XLOC_004820 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_004820
Unique NameXLOC_004820
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000086:434726..442690-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_004820 ID=XLOC_004820|Name=XLOC_004820|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7965bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086:434726..442690- (Clytia hemisphaerica)
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GTCTTGTTGAAGACCTGTTCAATAGCACTCATCGATAAAGTAGGCCGATA TTGATGGCCCGGTTGAACCAGTTGTATGTTCTTCACATTGCGATACTCAC GATTGATGCTGAATAATGAATCTTTGAAAATGATAATCAAAAGTAAAAAT GCAACTACAAAGAATAATTTGCCTTGAGAATTCGACATTGTCTGTTGCCC AATCATGATTTTGTNGTTTATCACATTTTCACACGTTTTGTTAGCAGAAA ATTCTTTATACTTTATCAATTATCAGAATCTTGCAGTTGCCAAGTGATAT TCCATTGAATTATTCCGCCTTCTGGTGTTTTAATTAAGCAATGGTTGCAA AATTTACTGAAAAAAGGTGTCTTTATTACTTCAGTAGACAAAAGACACGA GAAGAAAAAATGTGAGAGACCGGCCTCCCTAAAAGTTCATATTTTACATT TTTCAAGTAATGAAATGTTAAGTTGAGACTCGTAAGATTCGAGATAAATT TAGTGAACATTCTTAGTCATCAAACCACGATAATTCCAAGCCAAAGGGGA AAATTGTCTCCAGTGGGGGCTTTCATAGTCCTCATAGTACCTTTCTTATC AGGAGGGGGGTTTAGTATGAGAGAGAGAGGGATTTAAAGTATGTTGTAAT ATGTCTGTGATGCAGGGTAGCTCCAGCTGTATAGAGAAGTGTGAAGCAAG GATTTACTCTATAAACAGTGGCAAAAATAACTAATACAATTTTATGTCCC TTTGTTCAAAATATTTTTTTAGTATCTCTTTTCTATCCTAAAACTGAAAA TAAAAGTATCTTAAAAATATACCCTAAAATTTCGGACGCAAGCACACAAA CTAAAATAAAAACTTTTCTTTATCCATTCTTAAGTTTGCTTTGACGTGAG TATAAAGTGGCTTCTCTTCAACACTAACCAAATCATACTGTAAAGTATTC AGACCATCCTGAGCAAAATACCGATTAGAGTTACTCAGCTTTTGATTCAG TTTCGACTGCTCGTTTCCAGTTGGTCGGTTTTTATTTGAATGTTTCAGCA TTTTGTATCGTGCAACTGAAATAGAGTGTCGGTGAACCGTCAGTCCGTTT GCCCTTAACCGATTATACAAATTATCGTCCTCGCCACCCCATCCGTAAAA AAGATTCGTAGCTCCGTTAACTTGCCGGTAATGTTTTGACCACAAGGATG AAACACCACCAAAGATTTCATTATAGGGGAGAATATACCTCATAGTGCTT ACACCTGCTGATAAATGTTTCGGCGAAACTTGGCAACCGTAATCGATTTT ATCGTTCTCAGGTAGAAGATCAACATCGTGTACGATGAAACATTGATAGG GAAATAATTTCAAACCTTGATCGAATCCGATATTGAATAATTTAGCTCTA TTGAATTTATCTTGGCCAGTTTGCTCCACCACTAGAATTCTATAGTGTAA TTTCTGCCGTTTTAAGATTGGATGTAACTGTCGTAGAAGGATAGGTAATT GCAATTCACGGTTTCGGAACGGGATTACAATCAAAGTGGATTGCTTTGGT TTACAATCTTCAGGTTGCCACCAACCTCCTTTCTTGACAAACTTGAGCTC GTTCTCATAAAGCCATTCTAACGAGATCTCTTGTTGTAAAACAGCGAGCG GTCCAATAAGAGAAGTTTTGTTGCATTCAATTGCTTCACCACAATTCGTT TTTATGTGAACATCAATCTCTGGGCTGTGTTGTGAGACATTGTTGCTCTC CAGCCAGTTATTGAAATCCTTAGAGCAGCTACTTATGTTTAATGTGGAAC TCAATTCATTAGAATGTATCTTTTGAACCAATTCTGATGTTTCATTAGTG TTGATTCCGGTGGAATTGTCTCGTTTAACACTGAGCAACTTACTTTGGAT AAAAGTTGAAGAAATTTTTGCATCGAATTATCTGTGTTATGTTGCATCTG TTTCAATTTTGAATCAAATTTCTCATTCCTCTTCATAATAAGTTTACCGA TTGCTTTTACCACGGTCTCGGCGTTAAACGTTGGCTGATCATGGCCTGGT TGAACCACTTGGATGTTTCGGACATTTTGATATTCACGATTTAAACAAAA TATTGAATCTTTAAAAATTGTCACTGTCAGAAGAATGAAGAATAAAATGA AAACTTTTGAATTCGAACTCTTCGCGGTGATAGAAGTGACTTGGACCATC TTGGAGGCCTTACTTTAAATAATACCGAATCTACGATTCTTTATCATTAT ATCTTTAACCTTGTT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00008617TCONS_00008617Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008616TCONS_00008616Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008615TCONS_00008615Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008614TCONS_00008614Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008613TCONS_00008613Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000086supercontigsc0000086:434726..442690 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0 0 0.03 1.65 0.88 9.29 10.61 13.9 12.04 15.75 13.99 1.49 1.56 0.06 0.07 0.85 1.18 2.96 3.33 1.05 0.75 0.94 1.06 2.31 2.31 0 0 0 0.03