XLOC_043918 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_043918
Unique NameXLOC_043918
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_56:946117..958217-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_043918 ID=XLOC_043918|Name=XLOC_043918|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12101bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_56:946117..958217- (Clytia hemisphaerica)
CGGAAAAGTGACTATCAGCGATCCGTGGATAAAAAAATAAAATTAAAAAA CGAAAGTGACTATTGGCCATCCGATATAAGAGCAACCGACTGCAGCAAAC AGCGGTTACCAGGCTGTCGCATGAAAAAATATTTAAGAGAAATTTGTAGC TCAGACTCTAGGCTACCTTTAGTAGACTATTTTGCAAAATGTTTTTATTC CTTAGATAGTCCTCATATAGTACTATTCTGTAAACTAGTCATTTTTGCAA GTTTGTTTTGAAAAGTCTACCTGGTTTTACGCACGCAGATATAACGGGGC TTTTGTAGCTAGTTTTTAGATAGTAAGTGTGTGTATGACTCAAAAGTTCG ATTCACGTGGGAAAGCGCCGTGCAGGACAGACAGAATTTTTTTGTAAAAT CTTCAATAATTTTATTTTTTATAAAAACTTTTATATATAATATTCAATAT GTCAGAAGGTGGTGATACATTTGAAGACTTCTGGGGTAAGTTTTTAACTC TTTTTTATTACTCTTTTATGTTTGAGTTCACATTCATTCTGATGCTCAAT TTTCCCAGCAAATTAGCAGTTTTAGAGGAGTCATTTATTTAAATTTGTTG AGTATTTCCAAAGTTATTCCATTTTTAAAACACAAAAAATCACCCTTTTA AAGAATTGTCTCCTTACCCTGCACCAGCACAGGTGTTGGACTTGGAAATC AGTTCGGGAAATTGCATAGATCCGCAACGTTTCAAAATTTCGCAATTTTG CGTTTTTTTGCAACGATTCCCTCAGCGTGCGCTGCAATTTTTCGCAACGT TCCCAATGGAAGTGTGCGATTATAAACACCAACTATGACGACCAATTTTC GCAAACAAGCAAAATTAGGCAAAATCTGGCATATTTGAACAAAGTAGCAT TTCTTCTAAGAATGATTGTGAATAATCGCCAGGTAGGAAATTAAAATCCT 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TTAGTTTTGATATATCTATTTTGGTCCACGCCTTTGCCATTTTTTAATTT TTATGTTATCCTTGTAACGAATACCTTATTGGAACTAATTTTTGCGGGGA TTAATTTTATAGTGTTTTTCGCAGTTTTTTTGTCAAAATCGCAAAAATTT GAGTCCGCAAAAAATTTTGAGAGTTAAAAACTGGAAATACTTTTTTTTTT CAATTTTATCAAAAATTTGAAAAATTCCTAGGAAAATGAAAGAAATTTGT CCAAAAAAGAGCAAAACCCGCGAAATGAAATTTTTTTGATTTTTTTTTTG ACCGCAAAAATTAGTTCNATGTTTATGTTATCCTTGTAACGAATACCTTA TTGGAACTAATTTTTGCGGGGATTAATTTTATAGTGTTTTCGCGGTTTTT CGTCAAAATCGCGAAAATTAGTTAAATAAGGTAGATAAAATGAATTCTTT TGCTTTCAGGTTGAACCTGAGCCGGAACCAGAAGAGTCAGACGAAGACGA AGATGAACCTGAGGAAGGAGATGAAAGTGGTGAAGATGAAGAAGGTTCTG AAGACGAAGAAATGGTATGATCTATGGATATTTATTACAGATATAATACT CCTGAGAATCTAAATTTTCTATGGAAAGGTGTTGGAACAGATCTTACTTA TATAAAGTTAAATCCTCAAAACTCATCACCTTGCTGAAATTTAGAATGGA CACACTGTATAGTCTATTAATAAGCGTGTTTTTCAAATGTTGGTCATGTT GTTGTAGGGTAATCATGAAAGAATCTTTGCTCTGCTGTCCCTTTACATTA TCTTTATAATTCTCCCTTTCATTAACTTCTGCGAGTACAACATAACAAAA GATGGTTCACAGTAAGTTAAAAAAGCTGCTCTTTACTTTTTGTAGCCCAG TTTATTAGACGGTGAGGCGGTCGAAGATGACGATGAAGAGAGTGAGGACG 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TTCAAATGTTTTCTTTTATTTCTAGGGTACGGATGAAATCAAGTCCCTCC TATTGAAAGTAAGCACGATTGAATTATTTAACCTAGCTTTTCTTTTATAT TCTATTCTTGGAATTTGTGTAGCAGTTTTGATTGAATATCTTTTTATTTT CAAGCTTGTTCTCAGGAAAAAATGCAAAAATTCTGTTGGAAGAATTCTAT TAATTGTCTAAACCTTTTTTTTAGTCGCCAAATCTACCAAAGAAATTCGA TAAATTTGCAAATTATATGAAAAACAATCTGAAAGTTACGGATAAAAAGG TGAATTTACTTTCAATATTGTACCTTCATTGTTGTGTGCTTTCACTGATT CTAATTTGGTGAACCATTCAATTTTCGTGGAAATGGGATCGGGAGCTAAG CTGTTACGAGAAGCTACCGCGGAAACTCAATGTCACTACACCTCTCCCTA TCTACAACGCCTTTTTGGACCTACCCTGGTGGGGTGGAGGTCCTATAAAT TTACCTGTGTTAGTCCGTTCGTCCGTCCGTCTGTTCGTTCGTCTGTTCAG GATTGAATCATAGGAATCTTTTGATTTTTGGTACAAAGGTGCAAAAATGG TAGTGGCCAAAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAGAAAAAAAAAATTTGG GGCAAATTTGGGCAAAAAAAACGGTTAAAAAACGGTTTTTTTGGACTTTG TGAAAAATTGGATCATTAATTTTTTGCATGAAAGTAGGCTAACATCATTG GTAAAAGATGGCTCAAGCAGATTTTTGCAAAAAAAATTTGTTGTTTCAAA AAACGCATGTTTATCTATAAGAATCACTATTAATAAGCATACATCAATGT TCTTAGTCAAATTACTCAATTTTTTATGAGATAGATGCTTTTTTTTGCTC ATGAGGGCTTACTTTTGAAGAATATGTGTGTTTAGACATGAAATTTTGGT TGCTTGGCGCAGAGGAATGTAAAGAGATGGAAAAACAGCTTTTCTGATTA CTCAAAGTTCAACGATCACTTCTATTGAAAATTCTATTGTGAAAACATTG ATTAGGTCATAAAATGAAAGTCCAGAAAAGACGGCTCGCCATACAAATCG GACGGTTTCTACATGATTTGACGATAAAAATTAAAATTTGTTTTTCCTTT TTTGCCGACTACTACGTAGTCCAATTTTTAAGAAAAAGGAACAATATTTT TACCAATGTATAGCAAAAGAAATTCTTAACGTAATGATATTAAATTGGTT CTTATAAAACTGTCAGAAGTCGAGTAAAATCAAGATGAAGTTATAATTTT CTCGAGCTCTAGCTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAA ATTCTTAACGCAATGATATTAAATTGGTTCTTGTAAAACTGTCAGAAGTC GAGTAAAATCAAGATGAAGTTATAATTTTCTCGAGCTCTAGCTTTCCGTA TTATGGTGCGGTCATGATGCGGTTATATTAGTAGAATCGCTAGGAAATTC TGAGCAAGAAGATTTAGGTACCTTTTCGTATAGGAGAGGTGTACCCAAAA TATAAGCCCTAAAAGTTTGCGCATAATCAGGCATAAAACAAAAGAATTAT GCAGATTTTTTAAAGCGACAACAAAAGAAACCTATTTACTCGACATAGAC TCCCTTAAGGGCAAGAGACCTAGTATATGACGAGCGGTTTTTTAATTGTT TTCGAGAAGCTGTTTTTCCATCTCTTTACACTCCCATGCTTGGCGTGTTT TTATAGAAAAACTGGCCAAATTCGATATTTTTTTATGAGCAAATTACTTA GGTATTAGCTTTTCTCAAGATTGGCTCTTTCATTCTTTATGATGATTTTT TGCACAAAGATGCCTAACTGTAAACCCTCGAATGTGACGGAGCCGGATTT TCGAAAGAAAATGTTTTTGGGCAAATTTGGGCCAAAAAACGGGTTTTTTG GACTTTGTGAAAAATTGGATCATTAATTTTTTCTGATTTTTTGCCATGAA AATAGGTACCATCATAGGTGAAAGATGGCTCAAGCAGATTTTTGCGAAAA AATTTTGTTGGCTCAAAAAACGCATGTTTATCTATAAGAATCACTATTAA TAAGCATACATCAATGTTCTTAGTCAAATTACTCAATTATTTGATGAGAT AGATGTTTTTTTTGCTCACGAAGTCTTGAATATGAAAGAATATTTCAAGA TTATGAAATTTTGGTTTCTAAACGTTTTTTTTTTAATAAGAAACAAACGA CTAATTTTAATAGATCGTCACTATTTGTGTTCTGAATGATTGTTTAACGG TCATGCTCACGTAGATATCAATTATGTGTTAAATTCATAACAAGGTAGGT CCATAAAAGTATCACTTGTTTATTAACAAAGTATTCCAATTCATTTATTT CTAGACGCAACAAGAAGTGTGGGATTTTGTTCAGAAAAATCGAAAGTAGA AGATTGAATGCAGTTTTATCGTCTCTGTTAGTCTTTTGTAATCGAATGTA AATATTTAGCCACCGTCACGTGAGAAGAAAATTTATAAAGGGTCTTTTTA ATAACAACAAAAAGATGTCTTATTTTCTTGTTCTCGCATGCCACTCCTTC T
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070577TCONS_00070577Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070577-proteinTCONS_00070577-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_56supercontigscaffold_56:946117..958217 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
NPM1nucleophosmin isoform 1 Homo Sapiens
Expression

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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
236.48 213.14 204.41 193.27 181.7 146.81 178.37 197.09 137.79 139.03 126.19 117.27 150.08 169.34 146.76 172.25 205.05 182.19 25.81 39.95 176.11 174.87 184.98 156.25 169.43 215.18 61.37 50.15 122.47 137.77