XLOC_038360 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_038360
Unique NameXLOC_038360
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_354:43316..55830-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038360 ID=XLOC_038360|Name=XLOC_038360|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12515bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_354:43316..55830- (Clytia hemisphaerica)
CTAGAATAAACATAAACAAAAAAAACTAAAAACAACAAAAACGATAACTA CTGAATACATGCCTAGATGGCATAAATGAGAAAATCTCGCACATGGATAT TGAAAATTTCGAAAGTAGTTACGTTTCTACCGTTACTCAAACATCTGTTC CGGACAGCTGATCAGAACAAACTGCTGCCAGTTCAACTAACAAAAAGGAA TAAGCGTCGCGTAAAAACTTTCAGATCACGAGCTGAGAAACCCAGATGAG AACTCCACGTCAAAACACCCTAGGGATGGACAAGGAAAATTGTAATTTGT AACTGATAGGTGCTTCCTGAATAAAACAGGAATGCAGCAGAGGAAGGAAC AGTTGATATCATCACAAAATCGTGAATACCGTAACAAAATCTGTCAGAAG ATAAAGAAATTAAAGTGTACAGTTTTCAAGAAGAGTGACATATCCATCTA CATTGAAAAGGTTAGTTTAAACTTGAGTCGCTGGGTTACGGCGAAAACTT TTTCTAATTTTTCAACTAAAGTTCGGACTTGTCGTCCCTCGGATTGAAAA ATTTCTACATGAATTGAAGTGTAACTGAAGGGGGAAATCGCCGAAGTCAT GTGAAGTATAACATGATTAAATTTCACTCTTGAGTGCGTTTCATATAACC TGCGATTAACCAGCCTCTTCTGAACAACTTAAGCCTAAAAACGTTCTTAA CATGCTCTTATCCTCATCATGTTGAGTTTTTTTTATCCATTTTCCTAAGA AATTGGGTGTTTTTGAGTGTGCGAAGACTTGAAATGTTCTGAACTTGTTC TTAACATTTATGCCATTCTTCCGTAAGTTCTTATATAGTTTCTTCTTATG AAAAAAAACTTAGTATCTTCTTGGATGATAATTAAAATTTTCAGACTCAA ATGAGAAATTTTTTACATTTTTTACGCAGTCAGATTTAGGCTCAAAGATC 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TCTTTTGCCTGAGAAGAATTAAAGTTCGCCTCGAGCCCTTCGGGTTTAAA ACTCAATGTTACTGTCCTATCTAGCCTAAGGGCCGCTTATAGCTTATTGA TAGACTGGGTGGCGCTGATAAGTTGCTTGGTGTAATTTGGCAGGCTTCAA AACCCCGACAACTGCTCAGGTCCAAGAAGAGCCCCTTTACAGATGTACTC AAACACTTTAGGTGTACAAGACGTATTCTACGGTTTAATCGTGCAGATTT TTTCATGAATCGTTGGAAAAAGAACACTTTAAAATGAAAGTGACTTGTAG GTTAAACATATCCCTTTAATCCATAATTGCACGATGGGTTATTTTCTTTT TTATTTAGTGGACTTTCAAAGAGAGCAATTAATGGTTAATCGTTAATCGT TAATTGCATCCTGTAGTCATAATATTTGAGAAAAACACCCAGTCTATCAA AAAGCTATAGTGGCTCTTAGGCTAGGTAGGACAGTAACATTTACCACCAA AATTTTGAAAATAAACCATGCAAAAACCAAGAAAATATAATATTTGAAAT AAAAAGAAAATTCCCACAGACGATTTGGAAGCGCTCTGACTTAGGTTGGA AGGATTGTGTTCTAGCTCTGAGTTTTAACATGAGACTTAAGACTTGGGAC CTTGGGATCTGAGGATCCAAAAGTTCAAGAATGGTTATATATAGGGCTCA GAATACAGCCTTGATTAAGTCTATACCCAACCCAAATTGAAAAATTCGGT AAATTTTACAAACAGCCAAAAGCGACTTTCTCGCCCGGATTTTAAAATGC TAAAAACGAGAAATACACTCTTCTCAAGATGCATAAATTTATTGTTGTCC TCGTTTTCAAACAGATTTCATTGCTATGAAATTATACATTTAAACCAATT TAAATTCAAAAAAGGCAAACTTTAACTCTAAAACAAAAGTACTTGAAATT CAAAATGTCTCATGAGGTGTAAACAACACAATTATCATTGTGAATACACG CTTTTTTCTTATAAGAATAGTGTACTTTGGTTGAGGGTAAGCATTATTCT TATTTTTCTATTGTTCTAAACAATAGGCCTATTGTTTTAAACCCGAAATC TCACCCTGATATTCTTATAGAAGTTATTCTTATAAAAGAAAAAGCGTGTA TGTAATTTTATAGCAATGGAATCTGTTTAAAATCGAGGACAACAATAAAT TCATGCATCTCGAGAAGAGTGTATTGACTAAAACATATTTTGACCGATAT TGTCTCGGTGCCAAATTCTACAGGGTGTCTAATTTCGAACTAAAATCATT TTTTCCGGTTAAAAATGTCCCTTTCTTCGAATTAACTGACAGAAAGAAAT ATCAGCATTTCTGAATTTCCGTAAAAGTGATCTTTCCAAAAAGTAAAATA TTTCACAAAATACTAATTTGGGCTCAGTGAAAATACTCACCGAAATGGTC GGAAAAAGTTTTTTAATCAAAATTTAGGGGTTTTTTGGTAATTTTAGAGC AGAAATCGAATGCTGTAAACGGAATTAACCTAAATTCTCAATAAAATTTG ACCAATATTATAGATCCGGTCCCTTTTGGAGAAAAAAGCCATTATCAATA AAATTTTGGGAGGTATTTTTATGATTTTATTACAGTTTCAAAAATTATCA AAAAATAAAATTCAGAAATAGACTATAGTCTACTTTCAACCTGAGTATTT ATGTGAAATTCACGCGAACCGTGCAATTTATGTAGGAAACTTTGGCCTTC TCAATATTCGGAAATCTATGATATTGTCACACAAAAACAAAGTTTGAGGT TTTACCCTATTCCAAACCCCGGGCAAATGCTCCCCAGCACTATGTTTGCA AAAAGACAGGAGATGCGCTTGACCTTTGAAAATTGGAAATTTAGGGTATA 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ATCAATAAATGGGCAAAATAGACCCATTTGGAGAGTTTCACAAGAAACAA TGTGAATGGATTAATTGAAATAACTGAAGTTTAAAGTATCAGTAAAGTTT ATAATATATTTTTTGTCTAGCAGAAAATACTTTTTTCCTTTTCATTTTTA ATCTTCATGTTAAAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00061138TCONS_00061138Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00061137TCONS_00061137Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00061136TCONS_00061136Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_354supercontigscaffold_354:43316..55830 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0.05 0 0 0 0.04 0.2 0 0 0.05 0 0.17 0.03 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.04 0.24 0 0 0 0