XLOC_035223 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_035223
Unique NameXLOC_035223
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_266:607217..631843+

Legend: gene
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ATTACCTCCCTATCAGTCCTNctttaggcgtagaaactttcgcgagcaga aactttcgcgattttcgcgaattttggtccttttcgcgaaagtaaatgtc tttaaaaattctaggaagggccattcgcgaaagtttatgctcgcgaaaaa ttttcgacaaaatagaaaatctgttaaacttcaaactttgaataaaatgt aagttttatggcactttttagcctgctaaaagactaataagtcaaaggac aaatgtttcaagccaaNTTgctttttaactttattttgcTAATTCTTTCT TGTTTCTTTCAAGAAATCAACAATTAAGCGAAGGTAAAGTCAAACGCCAA ATGTCCATCATGAGAAGAGAACAAAAGATCGTCAATCTCGAATCCAAGTA AGTTCTGGAGTAACTGGTGATGTGACCAGTCACAATATAGAAATTTGAAC TTCTCAGCTACTCAAAAGAATCTATCCCTTTAACCAACTAATTCTCTCAC ATTTCTACTATATTTCAAAGGTATTGAACTTCGCAGATATTGATAGGAGT TCGAGCTTATGTATCTGCTCGTGGATATGTTTTACGCAAATTTTATTCTA CTTCCAATAGATTAAACGAATATGCTTCAGAAAGAAAAGCACACGAAGAT AAAATGAANTTCTcgattttacgtcttgattcgcaaaagtttatgctcgc gaattatatttttccgttaaattcgcgaaagtaaatgtcgtgaatttcgc gatttttcgtcctcgcgaaagtttctgctcgcgaaagtttgtacgcctaa agtatatatttttatcTTCTAGGATCGATGATCTTGAGGATGCAGTAAAA ATGAACGAACGTTTGAACCAACAAGNT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00055955TCONS_00055955Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00055956TCONS_00055956Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00055957TCONS_00055957Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00055958TCONS_00055958Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00055957-proteinTCONS_00055957-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_266supercontigscaffold_266:607217..631843 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
CCDC88APREDICTED: girdin isoform X6 Homo Sapiens
CCDC88BPREDICTED: coiled-coil domain-containing protein 88B isoform X3 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.32 2.81 2.5 1.94 37.72 29.69 31.29 33.99 31.58 33.69 24.44 31.25 5.77 5.5 5.83 6.78 5.15 5.32 6.8 7.49 7.19 7.04 3.03 4.67 8.82 10.2 8.4 5.38 6.67 6.91