XLOC_035707 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_035707
Unique NameXLOC_035707
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_281:327102..337962-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_035707 ID=XLOC_035707|Name=XLOC_035707|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10861bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_281:327102..337962- (Clytia hemisphaerica)
NNCGCCATCTGAGGACCAAGAAGCATAAAAACCTTTCTCACGAGGAAAGT CTCAAAATTTCGCATTCGTTACGAAAAAGAAGATCTGATACACGCAAGGA TACTAAGCACAAAAACTATCACAAAAGAAGGATTTGTGCTTTCCCGGGAT GTGGTATCCAAATCGAAAACGTATCTCATCATCTCCGAAATACGCACAGG ATGGAGCGAAATGACCACAACTACTTGACTTATTTAGCCGACTCCCGTCC AGTTGAAGGTAAGTTGAAAAACGATCTAATAATTTTCCCGGTAGCGCTCA TTGTAAGAAATATTCATCCCACACTTTGAGAAGCGGATTAAATCTTACAA AATAACTTCTTTAATGTGAATTTTTTTAATTTGACTGGTTGATTGAGAAA GTTTTTCAAAGTGTATTAATAATCAGTTGTGTGATGGAAAATTTAATTCA ACGGAAATTGAATTTAGCCATTTTTGTCTACTGCAAAGTTTGCTACGGTC AAAGTAGGCTTCAAACTTTTCTATTAGTTTGTGTGTAAAACAAAAGTCTA TTCGTTTTATTTTTAATAACTCTAAAATTTGTGTTTTAGAAAGCCCTCAA GTTGAACAAGTTGAAGAGGAGCACGTCGAACGATCCTTTCAACTTAATCC CGCAAACAAAAATCAAGATTCAAATGGTATGATTTTATTGTCACTGGTTT TGCACTACGAATCAAGACATTGAGGACATTCCTTCCGTTTTCAGTCATAA TAATGGCACAATAGTGGAATAATATTTCGTGAATGATATTTTATCCTATT TTTTCGCGAATATTTAACATGTTGTCCACGCTCCTGGAAAATCCCGAAAT TAACTATCATCCGGTAAACCCCTTGAAACTACTGGAATTTGATATTTATT TTTCAAAATGTCCTGGAATATTAAAAAAATATAAAATTCCTGGATATCTT 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TCGGCAATGCTTCCGATAAAGAGGTAATTATGAGCTCTAAAATCTGATAT CTGACCTATGCATTTTGTCCAAAGCAAAGTTATATTTGTATGATATTTGC TTATGTTTGGTTTTATCTTTTCAGAGATAAAATTTCTTCCCGCCAAAATT AGTTTTGGTTGGCTGTCAAGAAGAAGTTTGCCAAAATGCTTGAATGGCGA ATCGGTCACGTCATCTTTTTGTAGTGAATCCTTTATTAAAAAAGTACATT TCAAATTGCCTGGCAGTAAAATTTCAATTGCGTATAACTTTTGATAAATT TCGAATTATTTTCACTACTAAACTAAGTATTTTTTCTGTTTTTTAGAAAA AACCGAGGGGCAACTTTATAATTTAACAGCAGTAGATAACCTATTTCGGA AAAAATACTAATGAACACGAGTTTTTCCAAAGTATAGAAAATAAATTTTA TTCCCTAGGGAAAAACATTCCATTCATTACAAACAGTTGGTAATTTAAAA AAACAAACTCTTTAACTTCTAAAGTTTCTCAAGTCAAAAAATGATTGTTA TAGCATTGCCAGATAAAAAGTTGATATTTTTCTTTTCGTTTTTCTTCTTC GTTTTTGACTATTCTGCAAAAGAATTATATGCATAACATTCCACTCCGGA CTGTCTTAACAAAAAGTATTAAATGGCTATCTAATTCGAAATCTATCTTA AGTTATATGCATTGGAAAATTTACTGCCATCTAATCTGAAATTTGCTTTA AAAGATAAATTTTCCTCCTAGATTTACAACAAGATAAAGTCGCTCGAGAG ACATAAAAATGGGAAGAAAAAGAAGGAGATGAAAAAGAAGGAGATGAAAA AGAAAAAGACTCAAAAACGGAAATGCCTTTTTTCGAGTAGAGAGCTCGAA ATCATGCAATTAAAATGCCAGCCCATGATCAAAGGAGGATTGGCCATCAG 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GCACCATCATAGGTAAAAGATGGCTCAAGTGGTTTTTTCAAAAATTATTC TTGGGTAAATTTCAGCCAAAAAACGGCTGAAAAGATGGTTTTTTTGGGCT GGGTCATCTATTGGATCATTGATTTTTTCTGAATTTTTGCATTAAAGAAG GTAAAAGACGGCTCAAGCAGTATTTTGCAAAAAGAAAAAAAAAAGATTTT TTTTTCAATAATTATGACAGTTTCTCCCAATAAATTTGCTTTCATTATAA CTTTTTATTTTGACCAGTTATGTCTTTTGTGTTTCATTGTTTCAATGTTC ATTGATTAGTGTGATAAACAGGTAGGTCCATAAAAGTATCGCTTGTTTCT GTTAACGTAATACAAAATGACTTATTCTTATCAAATTCTGTCAAACACAC CCGAGAGGGTATTCTTAAAGTATTCGTACGATTCGGTCAATTTTCAACCT GACATTCTCATAGAAGATATTCTCTTTGTCCAAATTTTTTGCGTCTATTT AGTCGGATTTTCCACATGCCGAATCAAAAAGGACATTCTAAATGTAATTG ACTTTGGCTTGTTAACTTTTATGTTATTGTAATCAGTTGTAATTCTTAAG TATCATATTCAACTTTTTTAATAGGGAAGACGAAGAAGATGAAAACTCCT TTTCGGAATCTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAATTAGAATTAGAA GATTGATAACGATTATGACGAAGATGATATGCTCAAGATCTAAAATATGT GTCTATTGGACTTTGAAAAACTCTAGAATTAATTATGTAGCCTTTGAATT ATAGTTTTACAATACTATATTCTCATTCAACTCAGATGATAGCGAAAGCC TATGTATGCATTCAAAAACCTTTCGTCCGTGTACACTCACTTGCATTGAA TTTACTGGCCAGCTAGACTCAATTTTCTGCTGTAAGGACTGATCAAGATA GGAGCGTATAAAAACTTAAAGCAAATCCCTTACAGATATATAAATGACCC CTCGGAATCTAGGAAGAGTCTATATGCTGCCTCAAGGGAAGAAATTTCGG CAGGAAGAAAGTTTGTTGACTTTGCCTCAAATCCGTCAAATTAAGTTTCA GCCAAATTTAATTTTATTCCCCATCCGCCAAATGATATTTTTGTCTGATT TTTCACAATTTATCCACTAAAAGTATGTAATATCAATGTTTTGACCTGAA TATTTGACCTAAATCGCCGAATCAAATTCCTGCCAAAATTGATTTATTTC CTAATCCGCCAAATTAAATTCCTTACGAAATTTCTTCGAATAAAGTAACT TTAGGCCAGGTCTCCTTTAAAATATTTATTTGTTCATTTTGTTCGAAAAC AGGAAACTTACGAATGGATTTGGCTTGAAGCATTGAAACCTTTTTTATCT AAGTATTGGCCTCCTAAAGCCGAGAACTCACGGAATAAAGGCCGATATGC CCTAGAGTATTTTGTTTTGTATGTCAGAGTGTTGTGGTTGTGTGCAACTG TGAGTTTTAATACGTCAAAGAAAGAGATTTTGATCAATTTAGTGAGAGGG AATTTGCGATCTAGCGTTTTTAATTTTAGTTTTGAGATTTGAGAGTAGGA GGGGAGGCTATTTATTTTGAAATTCTATTAGTGATTTTGATCAAATTTAT TATAAAACCCAAACTTATTTTGAGATATGTTGTTTTTATTCCTTTTTTAT TCCTTTTACAATGTTTGTAATTTGTTGTTTTTATTCCATTTTTATTCCTT TTACAATGTTTGTAATTTGTTGTTTTTATTCCATTTTTATTCCTTTTACA ATGTTTGTAATTTGTTGTTTTTATTCCATTTTTATTCCTTTTACAATGTT TGTAATTTGTTGTTTTTATTCCATTTTTATTCCTTTTACAATGTTTGTAA TTTGTTAGAGATAAACTTGAAGATCAGAAAACCATTTAGTACAAATAAGA AGGCTTTTTTTACTAACTTATTTAGCTTTATTTTGGATTTTGTCCCTACT TGGAAATAATTGAAAATGTTTATAAGACATCCATTTTGAAAACCAACTCC CGAATATCGCTTCAAAATATAGAAATAACCACTCTTCTCTCCCGAACAGA CGTCTTCCCCTGCGATGATTGCTCAACGACAAAAACCCACCCTTTGCATC TATGATTTGAGACTTGGGACTTTCTCTCCCATTAAAGTAAGAGCTCCAGC TAATTAAATTTGATCAATTCAGCATCGTATTTATGCCATAGTGTTAAACT TTTAGACTTTTAATAATTAAAAGTATGCTTTATGAATTGATAAGAAAATT TTCCCTTCAAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00056688TCONS_00056688Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056687TCONS_00056687Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00056687-proteinTCONS_00056687-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_281supercontigscaffold_281:327102..337962 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.04 0.07 0.08 0 5.91 4.98 6.36 8.25 4.9 5.77 4.73 4.87 5 4.63 0.12 0.17 0.01 0.08 0.09 0.09 0.03 0.05 0 0.05 3.48 5.89 0.07 0.07 0.09 0.06