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transcript sequence >TCONS_00000207 ID=TCONS_00000207|Name=TCONS_00000207|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1217bp CAGTTTTAAGtttgaataaattaaaaacaGCCATGGGGTTTCGTTCAAAG AAGAATAAGGATGGTGAGAAAGGGAAGAAATTACCAAAGCGTAAAAACGG GACGTCTCAACGCAAGAAGAGTAGCGTGAACAGTGTTTCAATGGACGCTC CGGTCAAAGATTTCATTGTTCACGTTTATAATAATTTACATGAATCGACG GCTATGAAATTTACTGATGAACAGATTGAAGAGGTCAAAGAAGCATTTGC AATTTTCGATAAAAATGGTGATGGCACAATCACGACGAAAGATTTNCATT TGCAATTTTCGATAAAAATGGTGACGGTACAATCACGACGAAAGATTTGA TTACGGTCATGAGGTCGTTAGGGAAAAACCCAACAGAAGATGAAATTGAC GACATGATTAATGAAGTGGATACTGATGGTAATGGAGTGATTGACTTCAT TGAGTTTCTGGAGATGATGGCCAAGATGTCAACAGATGTTGATGAGACAA TCAAAGAAGCTTTCTACATCTTTGACAGTGATGGTTCAGGTGCCATTAGT TCAGAGGAGTTTCGTAAAGTGATGATGACGTTAGGTGCTCAAATGACTGA CGAAGAAGTGACAGAAATTATTGAAGAGGTTGATGTGGATGGTGATGGTC AAATTAATTTAGAAGAATTCGTTAACATGTTGAAAGGTGGAATCTAAAGA AAACACTATAACACAACCACTACAACAAATTATAAATGAATTTGCAACAA TcaacaaaaacgaaattaaTAATTCCGACCCCGACATTGTGCAGTGAATA AAGGCGGCGAAAAAATGTGAGCAGAAAAACATAACTTGCAACAGCTTTCG AGTCTTTGAATACGATTGTTTTCCGACATGATCCGTTATTGTTATTTGAG CTGGCGCATGACGTCTATTTGACGTTGTTTGGGATGTTATGGACGCAAGA TGAATGTTACTTTGACTTTGTGTACCCGCTTGAATGCGAGTTGTTGGCGG AATTGGAGGAAAACAGAACAAAATGGAAATCTGATGATCGTATGCAAGAT TGAGAAATGAATGAATCCATTCACAGAAAAAAACGTTGAATATTAtgaac aattttaaaatataagacaaaaatatttttaatacatAATATCTCTTACG TGCGTATTTCAGGAACTGAGCAGAATTTCTATGTCTTTCAATGTGCCTTT GGCGAAAGAAGAAATAC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000001:1202685..1224868- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00000207 ID=TCONS_00000207|Name=TCONS_00000207|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=22184bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001:1202685..1224868- (Clytia hemisphaerica) CAGTTTTAAGTTTGAATAAATTAAAAACAGCCATGGGGTTTCGTTCAAAG
AAGAATAAGGATGGTGAGAAAGGGAAGAAATTACCAAAGCGTAAAAACGG
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TCGTTACATGGACGTTATGGACGTAAAATGGACACAGAAACAATGTTGGG
TGTAAGCTGGGTACTAGCGCAACATTCGTTTAATGAAGACCAGCTGAAGC
AGAATGCATTAATAGAAATTGAAATCAAAGAGCGCTTCTGTAAATGCAGT
ACAGTAATATCGATAGTGAAATTGAAGTTTTAGGGTTTTTAATGATCCAG
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CTGCTAAACAATGAAGATTATATTTTGATATGACGTGGTAAAACAGTCTA
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TCGTATCAGTTAGAAAGTTAGTAGAAAAATTGCTAGGATAACTAGAATAA
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GTACCAAAGAATGAAGACAAAATTGCGACTTCTTTTATTGAAGACACGGT
CAATTCGGTAAGGTTTCTCATATTCTTTACTATAATTCATAGTTGTTATA
GGGTAATAATGCCTCTACAGTCCCCTCTAGGCAGAATAAGTTTTAACACT
GTGGAAAATGTTTGTGTATTTTCAAAGAAAAATGGCTGTGTAAGAATTTT
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TTTTTTAAATTCATGGGAAATGATTCTGTAAAATTGCAGGATCCAGAAAC
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TTGTTTCTTTTGTATTAGAACTTTACTTTACTGTTCAAGAAAATAACTTC
AAAATTCCTTCCTAGCAAAATGCTTAGCGACAGATCAAGATAAATTTCAG
AAAAGAGCTTCCAGAGGCATTTTCCTTAGCACCTCTACAAAGCTCAGATC
TTTCCTGATTAGTTTGGCGTCATAGCCTATTGACGTAACGGCGCTTACAT
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ATCGAATTTTAAAGGTATTAAAGTTATAAAATGGGGTAGAGTTTAAATTA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000001 | supercontig | sc0000001:1202685..1224868 - |
Blast
BLAST of TCONS_00000207 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: CALM3 (Calmodulin-3 OS=Homo sapiens GN=CALM3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 137.887 bits (346), Expect = 1.971e-38 Identity = 85/130 (65.38%), Postives = 103/130 (79.23%), Query Frame = 2
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The following BLAST results are available for this feature:
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