XLOC_039145 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_039145
Unique NameXLOC_039145
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_365:2592..13625-

Legend: gene
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>XLOC_039145 ID=XLOC_039145|Name=XLOC_039145|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11034bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_365:2592..13625- (Clytia hemisphaerica)
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ACATGAGCATATATGTCAGCCTAAAATATTTTTCAAGTGGTCATTTTTAT CTGTTTAAAAAGGTTTGGTAGTGGTCATATAACAAATAAGACATTCCACG GCTAGCTAACATTCCACTACTCCCAAAATCTGAACAAATTTTGGCTCAGG GTGAATCATAAGCATGATTCTTAAGCATATAATAAGCATAAACTATGCCT GGATGCTTTGAGAACTTAAGCATACACGAGCCTGACCAAGGGGCATACAC TTGCTTATAAAAAAAAAACATGCAGTTCTTACGTCTTTCAAATTCTTTGA TTTTGTTCACAGCGTCAAATCATAACTCGTGCAAATCTCCCAGACTTAAG GACATTGAAAATGATGAGGTATGAGCTTCTTTTGTTTTGCTTTGTTTTGC CTTTTTAAGTCGTCCGGATTGGTAGCTTCCACTTTGATTCTATACACTCT TGTTTTTATAAGAACATTCTTAAATTTCTATTGTTCCGAACAAATTTGCT CTGAGGGCCTAAATCTGGGGCTGGTGTTCTTATAAAATTGTATAAATAAA AAAGCGTGTTAAAGGGGTGATTTTTACGATGCTTATTTGACCATCCTTGC TTTCTAGAATTTTATTATTTTTCTCTTTTACCTACAAAGGTTTCAAGAGA ATGAGGCAAATTCGACGAGTTTTCGACTTCTTGAAGTTGCCAGGTAATTA GTAAACTTTGCCTTGCTCGCGAAAATAAAACTCGCTAAGTATTTGAAAAC GCTGATTCAAAATAAATACCAGAAAACTTCGCGGTTTCTTGACTTGCGAC AATTATTTTGATTAATAAGTGTAAGAAGTGTTTACCCATATCGCCAAAAC ATTGAGAATTTCAAAGAGAGAGGGTAGGAAAGGCAAATGAAAAGTCTACA CAGGAAAAAGTATGGAAATCACATGCTTGGTAAAACTGATTTCCGAGCAT GTGATCCTGCAAAAAATCACATGCATGTGAAAATGCAATTCACAAGCCAT CTTTTCTCAACTTAAATGGAGTGTCTGACTAGATCTAAAATCACAAATAG GATTGTTTGTCTTTCTTAGAGAGAGAGGTTTAATACCCTAAAAGTAACTC GCTTCTATTCTATTTAACAAGTGAGAGAAGATGGATTGTGAATTACACTT TCACAGGCATGTGATTTTTTGCAGGATCACATGCTCGGAAATTGGTTTTC ACACGCATGTGATTCACGGATTTTTTCCTGTGCTAGTTTAAAATTCACCG CATGGATGGTTTCTCGCAAAGTTCAGGCTCCCTTCGGCCTTAATGATGTT ACCTGCCTATGATCTGCTAGGTTAGTTTCGTTAGTTTAGTTTGGACCCGC ATTGTCTGGACTATCAAAGTGTGTAATGATTCCCTTTAGTATACTCTTTT GATGGTGGTAGACCCTTTCCAATATGTAAATCACTTATTGACTGCGTAAA TTCAAACTCGACTGGGAGACCAATTTCCTCGAATACACGGGTTGCAAAAT TATAGCAGTACAGTCGAAAAAGTTCACGTGACTTCATTCCCATGTTACTT GTTTTACAACTTACAGTTAATAACTTTATTAGTGTTGATAAAATAACTCC AACCAACCAGAAATGAATGTCATGTAACAAACGCATAAAAATTTCGAGTA AAAGCGTGATTTGACTTCAGTCTTAAATTTTGCAACACATGTATTACATA GGTTCGAATTGTCAGTTTGTAAGTTTATACGAACAAACTCTTATAAGAGT TTTTCCTTAGTTTCTCCTTGACGGGAGACTGAAAATGCGTTCAAATCATA GAAAGAATCGGATTATCAAAGTTGTTCTTCTCCAAATCCCTTATCCCACT AATCGCATGTATTTTTTTTTGTTTTCAGGAAAAGTTGTGGTCTAAGTGGA AGAACGTTACGAAAGTTACCCTTTCTCACGCATGCGCTCTTTTTGCAAGT AAGTCTCCATTGTTTCTCTTAAATAAAAGAAAGTGTGTCCGGAAATAGCG AAACAGATCTTGTATGATTTAAAATCCTCAAAAGCATTTATCTTACTGCG TTTATAAATTTGGTGGGAATTTAATTATGCAGGTGAAAGATTGTTTTAGC AAAAAAAAACTTGAAAGAACACAACTATGGAAAATGCATGAAATGAATTA ATTTTTTGCGGGAACTTAATTTGGTGGATGTCGGGTATTTCTAGGTAGTT CAGGAAAATTGGCATGCGTTGTATAAATTTATAGGCTTTTTGCTTTACAT GTCTCAAGTCTGCATTTTGTTTTTTCAGGTACACTGTAAGTAAGAAGAAT AAGATTTCGAGAAAGAAAAAGTTCTTCTGAAAACAAAAATTACGTTTTAA GAGCACAGAATTTAATGTCGATCGAAAATGTTTTCAAAAATGATAAGCGA GACCCTCTTTTATTTTTTTTCCAAAATGGAAGAAAATGGGTGAAAGCCGT CATGTAGGTAGTAATTATCTCATGTATAGTGTGG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00062479TCONS_00062479Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00062479-proteinTCONS_00062479-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_365supercontigscaffold_365:2592..13625 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
FKBP5peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5 isoform 1 Homo Sapiens
FKBP4peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
16.87 15.85 7.56 6.57 29.74 22.13 18.15 18.35 13.59 12.53 9.38 7.69 5.63 4.33 9.76 9.66 13.14 10.47 2.4 3.21 6.16 5.79 19.9 18 20.38 18.98 4.57 2.78 11.86 13.52