XLOC_040463 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_040463
Unique NameXLOC_040463
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_418:251945..279226-

Legend: gene
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>XLOC_040463 ID=XLOC_040463|Name=XLOC_040463|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=27282bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_418:251945..279226- (Clytia hemisphaerica)
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CACTTCAAGGCTTTAAACTCAAAAAGTTAAGAACATCTGAAGGCTTCAAA CATTTTGGATGTTCCTATAAAAAAAATAAAACTTCTACAAAGTTAATTCT GGTTAATGTCATAATTTCTTTCAAATTTGTAGGGATTAATGAAAGATGCC CGGGTGCTTCGTGTTTCATTTCTTCAAATTAAATCCACATTATAATGTAA CAGTATGGTTAACTACATAATTTATTAATTACCAATAATTATATAATGAC CATCTCTGTGTGTCTGTCTGCCGCCAAGTCTGCAGAATTGACATGATTAT TTAATGATTTTTGTTTGTGTGAAACTTCCGTCGGTTTTAAAAGTTTTGAG ATATTGAGATCTGATTTAGACTTTAAACCAGTAGACGAAATTTAAGTTGC TGGTTGCTTGATGGAAGTAAAGAATTAAAGCATTTTATTGGCCTGATATT CTTATTCCTGGTTTAAGGAAGCTAGGAACAGGGTCTAAATCCGAAGGTAC TATTTGGCTTTCGTTTGGTGTTGGAAAAACTGATTTTAAAACATGATAGG TATTTCCTTCTCACCGAAAGATTGACGTCGTCATTTTGAGAAATTATGAA CGACAAATCCATTGACTTCCCTCTCCATTTTTAATGGTTTAATATTTTGT TTGAATTATATCAAGGAAGTGGACATTAAAAATATTTTGGCATTAGAATT CCGCTGCTACCGTTTCTGATTTTTCTAGTGGAACTCTTCATAAAACTCTT GTTTTTGAGTTATTTATTTTTGTATAACGGTCTATGGTGCATGGCTTTTT TGAAAATATTTAAGGCTCCTATATCAAAGTTGATATAATTTGAATCGACT TTGGTTTCAATTAACTTGTTGAACTTTTTCTACTGGAGCCAGCGAAGGAT GGATGTTTGACGTTTTTCCTTTTGAAAAAAATTGATATTGAAATACAAAC CCATTGGAGCCTCATCAAATATGAATTCTTTGGAGACCAGGGAAACACAA AGGCGCTGCGATAACTTACAGATGCTTTTTATAGGAATTATCCAATACTT TTGAGTTCAAAATTTGATGTAGGCCAAGAATTTGAGTTCTTTAGTCAGGA ATGATAGCAGTTTGCAAAACGCCTACCTAAGGGATTGTTATGATTATTCC GTTGCATGTATTTTAATCGACATGAGAGAATGTTTGTCAATATAAATAAC CTTTTGAACCTTTACGCTAAACCTTTTCAAATAAAGAAAATTCTTTAACA AGATTAGAAATTTTAGCAATGAATGCCATTTTAATAACTTCTTTACGAGG GATAGATTCTTTGCTTACATGGTCTTCAGAGGTATTGCTTTACGATAAGC ACCTACTTTTCCTTAAGAATAGGTTGTGAATCTAATGATTTTTTTAATAT CTATAGATACGGTAATATCAGTAAACAGTCTTTGAGGATATGAAATTATA GATTGTAAATTCCTTTGGATTCTTACCCATGCCATTAATGAGTAAACTTC TTAATGAAAAAGAAGTACACCCTTTTTAATGAGAACCAAGAAATTTTTTT TGAGGCTGTTTTTCTTTTGTTAACTCTTTTGGCCTCAAATTGGATTATTT CTGCTTTGATACCCTATTTGCCCAAAATTTAGCCATTCCAGGCCGAGGGT TGTTCTTAAATTATATTTGTTTTTTTTTGCCATTTTGAGCCTCATTGTTT TCATAAAATTGTATTTATAAAAAGTGTATTTCGGCTCAAAAATAGCAGCC TTGCACAAAAATGTTTGATAAGATTTAATTCGCACCCAAATGTTGGGGCC AATGGTTCATTTTAATGAATATTTGATCTGGATGCTAAAACCTTTGCGCC GACTTTTCTATAAGCTCCTCGTCTACAAGTTTTTTGTAAGAACATCCAAA ATTTCTTAGGCTTTCGGATGTTTTTAACTTTTTTAATTTTAGCTTAAAGA TGTTCTTAAAACGCTTTTAATTCTTACAACTTTGTGAGTATTTTTGGGTG AATTTTTTAGAATGCGATGTTTTAGAGCTCACAAATCCTTCAAATGTTCT AAACCTGTTTTTAATAATTCGGCCATCGAAGCCTTTTGTTTTTATATTAT TTGTTCTTATAAAAAAAGTGTATAACTATGTTTAGAATAAATTTGCTTTT TCCAATCTATATGCAAAACATTCAAAATCTGTTTGTCTTAGGGGGTTTTG CATTTCAAAGGTTGCGTGGTCAAATTATTTGGGTTTGCTTGATTGCCTAC AATATTACAAATTATTTGTTTGATGGGTTAGGTATTTGAGTTGGGATTTG ACTGACAGGGACTCGTATGGGTGGTACTGTGTGTTACAGTATTATGTGTA TCAAAGGTTTCATTTGACGGTGTTTGCAAATGAATTGTTTTCTCCAATTG TAGTGGTCACTTTTGATATAAACATTCATATGAATACTTGTCTATAGATG ATAATATTTGCTGTCAACAACAACTTTAATATTGCTTTTCTTGCAAATAT TGGCAAATATTGAATATTATTTTTAATGGGTGGCAATTTTTTATTTGAAT TCAATGATTCAATGATTCAGCAATAAGTCTTTTCAATACAGATTTTATCG ATGATGGAGCGAAATTTTTCTGATTGGTCAGTTCTGATGCTTATTTTGAA ATGCTTTCTGATTCGTTCGTTGAAAGCGTGGTATTGTTTAGCTGAATGCA TATTATAATGCCTCTATGGCAAGGAAAATATTTTCATAAAACCGATTTTA ACCAAACGCAGATGAAGGGGGCCTCTCTAAGTTGTTTAGTCATTGAAACA TAATACTGTTTTTGGTAGTACCTGTCATATACTGTATTTCAAATACAATA TCTTGAAAACTTTCTTTATTGCCTCTCTTATTTGTAAAGTCATTGGAACA TCGTATGGTTTTTGGTCGTACCTGTCGTATACAGTATTTTGAATAAAGTT CTTCTTTGACAATCAAGTTATGGGTATCGACTTTTTTTATCGAATTCTAT TTTTGAAAAGGTGGGATTGTGTACAAATTAAATGAGAACGCCTATCCCTA ATTTTCCAGTGTTTAGAAGGAGGGGTCGGATAATTATTAGGTGTATGAAG TGCGAGAATACGAGCTACTTAAGAACCTTTGAAAGTATGGATTAGGCCTA ATTGTAGGTGGTATTAAGTTTGCCAAAGTTAACGTAATTGCAGCAGGGGT CCTCCGAGCTTTAGGGATTTGTCAGCGCAGAGAGGCGAGTTTGTCGAGGA GAAATTTTTGCTTTGAGTAGCGGATATTGAGTAACAAAGAGCGATCTCTT TTTTGAATAAATTGTAAGCGGCTTAAGATAATCCCTATTGGATCAGTTCT AATTAACCATGAAATTTACTCACTCTCGCACTCATAAGAATTTGTTTTTT AATTGCGAAGACACGTTTTGAAACTTCTCAGTTCGTCTTATAAGGTGTCA CCTAGAGGTTGCTGAACACGATTTTTTAATTGTTTCTAATTAGAGGTGAT TAAGCAAAGGCTCTAATATTATAATATATTTATTCTGTTGTTGAGCTAAT TATTGCGAGATATTAAGAAAAAGATAATTAGTGTCAATAAGAAAGGAATA TAAGGCATTGTTTTCGTTTCTCATTTCCTTAATCAGATTGAATGTGATAA GATAGTTTGGTGTGTGTTTTGTTTTTGTTTCAATTTTCTGGTTACGTTGT TCGCCGGTTGGCAAGGCTCTCACTTTCTGAGGTTCCGAGGTATGCACGTA CGTGTCTTTTACGAATAGTGGCATAGAGATGTACATGCTGTACAGGTTTA TTTGAAATCAAATGGGGAAATTCAATCCTTTTAGTGAGTTTTACTGTTGG GAGATTCTCATTATCATTTTAGCTATCGTCTTTCGTTAAATTACCCTAAA TTCTGCTAAATTAGATAAAGGTTGTAGGTAATATCTTGCTTAGTGTACAT GATGGAATTTTATCTATAATTTTCCTTTCGTATTTAATTTCAAAGCAACA AAACTCGAAACACAAATTACATAGATCTGAAAAATCTAATCAAACTGAAT CATATTGAAAAACATGATTGTGGATAAATTGAAAGAAACGTTTGAAGTAA GTATCTCTGTCAATTTCCTCTCATGTTAAACGACAACCCTCACTAAAACT TCCGTAATTTGAGAAACTCTCACAGCGAACTCTCTATTGATGGTACATTT TAGAGGGCTTTTAAGAGTCCTAAGTACACATGAATGAAATTTTACTCATC AAGAAGGAAAATAACTATTTGAGGAAAGTCAACTCATGGGCTTCCTTAGA CATTAGATTCTGTAAAGTTCACGCATGCACGCGCCGAGTTTTAAAATACT AAAGTAGTAATATACTCTGAATTCATTTGTAAGAAAGGATGATGATAAGA AAGTGAAATCTATAAGAATATGAATAGCCCGTAGAAGTGTGCAAATAAAA ACGCACAAAACAAAATGTCAAAAATTACCTCCAACGGGAAATGACATCAA TTTGTAGTATATAACGGTAGTTAAACCCTGCTGACAAGTTCATTCATTTC TCGCAAAATGAGTTTTCGGCGACGTCATAATTTGTCGACCTATTAGCTTC ATCTGTTTCTTGTCTCTTTTCCTCACTCTCTTTCGCCATACTTAAGGAGA TGCCGATTGTCAAGACAATGATGCGAGTTAACCGCAATCTTTTGCTTTCT ATATAAACACAAACATTTTGCCATTAGAGTAACATTTTCATTTTCGGCTG TCATTTCACAAGAAAACATCTTTGAGGCACTTTGTGAACGAAAACACTTA AATGCAGTTATGGTATTGAAAAACACGAACTGTCTTTCGCCTGCTTCGTT GAAAACAACGAAATCTGTGAAATATTCTTTGAAAGCCATTGCTTACTCTC TGGTAAGATCTCTTTGCCAATTTGCCATTGAAATTATATTGATTTATGAA ATATTACTTTTTCTGAATGGAATTGTCAGAGAACTTAATCCTTGACATAA TATCTGATTTTTGACCAATTTTATTTTTTCTCATTTCAGTTATGGGGTAT CGGCAAATCAGGCTACCGATGCAAAGTTTGTCAAATCGTTTGTCACAAAG ATTGCAAGAATCATGTTGTGATGGAATGTCGACCTCAACGATCATTCTCT ATGAGAGGTTGGTCATTTCTTTACGCTTCGACTCGATCGTCAAGGATCCC TTGATAATAAAAAACAACCATTTTTATAGGGCATTGCCATGCTTTCAGAG CAAGGCCTAACACATTTTATATCTATGTACCTTCGGCAACCGTTTGTTCC ATTTATGACTGTAGCGTAAATGTTTGGTCACGGGAAAAGATGCAGCAGAT TTTTCTTACTTTCTTTAGATAATATTACAAAATTCTCAGGGCTTGGTCCA TTCCCAAGAAACTGTTTTTTCAAAAATAATTCTGTCATATTAGTCAATCC TGCTATACGTTCGTTTTTCCTCTTTTTGCCAAAACCCAATCTAGTCCAAC TGACAAATTTCAATCAACCAATAGAATTATTTTTGTTTGATAAGTAAAAT TAAACCTTCTTTTTTTCTTTTGCAGATCCAAAGAAGTCTTTAAAGAAACG AATGAACCACGATTCTTCATGGCAAGGGTCCACAGATTCTGTGGTCAACG AATCATTGGATTCCACTACCATCAGTCGATTCTCCGACAGCTCTGTCGAT TTCTCAGATGCGTTGATCATCGAACGACTGAAAGAAAGAATCACTAGACT CGAAGTCGTAAGTTAATTTTTACTTAATCTTTTTCTCATAGCAAAATTCA AAATTCTATATATTATGTATATGTGAGGTCCCCATGTATGAGTTTGGTAA ATTATGTTGAAGTTAAAAAAATGTTCACTTGTTTTTTTGTGAATGGGCAT CTTTTCATTGAATTTATGAATCCTTATCCCTAAGCTAAATCAACACTGAT AATCTTAAATTTTTGAGATTGTTTCGTATAACTTCTGATTCAAGCTTACA CGCTTTAAAATGGAAGCCATTTTTAGAGAGTTAGTATAATTATGCTGACA TTGTTTCCACACGGTATAGCAAGAAAGACTGCATACATAAAGCGAATCAG ATTTCTTAGCTCTGGGATCTTTTTGTGTGAATTTAAATTTAAATATAAAG CATTTAATTTTATTTTCTTCTTAGGAAAAAATTGAAATGAAGAAAGAAAA TTCAACGTTGAAGACGAAACTGAATACAGCTGAGAAACAAGTCGAATCTT TGCAATCACAACTAGAACAGATTCGTCCTCTCTCCGTCAAATTCATGCTC GACCAACTAGAACGGTTGAGCACGTGTAAGGAGACGGATCTTTAATGTGA TTGGTAGTTGAGAATCAGTCCTTTAACCTGATTGGTTGGTTTGGAGATGC ATCAGTAACGTGATTGGTTCATTGATATTCATCCTTGAATCTGATTGGAT CATTTGAAAAAAAAAGAAGGATTCCGCCAAGCGTGCCCATTTGGAGAGGC TAAATGTACTCATTTTCACATGAAGGCCGTTCTATAGACATTCGTCTGCC GTAACTTAAGACCTTCGTACTGAAATGTGAAATGGTAAACATTACTCAAT AATCTCTATCAATCAAAAGAACATTTTAGAGAGAGCTCGAAAGCTCATTA AACTAGAGTTGGACTTTAATAGATACATCTAAAACTGCTTTATTTTGGAG TTCACCTGGAAAAAAGACAATATTTCTTCTGCTACAGCACAGTTTTCCTC TGTGTTACTCCGAACTTGAATCGTTCTTCAGAAAGCTCTTAATTTTATTC TTTATATATTAAGATGATATACACTTTATTTATAGTATTTATTTATTATC TTAAAAATGCCAGTTAATACCTTTTAGAAAATTTTATAAGGTAACATAGA AAACTTTGCTTGTATATATTTAGTTTTTGCCATAACTTCTATGTTGAACT TACCGTCCCCTGTAAAAATTCAAAACGATATTCCAATGAAAAAAAATAGA AATATTTAAAGTGATATTATGAAAATTTTTGATCTCAATCCTCTGACATG ATGAAAACATGATGACCTTTAGAAAACCATTTAGAGATTTTTCAGCCATA AAAGTTACGAAAAAGTCACTATTTCTTTCGTATTTTGTGTGAATATTTCA ATTTTTATTTGTATATTTTGTTTCTAAAAAATCTCATCAAATCCTTCAAT ATTCATTTCATTTAAAATATTATTCGTTCGTTTAGTTATTTTCTAAATAT TTGTCAAAATTTTATTTTTTTGTAGAATATCGCAAACTTATACGTCAAAA GTGAATTCAATATGAATACCATTCTTTAAATT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00064520TCONS_00064520Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00064519TCONS_00064519Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00064518TCONS_00064518Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00064520-proteinTCONS_00064520-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_418supercontigscaffold_418:251945..279226 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
5.79 5.14 1.41 0.72 56.06 43.79 31.37 31.73 16.99 21.27 18.48 14.85 55.5 49.91 25.21 28.92 29.09 57.49 24.4 25.57 25.71 27.08 13.45 17.03 20.78 22.17 15.8 9.14 7.7 7.9