XLOC_042930 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_042930
Unique NameXLOC_042930
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_49:766687..791293-

Legend: gene
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>XLOC_042930 ID=XLOC_042930|Name=XLOC_042930|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=24607bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_49:766687..791293- (Clytia hemisphaerica)
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TCGAGCATTTTTCTTCCTAAATTTACTACTTACTAATTACTACTCTCTTT AGACTAACCATCGTATTTTCTCGAACTATAAACTCCTAAGAAATCAATAA AATAGTGAGAATTATTTGAAGAAAATTATTCTAAAGGCACCTACTAAATT ATTTTGATATCACTCCATTCTAGGGAGAACAAGGCGTACCAGGAGCTCCA GGATTACCAGGATCCCCCGGAAACAATGGTAAACCAGGAGAACGTGGAGA TCCAGGACAAGATGGAGGACCAGGAGATCAGGGACCACCAGGATCACCAG GAAACCCAGGTGCCAGAGGACGTGAAGGAACTCCAGGACGACCTGGCCGA CGTGGAACACCAGGACCTAATGGAAAACCAGTAAGAAAGAACTCTAATAA TAATTTGTGAAAATCATGTCTTTTGTCCAAGGCTGATTATTGAATCAAAC AAAACACACATCAATTGAATTACTGTAGAGAATCATTTAGTTGTTCGAGA AACTGTTAAAAATTGCCAGAAATTGATGATCCTATTAAGTAGAACACCAA TTACAATAATCGTACAAATAGTCCCTTGTAAAAAATTATCATCAAAATAG ACTTTTCAATAAAGTAATCAACCATTCTTCTTTCTCAAGGGAGCACCAGG AGCAGCAGGACCAAAAGGATCAGACGGTCGACCAGGAGAACGAGGTCCAG AAGGATCTTCAGGTCCACGTGGAGTCAATGGAGCACGTGGAAGCCCAGTA AGTTGTCGCTGTCTTTTTTCTATAGAAAAGTCTTATCAATGAAGTGAGAT TACAATTAACTCGAACCTCTAAAGAACACATTTACTTTTTTTTTTGGATT AATCTTAAAATTAAGTTATCATTGTCCAAACTCGTACACAGTCCCTTAGT TCACTTTTCAAAGATTCTGATAGCACTCACGCGGCAAGTGGCTCTGGGTA CAAGATTGGTCACTGTCCGTTTTCTAGTTAAACCAACGATGTAAGACGAT AATAAGTCTCTCTGTAAACTGTAGTTTCAAAGCCATGCCACTCAAATCTC ATCTTCAGCTTGCAAGCCCTATTTGACTGGAATATTCTTTCGTATTTCTC TTAGGGTCCAGATGGAGCTGCAGGACTTGATGGAGCTCAAGGACCACCAG GTGACATTGGTGCACCAGGAAAAACCGGAGCCTCAGGAGTACCAGGACCT GTCGGACTTAGAGTAAGTATTAACCAGTATTGAGCGCAGAGTGCTTTTGT TAATGAGTAATTATTGAATGGATAAAATGTGGTATAAATGCATCGATGTA AGTAAGTGTTGAATCGAATCTGAAGTTGGATGATATAAAATTAAAAGCAT CTTGAAAATTAATACATAAGTTTCAAACATTAAGTTTGAATAAAAACAAA AAAAGATTAAATCGTTGTTATAATGGTTGATTCTTTTTCTTTCCAATGAT AGGGACCAACTGGACCACCAGGAGTTCGTGGAGCTAAAGGATCATCAGGA GATTCTGGTGATGATGGTGAACAAGGACCTGCTGGTACCGCTGGACAACC TGGTCTTGTTGTAAGTAAAGTCTCCTTTGTTGCTATTAGAAAAAGACTTG CATTTTCTAATAATTATATTTCGTTGTTCTTTTGGTGCTGCGAATACACC ATGTAAGAAATACTATAATTCAGTAGGTTAGACAACAAAAGATGACATAA AATAATAAAATAGGTGAAACATAAAAAGCTAAAAAAGGTACACAAAATAA AAAAGGTCGTTTATAGCTGGAAGAATATTTCGACCATTGACGTGTCTTTA TTTTGACATGTAAGATATTGCAAATGATAATGTCATTAAAATAAATCAAA TCACAATTTTTCTAGGGACCAATCGGAGAAATTGGAGAACGTGGACAAGT TGGAGAAGTCGGAGAAATCGGAGAGACTGGTCCACAAGGTATGCCAGGAC CAAGAGGTCCACCTGGACCACAAGGACCGGAAGGCCCAGAAGGAGCCCCA GGACCAATGGGTAAAGACGGAAACAAAGGACCTGTTGGAGACCCAGGAAA TGCTGGCAGACCTGGCAAACAAGGAGAAAGTGGAAAGCCAGGAAAAGACG GTGTTCCAGGAAACCCAGGAACTGCTGGTAAACAAGGACCAAACGGACTT TCAGGATCATCAGGACCACAAGGACCACCAGGAGAACAAGGTCAGCGAGG ACCTCCAGGACGAATTGGTGTTGTTGGAAATAATGGACCTAAAGGTTACG TTGGCCCTGACGGTTTGAATGGATTAACAGGTAAACGTGGATCACGTGGT AAAGAAGGACCTCAAGGACCCACTGGTGTCATTGGCCGTGATGGTCGCGA TGGAAAGCCAGGATACAACGGAACTGACGGTGATAACGGTGGTGTTGGAC CTAAAGGAGATTCTGGTGAACAAGGAGATAATGGAGCACCAGGATCTACT GGTGAGAATGGTGATGTTGGAGAGCCAGGAGTCGGTGGTGAAGATGGACC ACAAGGACCTAAAGGACCCAATGGTAACCCTGGAGCACCAGGTGCCCGTG GAAAGACAGGACCTAAAGGAGACCGTGGTGGTAAAGGAAAGACTGGTTCT GATGGACGTGGTGGCTCCAAAGGACAGAAAGGAAACATGGGACGTTATGG TATGCAAGGACCACCTGGTGATGCAGGAGAGAAAGGAGATGAAGGCCCAC AAGGAGAACGTGGACACCATGGACCACAGGTACTTTTAACTTTGAGTTGA TTCTTTGGTGATAGGGTCAATATTTTAAGACAGTTTTGGATGATCGAAAA TTTACAGTATTCTAAATCTAATTTTAGATCATTCAACTTTTTTATAGACT TAAACGTTAGAGAATAGAATACGTATTTGCTCTATATAATAATAGAGAGA CAAACAAAGTCGTTATAGCCATTCATTTTCACTTATATTGAAATACTGGA GATACATCGAGATAAAAGGAAATAAAAATCTTCTCTCTTTATATTAGAAA GAAGACTTATCTAATAACATTTTTTCTCCATGTATAGGGAAGCCCTGGAG ATTCTGGACCAAACGGACCAGATGGCGAAGAAGGATCCAAAGGATCTCTG GGAAACCAAGGACAAATTGGTAACGAAGGTATCCTTGGTGCTCCAGGACC TGGAGGAAGTCCAGGAAGTGCTGGAAATCCAGGTCCCCCAGGTCCACCAG GACCTCCAGGAGATATGTCTGGTGCATTAGCCGGCAACTTCTGGGATTAC TTGAATACTGGACATAACATGAAAGGTCCTGGTTATTACAGACAACGAAG ATCTGCTGAAAACCACAACGATATTGAATCCATCTTCAAAGAGGTATAAT ATTTTCTCTTTTATTAACATGATACCTAGGATAAAAATTGGGTAATAAAT CCATTTCTGATCAAGTGAACACATGGAGGATAGGATACACGTAACTCAAG CTGTCTAGAAGTTGCTTTCCGATCTTGCAATCTTATAGTCATCAAAGTTA AACCCTTACTAATGTTTTACAAGATTTGTATTAAGTAAAAGCATCACGAT TTTTTTCTTTTCCCAACAGAACTACAGGGTATTCCAAAACTTCGACAACT TGTGGAATCGTGTTATGGATGATATTGTCAACAAAAAATCTTTGGGAACC AAAGCTAACCCAGCAACCACGTGTGCTGATCTCTTCCGAACAAGAAAGGG ATTATCATCAGGTATGTGTGGAAGCTAGTCTACTCTCGATTTACTAGCTC TAAAATGAAGCTCCGTATTTTGATGTCAAAGCGATCACCTATTATATTAT TCAAGGAAAGATTTGAGTTATTGACTTCGATTAAATGTCCTTCTTCTCAA GGAAGAAAGAGTCGGCTGCTGTCTTAAAAACAAAGAATTCCCCATTTTAG TTATTTATAACTTATGATACCTAGGCCATTTCACAGTCGCAAAGCGTAAT GGGTAATCAGGACCACTGTGCTAATAACGACTTACTATTGGACAAAAGTT TTGAACATTTTTGCGTCTAGCAAACCGGAAGTCGTTATTAGAGCGCAACC AGTCCTGATTACCCATGATTCATTTCGACTGTGAAATGGCATATGCCACC CATTCTAATTTCAGGCGACTACTGGATTGATCCAAATGAAGGATCATCAC ACGACGCCATTTTGGTTCATTGCAATGCCACCAATTATGAAACATGTGTT TATGCTAAACAACCGGAAGCCGATAAAGATGTTTGGTTCGCTGGAAAACC ATCTTTCTTATGGGCTTTCAAAGAATACATGGATGAACCAGAAGGCGTAA GTATACAATAGTTGGGTAGAGCATTATTGGTAGAGCATTCTCCTCGCAGC TTCAATCTCTGTTTACTGCCAACTCGAAAAATATCAATAAAGCTTATATG GTTATGTGTGATCTCCGTGCTAAGAGTTGAGAAACTTTCTGAGGTGGAAT AGAAAATAAATTGTTCAAGTATCGGGAACAAGTGCTTCCAAATAGTTTGT AGCTTGCATATCTTCAAAGTCTCAAGAGCAAAAAGGAATGACGAAAATAC TAGAAAACGAGGGCTGACTCTTGACTTTTTATCAATCAACAAAGCATAAA TTTTTCAACAAACTGTAATGAATTCAATCGAATGATAAACAGACAAACGA GTATTTTTACAGTTGACTGTCACTCTAATTTGATCTTTAACTGAGGAAAC ATTTTCTTTGAATTAGAGAGAGATTCTAATTACAGAGTAATTGAAACAAC TTTCCAGCTGAGAGGAGCAATATTTTAGTTCGAATTAGAGAAAGATTCGA ATGATAGAGATTCGAATTAGAGAGAGTTGACTGTATCAAATTTTCTTTCC CTTTTTAGATTTCATATGCTGCCGATTTGGTACAATTGAAAATGATGAGA TTGTTAAGTAACACCGTTCGACAGAATATTACACTTCATTGTAAAAACTC TAATGGAGATATGAGCATTATGACGGATGAGAATAAAGAATATGAATTCA ATTCATTACCACGTGGTATGAGATCAAAAACCATCTCTAATGGATGCTCG GTAAGATCTGTTCTCGATTTCGTTCCCAGTGAATTATTAGCTTTTCGTAA GAGGGCGCGGGCTCCCGTAAGGCAACACCAGGGTATTCTCTGATGCCTAG CAGTAAAGTAAATAAAGCCTGGGATACATGGGGATGGAAGAGATAGGAGG GTGCTAGAAATAATCTTGTCAAGAAATCTAATCTTTTTTGAAGACTTAGT TAAGTTTAAGAATTCCTATCATCATTAAATTCAGAATAAGGTTGGAAAAA ACTCTTTTGAAATAGATATAATATACGTTTGGTATTACTCTACCGTCGTA CAGAGAATTTTTGCGAATCGTGCCGTTAAATTAAAGACGATGATGTTATA GGCACCTACCTATCACAAAACAAGCCATTTTATCTGATAAACAAAAAGTA AGAGGCGAAACTTTATTGAGCAAAAGCCAACTAACACAAATCTATAAATC CTACATAATTGCACCAGACATATCTTCTGGAGGTTCTTTTGGACCGGGAG GACCTGGATTTCCAGCACTTCCTGGACTTCCTATTGAGAAATAAATAATG TCAATTCTTTTTCTTTTTCAGATCAAAGATAACCAATGGCATAGTCGCGT TGTTGAAATCTTTTCCGACAATCTCCGTGGATTCCCAGTTCAAGATATTG GAAAATTCATTGCTACTGAAACTGAACAAGTTGGAGTCACCGTAGGACCT GTTTGTTTCAGTTAGAAGAATGGCATTAAATTTTTGATCATCTGGAAGAT CTTTTTGATAGAAGAACAGAGGCAGTTTGGAGAAGAATAGACATTAGATT GAACCATTTCCTAACCATTGCAACGAGTAAAGGAAAAATTTATCACATAC ACTGCTTTCACAACTACTGGGGTTGCGTCGAAACATCTTGATACAACAAA CCCTTCAAAACGTTTGATGAACACTCCACATATCACAATTTTAGATTTCA ATCAAAAATTTTAGATTAACAGTTTTTTATAGAAATTTTATAATAAACTA GAATTTTTTTCCATTTAATAACATCTAATCGTAATGTGACCAGATTATTT TATTTTTATGCTTCATTGAAAATCTCTTGTTTGTTCTTTTTCCAAAAAAG ACTGCCACTATCTTCTTGAAATAAGATTTTACTGTCATTATTTATAATTT CAACTTAAAAGAGGAAACAATAAAAGAGAAAACAATTGCTTGCGAGGGAG CTTACACCACACCCCTTTGAAATGTATTTACAGTATGACACGGCTTCAAG TACTTTTTTTACTCTTTTATTCAAGAAAAAGCTAAAAGATAATTGAAAGA GTTTGTCGTCGTATATTTGTGAGTATTTTGACTTTTACCTCTTGTACATA CGTTATTTACTATGAACAATAAAAAAATTAAATTGGTACACCTTTTATAG GGAAATAATAACTATAAAATATGAAAAAATNATTGCTTTTGTAAACAAAA AAATAGCAAAGTTGATTTCGAGCAAATTTGCAATAGAATGTTTTGATTAT AAAATAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00068909TCONS_00068909Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00068908TCONS_00068908Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00068907TCONS_00068907Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00068906TCONS_00068906Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00068905TCONS_00068905Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00068904TCONS_00068904Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00068903TCONS_00068903Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00068902TCONS_00068902Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00068905-proteinTCONS_00068905-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_49supercontigscaffold_49:766687..791293 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.17 0.16 0.33 0.26 5.66 5 38.41 43.34 27.41 35.36 24.47 20.83 217.79 211.35 33.67 27.79 202.44 182.7 241.98 127.53 787.32 783.46 237.15 359.95 664.07 479.12 13.5 8.02 44.89 30.58