XLOC_031112 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_031112
Unique NameXLOC_031112
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_15:239494..246482+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_031112 ID=XLOC_031112|Name=XLOC_031112|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=6989bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_15:239494..246482+ (Clytia hemisphaerica)
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ATATTTCGCAGgactattgacctctatgaaacaatctcaTTTAAATTTAT AGTTTATCAATAACAGTCTTTTAACATATTTTCTTGAAGTAGAGCTTCTC TCACTTTCCATACACAGCATTCATCCTTCTCATTCTTCGTtttcttttag atttttcatGCCATTCTTTAATGGCTTCACGTTCTTTCTTGGAGATTCTT GGAGCTACACTGAAATTTTGTTCGTTTAGTTGATGGACTGAAGCCATAAT TCGTTTCTTGTCTTTTTCATTGCCCAACGTTACTTTCAATGGCCGCCATC TTTTCGTCTTGAACATTATCATCCTTTCGAGCACCAATTCGTTCTGCGGT GACAACGTTTATTTATCTTTAATCCCGTACGATTTCCTACAACTTCCTCC ACGTAATCTTTTTCACCGGTCCGCTGTTCCTCTTTGTTCTCGTCTTTATT TTCAGCTAAATGATGAATGGTTAGGTTCTTTTCTTATACGGGAAACGTAC GTTGGTTCTGTATTTATATTGAAGTCGCTCAGGAGCTTGGCTACGAAGTC ATTCTCATCCTTGTTTTTGGTCTCTTTGACACCATGGATGATGATGTTGG CATCCCTTGATTGTTTCCTCTGTTCCTCgattttttcttcaactttttca cTCCGGAGAAGCCGTTTTATGTTGTTAGTTTTTGTCATCACAAACTTTTC GTAGGAATTTCCTCTTGATCCGTTGTAGTCTTTGCATTTATTGTCTCTTC GATTTTATTTACGAGTTTAGTTTCCAAGTCgggaaattttgttttgatta tttcagTTACTTGATTCTTCTCCTGTAGATATCCTTGACATCTTGCTTGC AGCTCCTTAACTACACAGCCTAGTCTCTTCTCATTTTCGCTACTATTTTT CTTGCTGTTCGCAAAGCCTTTGACACGCAGTGATTGATCGATTatatttt tattcagtttttcaTCGATTGAACAGCAATTTATACACTGGTACTTTCGT ACAGAATTTTTCTAGAAGAGCATTACATTTTCCAATTATAGAGGAATCGA GAGGATTTTATGGACTTTTTCGTTTCCCTGGACATTATTTCATTCTCCGC CCCCATGAACAgaatttttctagaaaagcaTTACATTTTCCAATTATAGA GGAATCGATAGGATTTTATGGATAATGAGTTCGGTTTTTTGTGTAAGATC GTAAAGGGATGTAAATATGTAtaagaagcttaaaatattttctcttttac cattatttttttcatagacTTTGTAAATTTCATTCAGAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00048978TCONS_00048978Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00048979TCONS_00048979Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00048979-proteinTCONS_00048979-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_15supercontigscaffold_15:239494..246482 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.03 0.04 0.26 0.18 4.02 3.14 2.56 2.6 1.63 1.46 1.67 1.17 0.89 0.95 0 0.02 0 0.03 0 0.01 0.05 0.02 0.01 0 2.83 3.33 0 0.03 0 0.01