XLOC_044781 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_044781
Unique NameXLOC_044781
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_71:138569..144342+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044781 ID=XLOC_044781|Name=XLOC_044781|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=5774bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_71:138569..144342+ (Clytia hemisphaerica)
ATGTCTTTCACTATAAAAAGGCTTGGAGATTCTTCAATCAACCATCTTCA
CTCATCAGTCCACTCAACAACGTAGAAGACCACCACAAAAATAACACCCA
CAAAAATGAAGTTAATCATCGCTTGTGCCTTGGTTGCTGGTAAGGCTTTC
attgtcatttttattttttggaatatttttcgtCTGATCAACTTAATTTT
TGGTCGAACCGAATTATTGAATATCTAAAGTTTGATTTCTTAGGCCAAAA
TTCTAATTCAAATTACTCAATATGTTTTAATCTATTTCCTTGTAAATTGG
CTATTGGAAAAACCTTCGTATATACAAGAGTAGACTTTATGAATAATCCc
tgtttttgtatcttttttgcAGTTGCCGCAGCTATTACCAACCCACCAAT
CACTGGAACCACACCACCAGCTATTCCATGCCCAAACTCATTATGCCAAG
GAAAATATGACGGAAACTTTGCCCTCAAATCACACAGAAACTATTTCCTC
CAATGTGTCGGTGGAAACGCTTATTGTCAAGCCTGCTTCCCACTTTCTTT
GGAATTCAGTCAAAGATGTAACCAATGTTTGTACAACCGCAAAGACGAAT
GTGTCACCACACAAAAATGGGAGCCAGCCACCACCTTTGCTTGCCCAGAC
AAATGCCCAGCCCGTGGACCAGACTTCACTGGCAACATTAAAGATGATCA
TGAACCACGACAATACGTTGCTTGCTGGAAGGGAGTTACTGTTGGATGTA
TCGCCTGCCCAGGAAACTTGAAATTCAACGAAAAAGAAAACGCCTGCTTG
TACGAAGGCAAATACCTTACCGCTCCATACTAAATTAAAAGNNNNNNNNN
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attgtttgtttgcttgattCAAGAGAGCTCAAAATTAGGATTTTCGATTC
CAACCTTGAATGTAAAAGCAATCATGATATTGACAACAGACTCATTAAGA
TTAATTACGATTCCTCAGACAGATTTTAACAGGAAACATCGGAACAACTG
TATCTTAGGAAAATCATCGCAATTCATAATTACTGGTATCTAAATAAGTA
TACAAGTTATGTAtgtatttatcaaaaatcctGTTGAGTAACAGGATGTG
CAGCCAATATTTCTATAGCTCGtttgtttttcaaatgaaattctCCATGA
TTGGCAGTAATTGAATGATCAGGCAGGACTTGTCAACTGGATGATAGATT
GTTGATGAACATGAAGAAGAACACATTCGTATCTATTCTTCTCCTGGTTT
GTGGTAAGTAAAATCGACCAGACAtttctgttaaaattttataataattt
tttttgtctctTCCAAAGTCGCTCTAAGggttaaagaaatcaaaacattt
caaagtagtccctctaagggtcggaaaattcacatCTTTTAGGAagtatt
tttgatttccagaaaagaaattgtaaaaatgtCTTTAACTAAGGGTAaga
tatttttcagaaatcgaagaaaatctttcaatgaAAGCAGATCCTTTTTA
TAGAGTTTTAGAGGGTTCTAGTGTGCTTCTGTGGACAACCCCTTTGATGA
AGATagattagcctggatatccagaccattaaacttttattttcactttt
aagtTTCAGTACtttaagaaacatttttaaattttataccAAGACAGCAA
GAAAGCCAAGGCTAACTTTAACTTGCCTGTTGATTTTAGTTGAGTGTATA
AGGTTATTACACCACGGAAAACTTGCCATACAGTTTAGAATACATAAAGT
GAACTGTCTTTAACGCGAATggctccttaactcgaacagatTTTATGgac
ccttcagttaacaatgcttcATTACTTTACTACACCCCGGGGGGGGGNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAAAAATGA
AGTTAATCATCGCTTGTGCCTTGGTTGCTGGTAAGGCTTTCattgtcatt
tttattttttggaatatttttcgtCTGATCAACTTAATTTTTGGTCGAAC
CGAATTATTGAATATCTAAAGTTTGATTTCTTAGGCCAAAATTCTAATTC
AAATTACTCAATATGTTTTAATCTATTTCCTTGTAAATTGGCTATTGGAA
AAACCTTCGTATATACAAGAGTAGACTTTATGAATAATCCctgtttttgt
atcttttttgcAGTTGCCGCAGCTATTACCAACCCACCAATCACTGGAAC
CACACCACCAGCTATTCCATGCCCAAACTCATTATGCCAAGGAAAATATG
ACGGAAACTTTGCCCTCAAATCACACAGAAACTATTTCCTCCAATGTGTC
GGTGGAAACGCTTATTGTCAAGCCTGCTTCCCACTTTCTTTGGAATTCAG
TCAAAGATGTAACCAATGTTTGTACAACCGCAAAGACGAATGTGTCACCA
CACAAAAATGGGAGCCAGCCACCACCTTTGCTTGCCCAGACAAATGCCCA
GCCCGTGGACCAGATTTCACTGGCAACATTAAAGATGACCATGAACCACG
ACAATACGTTGCTTGCTGGAAGGGAGTTACTGTTGGATGTATCGCCTGCC
CAGGAAACTTGAAATTCAACGAGAAAGAAAATGCTTGCTTGTACGAAGGC
AAATACCTTACCGCACCATACTAAACACAATCGAACGAAGTCGTAAAACG
AAAATCTCAAAACAGAAAACTCTGTTTTTACATCTTCACTTCACTTTCAT
TCTTTAGAATCCAACCTTTCTTGCAAGCCTCTATCTTGTTGTTCACTTTC
CTGTCTAACCCTGTAACTGAAAATCTTACTCTTCTATGAATTTCCTTCCT
TctctatttttgaaattttctataatTCTATAATATGATAATTTATCTTA
TTGTAATATTTAtctaaatgtttcaaaaatattttttcatctgAAAGAAA
CTACACCTAAAAATTATAAAACCG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00072103TCONS_00072103Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00072104TCONS_00072104Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00072104-proteinTCONS_00072104-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_71supercontigscaffold_71:138569..144342 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0.07	0	0	0	0	0	0.17	0.16	0	0.04	6.95	46.47	23.3	30.9	1.29	0.05	0	0.27	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0