XLOC_042417 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_042417
Unique NameXLOC_042417
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_477:434330..454886-

Legend: gene
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>XLOC_042417 ID=XLOC_042417|Name=XLOC_042417|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=20557bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_477:434330..454886- (Clytia hemisphaerica)
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TCGAAAGATCATGGATGGAAGATGTATCGGTACGTTTTCTATACTAACTT CTATCATTTTAGTCTGGTTAATCAAGACGAACGAAAAAGCTTTCTATACT AACTTCTATCATTTTAGTCTGGTTAATCAAGACGAACGAAAAAGCTTTCT ATACTAACTTCTATCATTTTAGTCTGGTTAATCAAGACGAAAGAAATAGT TTTCTATACTAACTTCTATCATTTTAGTCTGGCTAATCAAGACGAACGAA AAAGCTTTCTATACTAACTTCTATCATTTTAGTCTGGCTAATCAAGACGA ACGAAAAAGCTTTCTATACTAACTTCTATCATTTTAGTCTGGCTAATCAA GACGAACGAAAAAGCTTTCTATACTAACTTCTATCATTTTAGTCTGGTTA ATCAAGACGAAAGAAATAGTTTTCCATACTTGCTTCTATATTTTTATTTG GTCAAACAAGAAAAGCAATAAAAAGATTTGATATGACTAGATCTAAACTT CTGGTATTTCTTCACGTTTTCAGACATTGACGAATGTACAACGGATACGA CGATCTGTGCATTGGGAACATGTAAGAACACACAAGGAGGATACGAATGC ACATGTGGGCGTGGTTACAAATTCAATTCAACTACTGGTGGATGTACTTG TAAGTTTTAATACTCTACTATCTTTCTCAAAGGTCGTTTATTCACTGTCA ATGGGAACGCTGACGGCAAACATTTTGGAGATTTTTCATCTCAATTAATC AAAGGGAAGTAACCTTTAGAACACAATCAGTCCCGCACCCCTGCCACATA TAGGCTTTAGACCGTGAATATTCGACTGCATTTGGCAATTTCAGTTAACT AACATTAATAACATAGGCTTCAATAAACTATATGAAGTTAGATATGTATC GACCCCTAGTAGCACAATGAAAGAAAAAACTTTCTGGACGGGATTAGGTT CAAGTCTAACCGGTGCAAACCATGAGTTTAAAGCCAAACGCTAGAGGAGA ATCTTCAACCTTTCCCAAGCAAGAGAAAGTGAAGCTTTAAGATTTGCGCT GCATTTAAAATGACGGATTAAAACCAGCACTTTTTTTATCATCGTGTTTA ACATTTTCGAATTCTGGCGGTAAATGTTACTTCTAATCCAGCCTTTGTCT GAAAATCACTCGGGCTGCCCAATTTATGCAGGAAATAAGTAGCTCCAAAT CCTACATTAGAGATTCGACTCTAGCCTACGGTTATTCAAGATATGCACTA TTACAATGTCTTCCACAGACCAAACATCTGATTGGTTGAAAGTGACGTAT TGACTGGTTTTACGTTACTTACAACCAACCAGCTGTTGCGTCCATGAAGT AATATCAGGTATTACTTTCATATTTCTAAAAATTCTTTAAATTTAATCAA GCATTTAATCTCTACCTAGATATCGAGGAAGAAAACACAGGAACAGGAAC AGGAACAACCGACAGTTGTCAATACCAAGGACTGTGTGGTTGTCCACAGG GTACTTACCCGATCAATGTCTACGGACAGATCCAATGTTACGGTGAGTCA TTTGAATGTTTGTTGAAGGAAGCAAGGGCTCTTTTTAGTTTGTTTCGAAG TTTGTTTCTTTAAGCCATGCCAGCAAAAAAGCAAAAAATTGTTCTTTGAT TTGATTTTGGTCACTATGAAGAATGTTTCGCTGAGCGTTGCAATTTATAA ACCTTTGGAATGCTTTATTACACAAGAATAGTGTTTTTCACAGACATCAT CGAGTTTAACTGGAACGGGGATGGGAATGATAATCAAGTTGTCTAAGGCT TAGCCAGCTGGTCGTGGGCCCTGTGAAAACAATCAAAGTCTGTCTAAATA TCCTAGATGAATGATCCTAGATCAATGTATTAAATATCTGATAATAACTC TTATATGTTGAAGTGCAGTTAGTACTAAAGAAGTATCTAACCTTATAGAT ACACGTTTTTTTTTATAAGGAACCTTAACTTTGCTCTGAGCCTGGAGTTC CTTATTTTTACAGAGAATTTCAGTCTCAAAGTTCCTTATCGAGTTCCTTA ATACATAGGAAATTTTGAACTTTTTGCCCCTTGAAAGATCAAAATTTGGT CAAATTAGTCCCAATAAGGTACATTATTTTCCAATCCACTTACTCTCAGC CTGGGCAGTTCCTTAACAATTCCCTATTTTTTGAACCATTTTCAGCCCCG AGTTCCTTATAAACGTGTTCCTTATAAAAAAAAAAACGTGTATCCAATGA CTCGATCTCTTATGCTAAAACCCTACTTTTTTCATCACAGATATCAACGA ATGTCAACAGAACGCTTGCGGAGGAACTTCGTGCGTCAACACGCTCGGTG GTTACGAATGTCAGTGTCAAGGAGGCTACAATTATGGTGGTTATGGACAA GGCTGTCAAGGTATGGAATCGTTTTGAACAAGCTATTAATTAATGCTACA TGGGTTCAATCAATAAGCCATGCCAGCATTATATTATTTTAAAAACACAT TTATTTT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00067927TCONS_00067927Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00067926TCONS_00067926Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00067925TCONS_00067925Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00067924TCONS_00067924Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00067923TCONS_00067923Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00067922TCONS_00067922Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00067923-proteinTCONS_00067923-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_477supercontigscaffold_477:434330..454886 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
LTBP1PREDICTED: latent-transforming growth factor beta-binding protein 1 isoform X1 Homo Sapiens
LTBP3PREDICTED: latent-transforming growth factor beta-binding protein 3 isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
4.11 3.16 2.24 0.98 0.82 0.54 0.9 0.77 0.64 0.82 1.24 0.68 2.01 3.22 1.22 1.44 67.29 10.65 1.17 0.98 305.68 254.04 139.12 341.56 353.34 337.88 14.54 10.91 1.12 1.37