XLOC_041570 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_041570
Unique NameXLOC_041570
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_455:46065..52781-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_041570 ID=XLOC_041570|Name=XLOC_041570|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=6717bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_455:46065..52781- (Clytia hemisphaerica)
AATCGGAAAGTTCAAGTGATGAAGAAGAATCTGATACGGATCAAATTGAA TATATTGGGTATGTTTTGCTTACTTTTTACTTGATCATGATATCCAATAT ATTTTTCCACTGGTTCTCAACTTCAATTGAGCTAGAATCTGAGAATGTAT GTCTGTTAGTCAGTCAGTATGTCACCTCAATAAAACATTTGGACANTGCC AATGATTATAAGATGGTTATCTTTCAATTAGCAAAATGATTTCCTTTCTG ATTTGATTTGATACACATGTTATGGATATAGCATGTGGCTCCCTAGATTT TATAGAGGAGGAGATCTCCTATAAACAACTTAACTTAAATTATTATGTTT TAATAGCTAAAAAAAGACATGTGTACGAGCTTTTTGCTTATAGCTATATA GGTAAATACTTTTGAAACATGAGCAGCCATGTGTCCTACATACAGGTGAC AGGGAGAGATTCATCCTCAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCAAAGTTTTACTAGCCAAAGGAAT ATTCTTGCTAAACATAAGATGATTATGTTTATATATTTCCTACTGTCTGG ATTTCTGTCTCATTTGAATGGTTCAACTCTTTATAATACACAAAGAAATA AGAAAATAACATAAGAAATTGATTAAAGTTTATGAAAATGTTTGACTTCA TTTGTTGTTTCTATTTATTATCAACACTTGCCTTTAATTCATGGACATAT ACTTAAACTTCCACTTACATTTTCATTTGTCAGATATTTTTATGACAAGT CAAGAAAATTGAGATACAAAAACTAATATTTTGTAGTATGAGTGCATAGT GCTTTGTGACTTGGTTTATTGTACACTCAATGATCGATACATTTCATATC TAAAANCAAGGCGTTTGCGAACTACAATACTTTCCCTTTGAGATGATTCA TGCTAAATGGCATTAATAAGCAAAACGATCATAAGAAAAACCATGACAAA GCATCACACTGTGTTCATAACCAATACAGTTAGTCCGCCTTTAATGAAAT ATTATTTTGTTAGATCTGGTCAGCTTAGTGGAGTCAGTCTTGGTTTACTT GTGATTTGAAAAATCTAATTTCATATCCTAAAAAATTTGGGNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 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CTCAGGCTTTGTCATTTCAAAATTCCAGAATCATTCCAAAATTGCACTCC TAAAAAGTACTTTAGGCATGTGATGAGGAGTGCTATGAATAACTTTAGAA GTAAAATCTAAATTTATGGCCTTTGTCTGATCGCACTCCTCAAGAATTTT AGGTGTGTGTGAATCGTTAATTCAAACAACTACGACCCAAGTTTTTCTTT ATACATACCATAGATACAACAGAACATAAATTTATCTTTAAAAAGCTCTA AACACTAAAATAAAATCCTCCAAAAGCCAAAACAAGGTTGGAAACACAAA AATCCTTCCTCTCGCTAAGGCCGTCATCTTGGTTTGAAAATGTTTAAATC AAAATGTCTCATGGATTTCAGCGAATGGCAACATTTAGTGGGAAAGAGGA TTTGCTGACTTTTAAGCAGCCTCTATAAGAAACTTTTTCTTTAAACGATG AGCAGAAGCCTAGAGACTTCCAAAGACTTAAAGGGGAGTCTTTTATTTTC AATTTCCTAAAGGGGGTTACCACTTAACAGGGGGGATTCCNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNTCCCATAAATATCTGTTCTCATGATAATACTTGAAAATAGTAT TTCTCAACCAGTACTATTGAATTATTTCCCCTTGATAATGATATTGTCAA ACCTTTTAACAATAAGCTTGTCATTCAAGGTTTCAGGGCACTGAGCAAAA AAATTTAAGGAAGTTTTTATGGGTGTTTTTGAGGAGCAGATGTAAATCTG AACCTTTTCAGTCTTGAACCCAAAAATTCAAACCTTCAGACAGACAGGAA ATCTAGTACTATTATTCTGGAAAGATGATTCAAGTTCTTGTTGTTTTTGT 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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNAGTGTCCGAAAAAAAATTGGCACCCAAGTTATTTTGATTCCCCTACCC CTTAGCTTTCCAAAAATGTATAACAAGTGCTTTGACTAAAAAGATCGAGC GATTTTACAAATTTCCCCCTACTATTTTGTTGATATAATATTTTCAAATT GAAGAAAAAGTTTGAATCAAATATTTGTAATCTGATTAATTTTTTTTTCA CTCTAGTGATCAAGTGATTTATGGATAATCAGCATTCAAAAGATGTCCAA ATTGAAGAAATGGTAAAATTATTGTTTCTTGGGTTTAATGGAATATTACA TTCTGCTGGGGTCTCAAAAGGGGGTGGCAAAAGGGGGTGGCAAATGTTTC ATTTCAGGGAGATTCTGAAAAGGAGAAAGAAGGAGAGCATGGGAAAAAAG TTTTGACAAAGCTGATACCATTTGCAGCAAATTTATTACTTAGCAGTTGA AAAATCGTACATTATTGGTTAACTTACAAAGGGCTGAATCACTTTTTTTT TGGCAAAATTTAAGAATAATGGGCTAAACGTCTCAGAGGGAGGGGCAAAA GATGTTTCCTTTTTCTGGTTTGGAAGGTAATTTTTTGGTTTACAGACATT GGAAAGGAACCTTTAGACCGGATGATGAAAAAAAAATTAAAATTAAATTG TTTTTTTTTCAAACTTGAATTAATGGTTGAGAAAATAAAAGAAATGTGTT TTGAGATACCAGAAAACAACGAAAGTTTTGTAGTAGTTAACTTGTGTTAA GGGTGCCATTAAGGAAAGCATACAGTATTGGAGAGCTTTTGTTGTTCCTT TCTATCGCATCATACCATATCATCCGATACGATCAGTTCCATTGATATCC TGTGTGGTATTCTTGGCAGAAAATTAAAACTATCCATCATGACGCCTGCT TTTAACCATGCAGATCATGATTATGATTGAAGCAATTCCTTTTCCATTTT AGCTGTTAACTGGATGCTGGACATGTATTTAATATAAATTTGAAATGATA ACAACGTGATAATACTTCAAAAGACTGCCATCGGAGAAAGAGTATCGTGC TATTTCGATTGATTGACGGAGAAAAAATTATGGTAAACGATCGAAAGAGA CAATCCAACTTGTAATGGTTATATATTACATGATTTTTTTTAGAAGCATA CAAAAATCCGAAAACAGGCTCAGAGATTCTTAGGTCGAAAGCTTGATAAG GCTGAAAAATGCTTGGGGGGATGCTTAAATCTAAAGCATAAATTTCGGAA ATGCTGAAAATCTGTGAAATTCCAGCCAAAAAAGCCAAAATCAGGAAAAA AATATTTTTTGTAGGCTCAAGCAATGCTTGCCATATGCTAAATTTTCCCT ATATCTGAGCCTCGATATGCTTATAAGTGCAATGCTTATAAAAAACATGT ATTCTGCTTTTACCTAAACTTTAAAGTTATTAAAGACTGATTGACAATTG ACAATTCAACGCAGACTATTTCATGAAGGAAGTAATGCATCATAAACTCT CGACGCCTAGATATTTT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00066449TCONS_00066449Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_455supercontigscaffold_455:46065..52781 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.68 2.14 1.27 0.53 7.61 6.15 8.63 9.98 5.69 5.13 3.37 4.74 3.46 4.91 4.06 3.16 2.23 3.32 2.79 2.16 11.34 10.49 3.33 5.59 4.86 10.95 3.55 4.45 5.4 6.83