTGTATTTTTCATTTTTCAAATTTTGAAATTTGAAAATTTT
TACTTCATTTTAAATTTCAAAATTTGAAAATCATTTGGCACTTTCGTTAC
TTCGATTCTACCTATCGAAACACTCTCCAAAACATTGAAAATTCAAGCGC
TCGCGCGTCGCGCTGTTAGTACTTGTTTATTATTGCAAGAAACATTTCAA
TAAATGTTGAATGGAAGTTAACATTGATTATTTTTGTCTCTCTGTCTCTC
TAGAATATCATTAATAATAAGGAAAAATTCGTTTTAAATGTTAATCCATG
TTCTAATTGTTTGATTCATAAAGAGATGTACAAGTTCACATGTTTCTTAT
TCACAGTTGCAACTGTGAGGGCACAGCTTCTTTTCGGCTGGCCTAACCTA
CCCAAAAGGTTTTGAAAAGCATTAGTTAAACAAACTTTGTCAATCTTTAC
GTCATGATATTATAATATGTCATTTATTTCATTTTTCTTGTAAGCTTGTA
AATGACTACCCTTTTGGTCAGTTTTTTTTCAATGCTCGATGCACGTTATT
TCAAATTCTTTACTGTACTTCCCAGCCCAGGGGGGGAGACTCGACTCAAA
GACGACCTTATGTGCGGTTCAAAATTAGGCCTTTGGAATAGGACCCTTAC
AGTGCAAAAAGAAAATGTGGCTAAATTTGAGTCAATTTGGGCGAAAAATT
GACCCTTACGGTGTGTTTTTTTGAAATTTTTCGACCATATTAAGAGGTCG
ATGTCTAAGTAGAAGACAAACTGAATTTTCAATCAACCATAAATTCTAGT
TCACCTAGGCCGTTTAACTTGTACAGAATATACCCAATTAAATTCTTCTT
AAAGCGACCGTAGTGCAGTGGTAGAGCATCCGGCTACGGTTCACAAGGTT
GTGGGTTCAATCCCCAGCCGGATCATACCAAAGATTCCCAAAATGGTACT
TGATGCCTCTCTGTAAGTGGAGCAATCCAGGGAGAAAGAGTGGCGCCCTC
CCCTACCTTCGGGTAGATAGCTATCGAAAGAGGAGCGGTCACAGACTTAC
TTACTACATTCTTCTTCAACTATTACGATCTCATTAGAAATCTCTTCTAG
ATATTCTGAACCACTTTTTTCATTCTTTACCTTTTACAGGCCAGTTTGCA
AGAGTTGGGTCTTCTGGCGTTCTTCTTACTAATTGGCATCATTTTATTTG
CATCGGCTGCTTACTATTGTGAAGAACAAGTCAAAGACACCAAATTTCGA
AGTATCATTCATGGCTTCTGGTGGGCTATTGTTACTATGACAACTGTTGG
TTATGGTGATATGACGCCTGAAACACTAGGTAATTCACGTGGACAGTTCT
TACCACATACATGGCATGGTGTTTTTTTTCACTTTTAAAGGCCGGTCTCC
ACTTGCGCGCGTTGCGATCGCACTTTTTGGCTTCAATCCTTTTTGCTGGG
AAAAAATAGATTACGTCATAAAAATGTAGCGCGCGCTCGAAAAAATAGTT
GAACACATTTCAACTTTTTTCAACCGTTACGTCAGATCGTGCCATTTTTC
ATTTGACCAATAGCGTGGAAGCTTTACTCGAAAAAGTGCGATCGAAGCAC
GCGCAAGTGGAGACTAGCCTTAAAGCTAAAGTAAGTTATTCGGGAAAGCT
TCTTACTATTTTATCTATATACACGTTTTCTTATAAGAACATCTAAAATC
TTTGAAGCCTTTCTAAACTCTTTTTAGTTTTAGGCCTAAAGTGTTTTTTT
AAATGTTTCTATTTTCACCATTTTTGTGAAAGTTTTGTGCCATTTCCTGA
AGAAATTTGGTGTTTTAGGGTCCTTGAAGCCTTAAAAAGTCATTGTTAAC
TGAAGGGACTATTGACCTTGTTCGAGTTAAAAAGGCATTCGAGTTATAAA
GGTTTGAGCTTAAGAGAATCTACTATAGTAAGAAAAATTGTGATTGTAAT
TCGTTTTCCACATTGATAACAATATTCTACCATAAAATATACATTATATA
TCTTTTCATATTTCAGGTGGTCAACTCGTGGGTTCATTCTGTGTGTTGGT
TGGTGTCTTAGCTATTGCATTCCCAGTACCTGTCATTGTCAACAATTTCA
CATATTATTACACGCNGCTCCCAAAATCTGAACAAATTTTTACAAAATTT
CTGAAATTTCATTTAAAACTTGGCTCGGGGTGAATCATAAGCATGATTCT
TAAGCATATAATAAGCATAAATTATTCATGGATGCTTTGAGAACTTAAGC
ATACACGAGCCTGACCAAGGGGCATACACTTGCTTATAAAAAAAAAAACA
TGTATAATAAAAGATAGCAATAGCCACAGTCTAAACTAAACGTGACAAAT
GTTAATTATTATAGATTATTTTCACAACATTAGTGTGCGGATCAACANGA
ATCCGATTTAAATCCCGATATTAATCGGAATGAGACTTGTAAGAGTCGGA
AGAAAAGTGGTGCAAATGGTTTATTAAGCCTGCAAGATGACGACGAGGAT
GAAATTCATTACGATCTTGAATCACCAGTGTGAGAGGTTAACTGATAGAG
TGTGTTTTTGACCCTCCTCCTGCTACTATGAAAGGTGGCTGGAAAGGTGC
TCCATAATTGGAAAGAACCTGTCTGATGAAATAATGGTCGAAATCCTGCT
TTAAAGCTGTTAAAAAATCTACCGACAAAACATCATGGATACTATGAATA
TGAAGAAGAATCGAGTTCCACCATCCATGATTTGAATCATAGCCAGTTCT
TGAAGTTTTCTTTACCATCACTGGCATCGAACATAAAGCTGTAGATTTTT
ACAACGGAGATCGTTAAACCAGAGATCAGAAATTTTGATACTTCGTATAC
A
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00000555-exon-sc0000002-1575043694:515192..515349 | TCONS_00000555-exon-sc0000002-1575043694:515192..515349 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00000555-exon-sc0000002-1575043694:505071..505260 | TCONS_00000555-exon-sc0000002-1575043694:505071..505260 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00000555-exon-sc0000002-1575043694:503549..504383 | TCONS_00000555-exon-sc0000002-1575043694:503549..504383 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00000555-exon-sc0000002-1510915933:515192..515349 | TCONS_00000555-exon-sc0000002-1510915933:515192..515349 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00000555-exon-sc0000002-1510915933:505071..505260 | TCONS_00000555-exon-sc0000002-1510915933:505071..505260 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00000555-exon-sc0000002-1510915933:503549..504383 | TCONS_00000555-exon-sc0000002-1510915933:503549..504383 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00000555-exon-sc0000002-1491911889:515192..515349 | TCONS_00000555-exon-sc0000002-1491911889:515192..515349 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00000555-exon-sc0000002-1491911889:505071..505260 | TCONS_00000555-exon-sc0000002-1491911889:505071..505260 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00000555-exon-sc0000002-1491911889:503549..504383 | TCONS_00000555-exon-sc0000002-1491911889:503549..504383 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000002 | supercontig | sc0000002:503549..515349 - |
Blast
BLAST of TCONS_00000555 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: KCNA2 (Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2 OS=Homo sapiens GN=KCNA2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 129.413 bits (324), Expect = 5.263e-33 Identity = 72/120 (60.00%), Postives = 94/120 (78.33%), Query Frame = 3
Query: 108 KLSRYSKGLKILGYTFRASLQEXXXXXXXXXXXXXXXXSAAYYCEEQVKDTKFRSIIHGFWWAIVTMTTVGYGDMTPETLGGQLVGSFCVLVGVLAIAFPVPVIVNNFTYYYTXLPKSEQ 467
KLSR+SKGL+ILG T +AS++ELGLL FFL IG+ILF+SA Y+ E ++++F SI FWWA+V+MTTVGYGDM P T+GG++VGS C + GVL IA PVPVIV+NF Y+Y + E+
Sbjct: 306 KLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADERESQFPSIPDAFWWAVVSMTTVGYGDMVPTTIGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEE 425
The following BLAST results are available for this feature:
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