XLOC_042334 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_042334
Unique NameXLOC_042334
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_475:70385..84041-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_042334 ID=XLOC_042334|Name=XLOC_042334|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=13657bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_475:70385..84041- (Clytia hemisphaerica)
ATTATTTTTAACACACTTCATTTCAGCCTGGCCTGCTAAAACCAAACTGC GAAAACCAGATTTTAAAATTATATCTTTTATGTATGGATCGATGGTATGT ATCTTCATTTTCTCCTTTTCAGATGAAAATCTTAGATCTTAGAACTTTGA CAGCCACACATGGGGAATGATGAATTAAGGGAGTTTGGTAAGAACAGGAC GACCAGATGGTGTCAATCGAGCGAACGAATCAAGCAATTTTTAGGAACAT TTTTAAATCAAGATAGAAAATTAATGGTTGGAGGTCGCAGAGATTTTTCT TTTGATCCTGAGATACCTGGAAGTTATCTTTCAGGAACAAAAGAGTTGGA GGCCAGACAATGTTGGGATTTCTAGGAAAACTGGGCTAAAGTTGGNCTGA CTTTATTCTGGATAGACAAATATCCAGGTACAATAAACATTAAGTCCGGG ATCTGTTGAAATGGGAAGATATATGAGCATTTTAATATCATTGAACTAAT TCGAGTTATGTGTAACTCTAGTTAATTGTTGAAGCGCTGTTTATGTTCGC AGCTACGCGCACCATTTTGATTTCACCCCCACCGCGCGCCATTCCTGCTA CTATTGCATTGTGGCGTTCTGGCGCCCTGTCCCTCCGGATATTCTTCCAT TTTGTTTTGGCTCCATCCTTCGATTTTACAGCTACCAGAGTCAGTAACGT TTCAGAAAATTTTATATCTTTCGTTATCCTCTGCATCATTTGGTGGATTC CGATAAACTATGGTTATCTTACAATCTCCATTGTACATTTCTTATGTATT GCTGTTCTTTTTCTTCGATTTCTCCGTCTGCGTCAAGAGAAAGCTCAACA TTGGTCAACCTCCCCTCACAGCCTCCGGAAATGATCCACCAGCTCAACAC CAACGGTATGATCCCGCACTTGTTGCATCTTTGCCTCCACAGCAGCGCTC 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TTCGCGCTTTCAACTCGACATTTCTTCAGCGCGCGTATCTCGCACTTGGG AGTCTCATTCACTTTAAGATTTGCCGCGAACATTTGTCCCTAGTGGGTCT TAGCAGCCTTCCCGCCAGCTGCCGCTTCGGAGCACCTTACCTGTACATAA TTTTTGACTTTATTTTGTTAGGGTGTACATAATTCCTTTATCCTTCTTTG GCTTTATGCAGATTTACGTCATTCCGTGTATCTACCCGCCGGGGCCGTGT ATTCATTTGCCCGTCGGGGCCGTACCGCGCATTTACGATTCCGTGTACTC GACGCTCTGCGTATTTGCCCGCTGGGGCTGTTCCGGTATTGCCCGTCGGG GCCGTATCATTCCTTAAGTTGCCTTTAGCCTCAAGCATGATCAACATCCC CTTATTCATCCCAAATTCCGCCTAATCGACACCTCATTTTCGACCGTTAT GTTTCCGAAATACATATTTCTCGTTTCGACCGCATACCTATGTGTCCGTT TATTTCCTGTCCCGTTCTAAGTCGCCTGGCCTTTAAGCGTGTGATGCAAT TAATTCGAGTTATGTGTAACTCTAGTTAATTGTTGAAGCGCTGTTTATGT TCGCAGCTACGCGCACCATTTTGATTTCACCCCCACCGCGCGCCATTCCT GCTACTATTGCATTGTGGCGTTCTGGCGCCCTGTCCCTCCGGATATTCTT CCATTTTGTTTTGGCTCCTTCCTTCGATTTTACAGCTACCCGAGTCAGTA ACGTTTCAGAAAATTTTCCCTCCCGCCTGCCCTCGTTTCATGTTAATACT CGGTTTGCTCTCGCTCTCTTTTCTTTTATTTTAGATCACCATCGGACGTC GTCCAAGCGTTGTCGCCGTTGGCCTATTATAGGTGTCTTCCTTTCTTTCT GCCACGGTTTTTCCCGGTAGGCCCGGTTTTTCGACCAGGGGCAGAAAGAT 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CTCAATCTTTGAAATAAAAACGGTAGCAGCTCAAAACCCTGGAAATTTGC CTGATTCGAGTCTAATATTTCAAAATCTTGTGGTACTTTTTCCAAGTGGC ATTTTGAAATAATATTTTTATCCTTTCATTTTCTAGTTTGAAAAGACCAT GAAGGAAGAAGATGTATGTTTACTCTAAAAAGTGTGATACATTTGACGCT CTTCAAATCTAATCGACTTTTTTCTATCATTCGATACGCTACATTATTCG ATAATATTGAAAGTTTCCGTCAAAAAAAAAACTCATAAACCACGCTCCTC AATTCAATACACTCACTTATTCAATGAAAATTCCCTCTAAAATCGAATTG GAAAGCGTCAGCTTTATTATCTCTGTCTTTTTTGTCATCTTTATTTTTTG ATTAGGTCTAGATTAAATTCCTTTTTACAATCAACATATGATTTGATGCA TAATTTGCGCACTTTCTAAGTATGGAATACCATCTAAAAATGGGTAGAGC AGAAATAATGCTTGTATCGCAGTATTTAGTGATCCAGGATTTTTCCATTG TGAATGGAGGTCCTTGTCTGCTCTCAACTTTATCACAATCGAATCTTAAA AATACAATTTATAGATATTATACGCTTATTTGTTCAGGACATTGATGCAG ATGTCAAGGAAGAGTCTTCGGTTTTCATGTCACCAAACTCATTGAATGCT GATGCTGTTGGTCTACCTGGTCTCTTGTCAACTATAAATTATCCAGATAG GTATAGTTATGCCTTCCAAAAGGGTCGGTTTCAACTTGCGCGCGCGCTTC GCTCGCACTTTTACGAGTAAAGCTTCCACGCTATTGGTCAAGAGAAAAAT GAAGCAACTCCATCAACGTGATCTGACGTAACGGTTGAAAAAAAGCCGAA ATGTGTTTTTTTCGAGCGCGTGCTATATTTTTATGACGTAATCTTTTTTC CAAGCAAAAAAAAATGAAGCCAGAAAGTGTGATCGCAGCGCGCGCAAGTG GAGACCGGACTTAAGACTCGAAATTTCAAAAAAATGCAATAAGGTCTAGG GATGTTGGATGATGGGAAATTTAACCAGGCCCGATATCAAGCACCTCAGA GACTCCAAAAATCTCACCAAAAATTTGGCATGTTTCATTCCCTTTCATTG GCGATCTACACATTGATGATTTTTGAGAAAAAAAAACCTTACAAAGTGTT TTGACGCAGAGTCAACTTTTTTCGTTAATGCAGGAAATCCGAAAATTTAA AGTGACGTCAAAAATCGAATTTTTAGAGCCCGAAAATCTGGGTTCCAAAA ACTTTCGATTAAGTCGCAAAGTGAAATAGACGTTACTACCAAGAAAAAAG CCACAACCTCTACTTAGATCAAAGGCAAATGGATTAGCAGAAGAACTTTG CGTTAGGAAAACCAGTCCCCATCACTTCCCCGATGGGAATGTTTAATTTT TCACTTGCCATTGTACAGTTTTGCGTGAGATCATACAACTTCGATTTCCC AAATGGGCAAAAAAAACTGAAAATATTTCCCCAATGGAGCTGCTCTGGGG GACTGATAAGAAGAAAATATAAACTTGATCAATCTTCAATAAAGTTTCGG AAAATAATGAGTAATTTTATACTCTTTAGGAGCTCAAGCACAAGTGAGAG TATTTCGAAGAAGGTTTTACGAGATAGTGGTTTGTGCAGCAGCAAATCAC AAGATGATGAGAGTGATGAACTTCATTCCATTATTTCAAATGTAACATCC AAAATATTGAATGATGACAAAGCTTGCACCAGTGATTCTTTCAATTTGGA TCTCAAGATTACATCCAATGGTAATATTTTCCTGTTTTTATTTCTTGGGA GACACAAAAGGCTTGACTAAAAGCAAACTGGGAAACAGAATTTTTTATCT TTAAGGGTTTATGATTTAGCATATCATCCAGAAATCTTCCTGGATTTTTT TTGATTTCCACTTCAAATATGGTATTGCTTCGTTACTTTTTCGTTCCTTT TTTTTTCCTTGTTGGACCTACCCCGGTGGAGGTCCTATAAATTAACCTCT GCCCGTTCGTCCGTCCGTTCGTTACCAACTTTTCTCGAGATTGGCTCATT AGTTTCTGATTTTTTGCACAAAGATGTGTAACTATAAACCCTCGAATGTG ACGGAGCCCGATTTTCGAAAAAAAAAATTTGGGGGCAAATTTGGGCTAAA AAACGGCTAAAAAAAGGGTTTTTTGGACTTTGTGAAAAATTGGATCATTG TTTTTTTTCTGACTTTATGCATGAAAGTAGGGTACCATCACAGGTAAAAA ATGGCTCAAGCAGATTTTTGCAAAAAAAATTTGTTGGCTCAAAAAACGCA TGGTTATCTATAAGAATCACTATTGATAAGCATACATCAATGTTCTTAGT CAAATTACTCAATTTTGTATGAGATAGATTTTTTTTTTGCTCACGAGGGC TTACTTTTTGAAGGATATTTGTGTTTAGACATGAAATTTTGCCTGCTTGG CGTGTTTTTATAGAAAACTGGCCATATTCGATATTTTTTAATAAGCACAT TATCAATTACTTAGGTATTAGCTTTTCTCGTGATTGGCTCTTTCATTCTT TATGATTTTTTGCACAAAGATGCATAACTAAAATTTTTTGTAAAAAACGA ATTTTTAAGCTCAAAAAACGCATCTTTATCTATAAGAATCACTATTAATA AGCATACATCAATGTTCTTAGCCAAATTACTCAATTTTTTGATGAGATAG ATGTTTTTTTTGCTCACGAATATTTCAAGAGCATGAAATTTTGGTTTCTA AACGTTTTTTCATAAGAAACAAACNATTGGATCGTTGTTTTTTTCTGATT TTTTGCATGAAAGTAGGAAAAAGATGGCTCAAACAGATTTTTGTAAAAAA CGAGTTTTTCAGCTCAAAAAACGCATTTTTATCTATAAGAATCACTATTA ATACAATAATGACCGGTTAGTGAGGGCTGNGTGTTCTGAATGATTGTTTA ATGGTCACGCTCACGTAGATATCAATTATATATGTGTTAAATGCATAACC AGGTAGGTCCATAAAAGTATCATTTGTTGGATTTGGTCTAAAACGTTGAT TAAAGGTGTCTAAATTGTTCTGATTCATCGCGATTTTGTATTAAGGTTGA CTGCTAGGTTAGTCAAATGTCAAAATATTTTACTCATTCTTACTAACATT GGTTTTATTCTCTTCAGAAAACAGACCACCACCAAATCATCCACGAAACG GATTACTTTCAAATCTTCTCAACCCATCAGACAGTCCAAAATCATTTACT TCAATCACAGATCCCGACATTAAACGTGACACGTCACTAAACATCACTCA CGTTTACGAGCACATTGAACCGAAATATCTAACGGACGCTCTACGTACGA AAGTTCGAAACGTGTTACGTGAACATGACACGAAACAAACGATAAATAAT GAGCTCCACAAACGCCACGAAATTGTCATTCCTCTCGATGAGGATGATAA GGAAGATAGAGAAAGTATTTTCAGCGATAAAAGTGAAGAAATCCTTGACT CAGACTCTGATTCAGATTTCGTTCCATCAAAATCGGACTCTGAAGCTGAA ATGTTTACAGAGCCAAAACGTACACGTAAAACACCGCAACGGTTTTCGCC TAAAGCAGGGAAAGCTAAACGTCGAAAAACAATTGAAACAAAAACTCCTA AAGTTTTAAAAACAAAAGTTTCTGAATCGAAAACTGCAACATCTACTCCA CAAACTAGGCGACCACTTGGCCGACAGAATGGTACTAAAGTTGGCAATAA ATTTGTACATGATAAATGTGCGGCTTGGGATTGTATGAGACCTTCGGCTG CTATTAAACAAATCACATGGGTAGCTTGTGATGATTGTGATGCGTGGTAT CATGTTTCATGCTCAGGGTTGAGTGCTTCTGATGCTATGAAACCAGACAC GAAATATCACTGTGGTTGTGGTTGATTTCGACTACATTTAAATTCTTCTA TCTTTTCGTCATCATAATATTTTTTGACTTTTTAATCTGTACATATGGTC ATAAAATGTAAATATTTGTAAACTGATGTTTTTGTCTTTGGATTTTTTCT CTATTATCTTTTTTGTTTAAAGAAAAAACACATGGTGTTTTTGATACTTT ATCTTCG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00067788TCONS_00067788Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00067787TCONS_00067787Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00067786TCONS_00067786Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00067785TCONS_00067785Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00067788-proteinTCONS_00067788-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_475supercontigscaffold_475:70385..84041 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
20.63 19.31 10.72 7.17 22.85 16.56 10.33 10.18 8.37 7.5 9.62 6.91 5.67 6.19 6.52 6.19 9.58 7.56 4.91 3.9 7.87 8.94 14.83 13.65 18.72 20.04 7.29 4.76 11.25 12.45