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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at scaffold_49:112363..129990+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042878 ID=XLOC_042878|Name=XLOC_042878|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=17628bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_49:112363..129990+ (Clytia hemisphaerica)
CTCAATCATGTGTGTCCCATCCATCAAATTATATGTAAGTTTTcttgatt
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GGATTATAAGCGATCATGGtatgtttttcttctttcagttttcagttttt
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tttaattCCATTCGTAATCTTATCTCATAGGCGAGTTAACTTATCGACGG
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TTAGTTTCTACGCCCATGAAAAGCTCTTTTTGGTGAATAGATTTATATAG
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TGCATCTGAGCTTTATAAAGGTCATTTCTTTCTGCAAACGAAATTTTCTA
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gtaattttcgcgcctgctgccttccttagatgtggtagccGTTTCTCAGA
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aaaaaattcatcttAGAAGGCTTCGTCGCAAAAAGCAATTTCTTGAGAAG
GACATACAAATTAATTATGACTGATTGGATTACATTAAATATGCCCGCTA
TTTCACTTAAACGTGCTTATCCTCTTTGTGAACCGAAAATGCCGACTTTC
ATCCCTAGTCCTTTTTTAGAACATATCAAAAGCCGGGTAAAAATTGGATT
TAAGTCTATTTCTAGCTGGGGTTTCAGCCCCAAAGATTGAGTGCTACCCT
TATATATATAAGGTCATTTTAGGAGGGAAGACACTCTTCCCCGTTTCTGT
TTTCCTCTAACTAGGCCTATATTGGATTACTTCTACTTCGCATATAAGAT
AAATAAAACGGAGAAATTTAAGATGGTATGAAATATCAAATTCGAACCAG
GGTGCTATTCTCTTTCGGATTCATCACttctcaaaaaaaagtcaattaGG
ATTTAATAAGTGGATAGTACGAACTATGGGATaaacaaaaaaggttaaga
aatttCTCGGTGCTATGTTAAAATGCCTGGATGTCAAAGAAAAGGTTTTT
GAGGATATTGAGTCAAGTGGACGCGGACATAAATTTATTGCTTTATTGCA
GTGCGGTCTGTGTTCGTACGGATGAGCGGAACTTTGAGGTATGTGTCACT
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ATATTGTGTTGCAACAACGATCTGGGAAGAGTTGGACTGAGTATTAACGA
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TGAGACTAATGCGTCGATCTTATAATGAAAACAAGAAATTCAATCGAAAT
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AATATCTATTGCTCTCTTATCAAATGGCGTTAGAGAAAATCTTGGTGTGA
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tgatgttacttaatctttcttttttattatagaCCGGACTGACCGTTTCA
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ttggtAAGATTATTTTCTCCTTGACCCTGTCTCGAAGTAATGATTTTGTA
CAGTTTCTGTAGTACTATGTATTCGAGTATAGGAGTGATTCGAAAGTTGC
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TAGTTAATCGCCTGAAGGCTCGGCTGACGTCAATAGGATATATATTTAGA
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ttaagtaaaaagtaaaaacttagcattataaaattataaaagcTAGGTCA
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AAGGAAAAAGGGTAATAATCCTGAGGCATTTTGATTTCTTAATCAACAAA
CAGACGATAAGCTCTAATTGTAATGGCCTGCTCATTAAGAAGCATGATTA
TTTTTGTAGATTAGCTTCCCGCTGAGATGATTTATCTTAAAGTCTCAAAC
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ATTACGTGTTGCAAAATAAGCGTTGGAcgtttttaaggcttgaaaGCTTA
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GATTAGTCCGGCATGTTGTTTACCAATTTATCTTAGGTTTTCGAACCTTT
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ATAGCCCTATCCAGTCAAATAGTTAAGATCAGTGTTTATACTTTATTGGT
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agaaatgttttcttttttcgttGCCTTCCCCATTTTTCCAGAGCAGATTT
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AATTGCTAGAGGAAAATTCTTTACCCTTGAGGAAAGTTAGAAAATCATCA
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TCTAGTACAGAGTAGATAAACTTGCCGATGCCGTTGTCAACAGGAGAGTG
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TTAAATTAGGGTTCGATCTTATCCTTGATTCGTCTATACTACTCGTGCTG
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aaatgtcggCTGATTATTCATCAAGAAAGTAAACCGTTAGATCCTTATCT
AAAGGGATGCCATCACACAAGATTTGAGGGCTTGATAAGAGAAGAAACAA
CGATGACTTGGAAATTCAAATGCAAAGAACTTAACGTGAAGTTTTATGGG
GAAACTAATCACTTCACGGTAACTCGAGATAAGATTTGACAGGGTTTTAA
TAAAGTAGAACTCCCAGACAACCCAATACTGAGTTCTAGTTTCAAATAGA
AGTAACTGTGCTAACTATGAATATTTCGCTGTTCGGGAAATTGAAATTCA
CAGCTCCTGCTGGTTCTTTACGTCATAAGTCGATTTTGCTTTCCAATAAA
TTCCCTTTGCTTTCACCCGAGTGTAATGACCTGTATCACATTTTCGGGAG
AGTGCAATTGAGCTATTTCAGAAAAATGTTATACCCCCTTTTTTGAGGAG
GTCGTTTTGGGAAAGGTGACCccttagattttttttcaatttttcggtaC
CCCCTTGGCCAAtcctggatttttacactcaaAAAACTAGACCCATCCGT
TAGATATTTAATTTTCCAGACCACCTTGGGCGTCACATCTCCTCAACTTA
GGGGTTACAGACTATTTATCGGCTAACTTTTATCCACTAAAGATTCTCAG
CTCTACAGCTCTAAATTGCCGCCTTTTCTAAGgttgtttttaaaagaatc
gAACACTNATTTATCGGCTAACTTTTATCCACTAAAGATTCTCAGCTCTA
CAGCTCTAAATTGCCGCCTTTTTTAAGGTTCTTTTTAAAAGAATCGAACA
CGAAACACGAAAGTTACTTATCACTATATTGTAGAGTTAAGTACCGTAAG
TTCATTGAGTCCATTGTCTGAATACCAGCCTAAAAGCGTTGTGAAAGCAC
CATTGgaagaaaaaagtaaatttagcTAGCGCTAGTTTCACAGCTTGTAA
AAAGTACCCACTGTTTAGGTTGGAACCTTCGCtgactttctttctttttt
ttctttgactATTCCCTTGATCTCCTATGGCCGCTAAACTTCACGGTAAC
GCGATTCTGTTATTCTGTTAAAAACCTCCATTCATTTCATTCTCAAACGT
GTAGAAATGAAATAGAAAATCTCTGCATGCTGATTGGGGGCCAATAAACA
ATCGCCATCAAACTCAGCGgatcaataaaaagaaatcgGGAGGTTGTAAG
ATGTCAGCTTAAAAAGACATCAAAAACTtctgaaacttttttcataagaa
cgtGTTCTACTATtcgctaaaatataaaaacaagcTTGGCACAAAATCTG
GTAATCGTACCAAGATTATTATTTTCAATCCCAACTCTAAATCCCCATAT
ATTTTCTTTGAACACGTTTTCGGATTAATTCAGCGTCATTTTACTGATGA
AAGAATccctttttaggtttttatatATTCTTACAATAAATAAGAAATCG
TCATCTAGATAAAGATCTGTATTGTTATGCGAATGAGAATTAATTTCAGG
AAAATAGGTTGATATAACAGAGAGTAGTTCAGAAGGTTAGCCAGTTATTT
AATCGAAGTTCAGCCTCTCACATCTCAAAGGAacaaagttttatataatt
tgactgGTACTATCTGCGTGAAGAAGATGAGAGAAAatctaaaaggattt
tcaaatttcgatCCCATCTTAGGAAAAGGAGCTTGGGGAAATGTATACGC
ATGTCGTAAAAGTTTTGGAGGGTCGAAAAAGTACGCGGCCAAGGTGGTGG
AATTTGGGAATGACCTCGGTGTGAAATGGCAAACTGAAAACGAGATTGAG
GTGAGTACAAAATTAAATAcattgaattttattatttttcctgttttttt
ctAGATTCAAAACTCACTATTTGAGCTCGTAGGTTTTGTAAGTGGTTTTA
AATCggattccccccccccccaaacccTTGTCCAATTtcgataaaaatta
tttttttcttttttttttttaaattaaaaacccCCTATTTGAGCTCGTAG
GTTTTGTAAGTGGTTTTAAATCggattccccccccccccacacacATTGT
ACAAATTCAgtcaaaatgatatttttcaattgtaatcaacattttctgtt
tttgcctacggtatgctctctctctctctgaaAGCGGATTAAAATATTGA
TGATAGTTTTTTCATGCCTGACCTGAGGTAACTTTAGgttgtttttgatt
ttcttttcaactaAAGGTAAAGAtgtatttttaagttttataaACCGCAA
AAGATATTTTCCATCCCTAAGCCTCGAAACTTATATAAAATGCCAAAAAT
TTCGAAACGTTTCTTTTCTTACCTATGTTTTCCCTTTGATACAAATTAtt
cgtatttttctttttcagatctTGAAAGAAGTTGGTAACCATGGTAATAT
CGTTGGTTTCCATGGCGTTGTCAGGGACACGAGCAGCATTGCCATGATCT
TGGAGTTTATTCCCGGGGGATCATTTTTGGAAGGCTTACTAAATTGGCCG
GGCTTCAATGAGAATGGCATGAAAATAATTGCCAAACAATTATTGGAAGC
TCTGAAATTTTGTCACTCAAATCGAATCATTCATAGGGTATGTACACttc
tattgttttaactttgagTTTGTCCATGCCCGTATCTACCACGCATTGCG
TATTATTTTCGACATGTACTTGCGGTTTTTCATTTCCTATAAGGTTTATA
TAAGTTacatttgatttaattttggtTTGATATCAGCCTCTacaatcaac
caaaattaaattttgaacaaGACGTCATTTTGTATACTGACTTTAAACAT
GTGTTTTTTTTGTGTAGGACGTTTGTCCTGAAAACATATTATGGTTTAAT
GTGCCAACCGTTAAAAGACCTGACGTCACTCCAGTACTGAAGTTGATCGA
TTTCAATTTATCTCGAAAAGTTCCGGAAGATTCGACGTTTTTACGAGCGG
ACGCGCTTGGTAACCCATCTTATATGGCTCCCGAATGCCTGTCGGATGAA
CCGATCGCCACCTTCTCTGGAGATATCTGGAGTGTTGGCGTTCTCATGTT
CCTCTTACAGGTGAGTGTTGGTTCTTCACATTCTTCTCACGAACCTCTCT
ACAAAAGATAGTCGATTCTCATTCATTAGAATTTGCCATATATTACCGTC
AATGTgggatttcaaaatattgaattcTAATTCCTAACTCCTTTaagaga
aaattattattttttataatcGTCTGCTATCTTTTCTCCTTCAGTCTGGT
TACCCACCCTTCTTCAACGATAATTACAATCACCTACTTAAAAACATCCA
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ACGGGAAAGCTATCATTCAAGAAATTGTaagattttgagaatttttagtT
ATATATGGGAAAGACACTTCTTTATCTTCAAACTTTGCACTCATTTTGGA
AAGGTTACTTTGATGTTATAACCAGCGATAAAATCCgcttcagaaaaaaa
actttcattttattttcttcaGCTTCAACAAGAGCCAGAGAATCGACCGA
CAGCCAGTGAATTACTGACGCACCGCTGGTTCCGTACCCGAATCAGTACG
GCAACCCCGATCATAATCAAAACCACACCGATCAACCAAGCAGGCAGATA
CCTCTTTAGAACTCAAAACAACTCATCTACTCTCGAAGAAAAGATATGGG
CTGGTCAGAAAAGATTAAAAGGATTCCTCCGACATCTAAACGAGAAAAAG
ACGAGGTAATTTATGTCGAATTATGCAATTAAAGAAGTATTAAATCTCAT
ATCTAGTCTGCATGTTTTTCTCAATCATCATTGGTTTAAAATGCTTGAta
tcttaaaaattgaaatttttttatgaaacatCATTCTTTTCTTTCAGGGC
GAACCATCGGAAATATTCCTTAGTTTTCAAAGAGCGACAGGCCTTCATTC
CGGAATCTCACATGATCACCATACCAACAAGCGCGCTCATCAATGAGGTC
GATTTCTATCAACAAAAAGTCGCCGCAACCGCTTCCAAAACTCTCGAAAA
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GGTAGTTTGAGCCCCTTAACGTACAGAAGGATTGTATGTAATAAAAACTA
AACCCCTGTCGCAGAAAATTACGAATAACTCTGGAATAgctttttgagac
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ACATGCTTCTCATAATAATCATTTAATTAGTGGTATGTCGCACCCAGTTT
TTTAAACCAAAACAGCAAAGTTAATTGTGTGTCTAAGATGATTATTTAAA
GCTGGGTGTGGCCATGCTATAGGTAATAATTTATAACGGAAAAATAGTAG
AGTAGAAAAAAATACTTATACATTCAAAACGgaaaaaactttgtaaatat
tttcttgtatagagtatattatatatttttaatccCATGTGTATATTAGT
TGTAACACCGAATTAGTTCTTGAAAATATAATAGTTTATTTTTTGGGCTC
ATGTttattttgagcttttttgatTCATGTGTGAAAGGCGAAAGACTCGT
TTTTCTCGCTCTCTTACGCGAGTTACGATTACCATAGCTAAAGATAACAT
CTTTTTTGATGAATATTCAAGTTTGTTACGAATTGATTATCTATTTTAAC
TCGCAATTTCTAGTGTGTGACCCTCTCAATATTTTGCTTTCATCTTGCGA
ATAGAGTGACTTGTCTGGACCGCTTTGCAATTTTTTTAGATGTAAAAGGT
TTCGAAAATAGAAAACTCTTTCCCGAGTGTCCGAGATATACCAAGATGTC
CGTTATCCGCGGAGAGCAAGAAAAGAATCGTGTGATAGACTGAACCATCT
TTAAAATtgattgatttcttttttataaataggttTATAATAAGTGTATT
TTGAGTGGATTAATATGATGTTTAAAATATAATCTTTGTAAATAACAAAA
TtccaaacttttattttttgaccCTACC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_49 | supercontig | scaffold_49:112363..129990 + |
|
