XLOC_044521 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_044521
Unique NameXLOC_044521
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_63:448264..489209+

Legend: gene
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>XLOC_044521 ID=XLOC_044521|Name=XLOC_044521|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=40946bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_63:448264..489209+ (Clytia hemisphaerica)
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AAATTTCACGACAAAAATGACGATTAAACCAAAACAATCAACAGCAAAGG TCTGGGAAGGATGTCTATATGACCTGTATGCACATTCTTTTTTCCTTGCG TTTCCAGATCCACCTTCGGAAGGAGTGAGCAGCGGATATGAAAGTATGAG ATGTGAAAGTAGTGCTAATATTCATTCATCTGACAGTTCAAGTGAAAAAG GAAAATCACCAAGACCTAAAGGtaagaatttgatttttttttcgaatttt aaaGGATTTGATGAACTCGAAGACTTCTAATGagttatttgaaatatttt tgatgtctGTGCAAAGAAAAGGACAAGTCACTTACTGGGCTTTTGTCCTC CATCACCATTGATACTCGAATAAGAAGCTTGAGATTTTACCAGAGTTGTC GTCCTGAAAATTTTGGGACAAAGAATAAGATTTAACATAATCAATGCATT TGACAAAATTGCAAGGATCCTGATACAAAATATATAGTGAATTATCTTTT GCAATACCTTAAAGGCTTCATGGTGTTGTGAAACTATACTTATTGGTAAA CATGTCGGTAACTAATTTCACTGGCTAGggcgtttgctgaaaatttcgtt aCTTGCTTAttctttttgaagatattttattcGAAAAAGCATTAGagata ttcttcttttttttaattttagactCAGTTAACAAAACTATTTACGAGTT AGATGACGAAATTCGCGGGATAAATGTGAAAGACGAAGATAAAGCACGTT TCGCAAAAACATCCTTATTTCGCGCACAAATCAAAGAGTTGATTGGACAA CGACAGGATTTGAAGGAAGAATTACAACAAACGCTGAAGAGACTGGTGCT GAATCGTGTTCCTCTTCCAGACATTGATGGTAAgaagattttaaaataat tgcttttcatttttcatggtAGCCTGTACCTAAACACTAAAGACCAATTT TCGTGAAAAAGAGTTTGTTACAGGATCACTTATAAACCTTGTCTTCCGTT TTCTTTATTATCGATAAAACCTCTGAAGAATGTTccattcaaattgaaaa aaacaatcTAATCCATTTATACTGACCAAGGACTTAGTATTAACGGAGAC TCAGTAATGATCTTGATGTATCTTACATTGGTGGAAATTTCTGAGCTGGA AGACTAGTCGCAATGTTTTACCAGCTGTTGGTTTCACTTAACGTAGCAGA ACAGAAGTTCAGCATTACATTTATTTCCAAGTTTGCTAGAGAAAATCACT TTTTTTCTCATAGAACGCCTACGTGAAATCTCCATGCAGAATCGAAACAC CCCACAAGTTCTATCAAGAGAAAATCGAATTTTGGAACGAAAAGTTCGCG TATGTAAATCACACTTGGAACTTGTCTCGTGCTTAGAGGCTAACAAACAA AAACCTCAAAAGAAACGAACAAACTATCAAAAACTTTCGGCTAAACTGAA AGCCAAATTACTGAAATCACCGCCTATAACGCCAAGCAGGAAAGCCTACA AAGTCACTTCTGTTTAAACAGCAATGAACATATTTTAGggatattatatt attttttgatttatattaTCTGTGGGTGGTTTGGGATCATGTCTGTCTCT CTAAAAGGTGTACCATTCGTCTTTAAACAAGGTATTCGTAAATCGGCAAT TAAAGTGCAattaactctcgctaattcaagCTCAAGCTTCTAATTTGTTC GCAATTCAAGGGTCCACTATGAAGAATGAAAAGTTGTGACACCCAGAAGT AATTTTTTAATAACtgtaaaagtgaaatatttttattttttgtccaAAGA TAAAAACTCtgtaaaaccaaaatataacggttatatttttccaccgtttg aaattttatttcgtATTTTAAAAATGACGGTTTATTACTTtgtaaaaata gttttttgtttttctctctgTAAAACGTAAATTGTAACAACTTTGTAAAT AAATTACTTAAAATCAAACCATTAAAACTTTTGTACATATTTCTAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00071654TCONS_00071654Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00071655TCONS_00071655Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00071656TCONS_00071656Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00071657TCONS_00071657Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00071654-proteinTCONS_00071654-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_63supercontigscaffold_63:448264..489209 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.08 0.09 0.15 0.1 12.34 11.23 47.18 47.16 19.83 30.09 8.37 11.94 8.68 6.66 1.3 1.35 16.47 23.21 15.19 21.59 10.64 11.65 5.34 7.75 13.41 11.82 28.86 24.72 0.58 0.37