XLOC_037889 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_037889
Unique NameXLOC_037889
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_338:7558..38143+

Legend: gene
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tggctggtcattaaaatacaaagttaaatcaaaacaaaaatggtagagta gagctgcgagcggagctgtgtagctgtattttaatgaccagccaggtctt ttatttgagggctatgcatgttagcctccactgatgcaagttacccaatc tcacggtacttctcctgtttttctttgtaCCTCCATGGTCATAGTTTCGT AATGCAAGAGGTCAGTTTTGCTTTATTTCGGAACTATTTACGATATGCAC TGTTGCAATGATTCTGAGTTCGGTCGTAACTGATGTAAGATCAGTCAaaa cgtcacttgcaaccaatcagctgtttggtccgtgatgtaatgtcagaaga cgtTGAAGAGATACCTGTCATGACTACGTCAACTCTGAATAAAGTTAGCT CTTGTTTGACAACTTTTCATTTCGTTTCGTTACAGTATTTGCGCCTGGAA GGCCCGTATACTGGTATGACTGGATCTTAAGCCCTCTCTACACCTCACAC TTATCTAAACCTGGCGCAGATCCCAGTCTACACGTAATTTAGATGAAATC atctcaatgaaagaaaatagaCAGATGTTACCAAACCTGAGATTCACTGG TTGTTATATGGATTAAGACTAGTcagtgtttttaatgaaatgcTTGTCGT CCTTGAGGATGTCGATACAGTACTATGAATCACGGCAACATCCACTCTTT TGGTGACCGACATCCAGTAGCATTGTCTTTTGGTGACCAACATCCAGTAA TATTGTCTTTTGGTGACCAACATCCAGTAGTATTGTCTTTTGGTGACCGA CATCCAGTAGTATTGTCTTTTGGTGACCGACATCCAGTAGTATTGTCTTT TGGTGACCGACATCCAGTAGTATTGTCTTGGTAAGAAAAACCTAATTTAT GCATTCCCCTTCCAATGACCACATCCTTCAAATCATCAACACACCATGCA 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00060223TCONS_00060223Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00060224TCONS_00060224Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00060227TCONS_00060227Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00060228TCONS_00060228Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00060223-proteinTCONS_00060223-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_338supercontigscaffold_338:7558..38143 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
SHOC2leucine-rich repeat protein SHOC-2 isoform 1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.84 1.78 1.06 0.72 50.28 37.14 33.86 36.9 21.28 26.28 19.32 17.59 15.75 14.41 14.01 17.12 18.07 19.95 15.15 20.35 16.38 16.03 8.17 11.36 15.23 15.57 13.16 10.34 8.14 8.22