XLOC_043054 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_043054
Unique NameXLOC_043054
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_493:314288..357291+

Legend: gene
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>XLOC_043054 ID=XLOC_043054|Name=XLOC_043054|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=43004bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_493:314288..357291+ (Clytia hemisphaerica)
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AGTCAATTATATAATGTTGCTCTAGCCAAGAGACGTTTAGAAAATGATGA ATCGAGGACCCAAGAGTCCATTGATTCCGCTTTGAGTATATTGACTTTAG ATGGGGTCCCTATTGAAGACCTTggtcttgattttgttttaccGGGCACA AATTATGAGTTGAAAAAGAACGGCCGCAATACGCCAGTGACCATTGAAAA TTTGGATGAATATTTGCAGGTAaggtctaccattttgtttCCTAAATTTT TATTGCTTCAAATTATTAATTTGGGCTTAATCTTAGgatgtactctcggg tacctaaaaGCCGGGGGATTTTCCACCGAGTACATTCtcattccaacccc cccccacttattgatttttgggaaatcttttttgaaagttccctcctttt gccctaattctgctgtattagcctcctttttgaaaattttcctcccatga catttttattccaacccctccccccttattaagttttgagatattttcca acccccccccctatgAGGTagaggtacccgagagtataggTGGAAAAAGC AGAGAGCTCGAGTACTCCCCCAAACCCTTAGCATGTAAAACACTTTTCTT GTAATCTAGAGCTTGTTAGGTTCTGAGAGTAGCTTTCCATCCCGATAACC CATCCCAACAACACATCTTTCTCACATACAGTCAACTCTTTGTAATTCGA ACCTcttttattcgaatctctctgtaatccAAACCAAAATATTAGGAAAG TCGTGTAAAATGCTTTCTCTAATATCGAACCTTTCTCTATTTGATCTGAA GAAATtccttggtcccttgaagatcgaatttaGAAAGAGTCGACTGTAAC AATTAAGACAGGAGAATCACTTAtttgatattccgatggcggattggcgg tcgcccacgctaaagctctaaaggagcgggccattTTCCCATCGGAGAAG AATGATAGTCGGCCCTTGATGTGCCGCacccccagtcgggttcaacagcc ccTGTGCGTAAACCtataaatatttcggttggacccgccaatccccgaaa acgggggctgggttaccagatctcccgctgcaaaattcttgacgcggtct cgcaaTGTAAACCTtgcagatgttgaaaattttcccgaccttcagagctt tagcgtgtcggatgaaaatttcaccatctgggtgccagataagagAATCA CCATCAAACAGAACATACTCATTCAATGTAAACGTACTTCTAGATTCTTA TTATCTTTCTTTCAGTTGGTAGTTGAGTACACGCTCGTGGATGGAGTATC CGTACAACTTGAAGCTTTCAAAGAAGGATTCGAACAGTTCTTCAAACTCT CAAATCTTCAAATGTTTTACCCTCACGAGGTACAGTAAGAGTTTTAGCTG TTTTAGAGAGGATTTTGCAGGGTCCAATTTTGAGAAGCAAGCATTGGAAG TTAGGAAACTTATAAACCTCTACTCTGGGGTAAAGAAATCTTTCTACCCG GAATATTCTTATTTCAACTCCCCTCTCTTcaaattgaaatcaaatttttg aaagtttcttccttttcgtgtttttttttcatccaagacgttttaaacct aaaagtaatgatatttttttagatTGATTTGTTGTTATGTGGTAGTAAAT CGGAAAAGTGGGACTCCAAAGGTAAGCACATGATCTCGTGAAAGGTTTTT GTTCTGCTGTATTCTTTTCATACGATTTACTGACTTACGAAAATTTTTCA CTATGAAAAGATACAAATGCGAAGCAACTTCAGAAAGAAATTAGAAGCAA AATCTAAAGTTTGACTTTTagaaataacaatttttaaatggaaaaaaaaa caccaatacGCAGCCATACCAGACCTCGTACTGCCTTTTATACAACCGAA AACCCGTaatttgttctttcttttttcagaattAATGGAGTGTTGTAGAG CTGATCACGGATATAATATCGACAGGTAGgtttctattttcttttacaAC TTTTACTAAGAACACTTAAAATTAATCGATTGAAAGATGACAGGTTAGCT TCTCAGATGCGTTTTCCGTTGCTAAGTTTAATGTACTTACTAACTGATTG CTATTTTCCTTAAGGATATTTTAATTCCAGTTAACTGTTATTTCAGATGA ATGTCTGAAGTCATTTAAAGAATTTTGCTCTCCAATTTGATATCTCACGT GTAACAAAGTACCAAATCGACGACTAGATCACTAAAATCTGATGCTTATT TTATTACGACTTTCTTTTTCAGCCGTGCCGTGAAATTTTTGTTCGAGATT TTAAGCAAATACGAAGCAGACGAGCAAAGATTATTCTTACAGTTCATTAC TGGCAGTCCAAAACTCCCTGTTGGAGGTAAGAATCGAAATTCTGgagagt acatgtttttttataagcaagtgtctgtccctatgccaggctcgcattat gcttagcattctattgttctcaaacaatagagccattgtttaggtaccaa aaactgagcctgcatatgcttataaacgttatgcttataaaagaaaaaac atgtatagcgTCTACTgttgaattttcaatattttctttctccAGTTTAC CTTTGTATCGTCGATTATTTTTGAAGATGCATCGCGTTCTTGTGTTTcac ttctttttataagcaaccaggcTGCTATTCGATCAAATTAAGCAACCCCA GACTTGACCCGAAAATTAGGGTTTCTTATACTTTTTATGTGTACTCTCCA TAATTCGACCCTCTATATTGTTTCGAAAAGTTAAAGAGGAAATTGTCCTT GTTTTGGAATCTTAAGAAATGTAATTTCTCTCTGTTTAGGATTCAAGAGT CTGAACCCACCATTAACGATCGTCCGAAAAACAGTCGACCAATCAGCTAA TCCGGACAATTATCTACCGTCCGTCATGACGTGCGTGAACTACTTGAAAC TGCCGGACTATTCGAATGTCGAGATAATGAGCACTAAATTGAGGACTGCT TATTCAGAAGGCAAAAATGCTTTCCATTTATCCTAGTATAGGGATGACGT AATTGATTGTCTTATTGGTGCGCATTAGAATCATCCTTGTGAATTACTAC GTTTTTATTGGAAGACGAAAGATGATTGATCACACATAGAGATAGAAGAA AacctttattattattttcagaAACATTTGTAATATAGACCTTCCTTGCT TTCTTTCGTCAAGATGGCCTTTCATTGagttatatttttgtttccaaGAC AAAGCCGAGCCGGTAGAACCTATATGGATTTCGGCATTTTAGTCCTTATG ATCTGCAGTTACTTTTATTGAGTCAACATTTTCAGAGCAGATCTTATCTT CATCGTGTTTTGGTTTTAGAACAAGACTTTTTTGTCAAGAAATTTCTTAT ATACTGTGATCTATATGGCTTATattcattgagtttaaagcccgaagggc tagagtagaatctctaacctttctcaggcaagaaaaagtgaagccttaaa acatgcgccgtatttttgacgacagattgaatctagcaattcctttgttt acgattgatatttttttctaaatttagcggtagattttagtttcaatctg tcatttgtgtaaaaaccaggcgagccgctcaaggccgtgcaactttggta ggatcaCCCCTTCTCCCCTCACACTTCTTATAAGAAATGCTTCTGATTTC AAACCTGTAAGAAATAATATTGCAAAAGCTTCTACTTGAAAAGCTGGTTT TCGGCTAAGACTTCCAATCACTTTGATAGGTTGAATCTCGAGGTTTGTGC 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00069089TCONS_00069089Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00069090TCONS_00069090Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00069091TCONS_00069091Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00069092TCONS_00069092Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00069090-proteinTCONS_00069090-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_493supercontigscaffold_493:314288..357291 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
TRIP12PREDICTED: E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12 isoform X6 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
22.12 21.81 18.23 17.59 64.82 50.46 44.56 51.35 34.62 38.68 35.32 31.77 33.14 39.34 26.11 34.9 43.05 38.87 27.93 27.74 43.08 39.29 30.01 37.4 57.23 53.28 31.56 31.77 39.26 40.16