XLOC_006728 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_006728
Unique NameXLOC_006728
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000134:435814..479109-

Legend: gene
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>XLOC_006728 ID=XLOC_006728|Name=XLOC_006728|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=43296bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000134:435814..479109- (Clytia hemisphaerica)
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AGTACACAAATATAGAACAAGCTCCCTTGGAAACGCTATAACGCTCTCGA AAAAAATCAAAAGGGCAGCTCGATTCAGCATTTCTGCAGCTCATGTCACG ATATATTAAGCAGTTTTTGTCTTGATTAACCTACTTACACTCTAAACCAT TCTATTGTGCTCGTATGAATATTTCCCGACACATGGTATATNCTACTTAC ACTCTAAACCATTCTATTGTGCTTGTATGAATATTTCCCGACACATGGTA TATTTTTATAGGAAAAAATTTCATACTTTGCGTATGTTCTTCGTCGATCG GGTTAGAGTAATATACTTTTCTAATGGGTATCATCATTGTAACCACTATT ATTTATCTTCTTTAGAACATGTTCATGTTCATTTTTAACAAAGTTCATAC ATCAAGTTTTACGGAGAATAGGTTTTATTCTCAGGAATGTAACACTTTTT TACCCGCGCACCATCGCCTCATCTATGGTGTATTTTAGAATCAATATTCT ACCAATAGGATACTCTGCCAATTTTATACTGCGTCCTTTCCCAATGTAGT GAGTTACCTTATCGGGGAAAAGTGACGAAATTTCGGCCAAATGCCGAATA TCTTTCCCCGACGAAAATTTTCCCCGGTCTTAATGCGTTTACCAACTACC AGCAAGTGACGAATATTTTTCCCCGACAAAAATTTTCCCCGATGAAGGTT TCCCCTATAAGGTATTAATAAGCCCTGGCGTGTGTGCAAGGTCGTAGGTT CAATCCCTTGCCTGATTATAACAAATACTTCGTAATTACCTTCGGGTAAA CAGCTATGGAAGAGTGATCCATCGGGTCGCTCCTGACTGCGGTGGCAAGA ATTCTGAAACTTTCGATGTTCCTAGTTTCAAAAAGATTTACTTTTTGGAC CTACCTTGGAGGTCCTATAAATTAACCGATGTCCGTCCGTCCGTCCGTCT GTTACCAGCTTTCTCAGGATTGGCTCATTAGTTTTTTCTTATTTTTGGCA CAATGATGCAAAATGGCAATGCCCAAAATGTGACGGAACCCGATTTTTTC TCTTCATAGGAATTTTTCTCCAAAGAAAATACACAAATCCCTCAAATCGA AGGTTTGCTATCTGTTCGTAAAGGCGGATCAAAGAAATGGGAGAAACATT ATGTGGTACTCAGAGCTTCTGGTGTTTATTACAATCCCAAAGGGAAACAA AAGGTAAGGTCTGTCATCCCCAGATGAGATTGAGTTTTTATAAGTTACTT TAATAATTGGTCATTTGAAGTAATAGAAATGACGCGTTCTTTAGAAAATG TAACAAAATTGTTTTATTACTGGTTAACGACCAACCAAATCAAATAAGAG CTTGTAAAAACTCCATCTCGTCCAAATGCTTTTTTTCGTTTTAGAAACTT TCTCAAAGCGAGGTCGGTCTTTTATGACCACTTTTAGTTTTCATATAGGC CGGCCCTGGAATCATTTTTAATATGACTCACATCTGGAAGCGCCTATTCC CCCAGGTCACCCAATGTTTGAATATGTTTTTTTTTTTTGGTTTGAATCAT TTTGAATAATATTCTTTAATATCCGCTTCTAGTTTTCTTCGTGGCCGGCC GGCCCTACAATATTCTTAAAGTCAATTCTGGCGACACNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGGGGGGTCTG AATAAGCAGGGGGTAGGAAAATTTTCTAAATTCTAATAAGCGGGGGGATG GAATAAGAGAGGGGGTGATTTGAAGACAGAATTCTTTTAACTGATATCAA TTTCAATAACAAAAAAGAAACTTTAGCAAATGAACACGTAAAATAAGAAC CAATACTAACAAAATTTTTTTAACAAGTTTAAGGTCTATTTACACTGTAA TGAAATATTGAATTATTCTAATTTAATTAGCGGGGCGGGGGTCTTAATAA GAGCGGGGGGGGAAGGATTTTTTCTCTCTTAACAATTAGCGGGGGGGCGT CTATTCGGGAGACAAGAGTAGGTCACCCAATAAAAACGGTCCTAAATTTT GTATAGACTTTCAAAAGACCAAAAAAGATTTCAAATATTATGATAAAATG ATTTCTTCGATGTCGTACCTTTTTTGGGCGGGGATTTTACTCTTCGGCTC TACGATTCAAAAATGAACGATATAATATAAATTTACTAGACTAGATAATC ATAAATTGAATTAATATGTGATCCCAACTTTTGTAGACGAGAGAGCTTTC ATGTTTGGTTCAATTCGAGCACAACAACATTTATTTGGGCGTTGGCTACA AGAAGAAATACAAAGCGCCCACTGATCATGTCATATGTTTGAAACACCCA AAGATTCAAAACATCAAATCGAAACATATCATTTACCTGTGTGCTGACGA CAGCAAAACGATGTATCATTGGTTGACTTGTATTCGAATGGCTAAGGTAA ATCTCCCCTTTGGTGATACGTTACGTCAGGGAAAAAGCAAAATTTTCAGA TTTTACTTTTGTTTACTCAGACTTTTCCTACGTGCGACCCTTAAAGGTGC TTTTTCCAAGTTTCCCAAAGTGCACTGGAAGGATTGAAGGTGAGCGAAGA TAAGAAACTTGCACTCTAAGGGTTTAACACTTTGAAAATCTAACCATATT TTGCCGTAAGAGTCGATTTTTCGCTAAATTTTCTCTGCACTGTAAAGGTC CGATTTCAAAGACCTAATTTTGGACCGCACATACGGTCTCTTTTGAATCG AGTGAACCTCCCCCCTCCCCCGGACTCTTGCCAGACTACGTGTATGTCAA TCAAAACCATTATTTGTCCATTAGATGTCCGTTGGTAAAGAAAGAGGGAC AAAATATTAAACCTTCGAAGATTTCACAATTTTATTTTACAAATAAACCT TGAAAATTATCCTGGGAAGTAACGTTGATTTCTTCAGGAAAGTTGAGATG GTGGTCCATTTTTTCCGAGAACTTTTCAGCTATGGTTATTAAATTTCTTA TTCATGTCTCATCCTTTTATCATTTAACTGTTAATTATGTTTTTACTACT ATTTAAACTGTGATTGCATATCTATATACAATCATACGTCCCCATCAGTT ATAACTTTCACTAATACAACTTTCAATCCAATTGACCAAAATCTATTAGA TGTAACCCGTCAAAATTTTAGTTCATCCTTCCGTCTTTCGATCCTATAAA GAATAATTTTATCAAACTGCTGCACAGAACTTCAGAAATTTCAGTTCAAG GAGGCGGGAACTTACTTTTGGTTTACCTTTTATTTTATATTGTTCGTTCA CTCGTTCCGGCTAGATCACTGGCTAGAAATGCCCGAAAAACTGAAATTTG AACTCTTATTATAGCACACAGCAAAACAAATGTGAATTCTGGCATTTTGG GTGTTTCTAACATCAGGAAAGATAACGTAATCTTGACTTATAAGTTATAA AGAATCAACGATGTATTACGCTCAGAAATTCGGTTCTTTCAGCACTCTAT AGACTCTGTTGAGGAGCAAGCTCTGTTTCTCTGTTCATCACAAGCGATTA TGCGAAGCTCAACATTTAGTGTTTTGAGCCCTCTGGTGACAACAACAGTC TATGCTCGTTTACCTGAGCCGCACTGACGAGTCCTGGGAAGGACGAAAAA CGTGTCTGTGGATAGATATAAAAAATCAACTCCACAAAATTTATTCTCCT TTCACTTAGGCTTTCATAAAAAAATGAAAAGTCAACATACGTGAACATTT TCATTTTATCTTCTACAGTACGGTTACAATATGTATGAAGACTATTTGAC CACTCAACAAGAAGTTGAACGCGTCTTATTGGCTGGAAGTCGTTCCACCA TCACATCACAAGTCTCGACAACAAGCTCCAACAACACCAGTAGCAATGCT GTAAGTCTTTTTTCATTAATGTACAGTGGAGTCTCCTTAACTCGAACCTC TAACGCCCCTCCTAGAGTGGAGGCGTTTATTCGAAGGTGGCGTTTATTTG AGGAGGGTTCATCGATAATTTTTCCTTAAAGGAGGGGTGTTTAAATGAAG GGGGTGTTTATTCGAAGTAAAACGATATGTCAATAACGCGAAAAAATTGC ATCGGTACACTTTTTCTTTTTTTTTCCTTTTTTCTCCGGAAGACTGAATA AATTAACAGTTTTCCATTTTTTTTTCAGTAGTCCCGCTGTGACTCATAAA TAAAAGAATATATATATTTTACATTGTAGGTACACTAAACTAATATTTTC GTCATTACTTTATCTTACTAGTCAACCTTGGATCGCAAAGCGAAGATTGG GACAGTGCGTGGTACAGTGCGTGGTACAGTGAGAGGTACAGTGAGACATC AAGGTAATTCTTTCAAATACTTTTTTCGTTCTCAATCGGAGATTTAGTGA ACACTATAATTATTTTATGTCCTCATCATAATAGCCTAAAACCTTTGAAT ATCGTTTTCTAGTAATATAGCATACTAGACGACTTATTCATATATAGTAG AAAATAATACACGTTTTTTTAATAAGAACCAGTAAATTTTTGCTCAGGCT AGGCTGTTCTTAATTTTTGGAATTTTCAGGCTTAAATGTTCTTACAATGT TCTTAATACGCATATTTCTTTGTTTAAAAAATTAAAAAGGGTTTACAATC AATACTTACTTTAGTCAGATTGTTCTTCATTTTTCTTAGGGTTTGGCCAA TTTTCAGCCTCCTCGCGTTCTTTTAAAATTGTTCCTTTAAAAAAGCGTGT ACAAACTGACATTATCCCGTAACAATTATTGTATTATCATATAACATCTA TATTACTGTATTACTCGAACGTCTTTTTTTTTCTAGTGAAAAATGCTGAT GGTACGGTGGAAAGAGTGAAAGGAAAACAAGACGCTTTGGCTGAAGTTTT TTCCACAGCATGGTCTAAAGGAATTGCAGAAATTGAGGTAACACACATAC TTTTAATAAGTTTTGGATATAAGCTTTTCCTCTTTTGATAAGGTCGTTAC CAGTAAATCTAGCCTTGGACGCTCTTATTTTTAGCTGGTTTAAATGTTCT AAAGGTGTTCTTAATATATTCTATCTTATGTACACTCAATAGCCTTCAGA CAGTCTTTGAAATTTAAGCAGGAATTAATTGCCGAATCTTTCTAAAAAAA CGTGATTCACGTCAACATAATTCACGAGTCTAAATAAGATTACGAAAATA GGTAATATATTGGACTTTACCTAATTGACTTATAATCTTGTTTTATTGAT CTCTATCTTTTCTTAATTTCCAGGCATCCATGGTGCCAGAATCACCATTT TCACCAGAATTGAAATCACCAGCATCTCCCATGTCTCCTGAAGGGCGTTC ACCTGCAAAGACGTTCGATTTCACCAACAGTTCAATCAACACCACAACTC ATGGAACAACTGGCGAGAAATTAACACTAGACCCTGTGCCACCTGGACGA AAGGCTAGTCAGAAGAGTACAACTTCCACCGTTAGTGCTGCTTCCTCAGA TGGGATGTCGGGCGGTTCTGACACCTTCGGAGAGGAATTACCACCACCAC CACCGGATCTTCCGCCCCCGCCATCAAACATGTTTTCACCGGATAGTTCT TCCGATGATTTACCACTCCCTCCGCCGCCTCCTCCTCCTGGCGATACCCC CTCACCTCCTCCACCACCGCCCCCTCCGCCCTTCAACGGAACGTTATCTC CACCCCCACCTCCACCACCTCCACCGTCGAATGGAATTTCACCACCCCCG CCACCGCCACCACCACTTAGCAGTAAACCCGGCGGTCCACCTCCCCCGCC ACCCTTGAACGCCAAACCAACTCGTTAAGCACTTAATTATTTTTACTCAG ATCGTAAATGACTTATGGAAATTCACAGAAAAGATTTTCTGTATATTTAA ACTTTCATGATCAGATGCTTTGGATTGCAAATAATGATTTTTGTGGAGCG TTGATCGCTTCCGATGTGTTAATTTTTTGAAGATAACGATTAAACATTAA TTTTTTTCCTTTTGATAGAATATTAATTTTTTTTTGCCATCTCCTTAACT TTTTTAGAATCTTCTGCCGTTTAACCTTATTTTATATTTTTCTATGAAAT TTCTGTTGCATTGTTTTTTTTTGTAGAATTTTAGATGAATTTTTGTCATT ATGTTTTGCTTTTATTTATGATTCATTGTTACTATTTCTATGGTACTTGA CTTGGGTCCTTTTTTGTTAAGTTTTTGTTTTATTTTGTTGGGGTTATCGT TAAACTTAATTTTGTATTACTAAATTTACGTGATATTGGCACTTTTAAAA CTTTTCAGACAAATTTCGAAGGTGGTTTTTTTTTGGTGTCGTCGCACAAA TAGGTATTTACTCTGAGAGGTGCTTTGAATAATTCCTGTTTTTTTTCGAT AGATTTTGAATGTTCTTTGGTATAAATGATCCTTTTACACCAATGTTTTC CTTTTACAATGTTATTGAAAGCTATTTTCAAATTAATTCAACTCNCCAAT GTTTTCCTTTTACACTGTTATTGAAAGCCATTTTCAAATTAATACAGCTC TTTTTTTCAGAATTTAACCGAATATTTGAGAATATATTCTCTCTTGCTTG TACTGTAGTGTAAGACTCGCACTAAAAGAGTCTTTAGACTAATTTTCAGC ATTCATTTTTGACGCTGTTTTTGTTTGTCTGATCTAGAGCACAATGTATG TATCTGTAGGGATTTGCCCTAGCATGAAATTATTAAAGAAAGTTCAAAGA AAGTATGTAAATTTTACGCTTGGGATATAACCAAATCATTTTATTAACTA TTGAGAAGACGATAAGAAGATTTACTGCAAGTTTGAAGTTTCAATATTTT AGAATGTTATATTGTACTATATACACGTTTTTTAAGGAACACGTTTATAA GGAACTTGAGGCTGAAAATGGTTCCAAAAATAGGGTAATTGTTAAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00011991TCONS_00011991Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00011990TCONS_00011990Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00011989TCONS_00011989Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00011991-proteinTCONS_00011991-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000134supercontigsc0000134:435814..479109 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
34.77 30.99 25.1 21.23 30.5 23.9 22.91 26.06 17.19 20.89 17.48 12.48 25.38 27.48 17.43 23.06 25.61 25.26 27.71 28.2 21.5 24.53 24.36 27.2 27.18 27.49 30.66 28.36 39.42 35.83