XLOC_005571 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_005571
Unique NameXLOC_005571
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000100:410968..432155-

Legend: gene
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TCTGTTTTTATGACGTCATCAAAATAGCAATAATCTACGCAAAATAAAGG TTTTTTGCGAATTACGTTAAATTTCTAAATCATAAAACATCTGCCTAGAT TGAATCTTATTCTACTTAGTTATACGCTTCTTTTGAGCTCAAAATGAGCT TGTGAAAAACGTAAAACGTTGCAAGCATTTAGACCCTGCCTTAATCCCCT GGAGTCCATCGACCTCTCGGCAATTGTTCTTTTAACTTATATCAATTATG TGCTTAAGATCGTGTATTAATTGTATTTCGAAAACAACTTTTTTTTTAAA TTTTAGGCTCGCCTCTGATGGGTGACATCCAGTTGAGTTTATACGAAAGA CGCGGTGCGCTAGAAGTTGAAATCATTCGGGCTAAAGGATTATTAATGAA ATCTGGGGCTAAAACACTACCAGGTAATACGTTCAAACTGAGATTGTATT TGTAACCCTGTAACGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTACACAAGACTCA GAATGATAAGATCTATTAGTTACCTTAATAAATCCTTATAGCAATTCCTT AGATTCCATACGTTTCTCTATTTTCCCCTTTTTATGTAATGTGTATGTAA TGAGCCCGATATCTCATTTACCGAGAGTTTTTTTCGGGTTCTAAAAAAAA AATCAACAAATGCTTATAAGGCCGGACTCGACTTTCGCGCGACATGAGCG AAAACTTTTTGACGGTTTTGTAAGGTGATTGGTCGGTTGAAAAATGAAGC AATTCCATTGGTCGAAATTGACGTAACGGATGAAAAAAGTAGAACTTCCA TTCAACTTTTTTTTTGTTCGCACGCAACTTTTTTATGACGTAATCTTTTC TTCAGGCAAAATAAGTTGAGAAAAAAACTGTCGCCCATTTTGCGCAAAAG TGGAGACCGGCCTTTATCCTTATTCCACTATTCAACACCTTACGTGAAAG TATATTTACTGCGCTAATAGAATATCTAAACCTTATTTCTCCTTGTTTCC TTTTCAGCACCTTACGTGAAAGTGTATTTACTGCAAGGCAAGAAATGCAT TGTCAAAAAGAAAACCAAGACAGCTCGTCGAACGACAGATCCTTTATACT CGCAAATGTTGGAATTCCCTCAGGATTACAAAGGGAAAGTACTGCAGGTA CAGTAGCCTATACTAGACGTCACCCGCGTTTTTTCTGTGCAATTAACGTC TATTCATGATATCCACCGCTGCAATGACTTCACGAAATTATTCTGTTGAG ATTCTTTATTTTGAGATTTAGAAATAATCAGGATGAGAGGGTAATCGAAT GGGGTTCTACTGGGTTTCTCTTTAATTCGAACCTCTATAACTCGAACAAG CTTTCTGGTCCCTTCAGTTAGCAATGCCTTATACACCTTATTCCATATCT CGAAATGTCAAAGATTCGAACAAATTTGTGTTTCCCTGCGTGACCGAGTT ATGGGGTTTAAGGGTTTTATATTGGAAGTTTATCGTGGCTTGGATCATGA GACTTACGTTTGGCTACGTTTCGAGAGATTCTTCTCCCATCATCGGGCAA TGTGGAGGATGTTTCCCTCACTAATCTCGAAGCGTAACCAAACGTAAATC TCGTGATCCAAGCCACGATAAACTTCCAATATGAATATCATTGGGTCGAT AAACACAAACTTATTTTGATCAAAGGGTTTGAGTTTATCCAGCTAACAAA AACTTTTGTCCAGAACGAAAATGAAAAATTGGGATGGAAAATTGGTCAAA AAGCACTATTTTCATGATTTTGAAGCAAATAAGCTTTTAGAAAAATTTTC CGAAAAAATAATTCTAGTTAGATAAAAAGATACACCATCTACTGCAAAAA AATTTTCAAAATGTTTTTTCTTCGCCGAAACTAAGCTCTTCAAAGTTGAA ATACTCTTCTTTGCGAAAGTTTTCATTTTCTTCTTCATCAATTTTTTTCA TTGCGATTCTTAAATTTTCAGACTCGCGGATAATTGGCCTAACAGAAAAT GTATAACATGCCACAGTTTTGTGTGCTACATCAAGTAGAACTTTATATTT TGTAGTGGCAAATATTGAAAATTCACTATGGTCAGAGCCCTTAAAAGGGT TTGTTACCTGAAGGAAATAGAAAACTTGTTCGAGTTATAGAGGTTCGAGT TATAGAGGTTCGAGTTATGGAGCCTCTGCTGAATTAACTGTTAAAGACTG AATTTATTTACAAGAAATTTTATTGCATTTTTCAGGTGATGGTCTGGGGT GATTACAGTCGTGTCGACCGGAAAGTTTTTATGGGAGTTTGTCAAATTTT ACTGGACGATCTTGATCTCAGCCATCTGGTCATGGGATGGTACAAATTGT TCTCAACGGCCTCGATTGTTCAACCTCCATCTCCTGCCTCGTCTACCCAA ACTTCTAGTTCAATGCCTTATGGGTCGAACAGTTCAAGTGGATCACGTGG CTTCTGAGCTATTGTCATTATTATTGTTGTTGTTTGGGTGAGCGAGACAT GAAATAAGTATTTATTTGGGTCACAGAGGCATTAGGAAGAATTCATTCGA ATGTTTTGGTCACGTGCTAACAAAGATAGATCGCGAGTTGAATGTTTTCC CGCCAAAATAATCGAACGATTATGACAACGTCAACAAATTCACTCAATGG AGAGAGAGAGAGCGGCCTTACGGGAATTGCACAAGAAAATTAAAGATGCT GAAAATTTCTTCGATTTTGAAATGAATACATTTTATGAAATAAATGCAGG GAATACAATAATACGGTGAGGCTAGTGTACAACCTACCAACACATGTTTT CTTTTGTATGATTCGAATTTGTGGGCATGATTGAGATTCGACATGCTTTC CATGAACACAGAACAATAACAATGGTCTTATCAAATGCATTAATAGGAAA AATAACCAGACTGGGTATAGACATAGATTTATAAAGCCCGAAGAGGCTAG ATTTTGTGCTTTAGCTGAAAAATGTGTCGTGGTTAGGTAGGAAATCCTAC CTACTAAAAATAACCAGACTGGGTATATTGATGTTCAAATAACTATACCG TGATTTATTTTTGATTTAACACTAATTCGATATAGCCTAGAGGCTAGATA GGAATCTTCAACCTTTCCCGTGTAAGAGAAAGTGGTGC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00009938TCONS_00009938Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00009937TCONS_00009937Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00009936TCONS_00009936Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00009935TCONS_00009935Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00009934TCONS_00009934Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00009933TCONS_00009933Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00009932TCONS_00009932Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00009931TCONS_00009931Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00009935-proteinTCONS_00009935-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000100supercontigsc0000100:410968..432155 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.02 2.57 0.98 0.76 8.1 6.28 14.67 16.76 5.73 7.58 8.69 6.64 6.11 6.41 4.77 6.31 7.15 8.54 5.76 5.49 7.13 7.72 5.05 5.87 15.77 13.27 4.41 4.14 5.83 5.52