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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at scaffold_308:20974..33446+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036665 ID=XLOC_036665|Name=XLOC_036665|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12473bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_308:20974..33446+ (Clytia hemisphaerica)
CGTCTTTGACCAAGGGTTGTAACAATGGTTTAGTGGCCTTAAACGTACAG
AAtaacattgtttttatttttcagtttctagCTCTGGCAATGTTCCATTT
TATTTAAATCTTTGAAAGAGTTACAAGAATTTCTGATTTCCACACTAAAG
ATTCATTATGGCGGACAATGGACTTTCTGCGACGGAGATTCTTTCGTTGG
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CTCAATATATTGAACTATTTAACACCTGGACAACTGGCAAAGTTCTACAA
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TGGGAACCTATTTGGAAGGATTGGTAAGAAAAACTTTGATATAAATGAAA
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TGATGATTCATGATAAGCATATAACCGTCACCTTGCAAAGCTAATACCTG
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CGgtccaggacattcttatttcaaccccccccccctcccccgcttattaa
ttctaggcaaaaaggtttttgaaaatttgatcttTCGCGCTTTTTCTGCT
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ttccaaaccccccatTTATTAGGTATCCGAGAGTACAGACTTTCATCTGA
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TCGAATTAGAAAGTTAACtctgttttctttttactttttagcttcTTTTG
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GTGAATCGATGGGAATCACACCAATTATTCGTTTGACATTATTCGGATTA
TCGGTATATTTTTGCTCTTTGCACGATAACAAAATTGAAGCTATTCGTac
tatgcaccattgcaatgtcttctgacattacacattacatcacggatccA
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gccaatcagctgttgggtccctGGAAGAcgttgcaatggtgcatatcatg
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Gcacgctaatgacgacttactattggtcaaaagtattcaaattttttgaa
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gaccccttacgcaaatcgaacgttcgctttcataatggcggaagttacgt
tacttaacaaaacatgaaaaaactcTATACCTGAGCTAGACTAGCAAatt
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GAGCTTTAACTCTTAGATCCCGAAACACACGTATTTACCTTTAaaataac
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TACTTCTAACATTCATgacattttttgtacaaaaaagaCGGAGAGCGTGC
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CCGAGATTCtgttttctttgagaaaaataccctaaaatttcaaCCACACC
GTGAAATTGCCTTACATTTCATCCCCGTTTGAAATTCAATCTGAAAGAAT
GCACTCAAAAACCATCCCACGTGGACTTTTGGAGCTTAAAACAATAGAAT
CTTTATCTTCTtcgggatttcgatagaaaattTCATCCCCGCTGTGGGAA
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GGTTATCAACCGTAGAAATGAAGACGCCATCCTTATTAAAAACTATATTA
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CTAGTTCCCGTACCTCAAGCAGTGCCTAAAGACCAAAGAGTGAAGCCTGG
AGCTGGTTATTTTGTAGACTAGAGTAAATTTAACAATAATTTTCGCCATT
GTCTTTGCATCATACTGCAAAtctctaagaaattgggtgtcttttaaagc
cttaaaaagatcttaatttgttcttaatattttggtcatcgaagatttat
gttcttatatagtttgttcttataaaaaacatcttTGTGATGAATAACAC
GAAATATTGAGCAGATAAGTTAAAATAATTGTTCCATCACTTTAGGCCAT
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GGTTTGGCAGCTAATAGTATCGTCGATGTCATCTTCGGTGAAAATAGCGA
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CGGCCGAAAATATGGAGATGAGATATTGGGCAAGCCATCGATAGACAAGC
GTAGATTTAGGCCTGGCGTAAAAAGGTCCAATAATGTATTTCTTGTCAGT
TAGTAACTCTGAGACCCCGTACTAGATTGCGCTCAATGAAAATCCGATTC
ATTGCTAGAATCTCttcttttgctttcttttttcagtttttatgaAGATT
TTTCTGTCAGTTTATGTGGCAATGATGTCCTATCCATTCTTCGTGGCGCA
AAATGTTCGAAACAAAATGATTGGCTCCACGTTTGGAATTTTAATCTCCA
CGTATTGGTAAGAATCCCGTATTCCTGAATAAATTTCAGACATTTTATGA
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ATTTAACATGTATTTTTTGCAGATACTAGTATAACTTCTAAGAGgatcca
aaaattaaaaatgtaaaaaaaatcaataattagCGCAATGCACCGGCTTT
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AAATATTAACCAAACTTAAAGTCTTATCTACCGATTTTTGAGTCTCCTGC
AAAAGTTTCTGTGAATCTTCGAAAAGTCCGTTTAAAAATTCAACCATGAT
GCAAAAATATATCCCATTTAAAGTTTCTTAGTGTCAAGTTATCATCATAA
ACATATTTTACAGGCTTGCATTTGAGTTGTACAAATTTATTGCTTATGGT
GGTTCGTGCTTTAAACAAATCAACGAACAAGAAGGCTATGGACGAAGTAT
TTTATATGTTTTATTTGATATGCCGAAATTGATCTGTCTTGCTGGTTTGG
TGCTCAAATTCGCATATAATATTTTCGTCACTTTGGAGAAACGCTCAGAA
AAGAAACGTCAAGGAAAGGTAAAGCTGGCATATTAAATACCACACCACTG
CCTCGCAGCTCCGGTGAAAGTATTCCCATAGTGGGGATgataatttatat
aaaaagatattccacCTTTAAACTCCAGTGAGGATATGTTTGGAGTGCAT
TAAAAGTCaagatgaaataaaagtcaattcCCAATGGTGTTGAAACTGTA
GGGTGAATCTCCTACCGGGGACAAAATAGTGGGGCAGGGATCCCtctggg
tctgtgacacagggggatgtaagattgtttaaatTAAACGTCAATTTAAT
CTATAGCACCCATGATCATTATAAAAGAACTTGGACATATCTATAGGAAT
ACTTTTGATATAGGATCTTCTTATAAAGCAAAGGTGTGTCAAATTATAAA
GATCCGATTTTGTAGGAAATCTAGCACCAAATGTTTGTTGCATAAACAGG
ACAAGTCGTTAAACCAAGTTTTAAAGACGTCCATGCTTATTATTTGACCA
GACAACAGAATaacatttagaaaaatttaaaatgataaaaaatatctTAT
ACTTTTTCAGCATGTAAATTGGGTTTATGAGAACGATACAAATTGGAAAG
AGGAATACATGTATATCCACATTaaagaagttttcaaaaagCATCGCATT
GCCAAAGAAGAAAAACGATTGAAAAGGTATGTAGTGTAGATACTCGTTTG
AACCTTGATCGACAGACGATAGCAAAGTTTGGATCTTTCTTCGAATTTAG
ATGTATCAGACGAAAAATATGAACAGCTTGTCCCTTATTTTCTCATTAAA
AGTGGCCAAAAATAGTTGACTCTGTTGGATGGATGGAATGATTTTTCTAT
CCTTTTCTATTATCTTGACTTtcttagtctacacaatagctccaggcttt
tactcttggtctataggcactgctataggcggccactagtaaccCCCGCC
GAAAATCACTTATTAATAGGTTTGAAAATAATAGACAACTTttacaaaag
atgtttatcaatagaaatttcaaataaaagaatgtttaaatcacagctga
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aatcaaaatcaatgaaaaaacatTATATCATCTCAACTCTCTCAGATATG
TTCGGATTATGAAAAGGGGGCCACCAATTTGCTTGTGCTTGCTCAGGAAC
AAGTAACAGAGATGTccccaaaataataaaaaaaaggatcattttttctt
tttgtttttgcagACTGGGCAAAGTAGAAGAAGAGTCACCATTCTTACAA
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AGTGTGTTAAGATAGTGTTGTACTTGCCGTCTTTTTCATCTACTTTCTTT
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GCAAAATTTAATTCACTTGAAGTTCTAGTAACTATAAATTCGTCATCTgt
attttgatgcttttaatttttcatcaggATTTCAGTACGGCACACgattt
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TTCCATATCTATCTTATATCAACGCTCTCTAAGCCAGCCCATTATTGGCT
ATTTTGGCATGTAACAGTTTGCTGCCAAAACTCTCTATCTTTAACTTTAA
AGTAATAATCTTATATGAAAAAACTTTGTCAGAGGACAAGCAGAATCTTA
GCCAGTTACGTACTATTATATGTTGATATGATTTGCTTACTAGAAACATC
ATTTTCTCTTTTAGCAGTTAGTATTTATAACGAAAAATACTCTCCTGAAA
ACTGTTGCCTCGAATCAAATGGATATAATAGCCCCCTTATCACTTCTTAA
ACTCTGAAATCTTTCTCAAAAGCGGGaatacatccccttctcacagaccc
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GTTAGAAGATTCTGTGGGGATAAGAAAATTTTGCAGCGAGgatttttaat
tatttgataGATTTCAGCGTCGACAAAAACACGATTATAATTTTCCACTA
AGCACGATATTGGCCGACTTTTCCAGTGGGAGTGGTCTTATCGGGTCTTG
GGAAAGGCTCATTAACTTTGTTTGTCCATTCTTAGATTATGTGTTTCTCA
ATCGGGCTCGGTATAGTCATCTTCGTAAAATTACTGAATCAACTCATCGA
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CTGGAAAACTTTGATGGGAGAAATATTCGCAGGGACTTAATGTCGCGGAT
GGcgctattttcaagattttctgtCTTTTTATTGCCAAATTATACAtctt
ggttgttgaaatacgcattattagcgcttctttgatgccagtaaataTTT
ACAAGTAATTTATTTGACAATTTTGAggtttttttaaaatatttcgcaGA
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CGAAGCCgcgaaatccgcaaaattaaatccctgcGAAAATTTATCGCATT
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aaaaacaaaattttgagccCAAGATgagcactccaaaaccatctctaCTG
GATTTTCTGACCTGGggacaatataatttttaaataaactCTCATCTGAA
GTGCATGTTCAGAATCACTACTATAGATATATGTATGATCGTAAGGAATG
GTAGAAACACTCAAAATTGTTAGAAGGTGAGTGAAAGTTGACACAGGTTT
ATGCGTAGTTGTAAAAAATACCACATAACCAAACGCATATAATAAATGAA
GTCAACTTCTTTCTTTTCCTTAGCCTCATACTGGTTGGCAATGATGACCT
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CGTCACGTGATAAAATTGCGTTCCGGTGATAGGTCCTTTTTACCAAGTGG
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GTTTCCAAGTTGGTTACTGTATATGGGGTGAGTTTACTAATTTTCGACAG
GCAGCATATGACCACATAACATAGAcaaactaccttatcggccaaaactt
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CTGATTCGCTGGCTATCGATAACAGGTAATGTAACATTTTACCTTCTAGC
TAATAACCTCCCAAATTGAGACActaaatcatatttttgggCGTATTTAA
TTGAAGATCTCATTGCAACCTAGCCGACAGTATTACTTTTACCCATACAG
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TTTCAACAGTCTTCCGATCAGAACAATCAGAAATAGTCGCCGTTAATGTT
GACAATCAACATTATATAAAAGCTAGATTCTTGTTCAAGCCATGTTGTGA
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TTGAACTAGGTCTATTTCAAAGCATATTAGGGGTCAAAATATAACTTTTC
TACCGCATCATCTTATAGTCTTAACCAATAAGTTTCTGGTCTCTCCTCTT
TCCAGACTTTGTAGCAGGCCTTGTATGGAATCGGTTCTATAGTGAGTGGG
TGGTCTTTCCATGTATATCTaaatttaaatatttcacaataCCCGTCTTT
ACTTCCTTAATCTTGAGACCTGTTTCCCTCTTCAGAGTATCTAGGAAAGT
TGATTTCCTTGATCTTACTATAGACCCGTTGGTGACCAGAAGAATACTTT
AGATAGCTACAGTACTTTTAACTCTTTCTTTTATTCTTCCTTGATTTCAG
GCGAGCGTATCACATCTTCTCATATTTCATGCTCTTTTTCAATATCTTCT
TTGGTTTGGTGTCTTGTTTACTTCGTATCATAATCGGTTTGGTCCTTGGA
GTAGTTTTCATGCAGAGGTTGAGTAAAAGTACTCTACCAAGATCTTATGA
AAGAAGGGACCGGGGTGAGTGCGTTGTTTTAGTTCTCGCAATTGTTATAA
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AACACCCGCTTAGAAAATGTGTACGCAGTGATTTAATCATTTTAACCCTC
TTATCTGAGAAAAAGGTTTACAAACTTTTCGACTTCAAACACTTACACCA
CATATCAACCAATTGAACACAAAtttcatgctgattaagaaaaaggtcag
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AAGGAGACACTGTCCTGtaatgaaacatgtgtctgatacgttacacttat
gtaaaaataaaaccttttaagTGTATTTTTACTGAAGCGTTGTTATCCCT
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CGTTTCCTTCTTGCTTCTTGAACATCAACACTCGAACCCAGCTCTCCAAT
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TTCTTCAAAAATGAGCAAGGTAATTTGGAACAGAGGAAAACAGGAGGGAC
TTCGCTTAAAAGTCTTCTTCTtcgttaaaacttttttttacgtTTTCATC
AAACATCCAGTTTCAACACATTTACTATCAATTAGGTAAcgaccattttt
taactttttttgctaaaattatACTTCAAAAAGTCTGTAATTTCTACAAT
TGAGGGGTATATTTAGAATGAGAAAAACGAAAATTAAGTACTGCATGGTA
AatgtaattcaaatctttcttctttttctagtTAACAACTCGCAAAGTTT
ATGCATGGAACTCATCAAAATCGATAACACTGTCgcaaaaaaagcaaaag
aagCTCGCAACAAACATATAAGAGCTCGAAATCGTTGGCATTTATTCGTA
ACAATGACAATGAACCCTAGCATTATCAAATACCGAATCCGATTTTTAGA
TGTTAATATAGAGAGTTCAATTCTTtctgacaaaatgaaaaatctacTTG
ATGAAGGCCCTAAtatgaaaatcaaagatgataaCGATGATAAGAGTAGA
CCAAGTAGCAGTCTAAGTTTACGGCAACGACAAGGTAAAGTTTCTCATGC
ATACAGTAACGAAGAAATTGATGAAAACTATTACGTTTTTAAAGGCGAAG
TCGAGAAACCCGTAATAGCTTAAAATTATAACTTAGGTTTGTTAATTGGA
GGAGCTCAAATGATGTCACAATTAAAGTTGATTTACGGAAAGAATTACAA
CTAAAATAACAAGAAAGTTGTCGTGTTATGGAAGTCACAATGGCATATTG
CGAGGTTTTCAAAAGTGTTGAATGCACACTTTTAAAATTTGGTAAAAGAA
TATGAAAGTTGATAGTTAAATGTATTCAAGCTTTACCTCGAACCTGTCGA
ACCCATTCCTATACTACAACCTAATTCTTAAAACAGGCACGAACGGTTAC
ATCACGTCcatcgaaaattggtcattaaaccttttgttctccaagagagg
ggtagagctctcttggcttaatgaccaattaaaccAAAGATACACCGAAA
ACAGATTGTTTGCAATAAAATAGCATTCAGAGCATCAACATTTATCAGCA
GTGAAATTGTTtggtttttgcataaaatgaaagaactgtctccactggct
gcgtttagaccagcctggcatttgtaattgcttgcagtattcttttgaat
tctattgttccgtgcaattgttc
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_308 | supercontig | scaffold_308:20974..33446 + |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
| Ortholog Name | Description | Organism |
|---|
| STRA6 | stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog isoform f | Homo Sapiens |
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