XLOC_042128 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_042128
Unique NameXLOC_042128
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_47:182194..210434+

Legend: gene
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>XLOC_042128 ID=XLOC_042128|Name=XLOC_042128|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=28241bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_47:182194..210434+ (Clytia hemisphaerica)
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TAGAGGTTATCGAAGGAAAAAAATGACATTCCATAACGTCGTCGAAAATC TTTACCCTTCAAATATCAAAAGGGGTAGTACCAGGTCTTGAgaattattt gtttttaaagatcCTTTCAAATAATAGTTCTAAAAATATGAAGAGGCGAA TAAAATCAGACCCTGCTCTCCTAGGAAAAAGGCATTAATTTGCACCAATT CGTTGGAAATAAATTCTGTACTTTATTAGAACTTAGCTTTGTATCTCAGG AATTATAACTTACTGTCATTCTATTATCCCGTGGNCTGCttggaacattt ttttcttttttgtggaAGGGGACTTTTGGGATATTGGATCACTGTAAAAT CCTCTTAAAggtcttctttattttttatttctctatGACTCTGATGTTTT CGTATATAGCCATCAATTTCCCTTCAAAGTGTGCTTCAATTCTCAGTCAg atccaaaatctttttttgtttaattttcatgTCATTTTAATTGTATGCTA ATTTTATCTCGTTTGTACCTTTATTCAAAAGCAAAACCCTCTGCATCTTC TTCTCGCCATTTGCATCAGCACAGTGGCTATCAGGGAACCTCCCAAATAT ATTTAAGATTCCAAAATCAATATTTCTTTTGCCTAACCTGCTACCTGAAT TTTCAGCTTACCATTCCCCTTAAGACCCACACGACACGACATGTGATGAT ATTTTTATCAGAAGTTTTTTCTTATTAATCAGGGTTCTTAAAGAAATATG CGGtttataatgtttttatatagaCACAAATTAAAGGGTGAAATTTCCCA TGTTAGGAAATCCGACATGATTGTTTTACCATATAGATTTACGTTAGGTA ACCGAAGAAAAACCCCATCTTGTGACGTCCCTTAGTAAAGCACCAACCAT GTGTTTTCAACACAAAGTAAATCTGATGAATATTTcctcattttattttt taataacttAAACAAATTTTCTATCATTTATCTTTCACTAATATTCACTT ATTTTCCCGAATAACCCTATTTTTAAAGGTCATTGGTTTTATCTTAGAGA CTAATCTATTAGAGGTTATCGAAGGAAAAAAATGACATTCCATAACGTCG TCGAAAATCTTTACCCTTCAAATATCAAAAGGGGTAGTAGCAGATCCTAg aaattatttgtttttaaagatcCTTTTAAATAATAGTTCTAAAAATATGA AGAGGCGAATAAAATCAGACCCTGCTCTCCTAGGAAAAAGGCATTAATTT CCACCAATTCGTTGGAAATAAATTCTGTACTTTATTAGAACTTAGCTTTG TATCTCAGGAATTATAACTTACTGTCATTCTATTATCCCGTGGTCATCTG GTGACTTTTCTTCTCTGCCTTACAATTTATGTATCTCCTTCTATCCTTAT TGCACAAATATAAACGAAAATCAAATCAGAAAACTGAtaccattttccta tgaaaaacaTCCTCCATTCTCATATACATGTGTTACAGCTTTCCTTCGTG ATGATGAATAAAGGGAAGTttatgaagatgaagaagaataCATTGATTCA ATGAATCAATTTCTCTCCAATTTgcttttgtgacgtcatcaatgaagatg aaaattagTTATTCATGTAACCTTTCTCACTGTCCCTCCTTTTCATTTTG ATGTCGTCTAACTAACTGGTGAATAATTCTTTAtctgattttttgattta ttaccacttcattaaattttacttcaaaatattttgctccTTTTAATCTA GGTTGAATAACGCCACAGCCTTATCGTTGGAAGACTTTTACGTTTCCTCC TTCAAACCCGCCAATAACTTTAGATCAAAGTTTATCGAATGTTAAATGCA ATATCAATCGAAATCGATCNATCAAAGTTTATCGAATGTCAAATGCAATA TCAATCGAAATCGATcgattttaaatcgaaatagACCTAGTCTCAACAAT AATTGATTGTACAGAAATACGGAATTCGACGGAAACTACCTCTTTTAAAA TCTACTCTTATATTGGGGAAATGTTTTCACTTTGATTGTGAGAGGTCTGT TATTTTTCTGGCCTGTCATATAATCGGTCTTTTTCTTAAATCAAGTCTTT TATTCTTCATGTAGGTATGCTGCGTAAATGAGGACGAGACTTTGATTGGT TAAAGAGTATGGAAAACCAAAGACCAAGTGATATGGTTTGCATCACAGAT TCACAGAATTTCTCGTCCcaaaaagtttgatgaaaatTGTTTTCCTAAAG TTATATATGTTATGTAAGTCAGAAAACCCATTTTCTCAAAACGGATAAGG TTGGGCAGATTATTTATGCGATAACCCATATGGCATCTTTATTGCAAAAA TCAATATTGCTAAATTCAAGCATCTTACCACCATATTGTGACGGATGGCA GAGATTTTccaataacaaaaaataatgaaaagtaCCACGAAACATATTGT GAgaattttatgatatttttactAGCTTTGATAAGTTTTATAAACGACAA ATTTATTTAGATAAAAAATAGAAACTTAAAATGCTTACTACATTGGAATT GGAATCTAATTGCTTGGGCTGGGCTTTTATTTCATTCATGA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00067447TCONS_00067447Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00067450TCONS_00067450Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00067450-proteinTCONS_00067450-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_47supercontigscaffold_47:182194..210434 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.23 2.4 1.16 0.78 6.92 5.27 6.76 7.35 3.97 5.23 5 3.51 4.18 3.53 3.56 3.58 6 5.11 3.25 3.06 4.98 5.62 9.99 10.53 5.37 6.29 1.9 1.38 7.42 8.98