XLOC_038509 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_038509
Unique NameXLOC_038509
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_358:4200..23372+

Legend: gene
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CACTGACTCAGCACAAGGAGGTAATATTCATTATAtgaaactgaaagaaa attcttcaattttagcATCTCTCTTCGAAAAAATATACTATAGGTTAAAT ATTGTAACATATATCGCTTCTTGAACCACTTCAATAACATACAATAATCT TTCTAAAGGCGACGCTATCATGGAAGAGATGGACAAGAAGATCAAATTTT GGATTCCGAAACTTGGAGATCCAACTAATGAAAGCTGGCAAAAGACAATA AGACTTTTACATAATATCGAAAAGGTATTCGTTATTCCTAAAACCAGCAA AGCCACATTAGAATACTCACGGCCTAGTTGTTTACGATCGATTTGGTTTA ACTTTAAAACACGAAGAGCAAGTAGAAGTATAAAATAGTGACTGGCGGCT AAGATTTTACAGCTCCTACCAAACCCCGAGTCTATGACAAAAATATAATG GGCATTATTTTGGAACCATTATTTGGCTAAGCCTATATCGATCAACAGCG CTGAGCTGCcctaaagaaaaatattttggtgaAGTGATTTCGGACGAATT agctaaatttaatttatcaTAACTATTCTCCCAAATCGTGTCATTTCAAA CCGGTAACTTCCTACTCAACAACGATTCCTGCCAAAAAATTCACGGAACA GCTAATTATAATAATTTTCGGCCACCTTTCGAATTAAGTTCCTGCCCAAA TTTCTCTCTTTAAGGTAGCCACAATCTATGTTTTTGATCCACTTGGCTGT GGACTTCTAGGTTCCGAGGCAGCTAGCTCACAGTCTTTCTTGTGTTTTGG GCACAAGGAATCTGCAACTCTTGCGTCTTCTTTTGTCACAATAACATCCT TAAGTGAAAAACAACGTACGTGAACCCAGTGATCACACCCGTCCACAATA CACCCTATGCTGGAGTTCTTGAGTTCTACAAAGGGTCTATTGCCTTTGAT 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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGAAGTATGTTGG CCCTATATATGGGTTCATTCTTTACTATAGGGGGTAAATTTGCCTCGAAA TGTTCAATCTCCGAAAGGAGTCGAAATATCACACCCTATCCGtctaaaat atttgaagaaataTATTGGCCCTCATTCTTTATTATAGGGGATAAATTTG CCTCGAAATGTTCAATCTTGGAAAGGAGTCGAAATACCACACCTTATCCC cctaaaatatttgaagaagtaTGTTGGCCCTATATGGGTTCATTCTTTAC TATAGGGGGTAAATTTGCCTCGAAATGTTCAATCTCCGAAAGGAGTCGAA ATACCACACCTTATCCGtctaaaatatttgaagaagtaTGTTGACCCTAT ATATGGGTTCATTCTTTACTATAGGGGGTAAATATGCCTCGAAATGTTCA ATCTCCGAAAGGAGTCGAAATACCACACCTTATCCGtctaaaatatttga agaagtaTGTTGGCCCTATATTTGGGTTCATTCTTTACTATAGGGGGTAA ATTTGCCTCGAAATGTTCAATCTTGGAAAGGAGTCGAAATACCACACTTA 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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNttttttaaattcatttttttcgccttttggcacata tctttaataatttttctttcgttgatggtgaagtcgtctgtaatgctaaa gccaccaatttcattggatcgtttcagcttatgcagattttgcattatcc gttctttttcctctttactttttaagatcaacttgattggacgccaatgt agccctcttctgttttgtccaatgcgatgacggtttgatatctgggacgc caatgttacctattataccttcaatatctattttgtattgttcctctttg ttatctacctctaattccaccattccatgtataataatatttcgttttct tgattcgatgtctctttcttcattcttgttttcttgttggtgttctctca ctgctgatttgaaattatccttgtgtttcttagttatttcagcgtatgtt ttttctgatattttttctaTGTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNaagtcagc catcttattggttaagatgttttcgatatcgttcttaaggctgcggttct tggctagctggtttttgagctttttaatgacgttgtccttcttctcaatc tccctctgcatcatatgatacgagttctttagagatcgtgttatccgcac gcaattctgacatagatattgttcgttataagtgtttgcgaaatttttta gctgataaagcggtaattgtgtgcactcgtagtgTACCATGCAGTGTcat tttcggcattttagacggttttggtCATCGTCATCTGAGCAGGAGGTGAG AGTGCATGTTTGGCTTTGTTTAGCTTCGTCAAAtagttgtttttcttgct ttttgtcggttttttcgttcatgtttttttaacatggttacaaaaaatat ttgtccccaggatatggacactttggtcAAATAAAATACTTTGAAGATGA TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN agtgcatgtttggttttgtttagcttcttcaaatgggtgtttttctttct ttttgtcgggtttttcgttcatgtttttgattttgctaaatttcaaccat ttttgaagaactgGCTCATTCGTTgaccaaaaaaggtaaaaaaacggtca aaatctaaaaaaagtggatttttgtcaaatttttgcatttctcaGTGGGC ACAGAAAGTCTGGAGGACGACTATATGACGTCCAAATCACGTCCGCCCGT CCATAGCCCGTCCCGGTCAAATTGGGACGTCCTTAAAACGTCTTTAACGG ACTTGATTTTTAAAAGACGTCTAAAAGGCGTCCTAAAAACGTCCAAAATT ATGTTATTAAGACCGGTGATTGGAAGTCTGGTAACGAGTGTATACAAACA TGAATGTAGTAGGGGGTGTAATATTTCATGACATTGATTTTGTAAATGGA AATATTAGAGCGTTCAGCAAGAATTTCACaaatatataaatttcattttc 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CGCTTCACTCGTGACTTTAAACTCAAACTACGAAGTGTAGACAACGTCAA ACCGAACAGAAGTGGGTTAACTTTGGAAGACGTGAACAAATTTTTCGTCA ATCTGGAAAAAAAACTCGACGGGGCACCACCCGAGAATATTTGGAATTTT GATGAGACCGATTTCACTGACGA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00061370TCONS_00061370Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_358supercontigscaffold_358:4200..23372 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.17 0.13 0.14 0 0 0.26 0 0.3 0.16 0.52 0.38 0.08 0.58 0.17 0.1 0.36 0.54 0 0 0.28 0.12 0.35 0.28 0.2 0.8 1.65 0.17 0.28 0.5 0.14