XLOC_039286 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_039286
Unique NameXLOC_039286
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_371:401312..424129+

Legend: gene
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>XLOC_039286 ID=XLOC_039286|Name=XLOC_039286|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=22818bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_371:401312..424129+ (Clytia hemisphaerica)
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CGTAGAAAAACAGTTATAAAttttgatacatcaatttataaaatttttcc gaaaattttcaaTTAGTTCAACTTTgcagacaatttaaaaaaaaaatcga aaagaaaacgttaattacccattgaaacttagcattttttgcaagcgagg gtaATATAACATTCTATcgacatctttttaaagttcataaggtcattttt gcaattaagagtaattaaattcttaattactcttgatGGAATAAGTTTCC AAACaactttttggcaattttttgctaaaagtgtCAAGGAACCCAAAGCA AAAGTTTCATTTCAAATCTCTCAACAAATTtttcagagcccttaagtagc ATCAGAAAGTAGAATGGCATGAGAAAAATGCTAGAGTTGTTTGCAATCTA CTCACATTGCAATCTTAGTGGGAACTtacttaatttggcagatttagtaa acaaaaaaagcaaaaatccgTCAGACTAGTGTGATGTATCCAAAATTTCG AACTCATTGGATCCATTGGGATCCTGATAGGGACGTGGGGCTAAAAACTC ATAAATGATCCCCGACAGGGTCTCACAGTCCCTGGCTCATAGTGTCCCTT AAACCACCAAAGTCCAAAGTTAGTCTCTCTCATACTCCCCTCATAGCTTT GAACTCTCAATCTCTGGCTCTTGGAAGTTACACTGAACTCTCAACATAAT CGGTGGAAAAACGACATAATTTAGAAAGTAACTCAAGCAATAGGTTTTTT TAGCTTTGAGTATATTGAAATTCGAAATCCACAGAAGATTTACTTTTGTA TATTGATTAATATTTtccccactggctaaaaaattCTTATAGGCTATTTT GATAAATAATGGAGGGATGGATTACACATTCTATAATTTTACTAAGTAGT ATATTGCACTATAGTGGTCTTTTAAATCTAGAGTGCTGCGCTATGACTTC AATCAATTGCTGTAATGATTGGATTCTCTTTTCCTGTCAACACAAACTGA ACATAATGTCGCAGGGGGTATTCCCATTTTAACAAGTCATTTAATTTTGT GTTGTCATGGTAATGAATTGGTAACTACTAAATTGACTAACATAAAGAAG ATAGCAACTCTCGTATTTCTCGTATGAGAGTCTCGTTCATGTTATGAACT CTCATACATAAGTTCAGATCTTTTCTGAGAAACTTTGCTTGaatcaatgt caattgaatattTCTAGTGACTATGcttgaatcaaaacaaaatttcccGC TAACCTGTGACGTCATGGGCATGCCCGAAGCTTTCGTAAATAAAAAGTGC gcgaaaaacattcgaatgatCGAACAGTCGAACGTGCGTTCGAAAATTAG AAAGTGGCCAATCAAAACGTTTGTTTTTATGAATGAACATGCCCACAATC CTTTGCTTTATTTACAAATCATacgatttgaagaaaaaaaactgaataaa aataaaaatatagacaGACAGGAATGGTCACAGCGACCgaatcattgaaa aaatttcaacgtAAACAAACCGAAGAAAACCGTCCTTCCTGTCAAGGGTA TGTGATTGTTTGCGTTCTATACAGGGAACttttaaacaaatattttgcca aattcCTGTTTCGTCTTGCAAGGGAATTTTCTGTCTAAAGTCAAATGGAT TTTCCCTGTCTAAATCCCTACTCTATATAAAGTGAATCTCGTACTGCTTG GCTTTGTCAGTCATCTTCTACAGGAAACTTAATACGGTGTTGAACACAAA TATTCCAAAACATCTTGCTTAAGATGGCTGACTTCTTAGTCTATTTATTA AATGGGATTCTTTCACAATCTGGCTCAGCTAAAATCGAGAGCTGGAAAGA AACAAGCTTATTTTGTAAGTTAAtcatttttaaatagtttttatgCTTTT TTTTGGAGACTCTCAGTGCACTCTGTAAAAATATGATAGGCTAGCCAAAG GCGgacattgatttcaaagcccgaGCTTCAAACTCGCGAAATCCTTAGCC TTTATGGCATGGTACTTTTCCGGTCATATGATAAGTTCATGGTCAAGTAA TATATTCATTTCTTTGTCTTCAGGTAAATCAATCATACTGGAGGTTCAGT GTGTTCGTGGAAAATTGGTCAAGTGTTTACTGCCATTTGCTAAATTCGTG CTACCATGGCCTCTTgtgtttttagcaatttttgcacCCAGAGTTTGTTC CTCTGACACAAGTTCTGATAAGGAGGTGAGcgaagaaaagaagagaaagt GTCATTTTCTAGACGAACCcatcagaaaaaaatcgtgccaGTCCACATCA CAGGAACTCCAAATTTGTCGACCTTCGAGTGATGGTTTCAACCTGCTGAG TTTTGACTTTGAGAATGACGAAGTGCTCTTTGAAGAAATAGCTTTAAAGC TTTGCCAAATTGGTGATGACATGATGGAGAAATACAATGCGAAAAGTTGG TACCAGTTTTGGTGATCGAATTAATCTTTTTAGATGCAAGTATAGTTAGA GTTTTTGTATATAGTTTATTTAGAGGAAGAGgtatattttaaaagtttat tttatcGAACTAGCTAAATTTGAAATAtgaattttatcaattttgtaaca tatttgaattatttttgtccTATGATACTCcatgaattttattttgcaaC TCTCTGTTTGTCTTAtggatttataaaaaaataaagggAAACATTTTTGC TTTCAAGCTTTTGATTTCTATGAAATTACACATTTTAAATTGTGTTTTTA GGTCTTTTTTAGGATCTGCACCAATCGAAGtaacgaaagtgccaaatgat tttcaaattttgaaatttaaaatgaagtaaaaattttcaaatttcaaaat ttgaaaaatgaaaaatgg
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00062679TCONS_00062679Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00062680TCONS_00062680Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00062681TCONS_00062681Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00062682TCONS_00062682Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00062683TCONS_00062683Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00062684TCONS_00062684Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00062682-proteinTCONS_00062682-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_371supercontigscaffold_371:401312..424129 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
21.25 20.7 29.18 28.72 14.89 10.9 12.32 15.39 12.53 17.92 11.44 7.33 14.06 11.34 15.85 17.94 10.91 11.65 10.06 12.91 9.09 8.81 32.67 32.08 83.99 59.41 15.12 11.8 24.79 25.79